MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Hindbrain_E16.5_H3K27me3_65_128_0.503_1.55631e-10 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.025131 0.10139 0.707959 0.16552 0.06427 0.76942 0.045074 0.121236 0.0 0.997468 0.0 0.002532 0.85943 0.024405 0.077795 0.03837 0.0 0.205374 0.793032 0.001594 0.81133 0.008333 0.0 0.180337 0.021069 0.071751 0.888031 0.019149 0.047593 0.049516 0.723341 0.179551 0.10512 0.780188 0.012557 0.102135 MOTIF Hindbrain_E14.5_H3K4me1_86_139_0.507_5.845104e-08 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.0 0.916789 0.065727 0.017484 0.953483 0.02193 0.01846 0.006127 0.018929 0.059694 0.906887 0.014491 0.95379 0.021894 0.014493 0.009823 0.032736 0.025497 0.65237 0.289397 0.014385 0.032313 0.931631 0.021672 0.211291 0.750605 0.0 0.038105 0.861331 0.043915 0.069537 0.025217 0.178603 0.584764 0.042931 0.193702 0.195716 0.301846 0.48862 0.013818 0.015226 0.018921 0.437531 0.528321 MOTIF Neural-Tube_E14.5_H3K4me1_82_62_0.505_0.0003098984 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.007694 0.074222 0.879565 0.038519 0.045496 0.859292 0.021875 0.073337 0.002357 0.961741 0.026758 0.009144 0.906908 0.047381 0.01577 0.029941 0.008513 0.350548 0.635923 0.005016 0.801882 0.046194 0.061569 0.090355 0.00687 0.157827 0.668202 0.167101 0.045871 0.055564 0.826235 0.072331 0.074498 0.816022 0.045503 0.063977 0.697972 0.030108 0.254414 0.017506 0.014308 0.6825 0.016976 0.286216 0.412607 0.280838 0.279802 0.026753 MOTIF Stomach_E15.5_H3K4me1_85_113_0.507_1.910491e-15 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.025633 0.782847 0.0 0.19152 0.015698 0.958851 0.023139 0.002312 0.806795 0.136527 0.056678 0.0 0.012766 0.193345 0.791338 0.002551 0.88397 0.016374 0.086957 0.012699 0.0 0.147127 0.825616 0.027257 0.063345 0.048533 0.83187 0.056252 0.252337 0.736365 0.0 0.011298 0.738743 0.131952 0.121258 0.008046 MOTIF Cranio-Facial_E15.5_H3K27ac_86_67_0.510_1.686852e-09 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.010148 0.095983 0.711779 0.182091 0.062121 0.774542 0.056293 0.107044 0.003446 0.775008 0.219085 0.002461 0.801748 0.039529 0.064487 0.094236 0.0 0.023502 0.976498 0.0 0.851644 0.044645 0.051269 0.052442 0.040511 0.011505 0.863677 0.084308 0.167218 0.013497 0.718962 0.100324 0.063727 0.923142 0.009678 0.003453 0.0 0.914243 0.085757 0.0 MOTIF Hindbrain_P0_H3K27ac_84_108_0.501_0.001599435 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.06594 0.066828 0.746275 0.120956 0.058668 0.798881 0.046731 0.095721 0.003338 0.907281 0.08938 0.0 0.778184 0.06137 0.067449 0.092997 0.0 0.242377 0.757623 0.0 0.840226 0.026668 0.045165 0.087941 0.004321 0.033397 0.953508 0.008774 0.178225 0.006983 0.67898 0.135812 0.1322 0.831093 0.036707 0.0 MOTIF Intestine_E14.5_H3K27ac_104_130_0.502_8.61256e-05 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.004802 0.036202 0.802405 0.156591 0.04951 0.723883 0.049169 0.177438 0.001876 0.967539 0.030585 0.0 0.769372 0.043738 0.019909 0.166982 0.0 0.053937 0.94467 0.001393 0.868971 0.016845 0.047155 0.067029 0.024569 0.042789 0.870424 0.062219 0.216825 0.0 0.581474 0.201701 0.176083 0.799062 0.00996 0.014895 MOTIF Cranio-Facial_E11.5_H3K27ac_68_72_0.519_4.487841e-12 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.084932 0.065454 0.826927 0.022687 0.109179 0.721395 0.044843 0.124583 0.005291 