MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Hindbrain_E11.5_H3K4me3_75_31_0.585_6.540263e-113
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.494957	0.429355	0.016447	0.059241
0.022613	0.694656	0.224626	0.058104
0.015315	0.880016	0.005918	0.09875
0.042094	0.877952	0.002007	0.077947
0.27523	0.037391	0.660254	0.027125
0.103759	0.038172	0.839494	0.018575
0.022626	0.944538	0.02903	0.003806
0.146321	0.61907	0.057894	0.176714
0.038712	0.044031	0.828827	0.08843
0.026283	0.0	0.963886	0.009832
0.339888	0.0	0.072266	0.587846

MOTIF	Heart_E11.5_H3K9ac_23_42_0.580_5.131311e-286
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.312542	0.469568	0.179311	0.038579
0.019708	0.975631	0.0	0.004661
0.265487	0.013846	0.720667	0.0
0.240094	0.012663	0.736417	0.010826
0.0	0.975895	0.011235	0.012871
0.086563	0.800038	0.07795	0.035449
0.032308	0.0	0.967692	0.0
0.05216	0.021719	0.635015	0.291107
0.022405	0.126187	0.851408	0.0

MOTIF	Forebrain_E12.5_H3K9ac_30_39_0.603_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.266898	0.437716	0.0	0.295386
0.055719	0.812124	0.050204	0.081953
0.143015	0.032435	0.776853	0.047697
0.164155	0.057709	0.685308	0.092828
0.030611	0.901034	0.025923	0.042432
0.066607	0.752986	0.068354	0.112053
0.006728	0.014536	0.957948	0.020788
0.146946	0.02663	0.709514	0.11691
0.069294	0.013184	0.899071	0.018451

MOTIF	Hindbrain_E16.5_H3K9ac_14_19_0.624_1.216982e-315
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.021155	0.929928	0.018176	0.03074
0.058049	0.074772	0.822698	0.044481
0.024248	0.011127	0.93485	0.029775
0.065855	0.834213	0.042383	0.05755
0.034983	0.865614	0.032148	0.067255
0.015198	0.016569	0.961013	0.007219
0.145296	0.091117	0.545589	0.217998
0.10028	0.036785	0.779187	0.083748
0.287104	0.60212	0.049144	0.061632

MOTIF	Heart_E14.5_H3K9ac_18_29_0.590_1.103773e-316
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.0	0.924264	0.047445	0.028291
0.079404	0.042978	0.872741	0.004877
0.023045	0.04387	0.895174	0.037912
0.022627	0.840365	0.038098	0.098909
0.028815	0.846332	0.063844	0.061009
0.029701	0.023351	0.946948	0.0
0.272885	0.058575	0.439998	0.228543
0.08885	0.0	0.896404	0.014745
0.858526	0.016705	0.0	0.124769
0.143443	0.531063	0.182401	0.143093

MOTIF	Heart_E12.5_H3K9ac_26_33_0.573_6.610033e-289
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.017449	0.847068	0.067121	0.068362
0.142013	0.056837	0.619921	0.181229
0.065733	0.0769	0.830018	0.027349
0.088233	0.752706	0.061403	0.097659
0.010113	0.769176	0.116082	0.104629
0.029112	0.032842	0.938047	0.0
0.020368	0.016144	0.882758	0.080731
0.141943	0.077798	0.779269	0.00099
0.918932	0.0	0.015878	0.06519

MOTIF	Hindbrain_E11.5_H3K9ac_35_31_0.595_1.334595e-229
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.049311	0.818878	0.055218	0.076593
0.034038	0.116893	0.573835	0.275234
0.018409	0.111654	0.760702	0.109236
0.077296	0.847829	0.062478	0.012398
0.082372	0.706636	0.093438	0.117554
0.178997	0.039653	0.765805	0.015545
0.030769	0.007631	0.898314	0.063286
0.018989	0.011433	0.967483	0.002095
0.882524	0.042297	0.019396	0.055783

MOTIF	Limb_E11.5_H3K9ac_31_47_0.583_1.62907e-170
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.069064	0.780193	0.136762	0.01398
0.067379	0.096005	0.751321	0.085295
0.203798	0.044772	0.576143	0.175288
0.026404	0.892194	0.034501	0.046901
0.047135	0.713765	0.013827	0.225274
0.071737	0.096482	0.82609	0.00569
0.018488	0.028599	0.940222	0.012691
0.229124	0.0	0.767017	0.003859
0.943122	0.0	0.010008	0.046871

MOTIF	Limb_E13.5_H3K9ac_28_27_0.587_1.653201e-280
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.360911	0.102363	0.0	0.536726
0.0	0.889733	0.027622	0.082645
0.10863	0.047108	0.835562	0.0087
0.019389	0.0	0.956436	0.024176
0.133796	0.786681	0.034605	0.044917
0.051318	0.809244	0.094082	0.045356
0.044869	0.021261	0.905049	0.028821
0.056303	0.073819	0.737032	0.132845
0.227332	0.125482	0.647186	0.0
0.832581	0.024493	0.062686	0.08024

