MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Forebrain_E13.5_H3K4me2_8_7_0.646_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.145568	0.312161	0.342382	0.19989
0.029702	0.852544	0.037972	0.079781
0.047382	0.084378	0.841254	0.026986
0.020382	0.866401	0.023839	0.089379
0.06342	0.030349	0.762343	0.143888
0.037873	0.020939	0.912387	0.028801
0.161407	0.085166	0.638478	0.114949
0.039433	0.902289	0.024865	0.033414
0.11521	0.729122	0.014273	0.141395
0.080457	0.092643	0.727674	0.099226

MOTIF	Limb_E12.5_H3K4me2_18_8_0.627_1.739824e-315
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.083543	0.025012	0.224033	0.667412
0.157303	0.176057	0.505798	0.160842
0.057086	0.892736	0.01326	0.036917
0.043986	0.059035	0.861139	0.035839
0.070715	0.86029	0.049965	0.01903
0.061102	0.031544	0.696992	0.210362
0.026406	0.022232	0.933265	0.018098
0.14774	0.085034	0.603709	0.163517
0.026439	0.933922	0.014858	0.024781
0.043919	0.723668	0.001894	0.230519
0.122841	0.037081	0.803399	0.03668

MOTIF	Midbrain_E16.5_H3K4me2_18_9_0.643_4.656075e-320
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.193979	0.380109	0.0	0.425911
0.013908	0.918659	0.043995	0.023437
0.039602	0.067839	0.869722	0.022837
0.056646	0.883158	0.049422	0.010775
0.029664	0.060664	0.701715	0.207957
0.135472	0.04187	0.811019	0.011639
0.138573	0.023382	0.667325	0.170721
0.023403	0.844085	0.084804	0.047709
0.047802	0.889884	0.008533	0.053781
0.077793	0.106947	0.680839	0.134421

MOTIF	Cranio-Facial_E11.5_H3K4me2_18_22_0.667_1.000942e-311
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.0	0.978988	0.0	0.021012
0.0	0.010543	0.978967	0.010491
0.022008	0.917618	0.039457	0.020917
0.255087	0.005778	0.679146	0.059988
0.027344	0.011681	0.957469	0.003506
0.306166	0.01202	0.566475	0.115339
0.078169	0.888507	0.019738	0.013586
0.198056	0.746394	0.042068	0.013482
0.071619	0.833255	0.035563	0.059563
0.263963	0.190954	0.502376	0.042708

MOTIF	Forebrain_E14.5_H3K4me2_34_8_0.611_1.919494e-310
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.080884	0.843021	0.018518	0.057577
0.081114	0.747696	0.039781	0.131409
0.035024	0.078123	0.809715	0.077138
0.080804	0.847215	0.017391	0.05459
0.049705	0.018219	0.898299	0.033778
0.048387	0.027532	0.883591	0.04049
0.067191	0.046154	0.73699	0.149665
0.153231	0.62816	0.0564	0.162209
0.083012	0.775572	0.039297	0.102119
0.155064	0.711811	0.021324	0.111801
0.035844	0.324376	0.110467	0.529313

MOTIF	Limb_E15.5_H3K4me2_26_18_0.623_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.0	0.962244	0.02297	0.014785
0.01139	0.0	0.879275	0.109335
0.013914	0.846327	0.009926	0.129833
0.027278	0.021061	0.859051	0.09261
0.02603	0.053119	0.877541	0.04331
0.188232	0.024582	0.425665	0.361521
0.038797	0.921999	0.0	0.039205
0.048243	0.871589	0.039642	0.040526
0.127124	0.842854	0.018407	0.011615
0.0	0.156292	0.341297	0.502411

MOTIF	Liver_E16.5_H3K4me2_48_11_0.572_9.120246e-317
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.02973	0.956258	0.0	0.014012
0.005073	0.963397	0.0	0.03153
0.062135	0.04018	0.764025	0.13366
0.070569	0.737947	0.036377	0.155107
0.027379	0.025667	0.890375	0.056579
0.033439	0.073003	0.866855	0.026704
0.14951	0.087926	0.712431	0.050133
0.043515	0.606735	0.106666	0.243084
0.015247	0.928219	0.028761	0.027773
0.165442	0.226706	0.015374	0.592478

