MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Forebrain_E16.5_H3K4me1_37_76_0.529_1.030044e-111
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.963276	0.015904	0.0	0.020821
0.170726	0.767973	0.059424	0.001877
0.894177	0.067374	0.03072	0.007729
0.035125	0.020983	0.848573	0.095319
0.018382	0.856854	0.050771	0.073993
0.456913	0.280779	0.217894	0.044413
0.026379	0.031259	0.77719	0.165172
0.021327	0.948646	0.008384	0.021644
0.027755	0.0	0.021711	0.950534
0.235475	0.622111	0.0	0.142415

MOTIF	Intestine_E16.5_H3K4me1_17_114_0.527_3.700329e-82
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.854483	0.0	0.0	0.145517
0.228005	0.757339	0.0	0.014656
0.762025	0.174452	0.060069	0.003454
0.014093	0.029701	0.901378	0.054828
0.0	0.787181	0.070961	0.141859
0.839683	0.08754	0.030692	0.042085
0.037967	0.004162	0.953518	0.004353
0.059299	0.832078	0.03785	0.070773
0.082497	0.12162	0.056012	0.73987

MOTIF	Heart_E14.5_H3K4me2_84_177_0.516_3.663506e-35
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.131	0.12	0.614	0.135
0.132	0.639	0.119	0.11
0.729	0.054	0.075	0.142
0.131	0.09	0.671	0.108
0.117	0.663	0.095	0.125
0.13	0.03	0.033	0.807
0.099	0.12	0.624	0.157
0.132	0.133	0.134	0.601
0.132	0.6	0.133	0.135
0.742	0.087	0.049	0.122
0.671	0.112	0.139	0.078
0.643	0.119	0.128	0.11

MOTIF	Cranio-Facial_E13.5_H3K4me2_81_118_0.519_1.267289e-48
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.152128	0.021573	0.819678	0.006622
0.908171	0.0	0.006647	0.085182
0.101328	0.847729	0.048691	0.002252
0.841667	0.050326	0.085854	0.022153
0.045775	0.044297	0.864117	0.04581
0.058121	0.866352	0.023972	0.051555
0.556563	0.035539	0.240606	0.167291
0.077928	0.102617	0.793376	0.02608
0.06842	0.808474	0.028873	0.094233

MOTIF	Hindbrain_E13.5_H3K4me2_73_90_0.530_1.054276e-56
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.093414	0.129424	0.149341	0.627821
0.069926	0.02853	0.8747	0.026844
0.879241	0.044844	0.034212	0.041703
0.132081	0.833994	0.0172	0.016725
0.954658	0.01556	0.006268	0.023515
0.066055	0.038731	0.882128	0.013086
0.079792	0.782382	0.088234	0.049592
0.519282	0.121557	0.084138	0.275023
0.024329	0.240375	0.719097	0.016199
0.006873	0.903115	0.024634	0.065378
0.0	0.214286	0.51693	0.268784

MOTIF	Cranio-Facial_E13.5_H3K9ac_87_130_0.510_2.479992e-37
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.942454	0.0	0.017732	0.039814
0.142994	0.813445	0.037751	0.00581
0.817508	0.052202	0.023398	0.106891
0.074671	0.054146	0.852694	0.018489
0.02387	0.947231	0.018433	0.010466
0.784664	0.045642	0.035122	0.134572
0.021717	0.237778	0.730759	0.009747
0.065646	0.857774	0.032146	0.044434
0.181864	0.623826	0.027079	0.16723

MOTIF	Forebrain_E11.5_H3K9ac_85_139_0.502_4.98798e-41
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.857146	0.074993	0.040509	0.027351
0.02727	0.888043	0.081782	0.002905
0.803512	0.023767	0.04054	0.13218
0.020595	0.047666	0.892976	0.038763
0.212444	0.753725	0.010823	0.023007
0.917238	0.010274	0.057433	0.015055
0.012519	0.042385	0.79014	0.154956
0.119131	0.584079	0.283335	0.013455
0.089235	0.77823	0.122707	0.009828