MOTIF	Hindbrain_E13.5_H3K9ac_29_31_0.585_1.086944e-321
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.014934	0.778399	0.103851	0.102816
0.031646	0.254189	0.703369	0.010797
0.220714	0.020548	0.744893	0.013846
0.118533	0.760579	0.083061	0.037828
0.056528	0.847443	0.046557	0.049472
0.018199	0.130396	0.819029	0.032375
0.022377	0.013567	0.850992	0.113065
0.026523	0.06454	0.907306	0.001631
0.901702	0.014446	0.013386	0.070466

MOTIF	Liver_E16.5_H3K9ac_22_35_0.608_3.011499e-293
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.007786	0.864147	0.042085	0.085982
0.024926	0.036983	0.929694	0.008397
0.139625	0.039629	0.810938	0.009809
0.179898	0.732229	0.054344	0.033529
0.128899	0.717363	0.076649	0.077089
0.030589	0.052025	0.866351	0.051035
0.127587	0.005586	0.78209	0.084737
0.16452	0.079447	0.741106	0.014926
0.893492	0.046081	0.0	0.060428

MOTIF	Lung_P0_H3K9ac_42_55_0.602_3.791052e-178
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.046335	0.879568	0.064793	0.009303
0.019448	0.060108	0.897781	0.022663
0.028065	0.016665	0.954269	0.001001
0.153463	0.735321	0.108715	0.002501
0.447659	0.365179	0.114529	0.072633
0.033984	0.010622	0.955393	0.0
0.246099	0.02664	0.643372	0.083889
0.0163	0.015655	0.963859	0.004186
0.941703	0.0	0.03809	0.020208

MOTIF	Midbrain_E13.5_H3K9ac_29_21_0.589_7.853487e-310
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.018656	0.21563	0.190559	0.575155
0.060004	0.44848	0.10058	0.390936
0.170262	0.740787	0.0653	0.023651
0.016674	0.838143	0.108269	0.036914
0.026831	0.648771	0.171047	0.15335
0.079011	0.071664	0.646838	0.202488
0.002918	0.091267	0.883303	0.022512
0.143919	0.617355	0.053771	0.184955
0.072059	0.751259	0.075926	0.100755
0.065902	0.007113	0.84682	0.080164
0.007132	0.051761	0.818388	0.122719

MOTIF	Hindbrain_E16.5_H3K9ac_58_45_0.558_1.73811e-123
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.049722	0.79402	0.015764	0.140493
0.005038	0.963721	0.0	0.031241
0.035548	0.899372	0.039119	0.025962
0.379893	0.020935	0.452293	0.14688
0.024669	0.027649	0.940239	0.007443
0.0	0.921347	0.019074	0.059578
0.178093	0.64866	0.113357	0.05989
0.024778	0.04428	0.820968	0.109975
0.024168	0.0	0.850413	0.125418

MOTIF	Forebrain_E16.5_H3K9ac_69_57_0.544_4.979012e-76
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.016265	0.935769	0.031475	0.016491
0.00695	0.99305	0.0	0.0
0.048022	0.841451	0.042034	0.068493
0.465098	0.056535	0.337788	0.140578
0.116111	0.056642	0.827247	0.0
0.02731	0.909062	0.050103	0.013525
0.278595	0.665884	0.01466	0.040862
0.069123	0.007731	0.787994	0.135153
0.0	0.057077	0.942923	0.0

MOTIF	Hindbrain_E14.5_H3K9ac_54_57_0.564_6.894411e-311
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.013031	0.916373	0.035457	0.035139
0.030395	0.855176	0.0	0.114429
0.040454	0.824479	0.056737	0.07833
0.390156	0.049058	0.408721	0.152065
0.060404	0.076214	0.863382	0.0
0.087892	0.823503	0.016583	0.072022
0.127437	0.765044	0.054753	0.052767
0.058884	0.0	0.839216	0.1019
0.00276	0.0	0.984449	0.012791

MOTIF	Midbrain_E15.5_H3K9ac_67_57_0.543_1.860433e-53
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.0	0.977594	0.022406	0.0
0.011986	0.918277	0.0	0.069737
0.045768	0.784923	0.099317	0.069992
0.487671	0.032864	0.395149	0.084316
0.0	0.055763	0.941416	0.002821
0.043331	0.928423	0.028245	0.0
0.242742	0.714976	0.032528	0.009754
0.035625	0.0	0.761748	0.202627
0.0	0.0	0.99088	0.00912
0.869091	0.0	0.094711	0.036198

