MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Heart_P0_H3K4me2_69_85_0.547_3.81386e-70
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.720823	0.128798	0.082515	0.067864
0.013842	0.014934	0.769895	0.201329
0.029512	0.912514	0.025147	0.032828
0.086934	0.0	0.848121	0.064945
0.005872	0.052862	0.641433	0.299833
0.017181	0.778331	0.040245	0.164243
0.002645	0.008697	0.055934	0.932724
0.00193	0.458397	0.289798	0.249875
0.009678	0.018677	0.03515	0.936495
0.010417	0.917273	0.038476	0.033834
0.029599	0.930683	0.0	0.039718

MOTIF	Stomach_E16.5_H3K4me2_43_63_0.585_1.713931e-272
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.03944	0.050295	0.910265	0.0
0.851896	0.029923	0.038008	0.080172
0.010863	0.0	0.989137	0.0
0.839218	0.106529	0.032916	0.021337
0.348389	0.047674	0.581387	0.02255
0.442698	0.484151	0.040934	0.032217
0.051121	0.854791	0.024392	0.069696
0.004928	0.007454	0.955766	0.031852
0.134263	0.821902	0.026109	0.017726
0.0	0.028651	0.400368	0.570981

MOTIF	Limb_E13.5_H3K4me3_73_108_0.590_2.35278e-287
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.0	0.050223	0.949777	0.0
0.717518	0.05448	0.069955	0.158047
0.072613	0.0	0.927387	0.0
0.972413	0.0	0.0	0.027587
0.325974	0.0	0.403694	0.270332
0.056051	0.943949	0.0	0.0
0.028196	0.924018	0.0	0.047786
0.075837	0.0	0.897072	0.027091
0.03448	0.933256	0.032263	0.0

MOTIF	Liver_E13.5_H3K4me3_71_103_0.533_3.546023e-41
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.007079	0.98137	0.007242	0.004309
0.690762	0.216606	0.050267	0.042366
0.0	0.026071	0.973929	0.0
0.937195	0.051486	0.005433	0.005886
0.0	0.031558	0.968442	0.0
0.823248	0.030735	0.122876	0.023142
0.055619	0.04287	0.456776	0.444734
0.007831	0.865842	0.126327	0.0
0.062826	0.757834	0.058705	0.120634
0.0	0.0	0.867268	0.132732

MOTIF	Midbrain_E11.5_H3K27me3_13_26_0.553_9.336101e-46
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.857028	0.0	0.071964	0.071008
0.013574	0.054683	0.920003	0.01174
0.724745	0.09732	0.177935	0.0
0.053961	0.033202	0.874965	0.037872
0.038638	0.922954	0.0	0.038407
0.029261	0.895046	0.047768	0.027925
0.046248	0.0	0.939068	0.014684
0.0	0.900703	0.099297	0.0
0.032311	0.037991	0.908281	0.021417

MOTIF	Liver_E16.5_H3K9ac_8_5_0.627_2.200848e-310
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.049748	0.853336	0.007767	0.08915
0.129438	0.081757	0.61504	0.173766
0.049594	0.782023	0.052493	0.115891
0.043095	0.894389	0.02643	0.036087
0.062553	0.015893	0.894344	0.027211
0.075544	0.810421	0.038647	0.075388
0.075271	0.042287	0.779713	0.102729
0.017539	0.040756	0.88639	0.055315
0.083803	0.835816	0.057964	0.022417
0.0	0.150109	0.019761	0.830131
0.174155	0.69866	0.087099	0.040086
0.016478	0.463117	0.487208	0.033196

MOTIF	Lung_E15.5_H3K9ac_39_15_0.626_3.288366e-244
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.012371	0.038719	0.674058	0.274852
0.373365	0.387114	0.150924	0.088597
0.052938	0.905475	0.020461	0.021126
0.031203	0.067707	0.712698	0.188393
0.079269	0.815799	0.03353	0.071403
0.045013	0.036369	0.859222	0.059396
0.087464	0.046273	0.810891	0.055373
0.027115	0.810784	0.043305	0.118796
0.078013	0.050324	0.028566	0.843098
0.022813	0.890508	0.057208	0.029471
0.105935	0.752639	0.036944	0.104482
0.393161	0.338482	0.021067	0.24729

