MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Cranio-Facial_E15.5_H3K27me3_16_158_0.530_6.931879e-21
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.257	0.065	0.257	0.421
0.143	0.067	0.224	0.566
0.915	0.001	0.001	0.083
0.942	0.056	0.001	0.001
0.969	0.001	0.001	0.029
0.191	0.032	0.277	0.5
0.063	0.737	0.056	0.144
0.058	0.057	0.884	0.001

MOTIF	Heart_E13.5_H3K27me3_7_161_0.516_3.581151e-16
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.001	0.64	0.12	0.239
0.29	0.001	0.708	0.001
0.418	0.336	0.001	0.245
0.001	0.101	0.001	0.897
0.01	0.001	0.148	0.841
0.316	0.001	0.001	0.682
0.415	0.291	0.195	0.099
0.618	0.266	0.001	0.115

MOTIF	Limb_E12.5_H3K27me3_26_157_0.512_2.010057e-09
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.271	0.165	0.218	0.347
0.044	0.249	0.197	0.51
0.519	0.012	0.176	0.293
0.732	0.223	0.001	0.044
0.629	0.073	0.023	0.275
0.053	0.022	0.277	0.648
0.264	0.509	0.135	0.092
0.36	0.22	0.403	0.016

MOTIF	Kidney_E15.5_H3K27me3_10_153_0.528_3.000494e-17
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.23	0.093	0.261	0.416
0.212	0.15	0.215	0.423
0.479	0.13	0.192	0.2
0.765	0.086	0.042	0.107
0.841	0.068	0.09	0.001
0.001	0.128	0.388	0.483
0.116	0.686	0.021	0.177
0.205	0.094	0.605	0.096

MOTIF	Forebrain_E12.5_H3K27me3_83_154_0.501_0.002012665
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.149	0.615	0.124	0.112
0.118	0.112	0.625	0.145
0.625	0.139	0.107	0.129
0.104	0.098	0.06	0.738
0.069	0.077	0.08	0.774
0.126	0.087	0.086	0.701
0.724	0.092	0.098	0.086
0.763	0.08	0.071	0.086
0.743	0.059	0.085	0.113
0.122	0.109	0.103	0.666

MOTIF	Heart_E16.5_H3K27me3_13_158_0.534_4.752122e-27
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.118	0.147	0.11	0.625
0.134	0.116	0.119	0.631
0.553	0.114	0.148	0.185
0.682	0.135	0.098	0.085
0.654	0.09	0.102	0.154
0.18	0.143	0.164	0.513
0.1	0.667	0.115	0.118
0.108	0.12	0.677	0.095

MOTIF	Limb_E15.5_H3K27me3_20_156_0.524_1.905111e-16
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.147	0.122	0.111	0.62
0.131	0.123	0.109	0.637
0.569	0.095	0.115	0.221
0.751	0.102	0.062	0.085
0.605	0.078	0.087	0.23
0.174	0.11	0.154	0.562
0.141	0.58	0.098	0.181
0.155	0.085	0.676	0.084

MOTIF	Intestine_E16.5_H3K4me3_43_162_0.620_3.541403e-233
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.351	0.139	0.267	0.244
0.414	0.584	0.001	0.001
0.256	0.001	0.412	0.331
0.261	0.193	0.273	0.273
0.323	0.147	0.001	0.529
0.001	0.001	0.001	0.997
0.278	0.157	0.001	0.564
0.322	0.001	0.323	0.354
0.157	0.82	0.001	0.022
0.394	0.001	0.347	0.258

MOTIF	Kidney_E16.5_H3K27ac_7_160_0.550_3.354896e-119
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.703	0.108	0.11	0.079
0.11	0.115	0.098	0.677
0.713	0.078	0.102	0.107
0.765	0.085	0.082	0.068
0.715	0.097	0.1	0.088
0.115	0.116	0.1	0.669
0.104	0.709	0.096	0.091
0.128	0.113	0.662	0.097
0.078	0.727	0.086	0.109
0.103	0.123	0.662	0.112

MOTIF	Limb_E11.5_H3K27ac_3_155_0.569_2.380662e-95
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.684	0.123	0.118	0.075
0.133	0.097	0.104	0.666
0.724	0.082	0.094	0.1
0.77	0.083	0.069	0.078
0.743	0.083	0.088	0.086
0.125	0.11	0.119	0.646
0.099	0.686	0.108	0.107
0.108	0.109	0.686	0.097
0.099	0.709	0.096	0.096
0.111	0.104	0.686	0.099

