MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Cranio-Facial_E13.5_H3K27me3_53_159_0.507_0.0008751774
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.094	0.089	0.09	0.727
0.731	0.102	0.08	0.087
0.759	0.088	0.069	0.084
0.093	0.074	0.073	0.76
0.08	0.083	0.082	0.755
0.722	0.088	0.088	0.102
0.099	0.084	0.074	0.743
0.06	0.095	0.066	0.779
0.079	0.083	0.075	0.763
0.085	0.736	0.084	0.095
0.093	0.77	0.036	0.101
0.099	0.759	0.039	0.103

MOTIF	Liver_E11.5_H3K27me3_41_164_0.514_3.459575e-09
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.041	0.001	0.829	0.129
0.112	0.001	0.802	0.085
0.069	0.011	0.838	0.082
0.769	0.065	0.115	0.051
0.843	0.065	0.057	0.035
0.675	0.082	0.112	0.131
0.028	0.107	0.129	0.736
0.743	0.032	0.11	0.115
0.741	0.069	0.082	0.108
0.132	0.014	0.095	0.759
0.105	0.108	0.11	0.677
0.62	0.129	0.127	0.124

MOTIF	Forebrain_E14.5_H3K27ac_34_158_0.541_8.326374e-47
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.092	0.097	0.715	0.096
0.107	0.71	0.084	0.099
0.777	0.089	0.035	0.099
0.693	0.075	0.102	0.13
0.085	0.058	0.071	0.786
0.073	0.093	0.105	0.729
0.699	0.117	0.102	0.082
0.079	0.082	0.057	0.782
0.048	0.092	0.055	0.805
0.056	0.068	0.054	0.822
0.073	0.74	0.077	0.11
0.113	0.744	0.028	0.115

MOTIF	Forebrain_E15.5_H3K27ac_31_168_0.540_3.76627e-63
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.218	0.121	0.636	0.025
0.021	0.572	0.157	0.25
0.831	0.008	0.009	0.152
0.722	0.015	0.085	0.178
0.213	0.01	0.006	0.771
0.012	0.282	0.014	0.692
0.69	0.141	0.159	0.01
0.117	0.206	0.007	0.67
0.055	0.152	0.005	0.788
0.007	0.191	0.009	0.793
0.085	0.698	0.098	0.119
0.13	0.768	0.008	0.094

MOTIF	Hindbrain_E13.5_H3K4me1_19_153_0.539_4.196691e-137
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.124	0.028	0.739	0.109
0.109	0.088	0.703	0.1
0.717	0.11	0.1	0.073
0.751	0.075	0.12	0.054
0.727	0.09	0.114	0.069
0.017	0.09	0.075	0.818
0.747	0.057	0.105	0.091
0.825	0.041	0.038	0.096
0.093	0.058	0.087	0.762
0.112	0.025	0.082	0.781
0.118	0.094	0.691	0.097
0.11	0.739	0.079	0.072

MOTIF	Cranio-Facial_E15.5_H3K4me2_74_170_0.562_1.652271e-117
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.111	0.095	0.696	0.098
0.765	0.086	0.065	0.084
0.795	0.071	0.077	0.057
0.74	0.083	0.079	0.098
0.089	0.076	0.098	0.737
0.111	0.106	0.097	0.686
0.682	0.104	0.107	0.107
0.087	0.092	0.065	0.756
0.052	0.071	0.051	0.826
0.047	0.076	0.056	0.821
0.074	0.743	0.083	0.1
0.099	0.756	0.034	0.111

MOTIF	Limb_E13.5_H3K4me2_49_169_0.571_1.305589e-170
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7

MOTIF	Neural-Tube_E11.5_H3K4me3_61_168_0.601_9.688069e-164
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.1	0.1	0.1	0.7
0.7	0.1	0.1	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7

MOTIF	Forebrain_E15.5_H3K4me3_52_168_0.608_2.387727e-211
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.633	0.116	0.122	0.129
0.615	0.118	0.126	0.141
0.144	0.129	0.136	0.591
0.156	0.146	0.117	0.581
0.155	0.146	0.524	0.175
0.141	0.139	0.131	0.589
0.126	0.127	0.117	0.63
0.134	0.127	0.135	0.604
0.136	0.611	0.112	0.141
0.124	0.125	0.625	0.126

MOTIF	Hindbrain_E12.5_H3K4me3_59_162_0.593_1.152391e-132
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.633	0.103	0.147	0.117
0.598	0.098	0.138	0.166
0.155	0.131	0.149	0.565
0.166	0.109	0.103	0.622
0.159	0.17	0.526	0.145
0.145	0.159	0.126	0.57
0.103	0.114	0.111	0.672
0.116	0.16	0.044	0.68
0.165	0.546	0.139	0.15
0.136	0.152	0.583	0.129