MOTIF	Heart_E15.5_H3K9ac_15_30_0.637_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.0	0.702989	0.180875	0.116137
0.05746	0.819353	0.094466	0.028721
0.0	0.0203	0.922996	0.056704
0.911339	0.0	0.032966	0.055694
0.011268	0.027827	0.893738	0.067167
0.040545	0.609506	0.03266	0.317289
0.0	0.919413	0.080587	0.0
0.151035	0.111865	0.690929	0.046171
0.034765	0.735352	0.01312	0.216764
0.040742	0.040623	0.918634	0.0

MOTIF	Hindbrain_E13.5_H3K9ac_12_25_0.598_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.111893	0.732839	0.118622	0.036646
0.010155	0.062193	0.91988	0.007771
0.845569	0.080457	0.037103	0.036871
0.063685	0.099724	0.767692	0.068899
0.14665	0.702479	0.042071	0.108801
0.027441	0.923979	0.047493	0.001087
0.173985	0.059644	0.75724	0.009132
0.0	0.816096	0.044719	0.139185
0.173016	0.037724	0.78926	0.0

MOTIF	Hindbrain_P0_H3K9ac_27_50_0.619_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.861504	0.049214	0.029863	0.059418
0.083658	0.007762	0.890723	0.017857
0.83137	0.017788	0.039822	0.11102
0.12507	0.006751	0.848198	0.019981
0.083437	0.585027	0.201994	0.129542
0.181272	0.747541	0.033712	0.037475
0.032217	0.039086	0.757187	0.17151
0.067554	0.868596	0.026415	0.037435
0.0	0.0	0.984912	0.015088

MOTIF	Neural-Tube_E11.5_H3K9ac_53_90_0.576_4.327584e-155
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.785116	0.074274	0.039535	0.101075
0.067602	0.059972	0.872426	0.0
0.877235	0.08844	0.0	0.034325
0.033134	0.017927	0.94894	0.0
0.053071	0.926099	0.009676	0.011155
0.40168	0.564138	0.012121	0.022062
0.330213	0.010381	0.54298	0.116427
0.049029	0.880734	0.0	0.070237
0.026577	0.077269	0.84551	0.050643

MOTIF	Liver_E13.5_H3K9ac_20_22_0.588_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.025736	0.538176	0.192733	0.243355
0.009233	0.041927	0.948839	0.0
0.931991	0.0	0.034401	0.033609
0.064218	0.055455	0.849431	0.030896
0.034648	0.827212	0.033703	0.104438
0.211893	0.658245	0.088032	0.04183
0.01004	0.056621	0.912985	0.020354
0.210673	0.706873	0.03692	0.045534
0.087041	0.020272	0.757973	0.134714

MOTIF	Intestine_E15.5_H3K9ac_31_28_0.612_2.856106e-255
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.64682	0.069186	0.079322	0.204672
0.0	0.932701	0.044322	0.022978
0.080683	0.877936	0.006443	0.034939
0.248527	0.062771	0.624601	0.064101
0.031833	0.884422	0.059166	0.02458
0.045837	0.058817	0.883198	0.012148
0.278625	0.040774	0.622711	0.05789
0.062293	0.703004	0.226321	0.008382
0.037541	0.028189	0.0	0.93427
0.010742	0.922804	0.043991	0.022463

MOTIF	Intestine_P0_H3K9ac_46_15_0.590_6.466877e-214
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.401279	0.162499	0.0	0.436222
0.009106	0.886061	0.039856	0.064978
0.121278	0.795944	0.039779	0.042999
0.051085	0.086139	0.810136	0.052639
0.039484	0.629463	0.211302	0.119751
0.101402	0.033718	0.827138	0.037742
0.103882	0.066359	0.649252	0.180506
0.012111	0.909398	0.034079	0.044412
0.062491	0.044579	0.031787	0.861143
0.001016	0.900418	0.076001	0.022565