MOTIF	Hindbrain_E12.5_H3K27me3_71_140_0.503_4.110658e-10
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.825988	0.014906	0.042371	0.116735
0.004256	0.983991	0.011753	0.0
0.995779	0.0	0.004221	0.0
0.0	0.043397	0.938689	0.017914
0.100082	0.856002	0.028951	0.014965
0.777761	0.069705	0.032159	0.120374
0.011697	0.228329	0.654801	0.105173
0.008878	0.602077	0.389046	0.0
0.83854	0.097721	0.004901	0.058838

MOTIF	Hindbrain_E13.5_H3K27me3_8_134_0.520_8.702257e-46
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.011475	0.546122	0.347545	0.094858
0.978534	0.0	0.021466	0.0
0.034809	0.899846	0.065345	0.0
0.973123	0.010626	0.016251	0.0
0.0	0.026449	0.953846	0.019706
0.028187	0.912119	0.036633	0.023061
0.836945	0.021347	0.0155	0.126208
0.149432	0.039386	0.462376	0.348805
0.019241	0.857055	0.119728	0.003976

MOTIF	Heart_E13.5_H3K4me1_11_96_0.530_4.136528e-123
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.098563	0.017235	0.806012	0.07819
0.787541	0.064282	0.031011	0.117166
0.118013	0.788164	0.063881	0.029943
0.759054	0.050158	0.010805	0.179983
0.081899	0.032203	0.785831	0.100067
0.130287	0.814238	0.024042	0.031433
0.752983	0.075129	0.02226	0.149628
0.01089	0.049524	0.914256	0.02533
0.05369	0.868824	0.051792	0.025695

MOTIF	Limb_E14.5_H3K4me1_90_279_0.508_9.59269e-23
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.847706	0.0	0.092794	0.0595
0.253333	0.683585	0.0232	0.039882
0.745492	0.225084	0.013796	0.015628
0.144829	0.117638	0.698478	0.039055
0.008752	0.985415	0.0	0.005833
0.960875	0.002874	0.003373	0.032879
0.0	0.243738	0.753644	0.002619
0.064769	0.874614	0.060617	0.0
0.84066	0.068022	0.008482	0.082836

MOTIF	Heart_E14.5_H3K4me1_44_109_0.513_5.215326e-34
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.92006	0.010841	0.040157	0.028942
0.141028	0.782648	0.027409	0.048914
0.81164	0.132879	0.036813	0.018668
0.113547	0.036807	0.830032	0.019613
0.069066	0.758422	0.024046	0.148467
0.722745	0.051628	0.21145	0.014177
0.139993	0.108095	0.730935	0.020977
0.041943	0.910174	0.039264	0.008619
0.803991	0.090288	0.021741	0.08398

MOTIF	Liver_E11.5_H3K4me1_54_140_0.516_4.885508e-30
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.851375	0.031853	0.011714	0.105058
0.117003	0.781033	0.097827	0.004137
0.722659	0.055809	0.049193	0.172338
0.085577	0.000556	0.894581	0.019286
0.021801	0.897305	0.019208	0.061685
0.945327	0.029983	0.003834	0.020857
0.075756	0.089885	0.826975	0.007385
0.078883	0.823241	0.083773	0.014104
0.690541	0.059253	0.10299	0.147216

MOTIF	Heart_E13.5_H3K27me3_42_141_0.509_2.024872e-12
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.874232	0.125768	0.0	0.0
0.063369	0.845167	0.091464	0.0
0.817634	0.087481	0.094885	0.0
0.141221	0.010201	0.660432	0.188145
0.0	0.748072	0.240707	0.011221
0.879562	0.07827	0.012182	0.029986
0.038441	0.071611	0.874969	0.014978
0.044071	0.942518	0.009628	0.003783
0.823077	0.047712	0.065725	0.063486

MOTIF	Forebrain_E13.5_H3K27me3_22_140_0.515_9.684557e-28
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.734365	0.015132	0.078373	0.17213
0.021843	0.97459	0.003567	0.0
0.946387	0.043894	0.009719	0.0
0.04319	0.00994	0.938839	0.00803
0.0	0.929165	0.060555	0.010281
0.845166	0.088294	0.008383	0.058157
0.0	0.125748	0.569808	0.304444
0.0	0.978234	0.016235	0.005531
0.682366	0.023986	0.068274	0.225373

