MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Forebrain_E14.5_H3K27me3_10_153_0.544_4.126018e-46 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.029 0.679 0.216 0.076 0.099 0.735 0.001 0.165 0.001 0.062 0.886 0.051 0.001 0.964 0.034 0.001 0.172 0.001 0.654 0.173 0.012 0.04 0.947 0.001 0.086 0.001 0.879 0.034 0.313 0.001 0.001 0.685 MOTIF Lung_E16.5_H3K27me3_13_152_0.567_1.804263e-74 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.017 0.841 0.081 0.061 0.037 0.878 0.001 0.084 0.026 0.051 0.87 0.053 0.001 0.963 0.035 0.001 0.181 0.001 0.817 0.001 0.025 0.026 0.925 0.024 0.038 0.035 0.91 0.017 0.047 0.072 0.001 0.88 MOTIF Stomach_E16.5_H3K27me3_19_152_0.544_1.087824e-48 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.021 0.867 0.001 0.111 0.001 0.888 0.001 0.11 0.053 0.06 0.857 0.03 0.001 0.949 0.023 0.027 0.193 0.025 0.742 0.04 0.001 0.054 0.876 0.069 0.014 0.001 0.984 0.001 0.082 0.001 0.001 0.916 MOTIF Liver_E14.5_H3K27me3_27_34_0.582_3.502205e-102 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.226048 0.510741 0.05154 0.211671 0.0 0.899491 0.0 0.100509 0.024494 0.01279 0.898157 0.064559 0.0 0.757201 0.0 0.242799 0.024013 0.035016 0.928956 0.012014 0.011099 0.0 0.869052 0.119849 0.03654 0.058728 0.802794 0.101938 0.073242 0.037662 0.0 0.889096 0.004036 0.889124 0.10684 0.0 MOTIF Cranio-Facial_E12.5_H3K4me2_27_28_0.619_2.055371e-312 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.036415 0.902813 0.031573 0.029199 0.005393 0.927049 0.039662 0.027896 0.026546 0.041682 0.91711 0.014662 0.042383 0.64962 0.061631 0.246365 0.00864 0.064705 0.920823 0.005832 0.014732 0.038976 0.571473 0.37482 0.112248 0.114058 0.763857 0.009837 0.070214 0.036513 0.0 0.893273 0.123718 0.760183 0.038824 0.077275 0.118329 0.047414 0.45711 0.377147 MOTIF Neural-Tube_E13.5_H3K4me2_29_43_0.624_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.932607 0.0 0.0 0.067393 0.264372 0.649328 0.05412 0.03218 0.214346 0.756038 0.021749 0.007867 0.00701 0.932993 0.048988 0.011008 0.031874 0.030071 0.925327 0.012728 0.206507 0.71547 0.057218 0.020805 0.040219 0.03046 0.8893 0.040021 0.038253 0.037301 0.808363 0.116083 0.110711 0.824884 0.049307 0.015098 MOTIF Neural-Tube_E15.5_H3K4me2_43_28_0.596_2.66163e-319 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.893438 0.0 0.0 0.106562 0.023836 0.81703 0.056296 0.102838 0.165077 0.771289 0.063634 0.0 0.020225 0.785095 0.017958 0.176722 0.02554 0.032157 0.942302 0.0 0.264894 0.712718 0.0 0.022388 0.002927 0.043297 0.899906 0.05387 0.153161 0.038665 0.73164 0.076533 0.082956 0.795332 0.106921 0.014791 0.605277 0.083828 0.272438 0.038457 MOTIF Hindbrain_E12.5_H3K4me3_33_60_0.652_2.059387e-310 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.890986 0.0 0.0 0.109014 0.05616 0.923798 0.0 0.020043 0.217179 0.752705 0.0 0.030116 0.011089 0.940603 0.029762 0.018547 0.11145 0.0 0.866123 0.022428 0.028534 0.87243 0.061636 0.0374 0.062323 0.037524 0.693952 0.206201 0.007999 0.035729 0.690509 0.265764 0.266797 0.701237 0.020724 0.011242 MOTIF Liver_E16.5_H3K4me3_51_43_0.598_3.002452e-318 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.776358 0.012143 0.038454 0.173045 0.043218 0.934176 0.0 0.022606 0.132635 0.837105 0.019601 0.01066 0.013248 0.931439 0.048439 0.006874 0.199657 0.099527 0.669061 0.031754 0.204228 0.689118 0.059052 0.047602 0.005204 0.01446 0.969654 0.010682 0.223594 0.065351 