MOTIF	Limb_E14.5_H3K9ac_34_23_0.595_1.772779e-238
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.162049	0.775411	0.016998	0.045542
0.031881	0.902794	0.037992	0.027333
0.010673	0.086182	0.610459	0.292685
0.215766	0.689783	0.079701	0.01475
0.032191	0.022693	0.900901	0.044215
0.012607	0.064388	0.717741	0.205263
0.067267	0.876288	0.042355	0.014091
0.030122	0.039809	0.022941	0.907129
0.015834	0.904021	0.068342	0.011802
0.060849	0.212801	0.219776	0.506575

MOTIF	Lung_E14.5_H3K9ac_32_20_0.608_1.990645e-313
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.017523	0.922553	0.043609	0.016314
0.116226	0.814377	0.039132	0.030265
0.046497	0.053184	0.731709	0.16861
0.146905	0.667623	0.05331	0.132161
0.0429	0.034321	0.875939	0.04684
0.020179	0.057418	0.680055	0.242348
0.043842	0.835881	0.062539	0.057738
0.091992	0.021142	0.067	0.819866
0.01389	0.89685	0.060728	0.028532
0.081013	0.280671	0.236808	0.401508

MOTIF	Forebrain_E15.5_H3K9ac_40_18_0.599_1.87579e-313
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.021906	0.841969	0.033871	0.102254
0.090715	0.840561	0.030598	0.038126
0.040358	0.093531	0.712352	0.153758
0.111227	0.60949	0.155181	0.124102
0.072654	0.024664	0.866455	0.036227
0.063954	0.03991	0.846583	0.049553
0.057817	0.84011	0.038282	0.063791
0.024817	0.053682	0.050788	0.870713
0.013577	0.921417	0.049811	0.015195
0.215213	0.167586	0.160199	0.457002

MOTIF	Forebrain_E16.5_H3K9ac_31_25_0.595_3.710433e-321
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.108684	0.748323	0.131348	0.011645
0.152446	0.793737	0.031537	0.022281
0.094567	0.063908	0.654562	0.186963
0.15208	0.689863	0.053476	0.104581
0.03084	0.042989	0.874868	0.051304
0.061444	0.054733	0.837995	0.045828
0.048918	0.835644	0.044168	0.07127
0.054279	0.030519	0.046482	0.86872
0.003931	0.911368	0.03998	0.044721

MOTIF	Hindbrain_E11.5_H3K9ac_23_18_0.621_1.878932e-320
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.080751	0.754678	0.146656	0.017916
0.138093	0.818291	0.020274	0.023341
0.016677	0.057781	0.724168	0.201375
0.138661	0.785105	0.055645	0.020589
0.043679	0.039144	0.861175	0.056002
0.020286	0.08092	0.747729	0.151065
0.044604	0.829474	0.02868	0.097242
0.07744	0.024806	0.046841	0.850913
0.015674	0.895955	0.030695	0.057676

MOTIF	Midbrain_E12.5_H3K9ac_37_21_0.591_1.697687e-315
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.019982	0.81423	0.071116	0.094673
0.133561	0.763249	0.064451	0.03874
0.068463	0.108911	0.675471	0.147155
0.114733	0.736951	0.061873	0.086443
0.121759	0.027707	0.798952	0.051581
0.041236	0.04272	0.77259	0.143453
0.03204	0.864863	0.02342	0.079677
0.039154	0.010705	0.054042	0.896099
0.011551	0.928475	0.025801	0.034173

MOTIF	Midbrain_E14.5_H3K9ac_27_26_0.596_5.762337e-313
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.091946	0.742065	0.053147	0.112843
0.153034	0.78236	0.039815	0.024791
0.055027	0.075596	0.680191	0.189186
0.154035	0.715204	0.056104	0.074657
0.025719	0.039912	0.898456	0.035914
0.017972	0.071681	0.859828	0.050519
0.051662	0.845709	0.049618	0.053011
0.066813	0.042025	0.019843	0.871318
0.03759	0.828316	0.061927	0.072167

MOTIF	Midbrain_P0_H3K9ac_22_14_0.612_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.023476	0.854783	0.042382	0.079359
0.118176	0.731946	0.110618	0.03926
0.073398	0.076286	0.685317	0.165
0.118364	0.734132	0.069918	0.077587
0.034984	0.01996	0.909198	0.035858
0.018305	0.038025	0.896654	0.047016
0.042185	0.728589	0.151889	0.077337
0.05355	0.086447	0.08031	0.779692
0.017694	0.923835	0.024449	0.034022