MOTIF	Limb_E15.5_H3K27me3_31_111_0.518_2.615346e-26
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.842416	0.03816	0.030299	0.089124
0.048588	0.852016	0.096344	0.003052
0.849012	0.083116	0.064505	0.003368
0.022391	0.00477	0.888449	0.08439
0.052592	0.851659	0.056539	0.03921
0.724513	0.16256	0.040044	0.072883
0.010341	0.105806	0.689236	0.194617
0.019404	0.920438	0.043327	0.016831
0.686725	0.039862	0.138081	0.135331

MOTIF	Forebrain_E11.5_H3K36me3_42_124_0.544_3.743614e-46
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.784708	0.051359	0.045794	0.118139
0.047931	0.726694	0.211099	0.014277
0.854978	0.026554	0.051428	0.06704
0.031325	0.028033	0.931497	0.009145
0.042293	0.863841	0.056166	0.0377
0.917155	0.014547	0.023441	0.044858
0.041038	0.00543	0.834522	0.11901
0.044908	0.76109	0.151937	0.042064
0.618247	0.085382	0.193421	0.10295
0.186711	0.562049	0.0	0.25124

MOTIF	Hindbrain_E16.5_H3K9ac_68_143_0.538_1.650515e-96
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.855391	0.054742	0.0	0.089867
0.291835	0.654984	0.053181	0.0
0.975182	0.007863	0.016955	0.0
0.010107	0.031616	0.947638	0.010639
0.024518	0.756415	0.191315	0.027752
0.749162	0.208593	0.0	0.042245
0.0	0.021239	0.950542	0.028219
0.018368	0.957817	0.014782	0.009034
0.463741	0.065423	0.086169	0.384666

MOTIF	Hindbrain_E11.5_H3K9me3_14_138_0.532_2.836491e-08
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.801299	0.034824	0.054293	0.109584
0.009714	0.741508	0.009026	0.239752
0.592641	0.008724	0.219565	0.17907
0.053779	0.043779	0.833118	0.069324
0.26291	0.711447	0.025642	0.0
0.92612	0.023005	0.031684	0.019191
0.042181	0.028473	0.887725	0.04162
0.033468	0.962512	0.004021	0.0
0.82012	0.023855	0.025204	0.130821

MOTIF	Hindbrain_E14.5_H3K9me3_117_80_0.507_6.653939e-07
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.84555	0.034278	0.077945	0.042227
0.052038	0.083389	0.722062	0.142511
0.049405	0.906982	0.037624	0.005989
0.885392	0.010772	0.06663	0.037206
0.143372	0.0148	0.835189	0.006639
0.086861	0.776992	0.059133	0.077014
0.953877	0.004492	0.00537	0.036261
0.03489	0.026165	0.893744	0.0452
0.026265	0.555308	0.269476	0.148951
0.400881	0.186988	0.040661	0.37147

MOTIF	Hindbrain_E13.5_H3K9me3_89_55_0.515_3.197367e-19
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.034645	0.817715	0.067334	0.080306
0.806442	0.050779	0.050318	0.092461
0.121238	0.030911	0.817501	0.03035
0.050332	0.8266	0.099657	0.023411
0.799099	0.023411	0.039967	0.137523
0.058684	0.035391	0.830003	0.075922
0.048138	0.7412	0.112	0.098662
0.913718	0.004316	0.007466	0.074499
0.080714	0.024874	0.837554	0.056857
0.380679	0.070035	0.136378	0.412907

MOTIF	Hindbrain_E16.5_H3K9me3_12_45_0.536_1.311115e-40
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.080972	0.788078	0.066717	0.064233
0.786676	0.036977	0.054333	0.122014
0.093946	0.081815	0.795621	0.028619
0.092083	0.744661	0.112169	0.051087
0.770768	0.049505	0.078429	0.101297
0.041607	0.107182	0.777963	0.073249
0.03018	0.719282	0.138173	0.112364
0.829192	0.021384	0.053489	0.095934
0.049673	0.112744	0.7767	0.060883

