MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Forebrain_E16.5_H3K27ac_54_21_0.530_8.131093e-51 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.067217 0.778745 0.049802 0.104235 0.058817 0.85365 0.069704 0.017829 0.088733 0.054851 0.822007 0.034409 0.07737 0.040612 0.86582 0.016198 0.084284 0.625755 0.261947 0.028014 0.088934 0.013325 0.114421 0.783319 0.032832 0.770893 0.033781 0.162494 0.075563 0.877993 0.013868 0.032576 0.10503 0.822618 0.026359 0.045993 MOTIF Forebrain_P0_H3K27ac_39_23_0.542_6.26724e-145 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.14974 0.771219 0.038155 0.040887 0.0 0.823601 0.131567 0.044832 0.047606 0.033617 0.881455 0.037322 0.055557 0.101479 0.816392 0.026573 0.017598 0.397599 0.407601 0.177203 0.106079 0.049518 0.123081 0.721321 0.007729 0.86751 0.084938 0.039823 0.101353 0.741272 0.124182 0.033193 0.017938 0.892454 0.059542 0.030066 0.216415 0.251865 0.273717 0.258003 MOTIF Limb_E11.5_H3K27ac_36_21_0.532_4.579048e-25 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.151211 0.322567 0.20345 0.322772 0.006684 0.970182 0.009573 0.013562 0.193499 0.734169 0.043459 0.028873 0.039325 0.027366 0.894605 0.038704 0.153539 0.066049 0.704662 0.07575 0.009247 0.472036 0.305052 0.213666 0.03036 0.028113 0.012323 0.929204 0.008829 0.927727 0.013819 0.049625 0.099322 0.841008 0.006312 0.053358 0.006582 0.900497 0.042328 0.050592 0.037043 0.190588 0.496883 0.275486 MOTIF Liver_E16.5_H3K27ac_68_20_0.514_9.542221e-32 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.046548 0.0 0.47196 0.481492 0.052572 0.897584 0.0 0.049845 0.026232 0.853192 0.081861 0.038715 0.045073 0.030232 0.812715 0.111979 0.153659 0.0 0.80646 0.039881 0.230723 0.628227 0.058741 0.082309 0.015321 0.021617 0.065475 0.897587 0.016577 0.934943 0.0 0.04848 0.024567 0.946689 0.009949 0.018795 0.015709 0.798371 0.0 0.18592 MOTIF Heart_E16.5_H3K27me3_18_30_0.526_8.108929e-18 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.057055 0.882785 0.037966 0.022194 0.225204 0.047125 0.691719 0.035953 0.008284 0.023311 0.949312 0.019093 0.023171 0.906938 0.056748 0.013143 0.0797 0.022566 0.065855 0.831878 0.058797 0.773867 0.02897 0.138366 0.120308 0.847115 0.023254 0.009323 0.12091 0.786826 0.028918 0.063345 0.211719 0.024745 0.636581 0.126955 MOTIF Limb_E14.5_H3K27me3_16_21_0.556_8.495269e-45 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.032096 0.785177 0.141463 0.041264 0.090595 0.073573 0.753583 0.082249 0.069117 0.044669 0.795074 0.09114 0.080663 0.737834 0.049775 0.131729 0.036869 0.048135 0.049605 0.865391 0.027303 0.932368 0.00548 0.034849 0.048926 0.813439 0.015639 0.121997 0.106937 0.772323 0.053605 0.067135 0.023274 0.050582 0.772889 0.153255 MOTIF Kidney_P0_H3K27me3_13_20_0.551_1.856061e-24 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.071809 0.704909 0.114649 0.108633 0.071136 0.036583 0.854276 0.038006 0.064297 0.04567 0.854053 0.035981 0.046189 0.705588 0.164914 0.08331 0.052445 0.061876 0.038316 0.847363 0.022023 0.882168 0.04718 0.048629 0.01421 