MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Lung_P0_H3K4me1_80_145_0.508_2.055047e-17 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.352451 0.550788 0.069916 0.026845 0.954152 0.018414 0.006339 0.021095 0.105475 0.005439 0.889086 0.0 0.260389 0.60437 0.056582 0.078659 0.92049 0.034486 0.01761 0.027413 0.004169 0.928962 0.06687 0.0 0.902789 0.0336 0.063611 0.0 0.046445 0.020876 0.909971 0.022708 0.674327 0.051275 0.08031 0.194088 MOTIF Hindbrain_E15.5_H3K4me1_84_123_0.505_6.37347e-26 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.077074 0.746954 0.138348 0.037624 0.807577 0.130456 0.025831 0.036135 0.015221 0.226605 0.59844 0.159734 0.021004 0.708231 0.181695 0.08907 0.896362 0.005499 0.040783 0.057355 0.0 0.958311 0.039806 0.001883 0.913261 0.032578 0.054161 0.0 0.062073 0.041687 0.89467 0.001571 0.864126 0.098825 0.028929 0.008119 MOTIF Midbrain_E16.5_H3K4me1_73_89_0.509_1.877913e-22 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.035792 0.90576 0.047157 0.011291 0.894112 0.051418 0.042739 0.011732 0.038138 0.026369 0.773534 0.161959 0.042391 0.812781 0.08253 0.062297 0.689451 0.045563 0.02886 0.236126 0.109169 0.838352 0.047336 0.005144 0.725241 0.217506 0.036481 0.020771 0.068619 0.086947 0.839576 0.004857 0.81167 0.089385 0.052438 0.046507 0.208 0.348613 0.387959 0.055428 MOTIF Heart_E16.5_H3K27ac_81_52_0.508_1.277322e-20 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.0 0.386831 0.575248 0.037921 0.022299 0.031819 0.510362 0.435521 0.245977 0.33628 0.348775 0.068968 0.237915 0.648832 0.056603 0.05665 0.075312 0.8976 0.021793 0.005295 0.791687 0.034404 0.038155 0.135754 0.009844 0.935157 0.045639 0.00936 0.711901 0.107971 0.128348 0.05178 0.067075 0.069546 0.840166 0.023213 0.108294 0.793887 0.0567 0.041119 0.664434 0.110302 0.20522 0.020045 0.00436 0.964196 0.024248 0.007195 0.92755 0.019388 0.037185 0.015877 0.0 0.276205 0.567688 0.156107 0.238823 0.056218 0.314128 0.390831 MOTIF Kidney_E16.5_H3K27ac_81_73_0.507_9.958655e-25 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.06027 0.178375 0.632357 0.128999 0.207127 0.542471 0.050184 0.200218 0.04087 0.885026 0.065806 0.008298 0.760523 0.063698 0.037063 0.138717 0.028552 0.940744 0.0284 0.002304 0.695187 0.163402 0.034367 0.107044 0.02088 0.149596 0.813168 0.016356 0.097267 0.750947 0.099295 0.052491 0.715574 0.108863 0.130579 0.044984 0.070349 0.890021 0.029341 0.01029 0.836296 0.030361 0.113546 0.019797 0.033096 0.201321 0.715899 0.049684 MOTIF Cranio-Facial_E13.5_H3K27ac_85_96_0.508_3.836286e-34 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.026812 0.913578 0.053819 0.005791 0.798666 0.057503 0.060062 0.08377 0.037672 0.909754 0.048625 0.003949 0.725547 0.138335 0.106836 0.029282 0.069866 0.040846 0.87684 0.012448 0.050343 0.691168 0.190829 0.067659 0.765367 0.012611 0.180097 0.041925 0.095772 0.866629 0.032447 0.005152 0.89386 0.024894 0.078811 0.002435 0.146825 0.250497 0.466959 0.13572 MOTIF Hindbrain_E16.5_H3K27ac_90_132_0.506_2.195885e-56 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.068731 0.814586 0.113903 0.00278 0.709001 0.067474 0.0884 0.135125 0.04417 0.935691 0.016329 0.00381 0.750014 0.04427 0.096714 0.109002 0.003834 0.01469 0.972756 0.00872 0.030292 0.754615 0.203811 0.011281 0.837613 0.082482 0.05287 0.027036 0.050681 0.845027 0.094986 0.009306 0.850292 0.026446 0.059477 0.063785 MOTIF Forebrain_E14.5_H3K27ac_97_115_0.501_3.837037e-19 