MOTIF	Stomach_E14.5_H3K9ac_55_25_0.608_3.111489e-187
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.107884	0.410178	0.074298	0.40764
0.057874	0.704403	0.045555	0.192167
0.012038	0.924007	0.03001	0.033945
0.064228	0.886076	0.02082	0.028876
0.192169	0.010097	0.757116	0.040618
0.010172	0.051891	0.937937	0.0
0.016303	0.875066	0.049827	0.058805
0.047212	0.622417	0.106683	0.223688
0.023709	0.025215	0.682444	0.268632
0.0	0.099024	0.886479	0.014497

MOTIF	Forebrain_P0_H3K9ac_46_18_0.585_2.513233e-270
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.24281	0.38493	0.21634	0.15592
0.063099	0.73018	0.061868	0.144853
0.026175	0.912371	0.043538	0.017915
0.060647	0.889586	0.0264	0.023366
0.141655	0.029448	0.775446	0.053451
0.006621	0.042328	0.94832	0.002731
0.074697	0.772385	0.125848	0.02707
0.154631	0.507407	0.158852	0.17911
0.097089	0.015676	0.821962	0.065273
0.012884	0.0	0.968747	0.018369

MOTIF	Hindbrain_E12.5_H3K9ac_49_41_0.568_1.361609e-185
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.0518	0.761346	0.108705	0.078149
0.006147	0.944802	0.043508	0.005542
0.040804	0.945429	0.0	0.013767
0.265339	0.075894	0.539412	0.119354
0.073718	0.042056	0.884226	0.0
0.159019	0.738122	0.048326	0.054533
0.241446	0.611018	0.077702	0.069834
0.057632	0.027207	0.859859	0.055302
0.02583	0.0	0.97417	0.0

MOTIF	Limb_E14.5_H3K9ac_64_45_0.560_3.748621e-129
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.042944	0.774904	0.061861	0.120292
0.025767	0.90801	0.052434	0.013788
0.08575	0.839438	0.020003	0.054809
0.282729	0.09869	0.569323	0.049257
0.107625	0.057355	0.835019	0.0
0.067586	0.894645	0.032601	0.005168
0.227665	0.48252	0.050846	0.238969
0.025005	0.0	0.921248	0.053746
0.0	0.0	0.992173	0.007827

MOTIF	Neural-Tube_E15.5_H3K9ac_55_27_0.583_1.490706e-235
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.094016	0.232381	0.291429	0.382174
0.05866	0.735969	0.036115	0.169256
0.022925	0.935888	0.0	0.041187
0.056968	0.854877	0.040589	0.047566
0.185496	0.070212	0.668775	0.075516
0.014445	0.033695	0.858329	0.09353
0.0205	0.899508	0.064113	0.01588
0.229563	0.526668	0.095649	0.148119
0.019488	0.006783	0.888984	0.084745
0.0	0.0	0.982992	0.017008

MOTIF	Forebrain_E11.5_H3K9ac_66_50_0.553_1.796384e-211
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.013463	0.794014	0.05605	0.136473
0.013773	0.929867	0.022886	0.033474
0.077468	0.732403	0.004862	0.185267
0.096104	0.050964	0.745936	0.106996
0.0	0.025494	0.967387	0.007119
0.023488	0.944467	0.027291	0.004754
0.220369	0.489642	0.046079	0.24391
0.110453	0.05418	0.784571	0.050796
0.021911	0.0	0.881667	0.096422

MOTIF	Cranio-Facial_E12.5_H3K9ac_46_35_0.567_3.029306e-315
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.040582	0.841416	0.017624	0.100378
0.019881	0.926176	0.008666	0.045277
0.116435	0.748562	0.052976	0.082028
0.162776	0.050854	0.74397	0.0424
0.008309	0.059773	0.921564	0.010353
0.039294	0.835742	0.02056	0.104404
0.186124	0.58208	0.083706	0.148089
0.027125	0.007106	0.80259	0.163178
0.056473	0.095662	0.797814	0.050051

MOTIF	Intestine_P0_H3K9ac_53_23_0.576_1.400905e-228
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.08636	0.065601	0.332311	0.515728
0.05956	0.800625	0.053798	0.086017
0.006361	0.977176	0.008311	0.008153
0.151329	0.63314	0.06673	0.1488
0.155431	0.03774	0.757906	0.048923
0.031322	0.045242	0.911337	0.012099
0.061205	0.880384	0.040792	0.01762
0.15468	0.619296	0.065881	0.160144
0.043518	0.022182	0.869516	0.064784
0.014065	0.101978	0.82275	0.061207

MOTIF	Stomach_E15.5_H3K9ac_48_41_0.596_9.570062e-200
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.101289	0.696224	0.044059	0.158427
0.011137	0.911561	0.053945	0.023357
0.221647	0.626767	0.047094	0.104492
0.135088	0.060248	0.795032	0.009632
0.005709	0.100077	0.885315	0.008899
0.009112	0.953872	0.027355	0.009661
0.060212	0.693607	0.048583	0.197599
0.108921	0.077554	0.762477	0.051048
0.007856	0.027684	0.89982	0.06464