0.814762 0.080378 0.09065 0.074673 0.794014 0.047408 0.083904 0.091293 0.169735 0.613698 0.125274 MOTIF Liver_E16.5_H3K27me3_19_23_0.582_3.779004e-99 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.057683 0.813645 0.03842 0.090252 0.149423 0.034611 0.774894 0.041073 0.070378 0.068385 0.820969 0.040269 0.037494 0.763768 0.095725 0.103013 0.057086 0.040468 0.046446 0.856 0.007467 0.890355 0.030843 0.071335 0.029397 0.848474 0.021639 0.100489 0.156776 0.693609 0.095439 0.054177 0.110163 0.110498 0.657695 0.121643 MOTIF Midbrain_E11.5_H3K27me3_16_21_0.550_7.052589e-49 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.047439 0.872051 0.043066 0.037444 0.143522 0.070924 0.759045 0.026509 0.122126 0.058993 0.718084 0.100797 0.036866 0.59631 0.203729 0.163095 0.022126 0.022283 0.049126 0.906466 0.012604 0.908353 0.01087 0.068174 0.072032 0.805936 0.020425 0.101606 0.004341 0.875605 0.072288 0.047766 0.033416 0.062429 0.843936 0.060219 MOTIF Hindbrain_E15.5_H3K4me3_47_35_0.617_1.055387e-307 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.101496 0.051925 0.0 0.846578 0.031671 0.873374 0.081216 0.013739 0.021796 0.925775 0.02041 0.032018 0.056902 0.039458 0.866981 0.03666 0.161754 0.07648 0.613339 0.148427 0.019406 0.688122 0.117505 0.174966 0.025777 0.031907 0.009723 0.932594 0.01818 0.931702 0.016896 0.033222 0.099126 0.596362 0.02742 0.277092 0.026013 0.920778 0.032747 0.020462 0.043563 0.276019 0.469619 0.210799 MOTIF Hindbrain_P0_H3K4me3_30_20_0.674_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.014543 0.947891 0.0 0.037567 0.072759 0.024794 0.865231 0.037215 0.071659 0.053793 0.827361 0.047188 0.103747 0.783029 0.057686 0.055539 0.045564 0.030006 0.077747 0.846683 0.008377 0.823245 0.048072 0.120307 0.059153 0.710689 0.075434 0.154724 0.020183 0.872258 0.021663 0.085896 0.188274 0.041249 0.526763 0.243715 0.175206 0.473493 0.270532 0.080768 0.003052 0.715394 0.224912 0.056642 MOTIF Forebrain_E15.5_H3K4me3_27_16_0.678_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.06473 0.773725 0.109687 0.051858 0.135236 0.045551 0.783906 0.035307 0.138025 0.087572 0.72945 0.044952 0.082016 0.743743 0.111375 0.062867 0.055603 0.080056 0.081229 0.783112 0.009663 0.897726 0.023142 0.069469 0.024231 0.774118 0.094884 0.106767 0.032056 0.79532 0.090661 0.081963 0.097844 0.059036 0.728384 0.114736 0.041592 0.288918 0.667444 0.002046 MOTIF Midbrain_E11.5_H3K4me3_29_21_0.694_3.588063e-315 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.030638 0.799901 0.117164 0.052297 0.155821 0.049509 0.72891 0.06576 0.126939 0.080567 0.676758 0.115736 0.048683 0.774788 0.098943 0.077586 0.075946 0.090048 0.057683 0.776322 0.017848 0.834242 0.045534 0.102376 0.015724 0.819223 0.096627 0.068425 0.093707 0.703546 0.114435 0.088313 0.026382 0.073496 0.784454 0.115668 MOTIF Midbrain_E14.5_H3K4me3_35_21_0.664_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.065875 0.823981 0.05461 0.055534 0.130205 0.059599 0.702221 0.107974 0.04138 0.044519 0.836428 0.077672 0.051528 0.81253 