MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Limb_E14.5_H3K27me3_40_75_0.513_0.0008526816
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.060727	0.121725	0.45599	0.361558
0.230488	0.12654	0.561827	0.081144
0.261495	0.474051	0.240605	0.023849
0.00881	0.933105	0.034243	0.023841
0.909845	0.027257	0.028498	0.0344
0.001145	0.888941	0.023492	0.086422
0.003608	0.864389	0.124074	0.007929
0.012657	0.030961	0.047695	0.908687
0.066865	0.035188	0.865192	0.032755
0.017757	0.704385	0.053301	0.224557
0.097607	0.717677	0.091984	0.092732

MOTIF	Hindbrain_E11.5_H3K27me3_36_66_0.521_4.823183e-14
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.135068	0.128476	0.72303	0.013425
0.064901	0.858448	0.038953	0.037699
0.86285	0.055145	0.053436	0.028569
0.004944	0.1629	0.790611	0.041545
0.033327	0.06292	0.903074	0.000679
0.048311	0.044253	0.030757	0.876679
0.080454	0.071583	0.84257	0.005393
0.18523	0.044374	0.578794	0.191602
0.047338	0.793651	0.079668	0.079342
0.282515	0.538928	0.165415	0.013142

MOTIF	Midbrain_P0_H3K27me3_37_58_0.515_6.343546e-05
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.222859	0.016154	0.741274	0.019713
0.055532	0.863829	0.047189	0.033449
0.865578	0.066723	0.045943	0.021756
0.014619	0.263097	0.668046	0.054238
0.011978	0.037761	0.947973	0.002289
0.044242	0.055025	0.026048	0.874685
0.072427	0.004784	0.922789	0.0
0.06484	0.024014	0.638097	0.273048
0.058502	0.805197	0.078275	0.058026
0.131602	0.623449	0.171146	0.073803
0.59735	0.364446	0.024721	0.013483
0.098554	0.485496	0.372751	0.043199

MOTIF	Midbrain_E14.5_H3K27me3_45_88_0.508_0.001095805
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.669906	0.137039	0.023263	0.169792
0.044561	0.02884	0.886805	0.039794
0.212822	0.723705	0.013181	0.050292
0.006238	0.874638	0.115205	0.003919
0.847539	0.023117	0.085947	0.043397
0.002348	0.834485	0.135066	0.028101
0.001201	0.715861	0.257505	0.025433
0.044167	0.058293	0.054655	0.842885
0.011302	0.021042	0.952574	0.015082

MOTIF	Lung_E15.5_H3K27me3_37_53_0.520_4.43079e-11
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.0	0.178553	0.050356	0.77109
0.01995	0.073171	0.88664	0.02024
0.023618	0.916952	0.02194	0.03749
0.910706	0.024546	0.025494	0.039254
0.005034	0.125175	0.866158	0.003633
0.035239	0.051	0.911508	0.002253
0.249293	0.045058	0.042071	0.663578
0.073247	0.048974	0.856826	0.020953
0.044315	0.088847	0.686677	0.180161
0.138771	0.766454	0.029141	0.065634
0.177904	0.09172	0.375969	0.354407
0.0	0.5607	0.335346	0.103954

MOTIF	Kidney_E14.5_H3K27me3_35_57_0.516_2.025353e-05
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.146986	0.11808	0.727021	0.007912
0.083748	0.834273	0.045022	0.036957
0.874072	0.030577	0.041636	0.053715
0.003265	0.10307	0.869774	0.023891
0.059767	0.056612	0.883443	0.000179
0.032361	0.031933	0.038655	0.897051
0.021518	0.034841	0.942238	0.001404
0.054871	0.215065	0.694222	0.035842
0.098811	0.684193	0.086793	0.130203
0.368103	0.205197	0.326617	0.100082
0.330004	0.270075	0.173449	0.226471

