MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Liver_E16.5_H3K27me3_20_21_0.579_6.517603e-89 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.043162 0.906364 0.015045 0.03543 0.888021 0.010079 0.034474 0.067426 0.008722 0.047115 0.862217 0.081946 0.226443 0.745586 0.0 0.027971 0.077002 0.031375 0.834545 0.057078 0.0303 0.918739 0.02933 0.02163 0.075005 0.101789 0.730692 0.092514 0.093959 0.201208 0.680786 0.024047 0.22188 0.699038 0.015539 0.063543 0.43238 0.0 0.09076 0.47686 MOTIF Intestine_P0_H3K27ac_6_19_0.548_3.939342e-105 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.142828 0.700537 0.113337 0.043298 0.895605 0.04305 0.0 0.061345 0.007723 0.047075 0.937883 0.007319 0.019315 0.800973 0.043928 0.135783 0.022588 0.0 0.977412 0.0 0.045792 0.904785 0.020651 0.028773 0.047508 0.082776 0.869715 0.0 0.27555 0.090805 0.627629 0.006016 0.0 0.961427 0.026485 0.012087 MOTIF Liver_E16.5_H3K27ac_3_15_0.558_1.184108e-150 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.459881 0.189634 0.122202 0.228283 0.037592 0.804013 0.030966 0.127429 0.793877 0.083654 0.056968 0.065502 0.124722 0.064436 0.789216 0.021626 0.030265 0.931755 0.008251 0.029729 0.018844 0.0321 0.929752 0.019304 0.015526 0.908436 0.038409 0.037629 0.005247 0.079941 0.885943 0.028868 0.102663 0.098875 0.625842 0.17262 0.13608 0.676778 0.035828 0.151314 MOTIF Stomach_E14.5_H3K27ac_11_12_0.554_2.678257e-162 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.813497 0.092809 0.022556 0.071139 0.157579 0.044904 0.617432 0.180085 0.014894 0.885862 0.080529 0.018714 0.165224 0.020186 0.800596 0.013995 0.021855 0.953682 0.0 0.024463 0.025631 0.110235 0.829622 0.034512 0.173592 0.00752 0.800542 0.018346 0.048306 0.588001 0.079462 0.28423 0.003953 0.044934 0.932246 0.018867 MOTIF Midbrain_E15.5_H3K27me3_2_9_0.539_1.51479e-53 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.129393 0.766594 0.073967 0.030046 0.70675 0.067948 0.032283 0.193018 0.092389 0.044298 0.837897 0.025416 0.014774 0.943593 0.025243 0.01639 0.109108 0.008174 0.864718 0.018 0.046161 0.85231 0.07241 0.029119 0.022934 0.056536 0.886493 0.034037 0.093861 0.10311 0.752521 0.050508 0.1885 0.615233 0.035963 0.160304 0.094357 0.289191 0.304635 0.311816 MOTIF Limb_E12.5_H3K4me2_16_157_0.629_1.211474e-314 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.095 0.124 0.691 0.09 0.1 0.699 0.141 0.06 0.593 0.138 0.145 0.124 0.077 0.12 0.727 0.076 0.086 0.713 0.129 0.072 0.119 0.616 0.136 0.129 0.089 0.14 0.656 0.115 0.103 0.663 0.14 0.094 0.094 0.134 0.646 0.126 0.076 0.713 0.134 0.077 0.133 0.132 0.149 0.586 0.064 0.136 0.697 0.103 MOTIF Lung_E16.5_H3K4me2_30_159_0.604_2.476349e-317 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.069 0.786 0.113 0.032 0.722 0.099 0.083 0.096 0.055 0.106 0.788 0.051 0.101 0.743 0.096 0.06 0.079 0.111 0.719 0.091 0.089 0.737 0.088 0.086 0.095 0.129 0.676 0.1 0.049 0.099 0.804 0.048 0.091 0.781 0.096 0.032 0.662 0.109 0.12 0.109 0.044 0.083 0.827 0.046 0.08 0.756 0.102 0.062 MOTIF Forebrain_E15.5_H3K4me2_19_8_0.648_9.831906e-322 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.171308 0.617445 0.201881 0.009367 0.455327 0.041216 0.356752 0.146704 0.025247 0.029677 0.911359 0.033717 0.028849 0.805227 0.057785 0.108139 0.013443 0.018771 0.802299 0.165487 0.022069 0.888227 0.055216 0.034488 0.097691 0.043975 0.807915 0.050418 0.126737 0.09229 0.613048 0.167926 0.15732 0.648885 0.039584 0.154211 0.029171 0.801684 0.08303 0.086114 0.035979 0.942415 0.0 0.021606 