0.068452 0.06749 0.042741 0.033728 0.061018 0.862514 0.025103 0.822096 0.046114 0.106686 0.041285 0.843008 0.032764 0.082943 0.095875 0.70661 0.089399 0.108116 0.027168 0.091982 0.811834 0.069017 MOTIF Forebrain_E13.5_H3K27me3_59_65_0.503_2.396724e-11 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.008853 0.952469 0.038678 0.0 0.112942 0.734834 0.087859 0.064365 0.050321 0.0 0.949679 0.0 0.133941 0.039683 0.781299 0.045077 0.0114 0.696851 0.048474 0.243275 0.076332 0.025298 0.026069 0.872301 0.066115 0.885473 0.017044 0.031368 0.011666 0.971888 0.005917 0.010528 0.375807 0.582935 0.041258 0.0 MOTIF Lung_E16.5_H3K9ac_72_90_0.511_5.06552e-42 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.00358 0.919109 0.04733 0.029981 0.061687 0.037711 0.063556 0.837046 0.020941 0.935917 0.043142 0.0 0.031153 0.512876 0.027662 0.428309 0.36264 0.064065 0.570434 0.002861 0.049114 0.027996 0.905849 0.01704 0.021518 0.917264 0.020459 0.040759 0.025758 0.030218 0.012803 0.931222 0.00712 0.893113 0.035587 0.064179 0.007946 0.35628 0.119663 0.51611 MOTIF Forebrain_E14.5_H3K9ac_79_45_0.524_7.394542e-122 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.005162 0.845469 0.058244 0.091125 0.126321 0.011937 0.030421 0.83132 0.00815 0.954791 0.037059 0.0 0.02536 0.90167 0.026192 0.046778 0.272217 0.044954 0.654423 0.028406 0.08535 0.048794 0.78341 0.082447 0.083728 0.726534 0.072902 0.116836 0.061215 0.032368 0.058691 0.847726 0.0 0.778476 0.057656 0.163869 0.008889 0.838553 0.05631 0.096248 MOTIF Kidney_E16.5_H3K9ac_69_36_0.542_2.842852e-100 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.26077 0.255521 0.155835 0.327874 0.013259 0.797414 0.129351 0.059976 0.112321 0.032452 0.053813 0.801414 0.007404 0.930053 0.047314 0.015229 0.108879 0.79613 0.043958 0.051034 0.10676 0.03894 0.832486 0.021815 0.032799 0.030825 0.810122 0.126254 0.096736 0.62483 0.205044 0.07339 0.044817 0.03434 0.057048 0.863794 0.006075 0.811919 0.069567 0.112439 MOTIF Kidney_P0_H3K9ac_76_52_0.516_5.592348e-39 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.219734 0.179934 0.051088 0.549244 0.001345 0.842066 0.078867 0.077723 0.111068 0.080725 0.038049 0.770158 0.002692 0.943671 0.052141 0.001496 0.127212 0.690451 0.04604 0.136297 0.183702 0.042007 0.757045 0.017247 0.049906 0.059008 0.794513 0.096573 0.114745 0.754255 0.073856 0.057143 0.023644 0.041513 0.051429 0.883413 0.0 0.89623 0.049106 0.054664 MOTIF Lung_E14.5_H3K9ac_67_48_0.544_1.337871e-73 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.178697 0.526333 0.009208 0.285762 0.001846 0.885737 0.028521 0.083896 0.045255 0.009509 0.036634 0.908602 0.002408 0.946627 0.050965 0.0 0.137464 0.585337 0.237384 0.039815 0.031163 0.023147 0.927887 0.017803 0.105634 0.078318 0.646171 0.169876 0.071746 0.771177 0.08052 0.076557 0.023376 0.055298 0.056165 0.865161 0.0 0.777059 0.025668 0.197273 0.034833 0.765214 0.022254 0.177698 MOTIF Hindbrain_E14.5_H3K9ac_77_45_0.530_8.119906e-105 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.003899 0.7369 0.068094 