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.036557 0.788013 0.17009 0.005339 0.756807 0.059095 0.029368 0.154731 0.064046 0.907325 0.020329 0.0083 0.857879 0.024078 0.093449 0.024594 0.010353 0.038843 0.875272 0.075532 0.027507 0.783019 0.165423 0.024052 0.729529 0.030729 0.068562 0.17118 0.150617 0.79046 0.025895 0.033027 0.773639 0.13308 0.03932 0.053961 0.003187 0.202271 0.579213 0.215329 MOTIF Limb_E14.5_H3K27ac_92_98_0.503_1.85013e-26 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.043871 0.871687 0.076355 0.008087 0.779957 0.066375 0.056595 0.097073 0.063433 0.886379 0.042506 0.007682 0.801588 0.054599 0.096321 0.047493 0.005088 0.168383 0.813278 0.013251 0.073852 0.851755 0.054548 0.019845 0.76216 0.043791 0.075329 0.118719 0.054495 0.850493 0.081655 0.013356 0.6741 0.183424 0.130524 0.011953 0.0 0.184281 0.586944 0.228775 0.027678 0.112867 0.319268 0.540186 MOTIF Midbrain_E13.5_H3K27ac_64_69_0.521_1.672876e-40 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.291416 0.30532 0.027368 0.375896 0.08662 0.263278 0.630057 0.020045 0.021149 0.855647 0.116422 0.006782 0.744653 0.041936 0.136438 0.076973 0.037296 0.857386 0.096444 0.008874 0.724278 0.070712 0.106634 0.098376 0.017032 0.04376 0.914281 0.024927 0.044357 0.741444 0.137263 0.076936 0.811784 0.051502 0.089689 0.047025 0.032157 0.867779 0.091621 0.008443 0.769495 0.140347 0.057806 0.032352 0.017594 0.223448 0.677795 0.081162 MOTIF Neural-Tube_E11.5_H3K27ac_90_79_0.506_2.501391e-17 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.080604 0.733819 0.183921 0.001657 0.834725 0.066481 0.023853 0.074941 0.057193 0.834074 0.085509 0.023224 0.873288 0.049567 0.045228 0.031918 0.07788 0.795363 0.124542 0.002215 0.658831 0.226131 0.069474 0.045563 0.050825 0.058291 0.885175 0.005709 0.020813 0.824797 0.148623 0.005766 0.816237 0.080557 0.038136 0.065069 0.024587 0.897837 0.016965 0.060611 0.63798 0.079245 0.16569 0.117085 0.025951 0.525185 0.421268 0.027596 0.168396 0.129132 0.325024 0.377448 MOTIF Midbrain_E16.5_H3K27me3_46_142_0.510_3.810981e-18 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.009202 0.979938 0.01086 0.0 0.547535 0.019919 0.056936 0.37561 0.03343 0.837144 0.106874 0.022551 0.687616 0.061547 0.215219 0.035617 0.009247 0.017227 0.965217 0.008309 0.022806 0.894877 0.073145 0.009172 0.841136 0.021833 0.078532 0.058499 0.245402 0.734547 0.0 0.020051 0.736038 0.062383 0.070543 0.131036 MOTIF Limb_E13.5_H3K27ac_97_105_0.506_1.817277e-18 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.701721 0.048479 0.041064 0.208736 0.131549 0.809303 0.053763 0.005385 0.747534 0.162616 0.057819 0.03203 0.002738 0.142708 0.760798 0.093755 0.032484 0.886136 0.055831 0.025549 0.876238 0.061402 0.03231 0.03005 0.023218 0.954248 0.019825 0.002709 0.873236 0.075627 0.034109 0.017029 0.0 0.229626 0.762162 0.008212 0.626882 0.0 0.157689 0.215429 0.929004 0.054951 0.0 0.016045 MOTIF Midbrain_E13.5_H3K27ac_76_104_0.512_9.021324e-32 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.01437 0.826788 0.087601 0.071241 0.685047 0.081846 0.211265 0.021841 0.006037 0.105379 0.876914 0.01167 0.111858 0.839348 0.039788 0.009007 0.920952 0.039988 0.034317 0.004742 0.100643 0.865193 0.034164 0.0 0.716483 0.201853 0.07224 0.009424 0.082339 0.040076 0.859078 0.018507 0.765847 0.033935 0.061829 0.138389 0.407011 0.4299 0.102992 0.060097 MOTIF