MOTIF	Hindbrain_E14.5_H3K27me3_40_45_0.516_3.005944e-05
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.271886	0.050991	0.661518	0.015605
0.008844	0.870657	0.056674	0.063825
0.767263	0.04811	0.176537	0.00809
0.016486	0.130083	0.813714	0.039718
0.018697	0.03837	0.940763	0.00217
0.068475	0.022513	0.0	0.909012
0.022743	0.131167	0.830478	0.015613
0.043927	0.074078	0.6427	0.239295
0.014325	0.935527	0.021373	0.028774
0.190032	0.236934	0.157056	0.415978

MOTIF	Heart_E13.5_H3K27me3_13_23_0.514_2.298117e-07
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.041928	0.114887	0.818769	0.024416
0.022387	0.862528	0.057975	0.05711
0.651329	0.118603	0.109896	0.120172
0.001947	0.179739	0.779725	0.038588
0.021288	0.098898	0.873577	0.006237
0.024502	0.057301	0.034885	0.883312
0.025729	0.019797	0.953691	0.000783
0.16832	0.095418	0.693154	0.043107
0.04094	0.840582	0.048516	0.069962
0.265608	0.219442	0.165532	0.349418

MOTIF	Heart_P0_H3K27me3_40_55_0.507_0.001299553
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.122047	0.089569	0.774354	0.01403
0.090746	0.856069	0.03962	0.013565
0.787412	0.068221	0.015702	0.128666
0.008443	0.16729	0.73586	0.088408
0.099447	0.042134	0.855704	0.002715
0.045619	0.039586	0.035321	0.879474
0.070124	0.007748	0.922128	0.0
0.148912	0.032111	0.696921	0.122055
0.036727	0.854059	0.058169	0.051044
0.233506	0.168578	0.106623	0.491293

MOTIF	Cranio-Facial_E14.5_H3K27me3_30_58_0.525_1.335007e-12
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.126509	0.141561	0.71886	0.01307
0.044144	0.895997	0.035703	0.024156
0.815616	0.034454	0.046666	0.103264
0.004166	0.100406	0.894139	0.001288
0.07438	0.049148	0.874416	0.002056
0.052535	0.038239	0.019682	0.889544
0.048706	0.036553	0.913901	0.000839
0.122962	0.147623	0.605926	0.123489
0.082442	0.753077	0.100413	0.064068
0.141439	0.124819	0.375086	0.358656

MOTIF	Kidney_E16.5_H3K27me3_37_74_0.513_0.0003439256
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.122535	0.170801	0.698078	0.008586
0.050853	0.902749	0.038908	0.00749
0.879075	0.031434	0.046773	0.042718
0.004259	0.162828	0.789769	0.043144
0.103106	0.041996	0.849231	0.005667
0.082797	0.029723	0.013006	0.874475
0.055345	0.015564	0.923724	0.005366
0.052425	0.166674	0.621253	0.159648
0.070201	0.768188	0.09345	0.06816

MOTIF	Cranio-Facial_E12.5_H3K27me3_17_50_0.520_5.781643e-08
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.148365	0.097625	0.743798	0.010212
0.039211	0.897521	0.040813	0.022455
0.851909	0.051421	0.04894	0.04773
0.004663	0.111156	0.874171	0.010011
0.072364	0.02874	0.893634	0.005262
0.104796	0.066068	0.020362	0.808774
0.159286	0.022467	0.815131	0.003116
0.059382	0.179587	0.583689	0.177342
0.041947	0.834409	0.072662	0.050982
0.337977	0.154846	0.116133	0.391043

MOTIF	Neural-Tube_E12.5_H3K27me3_22_59_0.514_0.0001392073
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.166887	0.062109	0.761417	0.009587
0.043145	0.868225	0.04951	0.039121
0.785492	0.036335	0.046523	0.13165
0.0	0.11239	0.831626	0.055984
0.073381	0.019476	0.907144	0.0
0.066852	0.044161	0.009546	0.879442
0.135917	0.01807	0.838027	0.007986
0.053758	0.14796	0.662024	0.136258
0.029673	0.869539	0.087124	0.013664
0.251326	0.209214	0.197546	0.341914

