MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Hindbrain_E13.5_H3K27me3_27_47_0.515_1.372323e-11
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.041053	0.01351	0.919781	0.025656
0.043363	0.927729	0.0	0.028908
0.834922	0.057298	0.063815	0.043965
0.003702	0.04961	0.941188	0.005501
0.581578	0.267042	0.020861	0.130519
0.02304	0.047939	0.849687	0.079333
0.046026	0.036075	0.841921	0.075978
0.0	0.017578	0.901066	0.081356
0.52352	0.384684	0.042862	0.048934
0.755548	0.112253	0.076746	0.055454

MOTIF	Heart_E16.5_H3K27ac_86_62_0.505_5.088777e-06
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.002628	0.755564	0.03744	0.204368
0.04058	0.029091	0.382478	0.547851
0.070353	0.269783	0.37865	0.281214
0.148429	0.730382	0.105935	0.015255
0.095145	0.820601	0.030572	0.053681
0.152764	0.748812	0.024371	0.074053
0.174504	0.019688	0.021745	0.784063
0.000454	0.933608	0.059792	0.006146
0.076337	0.024811	0.203526	0.695326
0.002605	0.034369	0.863966	0.09906
0.015544	0.899127	0.023025	0.062304
0.023584	0.814273	0.019942	0.142201

MOTIF	Cranio-Facial_E12.5_H3K27ac_87_97_0.508_2.567434e-08
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.044338	0.09079	0.835764	0.029109
0.012027	0.946021	0.040071	0.001881
0.686802	0.180988	0.031152	0.101058
0.061174	0.217413	0.720288	0.001126
0.876604	0.057071	0.026301	0.040024
0.005911	0.008648	0.908304	0.077137
0.092559	0.038059	0.776467	0.092915
0.103771	0.07484	0.736529	0.08486
0.755087	0.083764	0.064843	0.096306

MOTIF	Midbrain_P0_H3K27ac_91_108_0.510_1.455955e-11
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.0	0.275289	0.299546	0.425165
0.047903	0.09678	0.848403	0.006913
0.043877	0.854765	0.011412	0.089945
0.788203	0.025411	0.077602	0.108784
0.023195	0.286543	0.685985	0.004277
0.810498	0.068058	0.056754	0.064691
0.005536	0.067665	0.817754	0.109044
0.056084	0.01139	0.912974	0.019552
0.13749	0.058981	0.768653	0.034876
0.833294	0.067447	0.033295	0.065964
0.504312	0.32664	0.070031	0.099018
0.145192	0.320845	0.52921	0.004753

MOTIF	Kidney_E16.5_H3K27me3_38_101_0.511_7.251523e-06
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.028132	0.029999	0.941869	0.0
0.120125	0.813716	0.0	0.066159
0.91204	0.013551	0.042629	0.03178
0.012445	0.061376	0.926179	0.0
0.705661	0.25222	0.017201	0.024917
0.012212	0.152374	0.809861	0.025553
0.027774	0.066737	0.671827	0.233662
0.034228	0.043345	0.757273	0.165154
0.837067	0.027965	0.102679	0.032289

MOTIF	Midbrain_E12.5_H3K4me1_75_53_0.509_5.373798e-11
letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.0	0.317131	0.258347	0.424522
0.330873	0.232257	0.244902	0.191968
0.125043	0.759566	0.08859	0.0268
0.117562	0.812857	0.028353	0.041229
0.136198	0.831277	0.016695	0.01583
0.163595	0.025062	0.048716	0.762626
0.000173	0.949663	0.049585	0.00058
0.038034	0.027313	0.16074	0.773914
0.03561	0.020768	0.914307	0.029315
0.110303	0.775755	0.030391	0.083551
0.099773	0.7858	0.026477	0.08795
0.174562	0.259582	0.137252	0.428603
0.114958	0.032777	0.457093	0.395172