MOTIF	Midbrain_P0_H3K4me2_41_12_0.596_4.251866e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.084065	0.790008	0.0644	0.061526
0.053722	0.902408	0.013507	0.030363
0.012841	0.093517	0.778846	0.114796
0.077724	0.878151	0.026626	0.0175
0.094665	0.012456	0.781521	0.111358
0.031786	0.024081	0.925449	0.018684
0.089398	0.031757	0.801316	0.077529
0.216835	0.541554	0.092309	0.149301
0.039616	0.855595	0.056104	0.048685
0.227839	0.246081	0.0	0.52608

MOTIF	Midbrain_E14.5_H3K4me2_22_7_0.630_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.058942	0.887899	0.030275	0.022884
0.051291	0.840086	0.021713	0.086911
0.045545	0.073699	0.815754	0.065002
0.071203	0.825134	0.056299	0.047364
0.083898	0.050451	0.795174	0.070477
0.107304	0.055592	0.78755	0.049554
0.072611	0.050824	0.79184	0.084725
0.060526	0.751625	0.065218	0.122631
0.158151	0.662631	0.039543	0.139675
0.042319	0.167075	0.308733	0.481873
0.28385	0.635397	0.046459	0.034294
0.015961	0.492898	0.341364	0.149776

MOTIF	Lung_E16.5_H3K4me2_48_17_0.581_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.018768	0.942397	0.02761	0.011225
0.16523	0.669415	0.02257	0.142785
0.045722	0.044368	0.781702	0.128208
0.09074	0.818601	0.016616	0.074043
0.013359	0.072463	0.864234	0.049944
0.196334	0.046364	0.625563	0.131739
0.023261	0.019232	0.905444	0.052062
0.056914	0.854552	0.038819	0.049714
0.048278	0.748835	0.031351	0.171537
0.0	0.297257	0.059831	0.642911

MOTIF	Heart_E14.5_H3K4me2_60_31_0.548_3.191664e-321
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.088547	0.874763	0.03015	0.00654
0.136408	0.846818	0.016774	0.0
0.086397	0.078259	0.623998	0.211346
0.17955	0.717734	0.020025	0.082691
0.028795	0.038146	0.87264	0.060419
0.050394	0.022969	0.890057	0.036579
0.042863	0.061898	0.857006	0.038233
0.049449	0.877834	0.032063	0.040654
0.043787	0.6648	0.024973	0.266439

MOTIF	Forebrain_E12.5_H3K4me2_52_28_0.588_5.007615e-314
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.025366	0.828287	0.029476	0.116871
0.097442	0.592657	0.046122	0.263779
0.053019	0.09203	0.84642	0.008531
0.006521	0.907816	0.014095	0.071568
0.049376	0.026843	0.730988	0.192793
0.164571	0.005771	0.757561	0.072096
0.027193	0.041487	0.865836	0.065484
0.0441	0.876864	0.033311	0.045725
0.023631	0.904424	0.0	0.071945

MOTIF	Neural-Tube_E12.5_H3K4me2_23_8_0.624_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.060304	0.892338	0.021453	0.025904
0.067944	0.792964	0.009254	0.129838
0.043888	0.035125	0.823053	0.097934
0.068889	0.868413	0.018396	0.044302
0.103788	0.027378	0.766956	0.101878
0.046718	0.037354	0.856071	0.059858
0.089208	0.045113	0.735853	0.129826
0.045635	0.761854	0.068271	0.12424
0.171659	0.722137	0.023584	0.08262
0.117107	0.365644	0.425135	0.092114

MOTIF	Liver_E11.5_H3K4me2_25_9_0.599_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.022747	0.95094	0.0	0.026314
0.086773	0.813129	0.016331	0.083766
0.058163	0.037566	0.794518	0.109753
0.06248	0.83989	0.027737	0.069893
0.016143	0.054407	0.868804	0.060645
0.165793	0.068145	0.694315	0.071747
0.016791	0.013687	0.903127	0.066395
0.04022	0.751641	0.062816	0.145322
0.081876	0.727253	0.060817	0.130054
0.12355	0.134833	0.274559	0.467058