MOTIF	Stomach_E16.5_H3K27me3_36_63_0.518_2.878087e-05
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.147098	0.062624	0.779209	0.011069
0.085823	0.831103	0.040777	0.042297
0.847657	0.025463	0.038581	0.088299
0.012461	0.103893	0.860545	0.023101
0.07027	0.032001	0.897729	0.0
0.055484	0.022386	0.026355	0.895776
0.062431	0.017598	0.911346	0.008625
0.175881	0.083725	0.565717	0.174677
0.036603	0.786234	0.112789	0.064373
0.113927	0.247796	0.253744	0.384532
0.191976	0.347822	0.277914	0.182289

MOTIF	Limb_E11.5_H3K27me3_31_113_0.516_0.0004621254
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.129957	0.768599	0.0	0.101444
0.0	0.92756	0.016426	0.056014
0.9584	0.0	0.0416	0.0
0.0	1.0	0.0	0.0
0.0	0.696218	0.303782	0.0
0.0	0.022565	0.025934	0.951501
0.080835	0.032652	0.869852	0.016661
0.0	0.715954	0.029026	0.25502
0.691703	0.041702	0.22526	0.041335

MOTIF	Cranio-Facial_E11.5_H3K4me1_72_39_0.523_1.864093e-33
letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.0	0.602821	0.014906	0.382273
0.393075	0.125848	0.440623	0.040454
0.143985	0.293951	0.071561	0.490502
0.050384	0.042071	0.878929	0.028616
0.065626	0.825991	0.06665	0.041733
0.914804	0.045193	0.029149	0.010854
0.008758	0.416427	0.552742	0.022072
0.022881	0.0	0.966447	0.010672
0.041461	0.038865	0.046057	0.873617
0.013155	0.052733	0.914612	0.0195
0.140824	0.040242	0.55473	0.264203
0.033221	0.886187	0.037043	0.043549
0.154006	0.01396	0.463786	0.368248

MOTIF	Neural-Tube_E11.5_H3K4me1_83_25_0.507_6.949672e-13
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.466103	0.263432	0.256573	0.013892
0.059542	0.106569	0.111304	0.722585
0.036605	0.042101	0.901437	0.019857
0.050015	0.864416	0.029726	0.055843
0.838226	0.017842	0.125319	0.018613
0.002916	0.494131	0.481643	0.021311
0.040911	0.020136	0.936662	0.002291
0.070801	0.029285	0.04611	0.853804
0.010883	0.003488	0.980671	0.004957
0.257055	0.057811	0.550001	0.135133
0.024178	0.942759	0.017285	0.015777
0.451668	0.438027	0.062291	0.048013

MOTIF	Forebrain_E15.5_H3K27me3_43_50_0.508_1.045876e-09
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.550389	0.107416	0.319171	0.023024
0.058919	0.33514	0.258543	0.347398
0.047546	0.636106	0.182957	0.133392
0.004536	0.964265	0.010716	0.020483
0.885985	0.019167	0.035372	0.059477
0.0	0.877652	0.044516	0.077833
0.032467	0.775313	0.190917	0.001303
0.120481	0.032332	0.021813	0.825374
0.048252	0.032364	0.864814	0.05457
0.022159	0.777465	0.0558	0.144576
0.059854	0.650334	0.195745	0.094067

MOTIF	Heart_E12.5_H3K27me3_66_41_0.504_1.698319e-21
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.231852	0.123697	0.305398	0.339053
0.028647	0.872485	0.051821	0.047047
0.001422	0.845829	0.008589	0.144159
0.873373	0.014599	0.048311	0.063717
0.0	0.673251	0.303037	0.023712
0.044377	0.828526	0.124808	0.002289
0.058332	0.02497	0.098313	0.818385
0.058622	0.055948	0.826059	0.059372
0.007647	0.709819	0.116333	0.1662
0.039569	0.902236	0.03825	0.019945