Cranio-Facial_E12.5_H3K4me1_71_114_0.511_7.190999e-37 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.705887 0.050913 0.1057 0.137501 0.168542 0.734738 0.032345 0.064375 0.777827 0.033314 0.032036 0.156823 0.02281 0.118676 0.739395 0.119119 0.052455 0.878561 0.025784 0.0432 0.875856 0.038536 0.013634 0.071974 0.023074 0.922778 0.051063 0.003085 0.907413 0.020493 0.058173 0.013922 0.0 0.210026 0.698651 0.091323 MOTIF Forebrain_E11.5_H3K4me1_42_93_0.527_1.91693e-116 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.834372 0.027416 0.024425 0.113788 0.128863 0.826813 0.011171 0.033153 0.79582 0.083438 0.060578 0.060164 0.028543 0.108638 0.817467 0.045352 0.05725 0.792556 0.108509 0.041685 0.828514 0.030629 0.059572 0.081284 0.043833 0.915277 0.020533 0.020357 0.797834 0.056586 0.132885 0.012696 0.009667 0.156916 0.816957 0.01646 MOTIF Heart_E13.5_H3K4me1_49_63_0.515_1.471044e-69 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.753399 0.087611 0.042867 0.116124 0.069201 0.778184 0.100408 0.052206 0.820071 0.055905 0.081755 0.042268 0.021202 0.047551 0.868955 0.062293 0.050463 0.819696 0.090571 0.03927 0.736511 0.11166 0.036478 0.115351 0.080494 0.824161 0.088791 0.006553 0.773552 0.099641 0.048213 0.078594 0.002846 0.073631 0.895492 0.028031 MOTIF Kidney_E16.5_H3K4me1_76_67_0.509_5.995659e-49 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.737804 0.050865 0.062167 0.149163 0.095253 0.796843 0.055601 0.052303 0.751168 0.085381 0.019344 0.144107 0.018545 0.211943 0.707804 0.061707 0.026324 0.900319 0.037226 0.036131 0.870388 0.0406 0.031622 0.05739 0.057896 0.888222 0.036385 0.017496 0.700202 0.147667 0.142395 0.009736 0.000747 0.097931 0.89014 0.011181 0.119006 0.199878 0.448653 0.232463 0.227 0.288629 0.454334 0.030037 MOTIF Cranio-Facial_E12.5_H3K4me1_83_71_0.507_1.104937e-29 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.473971 0.121176 0.355642 0.049211 0.052574 0.857205 0.081539 0.008683 0.781008 0.051934 0.092181 0.074877 0.030949 0.889199 0.070902 0.00895 0.793209 0.072833 0.073808 0.06015 0.033625 0.088456 0.818333 0.059586 0.118874 0.611116 0.214268 0.055742 0.786933 0.056438 0.117686 0.038943 0.027705 0.903832 0.056295 0.012168 0.896329 0.023231 0.048249 0.032191 MOTIF Cranio-Facial_E15.5_H3K4me1_88_82_0.505_6.438822e-54 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.046357 0.879334 0.058529 0.01578 0.713559 0.072172 0.062084 0.152184 0.024312 0.889965 0.078373 0.007349 0.798529 0.024193 0.021636 0.155641 0.001047 0.025115 0.943104 0.030734 0.050238 0.750379 0.150882 0.048501 0.75782 0.175529 0.03195 0.034701 0.086872 0.789752 0.101049 0.022328 0.858344 0.021745 0.06075 0.059161 0.065092 0.51471 0.297567 0.12263 MOTIF Limb_E15.5_H3K4me1_82_73_0.507_2.117748e-50 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.05415 0.924624 0.016263 0.004963 0.683552 0.015596 0.024279 0.276573 0.00425 0.894832 0.079368 0.02155 0.594782 0.128561 0.157915 0.118742 0.066063 0.063402 0.805916 0.064619 0.046736 0.778617 0.098834 0.075812 0.867938 0.049759 0.036666 0.045637 0.030605 0.927195 0.037086 0.005114 0.885936 0.029133 0.035973 0.048958 0.0 0.594354 0.350995 0.054652 MOTIF Forebrain_E12.5_H3K4me1_92_95_0.502_9.92145e-21 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.048566 0.859751 0.085301 0.006382 0.711817 0.064183 0.059293 0.164708 0.034965 0.811709 0.147688 0.005638 0.654348 0.104814 0.054864 0.185975 0.051866 