MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Forebrain_E11.5_H3K27ac_79_124_0.509_5.144389e-12
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.803226	0.065268	0.025951	0.105556
0.146122	0.050659	0.790469	0.01275
0.698597	0.158353	0.084122	0.058927
0.042133	0.193344	0.662915	0.101608
0.010821	0.843119	0.031773	0.114287
0.051012	0.793755	0.022339	0.132894
0.014315	0.934005	0.05026	0.001421
0.851935	0.039696	0.061056	0.047313
0.0	0.019969	0.980031	0.0

MOTIF	Cranio-Facial_E11.5_H3K27ac_90_93_0.507_1.006203e-08
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.011639	0.542112	0.411768	0.034481
0.802105	0.03146	0.085787	0.080648
0.028806	0.039472	0.925597	0.006124
0.867687	0.028159	0.050699	0.053455
0.056761	0.136659	0.754474	0.052106
0.117713	0.625371	0.203056	0.05386
0.109287	0.724418	0.1303	0.035994
0.008427	0.959799	0.011302	0.020472
0.733816	0.038501	0.103332	0.124351
0.003855	0.086191	0.905322	0.004632

MOTIF	Midbrain_E11.5_H3K27ac_79_80_0.514_3.997414e-13
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.027567	0.315566	0.652616	0.004251
0.798139	0.060652	0.074616	0.066594
0.056284	0.033432	0.903799	0.006484
0.833007	0.066376	0.057902	0.042715
0.020759	0.16138	0.763513	0.054348
0.066958	0.720943	0.17054	0.041559
0.144025	0.702622	0.08724	0.066114
0.016145	0.806189	0.164032	0.013634
0.782789	0.062197	0.048824	0.106189
0.0	0.073886	0.923641	0.002473

MOTIF	Midbrain_E13.5_H3K27ac_101_52_0.501_1.569409e-06
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.027769	0.759475	0.129462	0.083293
0.001444	0.915241	0.067763	0.015553
0.076448	0.077371	0.077976	0.768205
0.005973	0.057586	0.912381	0.02406
0.045695	0.040263	0.787751	0.126292
0.01767	0.128039	0.81897	0.035321
0.079221	0.775542	0.053399	0.091837
0.052678	0.188833	0.064975	0.693514
0.030174	0.740668	0.11705	0.112108

MOTIF	Liver_P0_H3K27me3_75_105_0.500_0.0005909052
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.078211	0.730553	0.071031	0.120204
0.000762	0.967144	0.029311	0.002783
0.08297	0.068689	0.045014	0.803326
0.003095	0.038257	0.940668	0.01798
0.120616	0.016689	0.745023	0.117671
0.069266	0.028096	0.82593	0.076707
0.130805	0.683467	0.066776	0.118951
0.036766	0.043495	0.082901	0.836838
0.040027	0.778312	0.056023	0.125638

MOTIF	Neural-Tube_E12.5_H3K27me3_29_49_0.511_0.0004895187
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.505107	0.214916	0.072828	0.207149
0.016072	0.902209	0.036222	0.045497
0.001534	0.886205	0.107284	0.004977
0.212213	0.050695	0.040413	0.696679
0.009471	0.028659	0.955646	0.006224
0.175682	0.037724	0.755378	0.031215
0.033472	0.025198	0.935083	0.006247
0.088101	0.745835	0.015217	0.150848
0.236078	0.070425	0.222055	0.471441
0.016245	0.825939	0.06621	0.091606

MOTIF	Heart_E16.5_H3K27me3_55_43_0.510_7.184591e-12
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.116991	0.518629	0.175153	0.189227
0.0	0.887067	0.102859	0.010074
0.099265	0.06765	0.108205	0.72488
0.038355	0.030809	0.881164	0.049671
0.035837	0.042145	0.893698	0.028321
0.022267	0.05095	0.900954	0.025828
0.133802	0.753453	0.032071	0.080674
0.130076	0.055297	0.044033	0.770594
0.088213	0.755153	0.043878	0.112756
0.015395	0.786422	0.067565	0.130618
0.337221	0.156472	0.389889	0.116418