MOTIF	Cranio-Facial_E14.5_H3K4me1_100_44_0.504_0.0003147123
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.243747	0.154934	0.292323	0.308997
0.124489	0.694264	0.03944	0.141806
0.136347	0.80971	0.035018	0.018924
0.1589	0.763178	0.054123	0.023799
0.137148	0.036397	0.113894	0.712562
0.002858	0.93513	0.05717	0.004842
0.007128	0.053287	0.065311	0.874274
0.040387	0.028973	0.876813	0.053828
0.014845	0.895091	0.026254	0.06381
0.088746	0.836916	0.020483	0.053854

MOTIF	Limb_E15.5_H3K4me1_81_53_0.507_8.81677e-18
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.0	0.314436	0.037067	0.648496
0.0	0.247955	0.15473	0.597315
0.0776	0.275214	0.423285	0.223901
0.117416	0.789052	0.077883	0.015649
0.111726	0.816847	0.012659	0.058768
0.142101	0.731776	0.018748	0.107376
0.179769	0.038491	0.042615	0.739125
0.002136	0.92939	0.060162	0.008312
0.055791	0.012941	0.101585	0.829683
0.033851	0.015386	0.825636	0.125127
0.02185	0.821482	0.107608	0.04906
0.012129	0.910823	0.043961	0.033088

MOTIF	Midbrain_E16.5_H3K4me1_90_44_0.504_3.899058e-13
letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.022266	0.154222	0.139198	0.684315
0.161141	0.133925	0.548291	0.156644
0.152091	0.648106	0.131074	0.068728
0.097826	0.835309	0.027387	0.039478
0.163595	0.792766	0.018347	0.025292
0.202391	0.023955	0.048452	0.725202
0.001451	0.926232	0.065087	0.00723
0.039635	0.017985	0.096543	0.845837
0.026734	0.013709	0.821594	0.137964
0.00949	0.919502	0.023397	0.04761
0.105631	0.733783	0.048257	0.11233
0.234736	0.750297	0.014967	0.0
0.413031	0.269297	0.272361	0.045312

MOTIF	Kidney_E16.5_H3K4me1_82_32_0.507_1.469446e-10
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.095657	0.125782	0.147015	0.631546
0.19289	0.140059	0.449165	0.217886
0.198606	0.310387	0.386499	0.104507
0.082498	0.785438	0.070003	0.062061
0.0606	0.881552	0.015179	0.042669
0.079374	0.018077	0.037567	0.864982
0.000325	0.880247	0.057632	0.061796
0.06579	0.014571	0.048876	0.870763
0.024799	0.049403	0.862023	0.063774
0.07895	0.737074	0.116943	0.067033
0.099416	0.713335	0.066803	0.120446
0.073651	0.777947	0.060288	0.088114

MOTIF	Lung_P0_H3K4me1_103_38_0.500_0.001281058
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.204527	0.078892	0.352019	0.364562
0.221335	0.09002	0.399898	0.288747
0.016392	0.739031	0.076521	0.168055
0.0622	0.904021	0.011092	0.022687
0.118988	0.017323	0.032561	0.831128
0.000901	0.900058	0.041351	0.05769
0.049958	0.01545	0.025486	0.909106
0.02079	0.040488	0.915478	0.023245
0.111946	0.646179	0.163947	0.077928
0.110775	0.71421	0.11294	0.062074
0.028084	0.814759	0.067784	0.089373

MOTIF	Liver_E11.5_H3K4me1_33_40_0.523_8.966423e-172
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.087225	0.068878	0.791129	0.052769
0.054472	0.819659	0.10964	0.016229
0.798122	0.032566	0.063904	0.105408
0.041498	0.068309	0.890193	0.0
0.822358	0.068095	0.072677	0.03687
0.072786	0.01629	0.893461	0.017463
0.062539	0.113485	0.789174	0.034801
0.092778	0.766743	0.110033	0.030446
0.687781	0.132104	0.075421	0.104694

