MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Forebrain_E12.5_H3K27me3_39_156_0.508_0.0004495646 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.771 0.073 0.081 0.075 0.79 0.056 0.085 0.069 0.066 0.081 0.093 0.76 0.158 0.507 0.162 0.173 0.136 0.171 0.478 0.215 0.07 0.812 0.056 0.062 0.049 0.089 0.004 0.858 0.041 0.057 0.042 0.86 0.037 0.076 0.067 0.82 0.052 0.812 0.061 0.075 0.086 0.093 0.001 0.82 0.718 0.111 0.082 0.089 MOTIF Limb_E15.5_H3K27me3_24_164_0.520_3.669083e-09 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.236 0.231 0.316 0.217 0.644 0.131 0.114 0.111 0.635 0.124 0.123 0.118 0.124 0.121 0.128 0.627 0.131 0.58 0.142 0.147 0.138 0.146 0.57 0.146 0.116 0.651 0.118 0.115 0.119 0.128 0.078 0.675 0.102 0.125 0.12 0.653 0.1 0.125 0.12 0.655 0.11 0.65 0.117 0.123 0.239 0.247 0.171 0.343 MOTIF Kidney_E16.5_H3K27me3_32_170_0.519_9.780445e-07 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.163 0.019 0.794 0.024 0.855 0.008 0.136 0.001 0.942 0.001 0.022 0.035 0.875 0.009 0.11 0.006 0.002 0.242 0.034 0.722 0.134 0.517 0.282 0.067 0.115 0.262 0.534 0.089 0.64 0.148 0.138 0.074 0.122 0.001 0.131 0.746 0.017 0.01 0.032 0.941 MOTIF Midbrain_E14.5_H3K27ac_23_160_0.555_6.864129e-96 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.864 0.087 0.034 0.015 0.806 0.057 0.076 0.061 0.101 0.089 0.094 0.716 0.066 0.472 0.212 0.249 0.063 0.065 0.774 0.098 0.677 0.141 0.029 0.153 0.112 0.023 0.001 0.864 0.054 0.073 0.044 0.829 MOTIF Midbrain_E13.5_H3K27ac_19_156_0.554_1.273106e-100 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.916 0.021 0.05 0.013 0.805 0.01 0.004 0.181 0.052 0.064 0.157 0.727 0.035 0.436 0.225 0.303 0.145 0.346 0.476 0.032 0.631 0.269 0.05 0.05 0.032 0.016 0.001 0.951 0.001 0.004 0.001 0.994 0.022 0.118 0.077 0.783 0.027 0.709 0.166 0.098 MOTIF Hindbrain_P0_H3K27ac_13_166_0.561_3.396629e-132 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.65 0.122 0.133 0.095 0.681 0.119 0.13 0.07 0.102 0.117 0.148 0.633 0.082 0.756 0.09 0.072 0.077 0.096 0.732 0.095 0.604 0.145 0.123 0.128 0.124 0.106 0.085 0.685 0.042 0.011 0.001 0.946 0.122 0.096 0.125 0.657 0.12 0.657 0.069 0.154 MOTIF Hindbrain_E15.5_H3K27ac_21_158_0.562_5.134432e-143 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.928 0.006 0.044 0.022 0.722 0.008 0.114 0.156 0.125 0.151 0.118 0.606 0.147 0.537 0.123 0.193 0.151 0.143 0.614 0.092 0.588 0.181 0.134 0.097 0.128 0.061 0.001 0.81 0.002 0.004 0.001 0.993 0.105 0.135 0.152 0.608 0.109 0.609 0.167 0.115 MOTIF Forebrain_E16.5_H3K27ac_20_166_0.549_1.516209e-67 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.871 0.033 0.048 0.048 0.798 0.105 0.038 0.059 0.108 0.084 0.034 0.774 0.115 0.727 0.094 0.064 0.093 0.077 0.745 0.085 0.761 0.069 0.104 0.066 0.047 0.058 0.064 0.831 0.034 0.041 0.031 0.894 0.056 0.079 0.063 0.802 0.061 0.796 0.071 0.072 MOTIF Hindbrain_E13.5_H3K27ac_13_158_0.554_3.138408e-138 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.074 0.09 0.784 0.052 0.799 0.059 0.071 0.071 0.93 0.018 0.029 0.023 0.867 0.033 0.043 0.057 0.084 0.062 0.103 0.751 0.071 0.693 0.11 0.126 0.131 0.109 0.693 0.067 