0.191107 0.100055 0.048788 0.039932 0.811226 0.012981 0.946053 0.039154 0.001812 0.117849 0.761338 0.085253 0.035561 0.168529 0.031256 0.771029 0.029186 0.011802 0.092129 0.761804 0.134265 0.071514 0.738494 0.061855 0.128137 0.053687 0.031311 0.04296 0.872042 0.0 0.937821 0.048169 0.01401 0.008246 0.385248 0.076689 0.529817 MOTIF Midbrain_E14.5_H3K9ac_65_34_0.556_1.284749e-126 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.005034 0.802085 0.05255 0.140331 0.049133 0.08122 0.028854 0.840792 0.002086 0.941 0.050134 0.00678 0.117385 0.676319 0.173337 0.032958 0.022493 0.059724 0.899891 0.017892 0.029918 0.048524 0.7757 0.145858 0.059732 0.581902 0.187668 0.170698 0.029021 0.028911 0.04479 0.897278 0.004464 0.901491 0.030443 0.063602 0.108073 0.454624 0.097889 0.339413 MOTIF Intestine_E15.5_H3K9ac_61_37_0.557_8.921821e-71 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.208234 0.489977 0.119143 0.182646 0.002171 0.698034 0.079335 0.22046 0.046442 0.061981 0.040238 0.851339 0.002898 0.952287 0.042355 0.002459 0.17192 0.739636 0.052959 0.035485 0.034936 0.052761 0.885369 0.026933 0.024021 0.082529 0.753398 0.140052 0.148325 0.7122 0.047223 0.092253 0.012965 0.067363 0.0479 0.871772 0.0 0.875947 0.043761 0.080292 0.043934 0.092269 0.274505 0.589292 MOTIF Neural-Tube_E13.5_H3K9ac_65_42_0.542_1.454054e-121 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.240466 0.52033 0.197661 0.041543 0.005209 0.881291 0.04598 0.06752 0.050604 0.017969 0.062693 0.868733 0.0 0.958786 0.041214 0.0 0.147717 0.552774 0.249079 0.05043 0.018686 0.023795 0.946114 0.011405 0.022355 0.047752 0.884303 0.04559 0.116283 0.576743 0.186053 0.120921 0.024198 0.084268 0.043451 0.848083 0.005528 0.911182 0.036896 0.046394 MOTIF Neural-Tube_E13.5_H3K9ac_61_53_0.544_1.230666e-153 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.006255 0.070158 0.912008 0.011579 0.072827 0.090533 0.831286 0.005353 0.967019 0.0 0.020057 0.012924 0.292598 0.237212 0.462123 0.008067 0.033751 0.74995 0.105504 0.110796 0.031815 0.892171 0.053602 0.022411 0.045067 0.066023 0.755656 0.133254 0.006765 0.023433 0.964862 0.00494 0.897747 0.025628 0.0 0.076626 MOTIF Intestine_E14.5_H3K9ac_52_36_0.579_1.932634e-156 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.156174 0.091809 0.738777 0.013241 0.067298 0.052625 0.869855 0.010221 0.891413 0.036456 0.038466 0.033665 0.102518 0.152312 0.719518 0.025651 0.116215 0.777019 0.042792 0.063974 0.01915 0.85896 0.071079 0.050812 0.135843 0.04997 0.714528 0.099659 0.064074 0.044502 0.889128 0.002296 0.803598 0.081093 0.059128 0.056182 0.260514 0.271471 0.431571 0.036444 MOTIF Stomach_E16.5_H3K9ac_62_63_0.545_2.184928e-109 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.18578 0.135687 0.66041 0.018122 0.218859 0.028926 0.750662 0.001553 0.941852 0.031491 0.015409 0.011247 0.189931 0.038453 0.748355 0.023262 0.099833 0.868166 0.0 0.032001 0.022502 0.854455 0.058934 0.064109 0.200237 0.059972 0.717212 0.022579 0.014893 0.031342 0.953765 0.0 0.863053 0.042213 0.049611 0.045124