MOTIF	Hindbrain_P0_H3K4me3_56_167_0.596_9.215459e-152
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.824	0.039	0.011	0.126
0.957	0.017	0.01	0.016
0.251	0.039	0.229	0.481
0.132	0.249	0.121	0.498
0.6	0.122	0.141	0.137
0.182	0.122	0.111	0.585
0.002	0.008	0.004	0.986
0.075	0.021	0.035	0.869
0.15	0.753	0.041	0.056
0.272	0.193	0.48	0.055

MOTIF	Lung_E14.5_H3K4me3_74_173_0.574_9.253778e-90
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.732	0.072	0.14	0.056
0.666	0.059	0.202	0.073
0.222	0.118	0.144	0.516
0.518	0.055	0.202	0.225
0.134	0.65	0.047	0.169
0.125	0.051	0.068	0.756
0.061	0.056	0.053	0.83
0.144	0.066	0.118	0.672
0.098	0.414	0.186	0.301
0.163	0.158	0.478	0.201

MOTIF	Forebrain_E12.5_H3K4me3_57_166_0.592_1.030007e-151
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.597	0.136	0.122	0.145
0.161	0.142	0.544	0.153
0.16	0.127	0.136	0.577
0.612	0.117	0.125	0.146
0.603	0.128	0.136	0.133
0.163	0.595	0.118	0.124
0.13	0.13	0.595	0.145
0.132	0.135	0.119	0.614
0.124	0.122	0.112	0.642
0.139	0.129	0.112	0.62

MOTIF	Midbrain_E16.5_H3K4me3_32_152_0.665_4.965774e-310
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.038	0.859	0.051	0.052
0.083	0.001	0.907	0.009
0.572	0.155	0.191	0.082
0.948	0.001	0.025	0.026
0.494	0.109	0.22	0.176
0.215	0.525	0.061	0.199
0.185	0.042	0.594	0.179
0.335	0.094	0.161	0.41
0.148	0.049	0.001	0.802
0.136	0.02	0.006	0.838

MOTIF	Limb_E11.5_H3K4me3_40_161_0.674_1.148619e-310
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.074	0.755	0.131	0.04
0.108	0.115	0.635	0.142
0.454	0.178	0.108	0.26
0.607	0.157	0.143	0.093
0.35	0.142	0.157	0.351
0.143	0.697	0.073	0.087
0.262	0.003	0.627	0.108
0.316	0.038	0.094	0.552
0.163	0.073	0.142	0.622
0.281	0.108	0.163	0.448
0.267	0.085	0.345	0.303
0.262	0.229	0.316	0.194

MOTIF	Liver_E12.5_H3K4me3_42_167_0.616_8.849143e-262
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.115	0.667	0.11	0.108
0.126	0.079	0.687	0.108
0.67	0.111	0.113	0.106
0.748	0.081	0.089	0.082
0.692	0.095	0.105	0.108
0.12	0.693	0.085	0.102
0.082	0.087	0.713	0.118
0.106	0.108	0.107	0.679
0.081	0.086	0.092	0.741
0.114	0.101	0.075	0.71

MOTIF	Heart_E15.5_H3K4me3_29_166_0.657_1.695642e-312
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.162	0.592	0.124	0.122
0.143	0.039	0.691	0.127
0.528	0.161	0.177	0.134
0.681	0.06	0.128	0.131
0.515	0.145	0.172	0.168
0.191	0.571	0.102	0.136
0.127	0.071	0.608	0.194
0.178	0.153	0.165	0.504
0.121	0.079	0.081	0.719
0.168	0.119	0.12	0.593

MOTIF	Intestine_P0_H3K4me3_28_158_0.669_1.469565e-310
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.577	0.114	0.132	0.177
0.704	0.066	0.126	0.104
0.514	0.18	0.141	0.165
0.222	0.515	0.135	0.128
0.149	0.132	0.512	0.207
0.114	0.162	0.156	0.568
0.088	0.145	0.026	0.741
0.135	0.195	0.172	0.498
0.124	0.714	0.025	0.137
0.116	0.137	0.623	0.124

MOTIF	Cranio-Facial_E12.5_H3K4me3_42_160_0.659_5.524152e-313
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.138	0.592	0.137	0.133
0.15	0.105	0.606	0.139
0.585	0.139	0.145	0.131
0.655	0.108	0.118	0.119
0.579	0.131	0.147	0.143
0.164	0.575	0.119	0.142
0.131	0.126	0.574	0.169
0.139	0.146	0.14	0.575
0.123	0.12	0.11	0.647
0.146	0.123	0.119	0.612