MOTIF	Heart_E14.5_H3K27me3_28_40_0.512_3.276524e-05
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.0	0.886908	0.102388	0.010704
0.114855	0.050189	0.105366	0.72959
0.014089	0.017687	0.929631	0.038592
0.051267	0.054822	0.868007	0.025904
0.02014	0.064349	0.885068	0.030443
0.098183	0.734047	0.035431	0.132339
0.08032	0.050782	0.134961	0.733937
0.089359	0.712081	0.15259	0.045971
0.029659	0.758374	0.023046	0.188921

MOTIF	Midbrain_E13.5_H3K27me3_55_45_0.505_9.90997e-09
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.005349	0.941499	0.040012	0.01314
0.042978	0.16723	0.077555	0.712237
0.030053	0.047435	0.89156	0.030952
0.104815	0.029629	0.836308	0.029248
0.054889	0.089298	0.829177	0.026636
0.098631	0.670492	0.111353	0.119525
0.135585	0.053978	0.044508	0.765929
0.05945	0.726689	0.098164	0.115698
0.048583	0.874558	0.036517	0.040342

MOTIF	Forebrain_E16.5_H3K27me3_39_52_0.512_4.802744e-05
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.003908	0.950234	0.024363	0.021494
0.088398	0.06822	0.154594	0.688788
0.035523	0.067922	0.879146	0.017408
0.043145	0.042779	0.824165	0.089912
0.071246	0.064856	0.769768	0.09413
0.085532	0.773443	0.058192	0.082834
0.14804	0.067117	0.045557	0.739285
0.070908	0.811143	0.037939	0.08001
0.062398	0.828693	0.02737	0.081539
0.241995	0.233953	0.43339	0.090662

MOTIF	Midbrain_E15.5_H3K27me3_44_33_0.510_0.0003764415
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.006085	0.905368	0.072691	0.015857
0.07728	0.121487	0.090239	0.710994
0.013737	0.090993	0.865567	0.029703
0.063148	0.071238	0.812695	0.052918
0.031152	0.089068	0.821122	0.058658
0.067974	0.761249	0.095495	0.075283
0.10568	0.051811	0.077981	0.764528
0.051652	0.807958	0.063309	0.077081
0.05734	0.794434	0.019121	0.129106
0.228132	0.307775	0.426481	0.037612

MOTIF	Neural-Tube_E12.5_H3K27me3_43_28_0.506_0.0001417714
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.007944	0.917745	0.06886	0.005451
0.049878	0.111681	0.061853	0.776588
0.008111	0.11634	0.846221	0.029328
0.073233	0.127108	0.740867	0.058792
0.026026	0.097336	0.809738	0.066901
0.080351	0.774636	0.08035	0.064664
0.094147	0.046363	0.075996	0.783494
0.049226	0.780805	0.097084	0.072885
0.04506	0.82396	0.025773	0.105207
0.294715	0.332785	0.295254	0.077247

MOTIF	Midbrain_P0_H3K4me1_82_31_0.512_4.066711e-15
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.005092	0.900993	0.083513	0.010402
0.11884	0.031352	0.09526	0.754548
0.008967	0.02954	0.937651	0.023842
0.027962	0.121549	0.726055	0.124435
0.02973	0.076054	0.717178	0.177038
0.120909	0.702086	0.049729	0.127277
0.051065	0.055188	0.052396	0.841352
0.048581	0.883871	0.036742	0.030805
0.057795	0.883243	0.010861	0.048101
0.275647	0.023866	0.548665	0.151823
0.196839	0.042984	0.343418	0.416759
0.013344	0.005737	0.71498	0.26594

MOTIF	Forebrain_E12.5_H3K4me1_75_44_0.510_6.680436e-12
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.0	0.884908	0.115092	0.0
0.225691	0.031516	0.053913	0.68888
0.006011	0.01842	0.909232	0.066337
0.042254	0.080113	0.84539	0.032243
0.018675	0.041557	0.889452	0.050315
0.027666	0.94984	0.009859	0.012635
0.021112	0.064476	0.023445	0.890966
0.086283	0.56929	0.158644	0.185783
0.055935	0.706433	0.077745	0.159887
0.134536	0.112248	0.651904	0.101311