MOTIF	Liver_E12.5_H3K4me1_18_38_0.541_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.08211	0.074278	0.789783	0.05383
0.070446	0.823821	0.090105	0.015628
0.775278	0.049222	0.075747	0.099753
0.026904	0.063487	0.908815	0.000794
0.817092	0.062767	0.059521	0.06062
0.056266	0.026173	0.884622	0.032939
0.068841	0.109631	0.783046	0.038482
0.082558	0.756729	0.114259	0.046454
0.714025	0.118695	0.080789	0.086492

MOTIF	Liver_E14.5_H3K4me1_34_37_0.528_5.043682e-182
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.099288	0.089802	0.761061	0.049849
0.045959	0.842938	0.078124	0.032979
0.791854	0.035298	0.054542	0.118306
0.038412	0.08505	0.873656	0.002882
0.840177	0.039546	0.086362	0.033915
0.059113	0.026225	0.878649	0.036013
0.078389	0.103213	0.773989	0.044409
0.077985	0.792942	0.093211	0.035862
0.763003	0.112465	0.049698	0.074833

MOTIF	Liver_E11.5_H3K4me1_38_19_0.522_1.100333e-179
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.067357	0.111262	0.732855	0.088525
0.035532	0.788764	0.103728	0.071976
0.029635	0.86561	0.026737	0.078018
0.061546	0.099927	0.075255	0.763272
0.001381	0.894894	0.074469	0.029255
0.102964	0.073532	0.039196	0.784308
0.016915	0.098811	0.816944	0.06733
0.048678	0.788967	0.077668	0.084687
0.05202	0.810051	0.046575	0.091355

MOTIF	Liver_E12.5_H3K4me1_12_23_0.544_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.06355	0.107171	0.737182	0.092097
0.033194	0.812918	0.083334	0.070554
0.032032	0.879264	0.031132	0.057573
0.061689	0.115995	0.080168	0.742148
0.001546	0.906721	0.06904	0.022692
0.09638	0.09545	0.045914	0.762256
0.023189	0.110845	0.789161	0.076805
0.039718	0.834163	0.059765	0.066354
0.050117	0.816823	0.044426	0.088634

MOTIF	Stomach_E15.5_H3K4me1_60_37_0.514_2.30782e-22
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.07231	0.112393	0.710002	0.105295
0.048766	0.728153	0.136618	0.086463
0.039526	0.907936	0.027098	0.02544
0.072239	0.036027	0.037448	0.854286
0.000262	0.846344	0.11483	0.038563
0.119995	0.080531	0.034002	0.765473
0.022452	0.047579	0.841047	0.088921
0.054618	0.739372	0.122275	0.083734
0.059989	0.809906	0.063664	0.066441

MOTIF	Forebrain_E13.5_H3K4me1_51_105_0.516_7.883218e-44
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.14623	0.711842	0.111608	0.030319
0.036455	0.895029	0.010619	0.057898
0.264063	0.692213	0.008915	0.034809
0.0293	0.0	0.106696	0.864005
0.004326	0.940218	0.047767	0.00769
0.04733	0.036697	0.021195	0.894778
0.053536	0.029513	0.897149	0.019802
0.023586	0.60473	0.3039	0.067785
0.14642	0.736255	0.0	0.117326

MOTIF	Heart_E12.5_H3K4me1_81_27_0.506_7.094229e-95
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.758563	0.042767	0.116575	0.082095
0.097595	0.033833	0.810089	0.058483
0.107181	0.077053	0.780572	0.035194
0.104825	0.808542	0.073684	0.012949
0.812604	0.0327	0.054799	0.099898
0.032523	0.094571	0.871598	0.001309
0.775497	0.096602	0.060436	0.067466
0.119385	0.032976	0.779643	0.067995
0.078545	0.099566	0.771776	0.050113

