MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Hindbrain_E16.5_H3K4me3_54_164_0.606_3.985033e-274 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.085 0.744 0.07 0.101 0.088 0.073 0.734 0.105 0.098 0.681 0.113 0.108 0.126 0.674 0.097 0.103 0.104 0.095 0.113 0.688 0.701 0.092 0.113 0.094 0.705 0.092 0.099 0.104 0.105 0.092 0.09 0.713 0.108 0.107 0.096 0.689 0.672 0.105 0.12 0.103 MOTIF Forebrain_E12.5_H3K4me3_42_160_0.628_8.703146e-251 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.206 0.061 0.124 0.609 0.794 0.031 0.072 0.103 0.715 0.051 0.067 0.167 0.164 0.055 0.03 0.751 0.143 0.098 0.063 0.696 0.595 0.081 0.132 0.192 0.211 0.419 0.156 0.214 0.164 0.182 0.173 0.482 0.195 0.638 0.063 0.104 0.072 0.111 0.726 0.091 MOTIF Heart_E11.5_H3K4me3_43_160_0.617_2.181488e-226 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.198 0.089 0.119 0.594 0.678 0.066 0.09 0.166 0.607 0.096 0.115 0.182 0.172 0.118 0.087 0.623 0.187 0.135 0.096 0.582 0.601 0.117 0.116 0.166 0.174 0.479 0.176 0.172 0.153 0.156 0.176 0.515 0.18 0.643 0.072 0.105 0.091 0.125 0.678 0.106 MOTIF Hindbrain_E15.5_H3K4me3_69_172_0.586_3.691764e-153 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.098 0.099 0.1 0.703 0.704 0.085 0.096 0.115 0.693 0.09 0.093 0.124 0.117 0.079 0.092 0.712 0.099 0.109 0.08 0.712 0.701 0.084 0.108 0.107 0.092 0.679 0.133 0.096 0.112 0.117 0.08 0.691 0.122 0.681 0.102 0.095 0.086 0.087 0.726 0.101 MOTIF Hindbrain_E15.5_H3K4me3_31_153_0.665_7.060542e-310 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.01 0.788 0.005 0.197 0.008 0.009 0.699 0.284 0.329 0.003 0.324 0.344 0.293 0.183 0.238 0.287 0.27 0.226 0.212 0.293 0.259 0.212 0.228 0.302 0.325 0.187 0.229 0.259 0.253 0.229 0.201 0.317 0.005 0.005 0.008 0.982 0.266 0.231 0.207 0.297 MOTIF Lung_P0_H3K4me3_17_156_0.697_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.409 0.001 0.263 0.328 0.961 0.001 0.001 0.037 0.412 0.124 0.21 0.254 0.265 0.247 0.134 0.354 0.28 0.258 0.089 0.373 0.29 0.218 0.234 0.257 0.257 0.283 0.251 0.209 0.245 0.247 0.24 0.268 0.278 0.72 0.001 0.001 0.001 0.215 0.783 0.001 MOTIF Midbrain_P0_H3K4me3_20_153_0.703_3.653488e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.206 0.792 0.001 0.001 0.001 0.001 0.923 0.075 0.252 0.252 0.176 0.32 0.255 0.226 0.242 0.277 0.313 0.447 0.001 0.239 0.276 0.005 0.4 0.319 0.325 0.189 0.261 0.224 0.314 0.215 0.001 0.47 0.001 0.001 0.001 0.997 0.294 0.165 0.001 0.54 MOTIF Hindbrain_E14.5_H3K4me2_22_151_0.639_4.440683e-313 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.013 0.944 0.042 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.251 0.191 0.268 0.29 0.174 0.233 0.285 0.309 0.259 0.356 0.218 0.167 0.351 0.004 0.188 0.457 0.291 0.128 0.353 0.227 0.605 0.001 0.001 0.393 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.997 MOTIF Stomach_P0_H3K4me2_18_154_0.634_4.485684e-312 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.997 0.001 0.001 0.001 0.661 0.034 0.003 0.302 0.249 0.229 0.181 0.34 0.293 0.211 0.192 0.304 0.271 0.302 0.182 0.245 0.287 0.231 0.164 0.318 0.285 0.202 0.202 0.311 0.001 0.293 0.269 0.437 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 MOTIF Liver_E16.5_H3K4me3_33_167_0.630_3.544556e-310 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.663 0.106 0.105 0.126 0.105 0.098 0.12 0.677 0.075 0.101 0.076 0.748 0.084 0.103 0.103 