MOTIF	Heart_E14.5_H3K9me3_69_117_0.520_1.556661e-22
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.066037	0.759798	0.111689	0.062475
0.821161	0.03403	0.008066	0.136742
0.081649	0.082232	0.811854	0.024265
0.096354	0.7447	0.091258	0.067688
0.831222	0.018765	0.130879	0.019133
0.15786	0.083898	0.721398	0.036844
0.023461	0.709356	0.055834	0.211349
0.822002	0.029348	0.068508	0.080142
0.084248	0.122629	0.70471	0.088414

MOTIF	Intestine_E14.5_H3K9me3_54_121_0.523_3.15455e-12
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.05579	0.8403	0.08078	0.02313
0.898886	0.044704	0.014925	0.041485
0.094396	0.059357	0.81314	0.033107
0.09948	0.760962	0.087783	0.051775
0.725623	0.108598	0.091978	0.073801
0.198327	0.053286	0.67536	0.073027
0.019147	0.698403	0.059397	0.223053
0.799963	0.037819	0.062157	0.100061
0.053991	0.067787	0.802891	0.07533

MOTIF	Liver_E11.5_H3K9me3_22_84_0.526_1.063153e-11
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.02312	0.794363	0.160949	0.021568
0.918586	0.043637	0.02275	0.015027
0.076641	0.017107	0.900225	0.006027
0.021508	0.823812	0.094647	0.060034
0.816806	0.058043	0.086582	0.038568
0.036862	0.031103	0.894929	0.037106
0.036081	0.677637	0.141027	0.145254
0.732472	0.038926	0.025532	0.20307
0.093223	0.023889	0.756888	0.126

MOTIF	Forebrain_E13.5_H3K9me3_71_85_0.517_1.69866e-20
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.061139	0.80642	0.09911	0.033331
0.866241	0.038832	0.063503	0.031424
0.084352	0.019808	0.788113	0.107727
0.073347	0.893919	0.025986	0.006748
0.759716	0.077236	0.034574	0.128474
0.030465	0.039215	0.799647	0.130673
0.020157	0.69687	0.185543	0.09743
0.951361	0.017328	0.012753	0.018558
0.10468	0.013169	0.818645	0.063506
0.118983	0.289452	0.233523	0.358042

MOTIF	Liver_E12.5_H3K9me3_82_103_0.502_5.290286e-05
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.023341	0.906437	0.030127	0.040095
0.83721	0.033253	0.024883	0.104655
0.071279	0.037672	0.811988	0.079061
0.022694	0.863182	0.09975	0.014374
0.755344	0.094084	0.023254	0.127318
0.073517	0.122253	0.760805	0.043426
0.033745	0.705942	0.132896	0.127417
0.906668	0.02911	0.015665	0.048557
0.10199	0.019503	0.767086	0.111421
0.205978	0.426388	0.234362	0.133272

MOTIF	Lung_P0_H3K9me3_46_45_0.518_0.0003707885
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.842832	0.020995	0.07549	0.060682
0.02044	0.031556	0.86367	0.084334
0.043713	0.91163	0.041585	0.003071
0.807113	0.089901	0.029341	0.073645
0.112185	0.176217	0.656796	0.054801
0.031144	0.82664	0.029221	0.112994
0.766042	0.107148	0.035639	0.091171
0.008155	0.029076	0.87921	0.083559
0.121116	0.81722	0.04695	0.014715
0.116394	0.209044	0.627462	0.0471

MOTIF	Stomach_P0_H3K9me3_34_76_0.522_0.001238709
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.784301	0.039061	0.141877	0.034762
0.149598	0.026054	0.308198	0.51615
0.068273	0.868585	0.049551	0.013591
0.751683	0.130433	0.07161	0.046274
0.015479	0.019959	0.927687	0.036876
0.045897	0.891024	0.022562	0.040517
0.860282	0.010145	0.028915	0.100658
0.021203	0.025196	0.919079	0.034522
0.010195	0.786255	0.028358	0.175192
0.07124	0.403346	0.342379	0.183035