MOTIF Heart_E16.5_H3K4me2_5_153_0.627_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.001 0.865 0.133 0.001 0.001 0.798 0.057 0.144 0.001 0.001 0.964 0.034 0.066 0.764 0.121 0.049 0.157 0.001 0.682 0.16 0.025 0.608 0.366 0.001 0.242 0.212 0.001 0.545 0.001 0.113 0.885 0.001 MOTIF Forebrain_E16.5_H3K4me2_32_18_0.616_8.72209e-310 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.008941 0.947317 0.043742 0.0 0.856266 0.015114 0.056618 0.072002 0.042696 0.073788 0.811367 0.072148 0.040189 0.91721 0.020301 0.022299 0.092858 0.077313 0.648376 0.181453 0.087768 0.794741 0.034442 0.083048 0.092094 0.061481 0.800302 0.046123 0.063489 0.059963 0.775142 0.101406 0.168382 0.710186 0.050185 0.071247 0.010233 0.356273 0.507404 0.12609 0.533422 0.0 0.252572 0.214006 MOTIF Hindbrain_P0_H3K4me2_16_14_0.652_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.05235 0.848118 0.071707 0.027824 0.821875 0.016748 0.090736 0.070641 0.050368 0.069507 0.748748 0.131377 0.024942 0.93116 0.035171 0.008727 0.029798 0.032465 0.735295 0.202441 0.065151 0.891173 0.028435 0.015241 0.126376 0.078017 0.735714 0.059893 0.078532 0.041026 0.727591 0.15285 0.108251 0.792494 0.078329 0.020926 0.008109 0.420624 0.441166 0.130101 MOTIF Forebrain_P0_H3K4me2_38_14_0.604_4.682243e-313 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.044507 0.889629 0.041969 0.023896 0.829804 0.044864 0.045944 0.079388 0.008232 0.042648 0.940752 0.008369 0.119116 0.805464 0.012295 0.063125 0.086409 0.073455 0.756775 0.08336 0.103328 0.753088 0.039051 0.104533 0.07617 0.041128 0.747212 0.135491 0.005988 0.117521 0.728615 0.147876 0.123247 0.811771 0.044976 0.020006 0.110833 0.356283 0.045386 0.487498 MOTIF Liver_E11.5_H3K4me2_17_14_0.614_1.47899e-316 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.110413 0.812657 0.067485 0.009445 0.740273 0.06054 0.039471 0.159716 0.055136 0.045457 0.809814 0.089593 0.018289 0.938503 0.023091 0.020117 0.014005 0.031415 0.835993 0.118586 0.147478 0.820184 0.028006 0.004332 0.036387 0.052072 0.795308 0.116233 0.09869 0.070758 0.733974 0.096577 0.02585 0.827047 0.122606 0.024496 MOTIF Heart_E16.5_H3K4me2_23_16_0.591_3.747221e-318 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.163718 0.344268 0.221975 0.270039 0.150901 0.799174 0.04448 0.005446 0.811927 0.013566 0.024716 0.14979 0.015051 0.061172 0.910628 0.013148 0.146513 0.807337 0.020378 0.025771 0.125009 0.033109 0.810548 0.031334 0.059863 0.908737 0.017933 0.013468 0.154313 0.060357 0.632438 0.152892 0.092546 0.055888 0.78935 0.062217 0.038627 0.832962 0.07924 0.049171 MOTIF Midbrain_E11.5_H3K4me2_12_12_0.658_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.071148 0.829459 0.081155 0.018238 0.746421 0.051063 0.074763 0.127753 0.027403 0.049026 0.889078 0.034494 0.103096 0.849248 0.018165 0.029491 0.055528 0.033222 0.822423 0.088827 0.076917 0.821818 0.044694 0.05657 0.126818 0.084146 0.654934 0.134102 0.063891 0.077207 0.807958 0.050943 0.088512 0.786106 0.049227 0.076155 MOTIF Liver_E13.5_H3K4me2_11_11_0.624_5.878942e-314 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.188153 0.343178 0.416436 0.052233 0.015334 0.816231 0.047376 0.121059 0.117038 0.627875 0.052887 0.2022 0.008814 0.032314 0.935079 0.023793 0.054766 0.918728 0.010732 0.015774 0.010938 0.042779 0.901958 0.044325 0.016322 0.852571 0.038129 0.092979 0.070319 0.039473 0.07725 0.812958 0.054006 0.050408 0.769676 0.125909 0.233841 0.723176 0.009775 0.033208 0.073502 0.145331 0.626449 0.154718 MOTIF