MOTIF	Intestine_E16.5_H3K4me1_94_43_0.502_8.848822e-49
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.777963	0.047192	0.133291	0.041554
0.0882	0.035983	0.825098	0.050719
0.079519	0.07814	0.812503	0.029838
0.089501	0.794932	0.102039	0.013528
0.810187	0.035776	0.050915	0.103121
0.040973	0.105164	0.851879	0.001983
0.778159	0.085172	0.069471	0.067198
0.088097	0.031116	0.814073	0.066713
0.105684	0.100604	0.749987	0.043725

MOTIF	Kidney_E15.5_H3K4me1_79_41_0.509_6.696098e-71
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.748214	0.059932	0.138917	0.052938
0.124437	0.041531	0.784158	0.049874
0.061737	0.099895	0.793009	0.04536
0.099402	0.849036	0.038001	0.013561
0.801384	0.046853	0.041982	0.109781
0.034517	0.102178	0.862694	0.000611
0.779979	0.102225	0.031987	0.08581
0.09395	0.034624	0.807252	0.064174
0.081233	0.10665	0.784894	0.027224

MOTIF	Liver_E13.5_H3K4me1_29_33_0.534_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.80014	0.041983	0.121168	0.036709
0.080974	0.031063	0.845738	0.042225
0.060884	0.055858	0.843273	0.039986
0.095493	0.802672	0.078241	0.023594
0.786582	0.043946	0.084624	0.084848
0.025739	0.069392	0.903057	0.001811
0.709888	0.096622	0.117856	0.075634
0.090527	0.047335	0.80149	0.060648
0.096538	0.090832	0.77217	0.040461
0.077759	0.342473	0.32442	0.255348

MOTIF	Liver_E14.5_H3K4me1_39_17_0.527_5.919515e-266
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.825917	0.026968	0.111754	0.035361
0.067665	0.024804	0.869805	0.037726
0.082445	0.059371	0.810113	0.048071
0.09202	0.796652	0.080361	0.030968
0.820912	0.026676	0.061805	0.090607
0.026849	0.063679	0.905839	0.003633
0.738015	0.04931	0.128498	0.084176
0.108731	0.04116	0.782906	0.067203
0.113192	0.094089	0.750389	0.042331
0.087138	0.312079	0.298252	0.302532

MOTIF	Liver_E15.5_H3K4me1_30_21_0.536_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.794998	0.045675	0.121646	0.037682
0.070062	0.040709	0.853122	0.036107
0.070938	0.065259	0.828586	0.035217
0.073675	0.799936	0.088996	0.037393
0.753823	0.047506	0.091408	0.107264
0.028661	0.058295	0.911341	0.001704
0.705616	0.098066	0.116909	0.079409
0.082935	0.043904	0.823691	0.049471
0.069903	0.104715	0.778757	0.046626
0.063181	0.456046	0.273653	0.20712
0.197216	0.195128	0.366182	0.241473

MOTIF	Liver_E16.5_H3K4me1_82_30_0.512_9.3341e-126
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.7832	0.043838	0.130658	0.042304
0.047492	0.037744	0.896172	0.018592
0.040603	0.03577	0.88058	0.043047
0.12763	0.776008	0.07337	0.022993
0.777052	0.065756	0.093686	0.063506
0.028309	0.077193	0.890957	0.003541
0.679756	0.082855	0.144608	0.09278
0.110785	0.031643	0.815098	0.042474
0.112703	0.121527	0.720162	0.045608
0.306867	0.059667	0.318731	0.314736

MOTIF	Stomach_E16.5_H3K4me1_62_16_0.513_1.344678e-40
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.724233	0.055254	0.155137	0.065375
0.097665	0.04645	0.823002	0.032883
0.049964	0.109604	0.79595	0.044481
0.060223	0.873068	0.049622	0.017087
0.760091	0.051424	0.033597	0.154888
0.044618	0.077934	0.876052	0.001395
0.774444	0.094703	0.067994	0.062859
0.082047	0.03699	0.820836	0.060128
0.072097	0.156079	0.723965	0.047858
0.074625	0.596161	0.137271	0.191943
0.051831	0.38643	0.259237	0.302502
0.386419	0.205497	0.261632	0.146452