0.918419 0.07629 0.0 0.697421 0.206643 0.039669 0.056267 0.008047 0.239013 0.752255 0.000686 0.861861 0.059841 0.041449 0.036849 0.008853 0.205637 0.733763 0.051746 0.139966 0.034778 0.66483 0.160426 0.015912 0.901663 0.060914 0.021511 0.187964 0.06288 0.167909 0.581247 0.12351 0.447006 0.212581 0.216903 MOTIF Kidney_P0_H3K27ac_71_86_0.509_2.184938e-11 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.210225 0.139841 0.344789 0.305145 0.018023 0.294356 0.439547 0.248073 0.034717 0.078165 0.727439 0.159679 0.122868 0.740865 0.00977 0.126497 0.004853 0.874202 0.120945 0.0 0.827065 0.049297 0.038652 0.084986 0.00858 0.173898 0.817522 0.0 0.830991 0.048493 0.040378 0.080137 0.01097 0.04663 0.902674 0.039726 0.033113 0.088816 0.730285 0.147785 0.089043 0.84588 0.032894 0.032183 0.208895 0.05653 0.307571 0.427003 MOTIF Cranio-Facial_E13.5_H3K27ac_81_42_0.510_4.600284e-15 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.482857 0.123785 0.0 0.393358 0.031562 0.757821 0.193607 0.01701 0.093771 0.729294 0.055383 0.121552 0.0034 0.883869 0.110711 0.002021 0.693398 0.169175 0.065923 0.071504 0.010687 0.0531 0.935905 0.000308 0.764088 0.028612 0.057418 0.149882 0.017175 0.090931 0.862631 0.029264 0.097491 0.018657 0.749778 0.134074 0.080976 0.890919 0.017275 0.01083 0.034398 0.676091 0.145417 0.144094 MOTIF Heart_E16.5_H3K27ac_94_82_0.502_1.989982e-12 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.043943 0.787477 0.144788 0.023792 0.182142 0.74524 0.014011 0.058608 0.0 0.983743 0.016257 0.0 0.849165 0.046732 0.053653 0.050449 0.00936 0.055611 0.93469 0.000339 0.692083 0.021338 0.069852 0.216726 0.091942 0.121957 0.77148 0.014621 0.060268 0.024767 0.757417 0.157549 0.025941 0.894784 0.034887 0.044389 0.052346 0.513741 0.181769 0.252144 MOTIF Intestine_E16.5_H3K27ac_94_97_0.501_4.642103e-13 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.014799 0.654901 0.135947 0.194353 0.236948 0.700577 0.040223 0.022252 0.0 0.988052 0.011948 0.0 0.880335 0.040438 0.036192 0.043035 0.032509 0.042359 0.923998 0.001135 0.825419 0.023837 0.04519 0.105553 0.075392 0.025623 0.878494 0.020491 0.06539 0.020633 0.595864 0.318113 0.133546 0.815532 0.0238 0.027121 0.073176 0.560147 0.113158 0.253519 MOTIF Limb_E11.5_H3K27ac_80_104_0.510_1.207354e-06 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.292332 0.640339 0.024279 0.04305 0.0 0.911499 0.084277 0.004224 0.854697 0.062608 0.027071 0.055624 0.037716 0.07955 0.882734 0.0 0.920427 0.013193 0.042639 0.02374 0.065836 0.173509 0.729026 0.03163 0.230758 0.0 0.726764 0.042478 0.114591 0.824462 0.060947 0.0 0.127524 0.693391 0.153136 0.025949 MOTIF Hindbrain_E12.5_H3K27ac_77_101_0.513_1.93294e-18 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.021741 0.736251 0.232032 0.009976 0.31063 0.632079 0.004984 0.052307 0.008091 0.958851 0.029768 0.003291 0.87513 0.039398 0.063072 0.0224 0.047421 0.04586 0.906719 0.0 0.814123 0.017298 0.053532 0.115047 0.104434 0.011093 0.849054 0.03542 0.040097 0.039726 0.789431 0.130745 0.263215 0.705188 0.020327 0.01127 0.224217 0.04649 0.615155 0.114139 MOTIF Kidney_E15.5_H3K27ac_86_58_0.506_2.758444e-11 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.598799 0.096173 0.063765 0.241264 0.042142 0.74302 0.150109 0.064729 0.133977 0.762392 0.042549 0.061082 0.002882 0.828623 0.167456 0.001038 0.801792 0.085101 