MOTIF	Heart_E16.5_H3K4me2_31_10_0.577_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.026575	0.931264	0.025167	0.016995
0.109108	0.683495	0.026396	0.181
0.048943	0.029213	0.856484	0.06536
0.065673	0.847325	0.019509	0.067494
0.045324	0.057495	0.72135	0.175831
0.103174	0.054095	0.734235	0.108496
0.025995	0.028842	0.84286	0.102304
0.051181	0.900818	0.026115	0.021885
0.048114	0.721024	0.041406	0.189456
0.064567	0.272604	0.263856	0.398973

MOTIF	Lung_E15.5_H3K4me2_23_6_0.611_6.603864e-313
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.090262	0.83188	0.015878	0.06198
0.097459	0.761519	0.025602	0.11542
0.015754	0.075318	0.828067	0.080862
0.042322	0.900145	0.008773	0.04876
0.104075	0.050231	0.739838	0.105857
0.058961	0.045395	0.799161	0.096483
0.033975	0.02945	0.881112	0.055463
0.052883	0.869251	0.04794	0.029926
0.15424	0.626728	0.042935	0.176098
0.060723	0.184735	0.346981	0.407561
0.201754	0.359241	0.334234	0.104772

MOTIF	Hindbrain_E15.5_H3K4me2_38_9_0.612_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.027627	0.876224	0.044653	0.051496
0.066131	0.805553	0.015306	0.113011
0.038517	0.02745	0.866256	0.067777
0.063995	0.869891	0.026153	0.039961
0.096	0.043151	0.721983	0.138866
0.126318	0.048015	0.749451	0.076215
0.054784	0.035297	0.822272	0.087647
0.05718	0.745497	0.062589	0.134735
0.070496	0.762341	0.041563	0.1256
0.183157	0.170898	0.147914	0.498032

MOTIF	Cranio-Facial_E13.5_H3K4me2_29_8_0.598_1.273701e-320
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.081566	0.815261	0.053973	0.0492
0.069243	0.824982	0.024978	0.080798
0.02986	0.049109	0.846367	0.074663
0.073862	0.835643	0.025666	0.06483
0.068485	0.068038	0.744748	0.118729
0.087996	0.060785	0.767447	0.083772
0.064088	0.069987	0.784733	0.081191
0.093588	0.769086	0.058046	0.079279
0.02587	0.835219	0.046816	0.092094
0.379495	0.126254	0.095848	0.398403

MOTIF	Lung_E14.5_H3K4me2_27_9_0.595_9.154435e-311
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.061471	0.883325	0.011268	0.043936
0.069022	0.762	0.013273	0.155706
0.047152	0.061309	0.832175	0.059364
0.096279	0.846825	0.032513	0.024383
0.06038	0.04269	0.836457	0.060472
0.101347	0.048523	0.818204	0.031925
0.116128	0.031575	0.750681	0.101615
0.14719	0.74562	0.064007	0.043184
0.072168	0.810571	0.008592	0.108669
0.294008	0.176705	0.146218	0.383068

MOTIF	Forebrain_E11.5_H3K4me2_34_16_0.639_1.244592e-315
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.07475	0.852703	0.049807	0.02274
0.076666	0.758407	0.030717	0.13421
0.037867	0.043371	0.822403	0.096359
0.026871	0.863267	0.053784	0.056078
0.02965	0.044856	0.808348	0.117147
0.10891	0.041155	0.790911	0.059025
0.098222	0.030982	0.817721	0.053075
0.168104	0.731023	0.066265	0.034607
0.100813	0.732051	0.047743	0.119393

MOTIF	Midbrain_E11.5_H3K4me2_17_7_0.650_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.054183	0.847998	0.047363	0.050456
0.031564	0.841109	0.029946	0.097381
0.011104	0.049658	0.874502	0.064737
0.078877	0.857129	0.021812	0.042182
0.070523	0.008218	0.81369	0.107569
0.080032	0.044611	0.8276	0.047757
0.104779	0.056074	0.719539	0.119608
0.144027	0.659219	0.066267	0.130487
0.092316	0.774072	0.025632	0.107981

