MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Forebrain_P0_H3K9me3_17_179_0.533_9.408388e-11 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.058 0.863 0.078 0.001 0.978 0.02 0.001 0.001 0.076 0.046 0.051 0.827 0.93 0.001 0.036 0.033 0.05 0.036 0.001 0.913 0.001 0.001 0.001 0.997 0.033 0.762 0.204 0.001 0.051 0.907 0.016 0.026 MOTIF Neural-Tube_E14.5_H3K9me3_35_178_0.518_2.49453e-06 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.044 0.94 0.015 0.001 0.949 0.02 0.014 0.017 0.001 0.029 0.001 0.969 0.823 0.001 0.001 0.175 0.056 0.104 0.001 0.839 0.001 0.022 0.001 0.976 0.07 0.818 0.043 0.069 0.021 0.902 0.001 0.076 MOTIF Forebrain_E15.5_H3K9me3_82_39_0.514_1.363277e-08 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.037786 0.882609 0.0 0.079606 0.011338 0.803114 0.010614 0.174933 0.905838 0.080168 0.004903 0.009091 0.027328 0.030441 0.072973 0.869257 0.816114 0.027985 0.144651 0.01125 0.014117 0.048163 0.064869 0.87285 0.256184 0.177693 0.035425 0.530697 0.004216 0.981324 0.014461 0.0 0.048917 0.870577 0.007639 0.072868 MOTIF Kidney_E15.5_H3K9me3_65_68_0.512_1.087397e-05 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.065702 0.13367 0.396519 0.404109 0.01624 0.818906 0.105515 0.05934 0.007729 0.924925 0.021676 0.045671 0.904289 0.040934 0.026646 0.028131 0.046238 0.138386 0.059209 0.756166 0.682181 0.053625 0.138613 0.125581 0.018542 0.068092 0.091715 0.82165 0.146448 0.075984 0.048783 0.728784 0.016855 0.898309 0.030314 0.054521 0.075982 0.84084 0.030542 0.052636 MOTIF Lung_E15.5_H3K9me3_22_41_0.521_1.437663e-10 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.011772 0.425698 0.0 0.56253 0.057486 0.056023 0.424236 0.462255 0.016465 0.881349 0.009718 0.092469 0.009212 0.903714 0.037033 0.050041 0.873611 0.022616 0.010707 0.093067 0.014852 0.043005 0.106952 0.835191 0.6491 0.032235 0.252649 0.066017 0.0491 0.106762 0.095846 0.748292 0.07567 0.053812 0.057192 0.813327 0.007212 0.947321 0.010064 0.035403 0.071468 0.803784 0.018597 0.106151 MOTIF Midbrain_E11.5_H3K9me3_50_30_0.514_4.668e-06 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.050332 0.084386 0.381386 0.483895 0.025769 0.947234 0.021759 0.005237 0.034673 0.934236 0.011603 0.019487 0.940385 0.025516 0.012709 0.021389 0.021497 0.09154 0.179361 0.707602 0.624752 0.033013 0.276126 0.066109 0.041588 0.174007 0.060074 0.724332 0.047573 0.057103 0.016914 0.87841 0.034396 0.86105 0.007236 0.097318 0.045498 0.796672 0.014987 0.142844 MOTIF Neural-Tube_E11.5_H3K9me3_21_14_0.518_5.235547e-06 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.026127 0.038378 0.894886 0.040609 0.904562 0.02079 0.04741 0.027239 0.774709 0.019505 0.175278 0.030508 0.039859 0.120062 0.057774 0.782305 0.820212 0.031113 0.142775 0.005901 0.031072 0.09114 0.04929 0.828498 0.043875 0.054595 0.888611 0.012919 0.016524 0.093324 0.869207 0.020945 0.131749 0.681528 0.030014 0.15671 0.140624 0.307967 0.128817 0.422591 MOTIF Neural-Tube_E14.5_H3K9me3_55_12_0.514_0.0007662605 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.33183 0.21271 0.313455 0.142006 0.187574 0.073572 0.338584 0.40027 0.053709 0.819659 0.031331 0.095301 0.058597 0.84969 0.0228 0.068913 0.895627 0.056701 0.033295 0.014377 0.020769 0.120048 0.063003 0.79618 0.660511 0.081971 0.117366 0.140152 