MOTIF	Midbrain_E11.5_H3K27ac_6_161_0.574_4.367184e-88
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.088	0.12	0.703	0.089
0.1	0.678	0.114	0.108
0.146	0.095	0.662	0.097
0.639	0.126	0.121	0.114
0.11	0.082	0.098	0.71
0.084	0.084	0.094	0.738
0.688	0.1	0.089	0.123
0.738	0.066	0.075	0.121
0.104	0.084	0.078	0.734
0.096	0.107	0.086	0.711

MOTIF	Neural-Tube_E13.5_H3K27ac_6_155_0.561_1.606508e-178
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.729	0.072	0.086	0.113
0.638	0.105	0.097	0.16
0.193	0.109	0.138	0.56
0.207	0.172	0.421	0.2
0.684	0.161	0.116	0.039
0.656	0.109	0.053	0.182
0.202	0.107	0.161	0.53
0.13	0.541	0.129	0.2
0.149	0.141	0.607	0.103
0.079	0.635	0.152	0.134

MOTIF	Hindbrain_E11.5_H3K27ac_1_159_0.583_1.887476e-121
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.132	0.263	0.466	0.139
0.042	0.778	0.072	0.108
0.136	0.136	0.638	0.09
0.359	0.235	0.22	0.185
0.129	0.037	0.041	0.793
0.013	0.02	0.017	0.95
0.157	0.112	0.088	0.643
0.353	0.184	0.262	0.201
0.25	0.513	0.082	0.155
0.394	0.143	0.212	0.251

MOTIF	Midbrain_E12.5_H3K27ac_4_157_0.572_3.131924e-144
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.297	0.149	0.154	0.4
0.191	0.037	0.494	0.278
0.19	0.257	0.203	0.351
0.601	0.09	0.101	0.208
0.997	0.001	0.001	0.001
0.909	0.001	0.001	0.089
0.208	0.19	0.237	0.364
0.13	0.568	0.159	0.143
0.167	0.087	0.703	0.043
0.182	0.425	0.272	0.12

MOTIF	Stomach_E14.5_H3K27ac_14_161_0.553_3.42737e-79
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.119	0.089	0.688	0.104
0.129	0.102	0.08	0.689
0.824	0.029	0.043	0.104
0.929	0.04	0.014	0.017
0.731	0.097	0.071	0.101
0.115	0.126	0.063	0.696
0.077	0.766	0.047	0.11
0.109	0.115	0.679	0.097

MOTIF	Liver_E15.5_H3K27me3_17_156_0.531_6.175579e-23
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.141	0.086	0.154	0.619
0.792	0.061	0.067	0.08
0.851	0.048	0.063	0.038
0.815	0.027	0.077	0.081
0.106	0.06	0.032	0.802
0.073	0.744	0.018	0.165
0.144	0.074	0.697	0.085
0.093	0.681	0.131	0.095

MOTIF	Forebrain_E14.5_H3K4me3_7_160_0.745_9.776363e-316
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.124	0.664	0.089	0.123
0.124	0.108	0.645	0.123
0.162	0.155	0.535	0.148
0.589	0.132	0.15	0.129
0.571	0.141	0.146	0.142
0.151	0.142	0.15	0.557
0.134	0.154	0.135	0.577
0.133	0.619	0.101	0.147
0.135	0.092	0.648	0.125
0.141	0.597	0.12	0.142

MOTIF	Forebrain_P0_H3K4me3_15_163_0.717_6.971968e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.118	0.523	0.082	0.277
0.15	0.114	0.586	0.15
0.187	0.718	0.091	0.004
0.041	0.041	0.681	0.237
0.764	0.042	0.08	0.114
0.26	0.438	0.078	0.224
0.223	0.115	0.26	0.401
0.259	0.189	0.042	0.51
0.296	0.28	0.201	0.224
0.114	0.585	0.224	0.077
0.26	0.298	0.351	0.091
0.313	0.266	0.195	0.226

MOTIF	Hindbrain_E15.5_H3K4me3_29_156_0.673_3.229146e-317
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.11	0.689	0.089	0.112
0.094	0.101	0.707	0.098
0.11	0.114	0.122	0.654
0.704	0.097	0.088	0.111
0.736	0.094	0.104	0.066
0.713	0.093	0.098	0.096
0.117	0.123	0.09	0.67
0.094	0.716	0.084	0.106
0.087	0.085	0.729	0.099
0.104	0.683	0.108	0.105