MOTIF	Cranio-Facial_E14.5_H3K4me1_91_35_0.508_1.827761e-07
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.002926	0.905627	0.067835	0.023611
0.104065	0.03246	0.091484	0.771991
0.004602	0.026238	0.936694	0.032466
0.045039	0.064773	0.839522	0.050666
0.042378	0.182555	0.656328	0.118739
0.089999	0.778043	0.031662	0.100296
0.057222	0.083659	0.062849	0.79627
0.054352	0.766465	0.033896	0.145287
0.067101	0.846317	0.010511	0.076072
0.335038	0.182411	0.385196	0.097355
0.152579	0.062442	0.465696	0.319283

MOTIF	Hindbrain_P0_H3K4me1_71_25_0.506_7.852226e-08
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.005816	0.962646	0.025358	0.00618
0.050351	0.030855	0.059524	0.859269
0.008712	0.069743	0.888525	0.03302
0.076326	0.067834	0.75066	0.10518
0.023159	0.163001	0.731755	0.082085
0.07629	0.752589	0.071737	0.099383
0.142142	0.048773	0.054852	0.754233
0.032184	0.777855	0.05267	0.137291
0.064549	0.853047	0.008606	0.073798
0.291905	0.302097	0.301922	0.104076

MOTIF	Limb_E11.5_H3K4me1_75_36_0.514_1.604099e-15
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.005599	0.909572	0.076389	0.008441
0.044423	0.048904	0.057848	0.848826
0.007698	0.028033	0.923076	0.041193
0.046903	0.063264	0.776875	0.112958
0.039361	0.188836	0.652988	0.118816
0.087432	0.734666	0.077529	0.100373
0.090445	0.053595	0.092744	0.763217
0.03482	0.802814	0.033139	0.129227
0.055728	0.857992	0.012986	0.073295
0.27833	0.332702	0.281957	0.107011
0.016075	0.065025	0.57945	0.33945

MOTIF	Lung_E14.5_H3K4me1_60_28_0.512_1.324426e-11
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.003331	0.953903	0.031217	0.011548
0.038922	0.03713	0.055138	0.86881
0.013586	0.020855	0.897946	0.067612
0.040039	0.050791	0.817649	0.09152
0.040301	0.240033	0.61657	0.103095
0.079838	0.72504	0.061757	0.133366
0.060209	0.06445	0.063219	0.812122
0.046314	0.77014	0.040938	0.142608
0.045568	0.849852	0.008153	0.096426
0.439096	0.213674	0.234601	0.11263
0.029785	0.048401	0.717028	0.204786

MOTIF	Forebrain_P0_H3K4me1_88_55_0.504_5.022476e-06
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.000885	0.91622	0.075084	0.007811
0.107723	0.034913	0.069489	0.787875
0.00691	0.025911	0.933497	0.033683
0.029616	0.051813	0.799107	0.119463
0.049068	0.086081	0.754397	0.110454
0.0953	0.733166	0.066597	0.104936
0.136904	0.047492	0.083351	0.732253
0.029073	0.763569	0.08255	0.124808
0.08896	0.791788	0.025378	0.093873

MOTIF	Midbrain_E14.5_H3K4me1_70_31_0.510_3.571902e-15
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.004066	0.90682	0.081292	0.007823
0.120974	0.042951	0.088002	0.748073
0.0118	0.028925	0.909454	0.04982
0.032771	0.039252	0.889275	0.038702
0.039887	0.169762	0.674023	0.116328
0.071765	0.803203	0.023284	0.101748
0.059083	0.048373	0.106001	0.786543
0.039834	0.783425	0.035751	0.14099
0.037287	0.783212	0.061183	0.118318
0.155543	0.185917	0.563968	0.094571
0.162163	0.211226	0.340371	0.28624

MOTIF	Midbrain_E16.5_H3K4me1_77_32_0.508_6.586814e-10
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.003312	0.967799	0.021006	0.007883
0.139708	0.039333	0.106957	0.714002
0.012382	0.02363	0.929264	0.034725
0.053584	0.058481	0.853074	0.034861
0.034583	0.124881	0.800697	0.039839
0.099386	0.723783	0.066142	0.110689
0.061011	0.060372	0.112946	0.765671
0.048037	0.721248	0.097775	0.13294
0.05773	0.815967	0.024521	0.101782
0.331081	0.112645	0.484323	0.071951
0.198053	0.324125	0.372794	0.105028