0.767 0.072 0.074 0.087 0.079 0.05 0.039 0.832 0.025 0.042 0.049 0.884 MOTIF Neural-Tube_E11.5_H3K27ac_15_162_0.562_5.703855e-71 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.835 0.051 0.015 0.099 0.749 0.075 0.037 0.139 0.141 0.127 0.121 0.611 0.143 0.514 0.154 0.189 0.158 0.175 0.641 0.026 0.598 0.147 0.12 0.135 0.129 0.043 0.005 0.823 0.037 0.071 0.014 0.878 0.026 0.159 0.14 0.675 0.05 0.679 0.111 0.16 MOTIF Hindbrain_E16.5_H3K27ac_21_162_0.563_6.083655e-115 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.638 0.111 0.136 0.115 0.625 0.109 0.123 0.143 0.151 0.156 0.153 0.54 0.121 0.59 0.138 0.151 0.145 0.137 0.611 0.107 0.533 0.162 0.151 0.154 0.15 0.12 0.116 0.614 0.107 0.128 0.099 0.666 0.127 0.142 0.139 0.592 0.127 0.592 0.132 0.149 MOTIF Neural-Tube_E14.5_H3K27ac_12_159_0.567_8.561046e-105 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.252 0.136 0.517 0.095 0.417 0.238 0.266 0.079 0.797 0.072 0.04 0.091 0.618 0.068 0.059 0.255 0.225 0.254 0.208 0.312 0.036 0.725 0.12 0.119 0.223 0.058 0.652 0.067 0.571 0.128 0.108 0.193 0.199 0.038 0.075 0.688 0.077 0.149 0.07 0.704 MOTIF Kidney_E14.5_H3K27me3_24_173_0.524_3.026302e-08 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.864 0.052 0.042 0.042 0.808 0.087 0.001 0.104 0.051 0.153 0.072 0.724 0.096 0.511 0.147 0.246 0.178 0.152 0.518 0.152 0.619 0.151 0.127 0.103 0.039 0.032 0.001 0.928 0.039 0.016 0.001 0.944 0.004 0.076 0.047 0.873 0.057 0.879 0.061 0.003 MOTIF Lung_P0_H3K27me3_24_164_0.545_6.267132e-17 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.817 0.07 0.046 0.067 0.054 0.083 0.055 0.808 0.052 0.791 0.05 0.107 0.056 0.108 0.764 0.072 0.779 0.108 0.048 0.065 0.039 0.058 0.028 0.875 0.056 0.059 0.037 0.848 0.052 0.075 0.042 0.831 0.053 0.793 0.064 0.09 0.117 0.115 0.7 0.068 MOTIF Cranio-Facial_E13.5_H3K27me3_13_156_0.519_8.468731e-11 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.146 0.121 0.648 0.085 0.72 0.091 0.128 0.061 0.815 0.099 0.005 0.081 0.758 0.004 0.115 0.123 0.131 0.145 0.124 0.6 0.07 0.781 0.066 0.083 0.066 0.124 0.678 0.132 0.594 0.144 0.127 0.135 0.096 0.08 0.101 0.723 0.119 0.069 0.12 0.692 MOTIF Heart_E12.5_H3K27me3_36_159_0.509_8.059917e-06 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.107 0.106 0.682 0.105 0.708 0.102 0.104 0.086 0.76 0.08 0.08 0.08 0.768 0.061 0.081 0.09 0.101 0.105 0.118 0.676 0.1 0.629 0.131 0.14 0.129 0.136 0.639 0.096 0.703 0.113 0.09 0.094 0.118 0.081 0.083 0.718 0.094 0.082 0.107 0.717 MOTIF Liver_E11.5_H3K27me3_27_169_0.522_1.460999e-10 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.116 0.096 0.695 0.093 0.729 0.094 0.113 0.064 0.765 0.077 0.085 0.073 0.749 0.074 0.083 0.094 0.115 0.096 0.119 0.67 0.125 0.63 0.122 0.123 0.121 0.104 0.657 0.118 0.65 0.134 0.103 0.113 0.095 0.08 0.068 0.757 0.081 0.096 0.122 0.701 MOTIF Liver_E15.5_H3K4me1_55_167_0.525_1.561582e-36 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.725 0.091 0.085 0.099 0.718 0.081 0.111 0.09 0.114 0.67 0.114 0.102 0.077 0.696 0.106 0.121 0.082 0.105 0.712 0.101 0.117 0.095 0.646 0.142 0.088 0.104 0.099 0.709 0.088 0.116 0.02 0.776 0.108 0.098 