MOTIF	Kidney_E15.5_H3K4me2_30_13_0.599_2.03076e-315
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.07323	0.859359	0.051054	0.016357
0.082134	0.725821	0.02335	0.168695
0.053239	0.087772	0.762547	0.096442
0.026917	0.821459	0.07393	0.077695
0.044242	0.014866	0.911266	0.029627
0.055621	0.038494	0.863672	0.042213
0.089025	0.037249	0.788418	0.085309
0.123415	0.737781	0.029429	0.109375
0.1077	0.712465	0.040089	0.139746

MOTIF	Midbrain_E15.5_H3K4me2_31_13_0.624_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.08228	0.843901	0.030012	0.043807
0.088859	0.773616	0.03213	0.105394
0.053945	0.060202	0.799202	0.086651
0.079215	0.820777	0.033004	0.067005
0.048719	0.022485	0.883094	0.045702
0.048323	0.012806	0.897448	0.041423
0.086375	0.030252	0.790039	0.093334
0.132377	0.711595	0.04497	0.111058
0.104194	0.684726	0.062596	0.148485

MOTIF	Stomach_E15.5_H3K4me2_32_13_0.612_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.061069	0.841806	0.059001	0.038124
0.07085	0.78994	0.0154	0.123809
0.026289	0.093157	0.77337	0.107184
0.059535	0.877445	0.020468	0.042552
0.10347	0.028462	0.834792	0.033276
0.032824	0.04893	0.879379	0.038867
0.08516	0.037926	0.84315	0.033764
0.138805	0.639538	0.065768	0.155889
0.072704	0.74338	0.060485	0.12343

MOTIF	Heart_E11.5_H3K4me2_35_11_0.584_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.074929	0.839012	0.033619	0.05244
0.133079	0.733652	0.02384	0.109429
0.033658	0.045263	0.849632	0.071447
0.078435	0.819197	0.026578	0.07579
0.145765	0.043073	0.772428	0.038733
0.135338	0.066092	0.70995	0.088619
0.040406	0.018684	0.885774	0.055136
0.055245	0.852879	0.040771	0.051105
0.100892	0.686106	0.058029	0.154973

MOTIF	Intestine_P0_H3K4me2_44_14_0.577_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.078515	0.820708	0.033314	0.067464
0.104348	0.744921	0.034386	0.116345
0.033643	0.075739	0.813063	0.077555
0.096122	0.815029	0.01652	0.072329
0.12104	0.025783	0.766454	0.086724
0.109122	0.061912	0.758054	0.070911
0.037733	0.024407	0.884087	0.053772
0.058404	0.855926	0.046057	0.039613
0.110875	0.718485	0.028101	0.14254

MOTIF	Stomach_E16.5_H3K4me2_47_12_0.583_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.078916	0.835363	0.024476	0.061244
0.080529	0.857631	0.025691	0.036148
0.044688	0.043886	0.785028	0.126398
0.109533	0.784945	0.026713	0.078809
0.18018	0.046451	0.728389	0.04498
0.095228	0.041413	0.800496	0.062863
0.042236	0.043051	0.844177	0.070536
0.054517	0.892138	0.017654	0.03569
0.047217	0.709413	0.02152	0.22185
0.137185	0.534556	0.07359	0.254669

MOTIF	Hindbrain_E11.5_H3K4me3_18_18_0.725_6.966326e-322
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.034059	0.914467	0.038079	0.013394
0.065822	0.039443	0.815377	0.079358
0.031663	0.020942	0.780486	0.166908
0.215501	0.007454	0.729418	0.047627
0.257887	0.664823	0.028297	0.048994
0.061557	0.608925	0.014581	0.314937
0.016045	0.957663	0.0	0.026292
0.029043	0.0	0.945837	0.02512
0.026989	0.944633	0.0153	0.013077
0.208317	0.2006	0.236583	0.3545

MOTIF	Neural-Tube_E14.5_H3K4me3_35_38_0.664_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.061624	0.854396	0.054767	0.029214
0.056639	0.0	0.893263	0.050097
0.0	0.021447	0.978553	0.0
0.471571	0.0	0.433026	0.095403
0.118783	0.813436	0.0	0.067782
0.033819	0.919391	0.0	0.046791
0.220953	0.750555	0.028492	0.0
0.0	0.0	1.0	0.0
0.131358	0.868642	0.0	0.0