0.041207 0.066105 0.098723 0.793965 0.032846 0.023528 0.029243 0.914384 0.036436 0.840876 0.035358 0.08733 0.053572 0.787613 0.012831 0.145984 MOTIF Kidney_P0_H3K9me3_14_25_0.529_2.104435e-05 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.091332 0.036678 0.871196 0.000794 0.843127 0.082454 0.022239 0.052181 0.751672 0.076237 0.156156 0.015934 0.043704 0.228907 0.006725 0.720663 0.80413 0.062973 0.116431 0.016466 0.019318 0.045996 0.010064 0.924622 0.13453 0.013113 0.834242 0.018115 0.050591 0.012627 0.890031 0.046751 0.047944 0.857342 0.087459 0.007255 MOTIF Stomach_E15.5_H3K9me3_6_35_0.540_9.727963e-05 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.184742 0.039181 0.74447 0.031607 0.811098 0.052998 0.031887 0.104017 0.676716 0.024671 0.202812 0.095801 0.050571 0.069829 0.004393 0.875207 0.932304 0.026399 0.027088 0.014209 0.023003 0.105687 0.015901 0.855408 0.183425 0.004957 0.794326 0.017292 0.023045 0.014537 0.918879 0.043539 0.076238 0.872644 0.036833 0.014285 0.390778 0.317614 0.259726 0.031882 MOTIF Liver_E16.5_H3K9me3_56_104_0.516_2.948417e-06 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.027961 0.943932 0.019039 0.009069 0.847887 0.042102 0.101237 0.008774 0.080633 0.23052 0.039989 0.648858 0.208301 0.009257 0.022624 0.759817 0.01469 0.061392 0.087565 0.836353 0.019551 0.094711 0.015625 0.870113 0.004076 0.862652 0.029019 0.104253 0.020474 0.954428 0.017956 0.007142 0.724999 0.144497 0.0737 0.056804 MOTIF Lung_P0_H3K9me3_19_61_0.528_3.661738e-06 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.047274 0.938558 0.007032 0.007136 0.835953 0.039743 0.087696 0.036607 0.032719 0.029483 0.190214 0.747584 0.300079 0.041334 0.16358 0.495007 0.018294 0.02876 0.089118 0.863828 0.02593 0.017518 0.017941 0.938611 0.022772 0.906918 0.02884 0.041471 0.016653 0.945916 0.004985 0.032447 0.653451 0.002134 0.058265 0.28615 0.188404 0.041347 0.642385 0.127863 0.146181 0.082433 0.351188 0.420198 MOTIF Forebrain_E14.5_H3K9me3_84_5_0.509_0.0009144281 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.114813 0.781974 0.04727 0.055943 0.068236 0.811227 0.018691 0.101846 0.944675 0.018886 0.019992 0.016447 0.025373 0.060103 0.063148 0.851376 0.675744 0.034424 0.154643 0.135189 0.027615 0.069991 0.043433 0.858962 0.050668 0.039716 0.008673 0.900943 0.076279 0.695429 0.033392 0.1949 0.068256 0.857644 0.014986 0.059114 0.476349 0.393941 0.028896 0.100814 0.273985 0.18328 0.184596 0.358139 0.2965 0.015645 0.419064 0.268792 0.337864 0.043072 0.051781 0.567282 MOTIF Heart_E15.5_H3K9me3_88_18_0.509_4.352862e-06 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.094042 0.745692 0.047846 0.11242 0.02344 0.8634 0.024003 0.089157 0.847982 0.026684 0.073096 0.052238 0.032155 0.022512 0.081482 0.863852 0.705824 0.03631 0.127009 0.130857 0.024369 0.034289 0.062305 0.879036 0.083264 0.043185 0.032708 0.840843 0.054077 0.874441 0.030877 0.040605 0.02246 0.856798 0.008403 0.112339 0.600872 0.23092 0.072847 0.095361 0.036915 0.150041 0.436833 0.376211 0.011238 0.295558 0.637813 0.055391 0.449238 0.0 0.042893 0.507869 MOTIF Intestine_P0_H3K9me3_42_29_0.527_7.497329e-07 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.005082 0.766024 0.097211 0.131683 0.007755 0.921763 0.011958 0.058523 0.914013 0.016523 0.057232 0.012232 