0.088 0.706 0.107 0.641 0.112 0.14 MOTIF Hindbrain_E15.5_H3K4me1_11_164_0.545_4.220898e-151 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.095 0.11 0.695 0.1 0.697 0.108 0.108 0.087 0.875 0.067 0.057 0.001 0.792 0.015 0.069 0.124 0.118 0.125 0.138 0.619 0.094 0.639 0.141 0.126 0.167 0.142 0.589 0.102 0.672 0.092 0.104 0.132 0.136 0.114 0.071 0.679 0.063 0.093 0.103 0.741 MOTIF Hindbrain_E13.5_H3K4me1_17_162_0.540_6.128374e-138 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.107 0.105 0.688 0.1 0.64 0.105 0.124 0.131 0.756 0.082 0.106 0.056 0.792 0.047 0.076 0.085 0.13 0.101 0.111 0.658 0.095 0.716 0.072 0.117 0.118 0.123 0.673 0.086 0.641 0.15 0.101 0.108 0.122 0.071 0.082 0.725 0.09 0.104 0.093 0.713 MOTIF Midbrain_E14.5_H3K4me1_10_169_0.545_1.640839e-106 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.746 0.087 0.081 0.086 0.728 0.08 0.093 0.099 0.109 0.11 0.119 0.662 0.079 0.661 0.127 0.133 0.116 0.131 0.675 0.078 0.618 0.13 0.128 0.124 0.115 0.074 0.068 0.743 0.057 0.077 0.078 0.788 0.098 0.1 0.096 0.706 0.107 0.674 0.11 0.109 MOTIF Hindbrain_E14.5_H3K4me1_9_166_0.543_7.955689e-109 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.726 0.093 0.078 0.103 0.706 0.078 0.098 0.118 0.099 0.093 0.137 0.671 0.088 0.714 0.087 0.111 0.081 0.104 0.736 0.079 0.666 0.1 0.098 0.136 0.101 0.088 0.071 0.74 0.082 0.071 0.093 0.754 0.117 0.115 0.118 0.65 0.113 0.637 0.113 0.137 MOTIF Midbrain_P0_H3K4me1_8_169_0.542_7.292209e-60 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.721 0.096 0.099 0.084 0.711 0.087 0.093 0.109 0.107 0.109 0.132 0.652 0.102 0.693 0.111 0.094 0.091 0.103 0.72 0.086 0.644 0.133 0.115 0.108 0.104 0.088 0.076 0.732 0.076 0.086 0.083 0.755 0.096 0.111 0.104 0.689 0.101 0.683 0.107 0.109 MOTIF Heart_E11.5_H3K27me3_34_161_0.514_3.568207e-07 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.04 0.056 0.857 0.047 0.832 0.032 0.071 0.065 0.876 0.005 0.085 0.034 0.833 0.027 0.048 0.092 0.049 0.086 0.121 0.744 0.101 0.634 0.092 0.173 0.112 0.185 0.617 0.086 0.706 0.118 0.09 0.086 0.143 0.019 0.045 0.793 0.054 0.046 0.077 0.823 MOTIF Heart_P0_H3K27me3_21_171_0.524_1.402517e-09 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.053 0.068 0.823 0.056 0.881 0.038 0.058 0.023 0.832 0.041 0.076 0.051 0.861 0.023 0.056 0.06 0.071 0.082 0.112 0.735 0.07 0.741 0.109 0.08 0.088 0.081 0.747 0.084 0.734 0.088 0.097 0.081 0.067 0.041 0.071 0.821 0.065 0.064 0.042 0.829 MOTIF Lung_E15.5_H3K27me3_29_178_0.526_6.219865e-11 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.055 0.059 0.819 0.067 0.882 0.076 0.041 0.001 0.853 0.003 0.085 0.059 0.857 0.002 0.078 0.063 0.057 0.066 0.117 0.76 0.056 0.708 0.105 0.131 0.148 0.084 0.697 0.071 0.607 0.174 0.115 0.104 0.094 0.008 0.096 0.802 0.063 0.047 0.073 0.817 MOTIF Forebrain_E13.5_H3K4me2_42_163_0.584_7.827741e-195 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.862 0.055 0.029 0.054 0.761 0.098 0.056 0.085 0.077 0.1 0.11 0.713 0.038 0.783 0.074 0.105 0.068 0.06 0.862 0.01 0.687 0.115 0.116 0.082 0.073 0.021 0.05 0.856 0.039 0.043 0.017 0.901 0.069 0.048 0.086 0.797 0.052 0.779 0.087 0.082