0.691749 0.019306 0.094849 0.78797 0.035347 0.081835 MOTIF Liver_E14.5_H3K4me3_45_47_0.626_3.69277e-310 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.795492 0.007344 0.037826 0.159338 0.009429 0.964332 0.0 0.026239 0.23371 0.683756 0.010938 0.071597 0.085164 0.827577 0.012108 0.075151 0.125498 0.0 0.707033 0.167468 0.017745 0.887208 0.055517 0.03953 0.027612 0.0 0.948459 0.023929 0.093075 0.032224 0.672917 0.201785 0.06161 0.859468 0.021642 0.05728 MOTIF Liver_P0_H3K4me3_32_27_0.645_1.51861e-319 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.689768 0.111393 0.035199 0.16364 0.01742 0.79255 0.050039 0.139991 0.130485 0.756122 0.033308 0.080086 0.058344 0.91108 0.023289 0.007287 0.200732 0.02408 0.583279 0.191908 0.013671 0.930438 0.053367 0.002523 0.021085 0.039686 0.870186 0.069043 0.114939 0.069643 0.80546 0.009958 0.05029 0.829758 0.012381 0.107571 MOTIF Forebrain_E15.5_H3K4me3_5_14_0.728_5.690648e-319 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.094555 0.731672 0.027617 0.146156 0.011161 0.897707 0.071118 0.020015 0.126451 0.713344 0.023082 0.137123 0.020582 0.039022 0.750502 0.189894 0.045326 0.814981 0.05208 0.087614 0.038911 0.039361 0.893146 0.028582 0.011288 0.012815 0.953559 0.022337 0.211237 0.70877 0.05317 0.026823 0.016077 0.022364 0.902016 0.059543 MOTIF Liver_E15.5_H3K4me3_3_6_0.700_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.049471 0.840413 0.006369 0.103747 0.074076 0.692836 0.096034 0.137054 0.06706 0.818133 0.043864 0.070944 0.08024 0.037098 0.797694 0.084968 0.096665 0.796294 0.058802 0.048239 0.054307 0.019827 0.877929 0.047937 0.029371 0.04411 0.829776 0.096742 0.116061 0.76774 0.038093 0.078106 0.013806 0.056185 0.837734 0.092276 MOTIF Lung_P0_H3K4me3_8_11_0.722_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.044316 0.81291 0.014838 0.127935 0.045033 0.771121 0.041828 0.142018 0.171646 0.766191 0.034706 0.027457 0.092372 0.022845 0.745372 0.139411 0.034203 0.838245 0.063796 0.063756 0.065619 0.027308 0.854794 0.052279 0.030813 0.027566 0.909226 0.032394 0.128545 0.681666 0.038041 0.151747 0.016264 0.0 0.939751 0.043985 MOTIF Neural-Tube_E11.5_H3K4me3_21_7_0.707_1.291839e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.089076 0.049848 0.608149 0.252927 0.046784 0.422759 0.27216 0.258297 0.225848 0.599481 0.016954 0.157718 0.063403 0.820365 0.039483 0.07675 0.021833 0.914791 0.015958 0.047418 0.177528 0.704964 0.047413 0.070094 0.072844 0.034743 0.833149 0.059264 0.14783 0.746208 0.080613 0.025349 0.03588 0.008502 0.908897 0.046721 0.028039 0.007018 0.924023 0.040921 0.14303 0.72717 0.090259 0.039541 0.033662 0.006126 0.830224 0.129989 MOTIF Liver_P0_H3K27me3_9_155_0.574_5.399123e-122 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.001 0.734 0.264 0.001 0.054 0.428 0.001 0.517 0.001 0.146 0.852 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.259 0.001 0.739 0.001 0.36 0.001 0.169 0.47 MOTIF Cranio-Facial_E12.5_H3K27me3_5_151_0.538_1.953519e-71 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.001 0.997 0.001 0.001 0.263 0.495 0.001 0.24 0.001 0.037 0.961 0.001 0.001 0.978 0.02 0.001 0.225 0.023 0.717 0.035 0.001 0.001 0.997 0.001 0.032 0.218 0.585 0.165 0.228 0.124 0.303 0.345 MOTIF Forebrain_P0_H3K27me3_8_152_0.538_1.699794e-38 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.034 0.882 0.001 0.083 0.158 0.717 0.001 0.124 0.001 0.078 0.821 0.1 0.001 0.997 