0.02591 0.045136 0.129807 0.799147 0.631564 0.015752 0.190843 0.16184 0.058679 0.039502 0.032028 0.869791 0.050202 0.051768 0.019672 0.878358 0.008265 0.872258 0.036494 0.082983 0.082684 0.804996 0.010542 0.101778 0.509945 0.276607 0.085518 0.127929 0.103243 0.009029 0.605362 0.282367 0.192197 0.353604 0.444661 0.009538 MOTIF Forebrain_P0_H3K9me3_39_38_0.525_2.743894e-08 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.025306 0.767424 0.0888 0.118471 0.059424 0.872681 0.038805 0.02909 0.932722 0.024093 0.011697 0.031488 0.027924 0.032818 0.042493 0.896765 0.560774 0.025586 0.228143 0.185497 0.048858 0.061032 0.017857 0.872254 0.027737 0.081242 0.112288 0.778733 0.020453 0.92575 0.031549 0.022248 0.029352 0.785369 0.004415 0.180864 0.294211 0.229057 0.251456 0.225276 MOTIF Kidney_P0_H3K9me3_69_9_0.511_0.006260828 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.043361 0.852965 0.007598 0.096076 0.027997 0.905834 0.010553 0.055616 0.928989 0.028858 0.020861 0.021292 0.015669 0.169191 0.050744 0.764396 0.664098 0.035288 0.145514 0.155101 0.042539 0.045122 0.053357 0.858983 0.033871 0.031835 0.066094 0.8682 0.008613 0.860274 0.038668 0.092445 0.017464 0.844551 0.01433 0.123654 0.551265 0.244725 0.112667 0.091342 0.078108 0.022698 0.495796 0.403399 0.061302 0.093321 0.68919 0.156187 MOTIF Cranio-Facial_E15.5_H3K9me3_39_21_0.518_1.885126e-06 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.297823 0.059091 0.297603 0.345483 0.0171 0.822333 0.060298 0.100269 0.003781 0.933455 0.023798 0.038967 0.915983 0.024056 0.025461 0.0345 0.017309 0.194982 0.055393 0.732315 0.575517 0.024826 0.207599 0.192058 0.020573 0.065429 0.070831 0.843166 0.073395 0.04845 0.032309 0.845845 0.003719 0.90644 0.069761 0.020081 0.088087 0.864424 0.011913 0.035576 0.608057 0.146703 0.155664 0.089576 0.024219 0.09535 0.42486 0.455572 MOTIF Lung_E14.5_H3K9me3_53_10_0.517_0.0001041308 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.028399 0.871192 0.025334 0.075076 0.017933 0.946159 0.012095 0.023812 0.907284 0.02088 0.010021 0.061815 0.019057 0.147296 0.126659 0.706988 0.632383 0.038025 0.161349 0.168243 0.050038 0.053787 0.066192 0.829984 0.042103 0.060715 0.070889 0.826292 0.02129 0.876004 0.055981 0.046726 0.021232 0.893299 0.035825 0.049644 0.543701 0.227799 0.116483 0.112016 0.005875 0.181668 0.478082 0.334375 MOTIF Forebrain_E16.5_H3K9me3_66_29_0.513_4.378701e-07 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.019995 0.877677 0.032787 0.069542 0.005206 0.946078 0.010285 0.038432 0.949611 0.025597 0.019965 0.004828 0.027458 0.156012 0.103942 0.712588 0.640104 0.039318 0.172854 0.147724 0.055188 0.108366 0.053994 0.782453 0.117562 0.01299 0.045254 0.824194 0.004275 0.916058 0.058753 0.020914 0.074124 0.83243 0.004041 0.089405 0.329807 0.310546 0.180761 0.178885 MOTIF Liver_E15.5_H3K9me3_40_30_0.511_0.0008474282 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.011975 0.960232 0.006627 0.021166 0.013389 0.95601 0.021423 0.009177 0.870614 0.019367 0.080442 0.029577 0.049368 0.14556 0.213358 0.591714 0.675683 0.057224 0.130972 0.136121 0.075602 0.070737 0.074827 0.778835 0.031282 0.05074 0.030156 0.887822 0.007961 0.919507 0.04755 0.024982 0.086838 0.850477 0.014485 0.0482 0.387792 0.295397 0.167275 0.149536 MOTIF