MOTIF	Heart_E15.5_H3K9ac_25_16_0.619_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.072512	0.774584	0.065995	0.086909
0.134661	0.784658	0.05225	0.028431
0.059217	0.03289	0.780659	0.127235
0.098287	0.758728	0.0554	0.087585
0.03293	0.043736	0.870609	0.052724
0.052773	0.053749	0.737802	0.155675
0.06576	0.78195	0.09728	0.05501
0.053744	0.051316	0.041887	0.853054
0.00982	0.898317	0.045068	0.046794

MOTIF	Neural-Tube_E13.5_H3K9ac_19_14_0.596_6.50382e-311
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.054876	0.798304	0.093294	0.053527
0.08138	0.771077	0.11479	0.032753
0.065532	0.06018	0.722596	0.151691
0.105099	0.741195	0.064739	0.088968
0.048305	0.012118	0.88871	0.050867
0.019098	0.024343	0.826882	0.129677
0.046234	0.81078	0.06641	0.076576
0.030255	0.09249	0.077076	0.80018
0.026686	0.859791	0.045355	0.068167

MOTIF	Liver_P0_H3K9ac_27_18_0.587_1.342706e-290
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.157277	0.77966	0.047986	0.015077
0.07048	0.056338	0.713895	0.159287
0.037156	0.898651	0.030594	0.033599
0.046393	0.019934	0.87933	0.054343
0.07208	0.080668	0.671508	0.175745
0.049437	0.756961	0.039056	0.154547
0.043291	0.089964	0.021264	0.84548
0.005493	0.920234	0.036863	0.03741
0.128443	0.730377	0.036382	0.104798
0.105989	0.843465	0.027182	0.023364

MOTIF	Forebrain_E13.5_H3K9ac_29_35_0.596_1.049959e-312
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.197933	0.73997	0.029404	0.032693
0.010042	0.072153	0.862362	0.055443
0.246673	0.619678	0.017798	0.115851
0.037687	0.080029	0.808652	0.073632
0.023907	0.05403	0.857097	0.064966
0.023501	0.953357	0.011146	0.011996
0.055476	0.022123	0.0	0.922401
0.022431	0.886023	0.035452	0.056093
0.013371	0.499264	0.153657	0.333707

MOTIF	Midbrain_E11.5_H3K9ac_33_32_0.600_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.027466	0.070542	0.892091	0.009901
0.874975	0.041794	0.049368	0.033863
0.003072	0.039513	0.86032	0.097095
0.144737	0.727492	0.059699	0.068072
0.03588	0.815556	0.060581	0.087983
0.203314	0.045209	0.57182	0.179656
0.022225	0.87388	0.056077	0.047817
0.042438	0.052592	0.768224	0.136746
0.122244	0.81689	0.039581	0.021285

MOTIF	Lung_E16.5_H3K9ac_11_14_0.613_8.361849e-312
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.09101	0.796612	0.033595	0.078783
0.031038	0.069925	0.758739	0.140298
0.060693	0.753252	0.05849	0.127565
0.053607	0.065791	0.818413	0.062189
0.042544	0.030526	0.766415	0.160515
0.016032	0.888982	0.035465	0.059521
0.055941	0.069439	0.036838	0.837782
0.007895	0.879297	0.021581	0.091227
0.094612	0.698677	0.036469	0.170242
0.089588	0.356062	0.411965	0.142385

MOTIF	Neural-Tube_E14.5_H3K9ac_23_15_0.627_8.566857e-311
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.095433	0.799438	0.030846	0.074283
0.063426	0.108324	0.716804	0.111445
0.085567	0.760089	0.096497	0.057848
0.056364	0.017682	0.853148	0.072806
0.060971	0.042643	0.745294	0.151091
0.014127	0.842779	0.046983	0.096111
0.084625	0.018759	0.038385	0.858231
0.01298	0.895578	0.016222	0.07522
0.035069	0.781339	0.041746	0.141846
0.086914	0.535997	0.344833	0.032257