MOTIF	Kidney_E16.5_H3K4me3_35_168_0.650_9.876372e-321
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.109	0.535	0.246	0.11
0.081	0.73	0.108	0.081
0.09	0.081	0.745	0.084
0.494	0.087	0.216	0.202
0.434	0.274	0.068	0.224
0.09	0.322	0.075	0.513
0.302	0.161	0.07	0.467
0.644	0.101	0.14	0.115
0.082	0.404	0.252	0.263
0.303	0.078	0.419	0.199

MOTIF	Midbrain_E15.5_H3K4me3_60_159_0.606_2.031828e-190
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.659	0.135	0.092	0.114
0.324	0.283	0.214	0.18
0.001	0.886	0.112	0.001
0.151	0.147	0.636	0.066
0.644	0.093	0.036	0.227
0.471	0.164	0.233	0.131
0.132	0.157	0.145	0.566
0.209	0.108	0.111	0.572
0.726	0.001	0.08	0.193
0.267	0.464	0.147	0.121
0.171	0.211	0.325	0.292
0.273	0.189	0.183	0.355

MOTIF	Cranio-Facial_E11.5_H3K4me2_62_165_0.580_6.207163e-139
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.129	0.141	0.118	0.612
0.13	0.146	0.114	0.61
0.149	0.123	0.575	0.153
0.14	0.569	0.137	0.154
0.139	0.126	0.137	0.598
0.143	0.118	0.134	0.605
0.604	0.13	0.118	0.148
0.603	0.148	0.139	0.11
0.147	0.615	0.117	0.121
0.132	0.11	0.61	0.148

MOTIF	Hindbrain_E13.5_H3K4me2_25_165_0.627_1.885823e-315
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.125	0.668	0.064	0.143
0.117	0.085	0.613	0.185
0.153	0.169	0.135	0.543
0.119	0.112	0.112	0.657
0.18	0.088	0.099	0.633
0.608	0.135	0.089	0.168
0.502	0.164	0.198	0.136
0.138	0.625	0.094	0.143
0.185	0.041	0.636	0.138
0.516	0.184	0.165	0.135

MOTIF	Midbrain_E11.5_H3K4me2_44_161_0.611_7.210663e-292
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.095	0.108	0.098	0.699
0.109	0.657	0.082	0.152
0.109	0.119	0.657	0.115
0.097	0.109	0.102	0.692
0.08	0.084	0.091	0.745
0.109	0.08	0.08	0.731
0.717	0.117	0.074	0.092
0.707	0.1	0.11	0.083
0.118	0.686	0.092	0.104
0.112	0.086	0.709	0.093

MOTIF	Kidney_E14.5_H3K4me2_21_156_0.643_3.919634e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.113	0.782	0.001	0.104
0.081	0.08	0.734	0.105
0.172	0.148	0.156	0.524
0.636	0.003	0.171	0.19
0.997	0.001	0.001	0.001
0.854	0.026	0.083	0.037
0.203	0.158	0.143	0.495
0.3	0.59	0.003	0.107
0.208	0.135	0.545	0.112
0.068	0.319	0.157	0.456

MOTIF	Midbrain_E14.5_H3K4me2_27_157_0.628_2.069609e-310
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.552	0.15	0.159	0.139
0.127	0.626	0.12	0.127
0.136	0.108	0.625	0.131
0.564	0.153	0.149	0.134
0.16	0.12	0.13	0.59
0.11	0.117	0.11	0.663
0.154	0.136	0.123	0.587
0.544	0.161	0.142	0.153
0.131	0.637	0.112	0.12
0.129	0.118	0.61	0.143

MOTIF	Heart_E15.5_H3K9ac_17_153_0.635_2.504084e-312
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.188	0.714	0.027	0.071
0.011	0.055	0.806	0.128
0.17	0.184	0.154	0.493
0.707	0.042	0.127	0.124
0.954	0.001	0.039	0.006
0.622	0.067	0.124	0.187
0.174	0.147	0.148	0.531
0.129	0.71	0.001	0.16
0.015	0.075	0.838	0.072
0.067	0.18	0.128	0.625

MOTIF	Neural-Tube_E15.5_H3K9ac_37_164_0.623_1.352479e-294
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.111	0.699	0.105	0.085
0.108	0.077	0.717	0.098
0.664	0.108	0.126	0.102
0.087	0.108	0.108	0.697
0.072	0.098	0.078	0.752
0.092	0.105	0.089	0.714
0.082	0.094	0.114	0.71
0.112	0.71	0.076	0.102
0.117	0.118	0.664	0.101
0.103	0.112	0.109	0.676