MOTIF	Limb_E13.5_H3K4me3_39_161_0.652_6.657081e-311
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.137	0.591	0.139	0.133
0.148	0.108	0.621	0.123
0.578	0.145	0.148	0.129
0.64	0.115	0.126	0.119
0.574	0.14	0.146	0.14
0.162	0.578	0.125	0.135
0.123	0.123	0.587	0.167
0.142	0.151	0.137	0.57
0.117	0.127	0.111	0.645
0.139	0.117	0.126	0.618

MOTIF	Forebrain_E13.5_H3K4me3_42_161_0.654_1.226864e-310
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.133	0.595	0.139	0.133
0.145	0.113	0.612	0.13
0.578	0.144	0.147	0.131
0.643	0.108	0.125	0.124
0.577	0.135	0.145	0.143
0.153	0.585	0.128	0.134
0.128	0.127	0.589	0.156
0.142	0.15	0.138	0.57
0.125	0.122	0.115	0.638
0.141	0.123	0.123	0.613

MOTIF	Intestine_E15.5_H3K4me3_30_163_0.660_6.627612e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.13	0.595	0.137	0.138
0.145	0.113	0.608	0.134
0.585	0.139	0.141	0.135
0.641	0.106	0.127	0.126
0.583	0.136	0.14	0.141
0.155	0.582	0.128	0.135
0.125	0.126	0.594	0.155
0.145	0.139	0.144	0.572
0.121	0.132	0.111	0.636
0.146	0.126	0.127	0.601

MOTIF	Neural-Tube_E14.5_H3K4me3_32_174_0.672_1.557466e-310
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.135	0.603	0.13	0.132
0.148	0.106	0.609	0.137
0.581	0.133	0.147	0.139
0.646	0.102	0.13	0.122
0.579	0.131	0.145	0.145
0.148	0.589	0.125	0.138
0.131	0.121	0.588	0.16
0.153	0.145	0.138	0.564
0.124	0.128	0.115	0.633
0.145	0.125	0.12	0.61

MOTIF	Kidney_P0_H3K4me3_31_158_0.674_3.090191e-311
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.126	0.602	0.141	0.131
0.138	0.104	0.623	0.135
0.582	0.146	0.139	0.133
0.628	0.116	0.133	0.123
0.573	0.141	0.149	0.137
0.149	0.604	0.123	0.124
0.119	0.121	0.599	0.161
0.142	0.15	0.14	0.568
0.122	0.128	0.124	0.626
0.148	0.13	0.127	0.595

MOTIF	Heart_P0_H3K4me3_23_158_0.660_7.277654e-311
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.13	0.599	0.139	0.132
0.135	0.106	0.632	0.127
0.56	0.147	0.164	0.129
0.633	0.112	0.135	0.12
0.574	0.139	0.152	0.135
0.15	0.605	0.123	0.122
0.116	0.117	0.609	0.158
0.14	0.15	0.15	0.56
0.12	0.131	0.12	0.629
0.142	0.129	0.129	0.6

MOTIF	Stomach_E16.5_H3K4me3_30_157_0.656_2.131864e-314
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.127	0.606	0.134	0.133
0.14	0.1	0.627	0.133
0.573	0.141	0.156	0.13
0.634	0.114	0.128	0.124
0.558	0.143	0.159	0.14
0.161	0.593	0.123	0.123
0.122	0.121	0.594	0.163
0.143	0.147	0.145	0.565
0.114	0.125	0.112	0.649
0.148	0.13	0.12	0.602

MOTIF	Heart_E12.5_H3K4me3_43_168_0.604_2.647804e-205
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.607	0.129	0.114	0.15
0.651	0.135	0.102	0.112
0.558	0.117	0.165	0.16
0.177	0.548	0.168	0.107
0.142	0.154	0.099	0.605
0.101	0.133	0.144	0.622
0.034	0.169	0.089	0.708
0.153	0.169	0.141	0.537
0.147	0.586	0.133	0.134
0.148	0.132	0.582	0.138

MOTIF	Stomach_P0_H3K4me3_64_168_0.610_4.872197e-198
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.189	0.116	0.131	0.564
0.149	0.534	0.12	0.197
0.168	0.098	0.557	0.177
0.585	0.145	0.187	0.083
0.82	0.033	0.039	0.108
0.621	0.14	0.098	0.141
0.611	0.148	0.165	0.076
0.197	0.127	0.559	0.117
0.124	0.179	0.132	0.565
0.136	0.135	0.122	0.607

MOTIF	Midbrain_E16.5_H3K9ac_62_174_0.563_4.860722e-107
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.845	0.081	0.04	0.034
0.07	0.058	0.098	0.774
0.058	0.047	0.02	0.875
0.934	0.001	0.064	0.001
0.071	0.001	0.024	0.904
0.001	0.058	0.001	0.94
0.046	0.044	0.081	0.829
0.053	0.92	0.026	0.001