Forebrain_E11.5_H3K9me3_65_16_0.513_4.59644e-06 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.412079 0.039153 0.323918 0.22485 0.018055 0.843765 0.075881 0.062298 0.058378 0.890086 0.012756 0.038779 0.828379 0.060965 0.091049 0.019607 0.024729 0.131195 0.081643 0.762433 0.737078 0.036268 0.143554 0.0831 0.053559 0.131297 0.044857 0.770287 0.112734 0.122196 0.030376 0.734693 0.013986 0.941803 0.028124 0.016087 0.02989 0.855386 0.019021 0.095703 0.444787 0.372789 0.081781 0.100644 MOTIF Hindbrain_P0_H3K9me3_84_21_0.512_7.164276e-05 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.027244 0.775904 0.100183 0.096669 0.023605 0.840393 0.038946 0.097055 0.878874 0.050654 0.051611 0.018861 0.017415 0.107753 0.050282 0.824551 0.640768 0.100101 0.125659 0.133472 0.015105 0.068484 0.017487 0.898923 0.111314 0.098491 0.027854 0.762341 0.047032 0.855637 0.052494 0.044838 0.037427 0.880852 0.005224 0.076497 0.563385 0.27028 0.02299 0.143345 MOTIF Neural-Tube_E15.5_H3K9me3_109_11_0.507_1.615544e-10 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.051257 0.904495 0.014289 0.029959 0.015231 0.922672 0.023422 0.038675 0.835584 0.126334 0.020792 0.017291 0.026631 0.19212 0.038071 0.743179 0.675321 0.076662 0.103785 0.144232 0.013938 0.040055 0.074874 0.871133 0.096164 0.137402 0.041812 0.724622 0.027188 0.84532 0.047717 0.079775 0.039397 0.859417 0.008825 0.09236 0.363365 0.413019 0.067119 0.156497 MOTIF Midbrain_P0_H3K9me3_102_26_0.505_0.03751462 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.942896 0.028949 0.021318 0.006838 0.148337 0.189131 0.499729 0.162804 0.102111 0.724981 0.024726 0.148182 0.032216 0.925627 0.016032 0.026125 0.858298 0.038694 0.092697 0.010311 0.018275 0.176439 0.064278 0.741008 0.742444 0.11104 0.094413 0.052104 0.015558 0.034751 0.022934 0.926758 0.052594 0.060517 0.01723 0.869659 0.045378 0.820757 0.019115 0.11475 0.081854 0.80572 0.008504 0.103922 0.736102 0.11019 0.016884 0.136824 MOTIF Hindbrain_E11.5_H3K9me3_19_78_0.531_1.239837e-07 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.009131 0.795267 0.152496 0.043106 0.893354 0.06415 0.025108 0.017388 0.017081 0.123686 0.062027 0.797206 0.821801 0.136603 0.028021 0.013575 0.04166 0.017531 0.1402 0.800608 0.044708 0.164312 0.039245 0.751735 0.038637 0.917962 0.043401 0.0 0.18699 0.720096 0.008356 0.084558 0.767119 0.109409 0.045893 0.077579 MOTIF Lung_E15.5_H3K9me3_3_73_0.532_6.286592e-07 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.076697 0.884149 0.031859 0.007295 0.955442 0.01928 0.008515 0.016763 0.006395 0.100969 0.147413 0.745223 0.710809 0.014908 0.164874 0.109409 0.038954 0.034078 0.042318 0.88465 0.026724 0.206328 0.104814 0.662134 0.039222 0.780257 0.010425 0.170097 0.010668 0.896806 0.006697 0.085829 0.785601 0.003984 0.028408 0.182006 MOTIF Stomach_P0_H3K9me3_30_32_0.524_1.558119e-07 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.545375 0.035335 0.213657 0.205632 0.050636 0.851402 0.025173 0.072789 0.017614 0.908742 0.013162 0.060481 0.897905 0.008685 0.033448 0.059962 0.017824 0.047144 0.064528 0.870503 0.701101 0.018995 0.170995 0.10891 0.036785 0.094443 0.060684 0.808087 0.034947 0.152829 0.067987 0.744236 0.043818 0.797238 0.101425 0.057519 0.007332 0.871019 0.023185 0.098464 0.744397 0.090582 0.070415 0.094607