0.71 0.085 0.738 0.078 0.099 0.114 0.087 0.697 0.102 0.103 0.119 0.657 0.121 0.11 0.104 0.114 0.672 0.101 0.72 0.085 0.094 0.092 0.095 0.716 0.097 MOTIF Forebrain_E13.5_H3K4me3_71_173_0.580_1.802656e-100 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.338 0.18 0.301 0.181 0.07 0.448 0.209 0.273 0.248 0.059 0.111 0.582 0.217 0.058 0.164 0.561 0.289 0.005 0.192 0.514 0.254 0.214 0.006 0.526 0.166 0.635 0.059 0.14 0.417 0.113 0.34 0.13 0.006 0.353 0.24 0.402 0.122 0.076 0.111 0.691 0.263 0.492 0.059 0.186 0.225 0.148 0.481 0.147 MOTIF Intestine_P0_H3K4me3_52_164_0.604_6.704166e-201 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.14 0.128 0.597 0.135 0.159 0.55 0.131 0.16 0.618 0.108 0.148 0.126 0.585 0.124 0.157 0.134 0.142 0.127 0.118 0.613 0.126 0.146 0.126 0.602 0.136 0.625 0.111 0.128 0.128 0.123 0.608 0.141 0.126 0.14 0.145 0.589 0.145 0.128 0.117 0.61 MOTIF Neural-Tube_E14.5_H3K4me3_40_167_0.651_6.021263e-315 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.966 0.001 0.01 0.023 0.696 0.035 0.055 0.214 0.351 0.017 0.019 0.613 0.087 0.267 0.071 0.575 0.314 0.504 0.016 0.166 0.092 0.074 0.533 0.301 0.165 0.222 0.239 0.374 0.154 0.086 0.116 0.644 0.139 0.656 0.001 0.204 0.104 0.062 0.749 0.085 MOTIF Kidney_E15.5_H3K4me3_26_160_0.671_6.552726e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.5 0.138 0.177 0.185 0.581 0.068 0.177 0.174 0.173 0.105 0.159 0.563 0.047 0.329 0.086 0.538 0.107 0.782 0.034 0.077 0.085 0.072 0.73 0.113 0.078 0.191 0.236 0.495 0.024 0.199 0.075 0.702 0.097 0.717 0.001 0.185 0.145 0.198 0.479 0.177 MOTIF Hindbrain_E16.5_H3K4me3_33_158_0.644_2.179613e-316 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.708 0.093 0.099 0.1 0.696 0.098 0.099 0.107 0.102 0.09 0.107 0.701 0.078 0.105 0.098 0.719 0.121 0.693 0.092 0.094 0.116 0.113 0.67 0.101 0.085 0.11 0.099 0.706 0.074 0.107 0.101 0.718 0.113 0.701 0.081 0.105 0.109 0.109 0.692 0.09 MOTIF Cranio-Facial_E12.5_H3K4me3_48_162_0.650_2.100956e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.714 0.083 0.09 0.113 0.694 0.094 0.108 0.104 0.091 0.094 0.11 0.705 0.102 0.086 0.095 0.717 0.102 0.699 0.087 0.112 0.109 0.103 0.668 0.12 0.1 0.107 0.108 0.685 0.083 0.105 0.097 0.715 0.107 0.694 0.076 0.123 0.091 0.098 0.71 0.101 MOTIF Limb_E12.5_H3K4me3_31_158_0.642_3.791811e-313 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.734 0.077 0.098 0.091 0.698 0.1 0.1 0.102 0.081 0.091 0.105 0.723 0.087 0.104 0.103 0.706 0.107 0.698 0.09 0.105 0.106 0.12 0.66 0.114 0.109 0.107 0.107 0.677 0.08 0.11 0.102 0.708 0.111 0.709 0.073 0.107 0.103 0.104 0.689 0.104 MOTIF Hindbrain_E14.5_H3K4me3_25_161_0.690_1.575986e-313 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.658 0.09 0.148 0.104 0.532 0.137 0.15 0.181 0.169 0.116 0.096 0.619 0.126 0.158 0.126 0.59 0.153 0.608 0.074 0.165 0.083 0.144 0.603 0.17 0.158 0.161 0.179 0.502 0.147 0.159 0.174 0.52 0.096 0.706 0.025 0.173 0.077 0.135 0.694 0.094 MOTIF Neural-Tube_E15.5_H3K4me3_24_160_0.673_4.721233e-314 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.662 0.083 0.145 0.11 0.573 0.132 0.137 0.158 0.174 0.113 0.121 0.592 0.134 0.202 0.09 0.574 0.146 0.62 0.126 0.108 0.138 0.072 0.632 0.158 0.164 0.185 0.181 0.471 0.095 0.14 0.113 0.652 0.16 0.613 0.054 0.173 0.117 0.134 0.612 0.137 MOTIF Midbrain_E13.5_H3K4me3_25_164_0.678_4.768964e-310 