0.054406 0.808067 0.085661 0.043854 0.775293 0.127442 0.053411 0.834475 0.084912 0.032688 0.047925 0.026167 0.938545 0.025755 0.009533 0.897045 0.028921 0.029684 0.04435 MOTIF Hindbrain_E12.5_H3K4me1_68_93_0.515_1.308792e-87 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.036436 0.876496 0.081496 0.005573 0.74294 0.061349 0.100225 0.095486 0.031407 0.827709 0.133491 0.007393 0.648419 0.06314 0.086386 0.202054 0.042915 0.047611 0.822923 0.086551 0.068508 0.752711 0.112895 0.065885 0.843572 0.051672 0.043753 0.061004 0.037453 0.933987 0.024241 0.004319 0.902727 0.018083 0.044789 0.034401 0.04649 0.428395 0.488579 0.036536 MOTIF Limb_E12.5_H3K4me1_85_101_0.505_3.246202e-22 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.012854 0.900987 0.075238 0.010922 0.792682 0.059565 0.023179 0.124573 0.036329 0.855831 0.097919 0.009921 0.701413 0.093918 0.057375 0.147294 0.086121 0.09017 0.767535 0.056175 0.154 0.763545 0.02649 0.055965 0.846794 0.059947 0.04623 0.047029 0.011759 0.894107 0.041177 0.052958 0.853597 0.03082 0.037038 0.078545 MOTIF Lung_E14.5_H3K4me1_63_74_0.512_4.501549e-21 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.042136 0.820156 0.131445 0.006263 0.720935 0.051978 0.051875 0.175212 0.029099 0.836049 0.078877 0.055974 0.77482 0.11341 0.064217 0.047553 0.085915 0.107196 0.742937 0.063952 0.083739 0.799845 0.036396 0.08002 0.804626 0.07807 0.078302 0.039002 0.009209 0.943006 0.017124 0.030662 0.89456 0.012599 0.048701 0.04414 0.004212 0.446947 0.497102 0.051739 MOTIF Midbrain_E16.5_H3K4me1_86_90_0.505_8.870021e-34 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.022545 0.936104 0.03459 0.006761 0.777738 0.046793 0.032119 0.14335 0.020998 0.916029 0.059163 0.00381 0.764872 0.120577 0.082221 0.03233 0.071032 0.056726 0.801965 0.070277 0.02988 0.701004 0.219714 0.049402 0.898159 0.040123 0.021994 0.039725 0.108196 0.84547 0.03312 0.013214 0.836625 0.019827 0.128701 0.014847 0.048597 0.290632 0.487838 0.172932 MOTIF Stomach_E15.5_H3K4me1_70_82_0.511_5.19458e-46 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.026051 0.960006 0.005809 0.008134 0.832902 0.038883 0.034997 0.093219 0.020263 0.88682 0.084487 0.00843 0.679944 0.165624 0.084606 0.069826 0.084126 0.099854 0.75767 0.05835 0.035903 0.817867 0.119216 0.027014 0.850013 0.068781 0.038911 0.042295 0.117851 0.863394 0.016206 0.002549 0.785985 0.018677 0.13871 0.056628 0.008198 0.279102 0.618821 0.093879 MOTIF Heart_E16.5_H3K9ac_75_93_0.519_5.95661e-67 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.791926 0.041614 0.005961 0.160499 0.023776 0.954455 0.021768 0.0 0.8623 0.03676 0.056535 0.044405 0.026054 0.05352 0.89468 0.025746 0.040243 0.874279 0.017744 0.067735 0.824993 0.081816 0.071376 0.021815 0.052908 0.888993 0.04364 0.014459 0.419458 0.277347 0.276948 0.026247 0.0 0.127275 0.833171 0.039554 MOTIF Neural-Tube_E13.5_H3K9ac_92_93_0.507_6.019205e-56 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.036578 0.849736 0.087594 0.026092 0.708912 0.118249 0.079919 0.09292 0.055916 0.891295 0.04992 0.002869 0.834263 0.019453 0.108225 0.038059 0.056911 0.870172 0.07073 0.002187 0.765818 0.053107 0.043978 0.137097 0.009711 0.031167 0.952019 0.007103 0.019797 0.867381 0.10903 0.003792 0.628713 0.082456 0.090859 0.197972 0.050407 0.656456 0.257963 0.035175 0.324921 0.100165 0.403124 0.171791 0.008766 0.325093 0.551409 0.114732 0.898135 0.074981 0.0 0.026885