0.001 0.001 0.058 0.001 0.84 0.101 0.086 0.001 0.874 0.039 0.001 0.001 0.863 0.135 0.111 0.138 0.338 0.412 MOTIF Hindbrain_P0_H3K27me3_14_155_0.531_8.323114e-22 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.064 0.735 0.001 0.2 0.182 0.726 0.001 0.091 0.001 0.002 0.821 0.176 0.001 0.897 0.031 0.071 0.226 0.001 0.641 0.132 0.001 0.001 0.869 0.129 0.102 0.001 0.665 0.232 0.37 0.19 0.088 0.352 MOTIF Intestine_E14.5_H3K27me3_6_151_0.574_8.693222e-146 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.121 0.539 0.339 0.001 0.136 0.572 0.001 0.291 0.001 0.026 0.947 0.026 0.001 0.975 0.023 0.001 0.193 0.001 0.702 0.104 0.001 0.027 0.971 0.001 0.023 0.151 0.763 0.063 0.178 0.037 0.322 0.463 MOTIF Heart_E15.5_H3K27me3_5_154_0.527_5.060618e-43 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.094 0.723 0.109 0.074 0.124 0.676 0.031 0.169 0.034 0.061 0.833 0.072 0.03 0.876 0.05 0.044 0.104 0.049 0.769 0.078 0.055 0.072 0.812 0.061 0.084 0.116 0.672 0.128 0.164 0.099 0.097 0.64 MOTIF Limb_E15.5_H3K27me3_1_153_0.539_1.806688e-63 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.078 0.769 0.074 0.079 0.137 0.636 0.039 0.188 0.02 0.076 0.862 0.042 0.03 0.913 0.035 0.022 0.093 0.038 0.787 0.082 0.099 0.052 0.794 0.055 0.088 0.145 0.67 0.097 0.138 0.112 0.176 0.574 MOTIF Liver_E11.5_H3K27me3_4_152_0.562_5.323623e-115 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.106 0.697 0.143 0.054 0.082 0.855 0.013 0.05 0.081 0.704 0.053 0.162 0.023 0.116 0.857 0.004 0.011 0.9 0.078 0.011 0.148 0.017 0.765 0.07 0.033 0.067 0.827 0.073 0.067 0.167 0.683 0.083 0.122 0.123 0.281 0.474 0.109 0.261 0.352 0.279 MOTIF Hindbrain_E14.5_H3K27me3_5_151_0.560_4.163803e-89 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.022 0.611 0.307 0.06 0.028 0.63 0.04 0.302 0.001 0.102 0.896 0.001 0.001 0.946 0.052 0.001 0.116 0.012 0.803 0.069 0.08 0.108 0.692 0.12 0.079 0.023 0.794 0.104 0.1 0.047 0.414 0.438 MOTIF Liver_E12.5_H3K27me3_2_151_0.530_3.527879e-90 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.132 0.641 0.133 0.094 0.001 0.73 0.001 0.268 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.965 0.033 0.001 0.062 0.001 0.821 0.116 0.042 0.001 0.809 0.148 0.099 0.152 0.501 0.248 0.131 0.078 0.464 0.326 MOTIF Lung_P0_H3K27me3_12_154_0.563_3.468477e-40 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.753 0.115 0.063 0.069 0.028 0.882 0.071 0.019 0.04 0.892 0.01 0.058 0.008 0.138 0.814 0.04 0.054 0.883 0.047 0.016 0.127 0.019 0.814 0.04 0.033 0.017 0.89 0.06 0.092 0.089 0.799 0.02 0.099 0.147 0.192 0.562 0.712 0.103 0.106 0.079 MOTIF Kidney_E14.5_H3K9ac_41_69_0.603_3.419983e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.865559 0.068696 0.0 0.065745 0.028452 0.918233 0.053316 0.0 0.035813 0.674928 0.022893 0.266367 0.123958 0.0 0.799614 0.076428 0.026637 0.956226 0.0 0.017137 0.055459 0.019746 0.924795 0.0 0.043087 0.051157 0.885757 0.019999 0.0 0.019839 0.698089 0.282072 0.045334 0.034463 0.617114 0.30309 MOTIF Midbrain_E13.5_H3K9ac_54_32_0.553_9.646442e-124 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.0 0.899099 0.034827 0.066074 0.864474 0.040926 0.013006 0.081593 0.0 0.99297 0.0 0.00703 0.258302 0.641556 0.018961 0.081181 0.01627 0.021772 0.88431 0.077647 0.039263 0.88475 0.032906 0.043081 0.190679 0.009593 0.754684 0.045044 0.182497 0.033825 0.777502 0.006176 0.077262 0.090263 0.792686 0.039788 0.431616 0.0 0.335324 0.23306