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.662 0.086 0.133 0.119 0.56 0.14 0.144 0.156 0.183 0.131 0.13 0.556 0.152 0.168 0.157 0.523 0.146 0.645 0.078 0.131 0.112 0.079 0.634 0.175 0.129 0.144 0.164 0.563 0.158 0.146 0.117 0.579 0.139 0.626 0.068 0.167 0.122 0.116 0.654 0.108 MOTIF Cranio-Facial_E11.5_H3K4me3_31_158_0.672_4.852144e-312 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.61 0.124 0.134 0.132 0.581 0.133 0.143 0.143 0.146 0.135 0.139 0.58 0.13 0.146 0.125 0.599 0.141 0.599 0.126 0.134 0.13 0.124 0.602 0.144 0.125 0.139 0.141 0.595 0.12 0.138 0.128 0.614 0.134 0.606 0.116 0.144 0.124 0.137 0.612 0.127 MOTIF Stomach_E16.5_H3K4me3_32_166_0.649_4.172514e-312 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.612 0.119 0.136 0.133 0.597 0.135 0.134 0.134 0.152 0.127 0.137 0.584 0.127 0.147 0.133 0.593 0.137 0.604 0.125 0.134 0.133 0.121 0.608 0.138 0.135 0.141 0.136 0.588 0.128 0.145 0.13 0.597 0.137 0.61 0.112 0.141 0.13 0.13 0.607 0.133 MOTIF Kidney_E14.5_H3K4me3_24_154_0.688_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.89 0.039 0.032 0.039 0.859 0.049 0.042 0.05 0.425 0.014 0.028 0.533 0.233 0.225 0.259 0.283 0.11 0.814 0.048 0.028 0.062 0.047 0.814 0.077 0.454 0.006 0.497 0.043 0.305 0.188 0.285 0.222 0.042 0.863 0.061 0.034 0.041 0.068 0.832 0.059 MOTIF Limb_E14.5_H3K4me3_38_163_0.654_1.900752e-312 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.768 0.062 0.084 0.086 0.702 0.095 0.09 0.113 0.097 0.106 0.097 0.7 0.085 0.125 0.11 0.68 0.104 0.704 0.092 0.1 0.118 0.1 0.693 0.089 0.69 0.107 0.121 0.082 0.708 0.099 0.109 0.084 0.14 0.682 0.095 0.083 0.1 0.109 0.671 0.12 MOTIF Kidney_E16.5_H3K4me2_90_173_0.522_6.773296e-28 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.114 0.102 0.682 0.102 0.141 0.627 0.131 0.101 0.74 0.094 0.074 0.092 0.696 0.109 0.118 0.077 0.686 0.098 0.122 0.094 0.118 0.668 0.131 0.083 0.73 0.063 0.086 0.121 0.13 0.107 0.688 0.075 0.69 0.13 0.104 0.076 0.664 0.108 0.14 0.088 0.169 0.558 0.139 0.134 0.134 0.142 0.569 0.155 MOTIF Liver_E12.5_H3K4me2_28_156_0.575_8.960267e-167 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.207 0.5 0.219 0.075 0.031 0.137 0.459 0.373 0.175 0.168 0.165 0.491 0.003 0.139 0.242 0.616 0.178 0.452 0.162 0.208 0.261 0.236 0.28 0.223 0.193 0.185 0.439 0.183 0.223 0.212 0.004 0.561 0.042 0.011 0.197 0.75 0.243 0.083 0.061 0.613 MOTIF Intestine_P0_H3K4me2_9_159_0.631_4.357048e-311 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.853 0.006 0.14 0.001 0.724 0.009 0.258 0.009 0.694 0.117 0.061 0.128 0.219 0.18 0.509 0.092 0.144 0.665 0.117 0.074 0.283 0.001 0.688 0.028 0.649 0.229 0.108 0.014 0.5 0.108 0.261 0.131 0.044 0.91 0.032 0.014 0.016 0.02 0.883 0.081 MOTIF Lung_E16.5_H3K4me2_14_156_0.623_3.086454e-310 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.718 0.102 0.096 0.084 0.73 0.094 0.097 0.079 0.661 0.105 0.117 0.117 0.112 0.67 0.123 0.095 0.111 0.674 0.129 0.086 0.096 0.102 0.721 0.081 0.703 0.088 0.106 0.103 0.124 0.114 0.665 0.097 0.092 0.742 0.073 0.093 0.096 0.083 0.717 0.104 MOTIF Limb_E14.5_H3K9ac_7_162_0.641_2.825674e-310 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.721 0.059 0.156 0.064 0.807 0.031 0.109 0.053 0.615 0.071 0.16 0.154 0.13 0.657 0.13 0.083 0.144 0.671 0.142 0.043 0.104 0.027 0.84 0.029 0.637 0.117 0.15 0.096 0.163 0.159 0.527 0.151 0.064 0.897 0.017 0.022 0.042 0.1 0.706 0.152