0.064121 0.048986 0.006411 0.05064 0.942949 0.0 0.801822 0.051796 0.048393 0.09799 0.066771 0.01923 0.897078 0.016921 0.167548 0.070695 0.705563 0.056195 0.116468 0.810967 0.039644 0.032921 MOTIF Neural-Tube_E11.5_H3K27ac_85_80_0.508_4.046118e-12 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.006754 0.753082 0.191525 0.048639 0.187289 0.714199 0.049212 0.0493 0.005335 0.853449 0.141216 0.0 0.829537 0.074546 0.063506 0.032411 0.023627 0.056856 0.919517 0.0 0.839938 0.042739 0.038265 0.079058 0.072054 0.025964 0.888231 0.013751 0.166307 0.043519 0.689977 0.100197 0.164615 0.73032 0.067482 0.037583 MOTIF Kidney_E14.5_H3K27ac_66_51_0.519_6.899994e-16 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.012544 0.783326 0.137353 0.066776 0.046702 0.677449 0.122373 0.153476 0.0065 0.856628 0.117477 0.019395 0.702879 0.027682 0.205728 0.063712 0.003504 0.058041 0.936002 0.002453 0.872143 0.031668 0.050274 0.045915 0.084444 0.082364 0.81487 0.018322 0.135619 0.038568 0.772322 0.053491 0.069447 0.862683 0.043901 0.023969 0.310849 0.188195 0.356298 0.144658 0.251241 0.705104 0.014527 0.029128 0.4956 0.024013 0.418365 0.062022 MOTIF Neural-Tube_E13.5_H3K27ac_46_23_0.526_2.216004e-33 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.035686 0.840764 0.047549 0.076001 0.071405 0.623443 0.11366 0.191491 0.010826 0.838223 0.148502 0.002449 0.653393 0.201117 0.122366 0.023124 0.005598 0.051194 0.942363 0.000845 0.788502 0.057726 0.065375 0.088397 0.054245 0.085659 0.845198 0.014898 0.082836 0.054487 0.808501 0.054176 0.124467 0.827729 0.017406 0.030398 0.224368 0.038185 0.4564 0.281047 0.012886 0.83716 0.026187 0.123766 0.489945 0.237364 0.272692 0.0 MOTIF Lung_E14.5_H3K4me1_57_29_0.512_1.057956e-14 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.004938 0.565432 0.355148 0.074481 0.052083 0.838687 0.031314 0.077916 0.007397 0.876944 0.068839 0.046819 0.735333 0.039309 0.173455 0.051904 0.014741 0.062797 0.920128 0.002334 0.800012 0.015284 0.042436 0.142268 0.020707 0.107421 0.854094 0.017778 0.166199 0.032427 0.722913 0.078461 0.029733 0.871917 0.039346 0.059004 0.116007 0.209403 0.663475 0.011115 0.001659 0.351889 0.048945 0.597508 0.003102 0.352751 0.623706 0.020442 0.035422 0.266705 0.006507 0.691366 MOTIF Midbrain_E12.5_H3K4me1_85_36_0.507_1.76898e-09 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.039805 0.800107 0.114535 0.045553 0.163704 0.681631 0.011602 0.143063 0.016777 0.948964 0.027776 0.006482 0.703169 0.090635 0.137558 0.068638 0.024699 0.118292 0.856074 0.000935 0.806263 0.035985 0.03944 0.118313 0.051378 0.060242 0.859716 0.028665 0.096441 0.052028 0.738493 0.113038 0.029254 0.912579 0.032956 0.025211 0.070535 0.489366 0.236642 0.203456 0.369463 0.38158 0.010352 0.238605 0.007857 0.454321 0.492796 0.045025 0.043646 0.227674 0.019537 0.709143 MOTIF Kidney_E14.5_H3K4me1_71_48_0.512_2.397177e-10 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.240187 0.266247 0.050984 0.442582 0.026881 0.767621 0.122027 0.083471 0.038178 0.772661 0.101173 0.087988 0.000628 0.902977 0.096395 0.0 0.889541 0.040747 0.047363 0.022349 0.002017 0.058859 0.938829 0.000295 0.764296 0.041983 0.087016 0.106705 0.263493 0.110146 0.606629 0.019731 0.077192 0.007423 0.855683 0.059702 0.094439 0.838114 0.034011 0.033436 0.089232 0.542761 0.178303 0.189704 0.027605 0.928312 0.035895 