MOTIF	Heart_E14.5_H3K27me3_45_54_0.508_1.858426e-16
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.029418	0.878528	0.026938	0.065116
0.0	0.95201	0.00083	0.04716
0.702318	0.01437	0.236834	0.046478
0.0	0.870348	0.085458	0.044194
0.010636	0.765726	0.223638	0.0
0.029387	0.045464	0.115183	0.809965
0.110141	0.03693	0.834879	0.018051
0.012732	0.687777	0.044127	0.255363
0.088801	0.842166	0.058694	0.010339

MOTIF	Limb_E12.5_H3K27me3_49_41_0.507_1.278559e-24
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.876823	0.0	0.114527	0.00865
0.072479	0.064741	0.509182	0.353599
0.055546	0.840451	0.042635	0.061367
0.00045	0.971061	0.006392	0.022098
0.877023	0.022848	0.051835	0.048294
0.0	0.896751	0.063768	0.039481
0.0246	0.715188	0.249357	0.010855
0.027754	0.029451	0.145435	0.797359
0.065062	0.025542	0.869507	0.039889
0.010232	0.628821	0.167519	0.193428
0.023576	0.797726	0.128195	0.050503

MOTIF	Forebrain_E12.5_H3K27me3_47_77_0.507_4.299498e-11
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.685897	0.101127	0.08433	0.128646
0.053518	0.092832	0.752592	0.101057
0.100633	0.056256	0.834323	0.008788
0.102569	0.840197	0.013186	0.044048
0.865335	0.058237	0.03402	0.042408
0.008182	0.149335	0.720023	0.122461
0.104815	0.204015	0.686523	0.004647
0.085049	0.034216	0.012755	0.86798
0.012723	0.011122	0.969189	0.006967

MOTIF	Cranio-Facial_E12.5_H3K27me3_20_60_0.516_3.298274e-15
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.045612	0.71968	0.19244	0.042268
0.002886	0.964088	0.00805	0.024976
0.897245	0.033848	0.044854	0.024053
0.0	0.731259	0.09426	0.174482
0.022778	0.826225	0.150997	0.0
0.01773	0.020876	0.08335	0.878044
0.034888	0.017382	0.906579	0.041151
0.005595	0.787798	0.052872	0.153735
0.046225	0.671622	0.21929	0.062862

MOTIF	Heart_E16.5_H3K27me3_52_63_0.511_1.763425e-05
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.170598	0.636959	0.139533	0.05291
0.002301	0.905977	0.004381	0.087342
0.837827	0.038485	0.054629	0.069059
0.0	0.760826	0.087531	0.151643
0.059379	0.792714	0.141841	0.006067
0.03277	0.019808	0.075161	0.872261
0.031727	0.031893	0.8828	0.05358
0.005213	0.727207	0.163768	0.103812
0.05711	0.778095	0.113689	0.051106

MOTIF	Liver_E11.5_H3K27me3_52_69_0.509_1.697253e-06
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.162746	0.612035	0.171176	0.054043
0.001003	0.978023	0.01279	0.008185
0.863842	0.023377	0.050393	0.062387
0.001224	0.715793	0.19889	0.084092
0.089839	0.862901	0.046798	0.000462
0.044999	0.020675	0.083669	0.850657
0.034589	0.03331	0.882248	0.049853
0.006261	0.727042	0.157031	0.109665
0.046672	0.816752	0.108445	0.028131
0.440466	0.233191	0.11638	0.209962

MOTIF	Liver_E16.5_H3K4me1_111_62_0.502_0.0003834049
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.119922	0.404113	0.458157	0.017808
0.079676	0.822517	0.061205	0.036602
0.0	0.97435	0.019042	0.006609
0.892614	0.023151	0.04538	0.038856
0.002789	0.623354	0.366573	0.007284
0.171788	0.783973	0.037256	0.006983
0.002487	0.042573	0.189833	0.765107
0.077194	0.049231	0.81216	0.061414
0.015804	0.813113	0.040854	0.13023
0.034425	0.888075	0.03646	0.04104