MOTIF	Neural-Tube_E13.5_H3K4me1_95_40_0.504_3.999024e-10
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.006445	0.898769	0.087275	0.007511
0.102889	0.035218	0.062743	0.79915
0.011524	0.032612	0.918048	0.037816
0.09614	0.09994	0.738239	0.06568
0.041857	0.182914	0.678088	0.097141
0.06351	0.76846	0.073569	0.094461
0.043176	0.033749	0.081982	0.841093
0.040439	0.820822	0.050279	0.088461
0.069543	0.780072	0.042206	0.10818
0.293002	0.103487	0.523382	0.080129

MOTIF	Forebrain_E13.5_H3K4me1_83_35_0.506_2.131264e-18
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.003827	0.930953	0.059185	0.006035
0.083065	0.042496	0.066398	0.808041
0.010684	0.025165	0.915059	0.049093
0.046152	0.070973	0.833936	0.048939
0.026198	0.137364	0.744426	0.092012
0.055669	0.784704	0.062226	0.0974
0.114955	0.080909	0.047946	0.75619
0.042514	0.744395	0.091563	0.121527
0.076981	0.748597	0.046978	0.127444
0.232556	0.128846	0.577312	0.061286

MOTIF	Neural-Tube_E15.5_H3K4me1_89_45_0.505_5.109514e-16
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.004368	0.908371	0.079864	0.007397
0.079534	0.044115	0.084477	0.791874
0.013678	0.032642	0.901898	0.051782
0.103565	0.051457	0.8028	0.042178
0.030522	0.108905	0.78873	0.071844
0.07465	0.750316	0.106538	0.068496
0.089873	0.048847	0.07899	0.78229
0.054177	0.745183	0.104916	0.095724
0.099043	0.778684	0.048973	0.073301
0.26005	0.170671	0.518497	0.050783

MOTIF	Forebrain_E14.5_H3K4me1_80_28_0.508_2.626985e-12
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.006421	0.932957	0.050283	0.010339
0.070233	0.084108	0.066383	0.779276
0.027917	0.063871	0.862344	0.045868
0.057211	0.045969	0.809585	0.087235
0.026042	0.104216	0.798225	0.071517
0.05824	0.81703	0.059276	0.065454
0.086956	0.055204	0.057207	0.800633
0.034688	0.761022	0.103604	0.100685
0.058905	0.70455	0.020381	0.216164
0.191694	0.178141	0.569323	0.060841

MOTIF	Stomach_E15.5_H3K4me1_54_20_0.517_3.17958e-30
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.003545	0.966021	0.023542	0.006892
0.105585	0.043775	0.069508	0.781132
0.024619	0.031948	0.8588	0.084633
0.034173	0.057402	0.802912	0.105514
0.038041	0.141937	0.746773	0.073249
0.074908	0.807917	0.046487	0.070688
0.06356	0.058129	0.070637	0.807674
0.039142	0.771682	0.08775	0.101426
0.075951	0.693049	0.024825	0.206174
0.292489	0.101015	0.544083	0.062413

MOTIF	Stomach_P0_H3K4me1_59_11_0.522_7.359024e-19
letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.00874	0.939632	0.049968	0.00166
0.081135	0.032437	0.04173	0.844698
0.013122	0.070068	0.882632	0.034177
0.086476	0.064354	0.768753	0.080417
0.019376	0.178519	0.700322	0.101783
0.071301	0.831437	0.030138	0.067124
0.095875	0.06745	0.060743	0.775933
0.039461	0.801814	0.039634	0.119091
0.057908	0.852604	0.011514	0.077974
0.272208	0.30018	0.371524	0.056087
0.009801	0.382902	0.503339	0.103958
0.295254	0.173695	0.299182	0.231869
0.032069	0.29002	0.457207	0.220704

MOTIF	Heart_E16.5_H3K4me2_80_49_0.516_2.381451e-25
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.0	0.975486	0.024514	0.0
0.066929	0.033702	0.023856	0.875513
0.010682	0.13507	0.823798	0.03045
0.038214	0.190468	0.641163	0.130155
0.095155	0.060635	0.767352	0.076858
0.03709	0.85595	0.069684	0.037276
0.08569	0.022211	0.027717	0.864381
0.028548	0.795108	0.039659	0.136685
0.040621	0.687915	0.145662	0.125801
0.053221	0.157276	0.525184	0.264318
0.457904	0.038497	0.447724	0.055875