0.008188 0.028338 0.537781 0.040188 0.393694 MOTIF Heart_E11.5_H3K4me1_96_54_0.504_1.230381e-05 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.153431 0.620517 0.020995 0.205057 0.0 0.959176 0.015048 0.025776 0.802296 0.020474 0.095047 0.082183 0.013692 0.151603 0.833533 0.001172 0.877454 0.013914 0.03788 0.070752 0.054993 0.041504 0.883138 0.020365 0.229616 0.033021 0.503788 0.233575 0.055786 0.902838 0.007185 0.034192 0.029205 0.852093 0.102187 0.016516 0.0 0.629277 0.200452 0.170271 MOTIF Lung_P0_H3K4me1_97_35_0.502_6.098413e-05 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.017301 0.900495 0.059746 0.022458 0.095379 0.743682 0.018658 0.14228 0.009436 0.863009 0.109327 0.018228 0.665013 0.124011 0.134384 0.076591 0.013671 0.075468 0.908256 0.002605 0.764556 0.029444 0.038843 0.167157 0.014901 0.146352 0.826278 0.012469 0.111658 0.0 0.690086 0.198257 0.036381 0.895139 0.048894 0.019586 0.37336 0.498605 0.074353 0.053682 0.06608 0.571742 0.018375 0.343803 MOTIF Cranio-Facial_E12.5_H3K4me1_92_41_0.506_2.179283e-08 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.038887 0.838874 0.07888 0.043359 0.150117 0.666377 0.020168 0.163338 0.030257 0.935703 0.01514 0.0189 0.794643 0.038458 0.13296 0.033938 0.013191 0.087318 0.897978 0.001513 0.86134 0.034945 0.022228 0.081486 0.06481 0.053525 0.839682 0.041984 0.113233 0.074184 0.679334 0.133249 0.055541 0.905625 0.014043 0.024791 0.223733 0.48763 0.134953 0.153683 MOTIF Cranio-Facial_E14.5_H3K4me1_85_32_0.509_7.083223e-10 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.14398 0.052648 0.387892 0.41548 0.017959 0.780006 0.168423 0.033612 0.08546 0.70098 0.07008 0.143479 0.014415 0.902229 0.067555 0.015802 0.802512 0.035846 0.104255 0.057387 0.007235 0.050326 0.941069 0.00137 0.814518 0.017074 0.042626 0.125782 0.069861 0.0501 0.858337 0.021701 0.13813 0.061367 0.740503 0.059999 0.08727 0.786572 0.082657 0.043501 0.159734 0.544378 0.204713 0.091174 MOTIF Limb_E12.5_H3K4me1_86_34_0.505_1.034406e-09 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.036302 0.066742 0.466103 0.430853 0.052598 0.778956 0.095839 0.072607 0.073187 0.709168 0.028872 0.188773 0.013489 0.889329 0.076684 0.020498 0.78731 0.039371 0.146762 0.026557 0.002851 0.05976 0.937084 0.000306 0.867486 0.02397 0.012414 0.096131 0.036296 0.050179 0.886749 0.026776 0.15528 0.070613 0.624194 0.149913 0.052773 0.912155 0.009014 0.026058 0.20887 0.408587 0.30929 0.073252 MOTIF Limb_E14.5_H3K4me1_103_72_0.506_1.709956e-09 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.035203 0.631828 0.224954 0.108016 0.079859 0.74881 0.012441 0.15889 0.0 0.963457 0.02117 0.015373 0.755385 0.045009 0.123626 0.075979 0.004559 0.019442 0.973632 0.002366 0.810839 0.020931 0.012733 0.155498 0.033606 0.045043 0.88631 0.035042 0.194652 0.002954 0.683004 0.11939 0.056449 0.836572 0.072662 0.034318 MOTIF Stomach_E14.5_H3K4me1_80_34_0.508_4.03281e-10 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.24696 0.059668 0.222179 0.471193 0.038614 0.688473 0.24797 0.024944 0.057854 0.721004 0.018895 0.202247 0.014252 0.961627 0.018546 0.005575 0.579774 0.191511 0.147775 0.08094 0.008064 0.031296 0.959414 0.001226 0.838543 0.016118 0.037024 0.108314 0.02189 0.049565 0.908225 0.02032 0.179668 0.028425 0.723986 0.067921 0.070225 0.840441 0.054083 0.035251 0.125877 0.398694 0.435531 0.039897