Forebrain_E14.5_H3K4me2_42_33_0.597_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.037556 0.897108 0.065336 0.0 0.830677 0.073633 0.017404 0.078286 0.003775 0.064557 0.858758 0.072909 0.185783 0.754375 0.032867 0.026976 0.02499 0.033498 0.837806 0.103706 0.10327 0.757143 0.027519 0.112068 0.130169 0.016898 0.720937 0.131995 0.100498 0.05067 0.816614 0.032218 0.116402 0.036165 0.768132 0.079301 MOTIF Hindbrain_E12.5_H3K4me2_28_17_0.624_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.066662 0.875113 0.047406 0.01082 0.120922 0.635676 0.051876 0.191525 0.033426 0.091452 0.844538 0.030585 0.107821 0.784608 0.020545 0.087027 0.071732 0.030493 0.725798 0.171977 0.083847 0.838703 0.031318 0.046132 0.158402 0.034395 0.060399 0.746804 0.002424 0.074634 0.915951 0.006991 0.018555 0.855562 0.040082 0.085801 MOTIF Lung_E16.5_H3K4me2_16_19_0.621_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.025156 0.872895 0.062798 0.03915 0.021694 0.901013 0.031981 0.045312 0.043683 0.051356 0.861432 0.043529 0.033059 0.93669 0.016507 0.013743 0.139379 0.039677 0.564876 0.256067 0.117088 0.797548 0.04314 0.042224 0.073242 0.061996 0.025141 0.839621 0.001841 0.053616 0.923657 0.020886 0.160309 0.614425 0.044525 0.180741 0.190063 0.261341 0.365341 0.183255 MOTIF Stomach_E15.5_H3K4me2_16_155_0.646_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.001 0.873 0.005 0.121 0.001 0.584 0.001 0.414 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.681 0.254 0.064 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.859 0.139 MOTIF Lung_P0_H3K27me3_29_25_0.538_1.039111e-21 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.054709 0.906384 0.015596 0.023311 0.002235 0.935274 0.058214 0.004277 0.866104 0.01202 0.052569 0.069307 0.024054 0.04434 0.797447 0.134159 0.082499 0.863338 0.044464 0.009699 0.058267 0.019302 0.741835 0.180596 0.017559 0.9576 0.009014 0.015827 0.260379 0.08745 0.534876 0.117296 0.139154 0.012136 0.714653 0.134056 0.526869 0.206177 0.12855 0.138404 MOTIF Stomach_P0_H3K27me3_26_19_0.539_4.498169e-12 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.14854 0.232816 0.040392 0.578252 0.123177 0.7452 0.043231 0.088392 0.034855 0.935756 0.026161 0.003228 0.884228 0.047209 0.045735 0.022828 0.008749 0.041631 0.856323 0.093297 0.123284 0.800309 0.029689 0.046719 0.019406 0.092722 0.863023 0.024849 0.027092 0.700712 0.060664 0.211533 0.194444 0.066265 0.697609 0.041682 0.057648 0.054517 0.801096 0.08674 MOTIF Heart_P0_H3K4me3_60_28_0.587_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.044454 0.887112 0.032538 0.035896 0.0 0.945937 0.054063 0.0 0.867 0.038169 0.029196 0.065635 0.003102 0.019344 0.970161 0.007393 0.062327 0.863297 0.056581 0.017794 0.13281 0.065803 0.775145 0.026243 0.151923 0.628557 0.063141 0.156379 0.10138 0.657543 0.073929 0.167148 0.162914 0.082886 0.669328 0.084872 0.448676 0.412874 0.016018 0.122431 MOTIF Intestine_E14.5_H3K4me3_34_31_0.673_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.188857 0.568833 0.0 0.24231 0.021562 0.888184 0.065998 0.024256 0.754971 0.0 0.043785 0.201244 0.009612 0.059546 0.9079 0.022943 0.027199 0.95349 0.013199 0.006113 0.198786 0.023192 0.727495 0.050527 0.18318 0.807799 0.0 0.009022 0.037847 0.837989 0.077203 0.046961 0.007953 0.064582 0.900862 0.026604 MOTIF Neural-Tube_E14.5_H3K4me3_22_29_0.703_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.026785 0.721953 0.022903 0.228359 0.0 0.968054 0.017088 0.014858 0.860757 0.035867 0.051052 0.052325 0.004084 0.07784 0.897617 0.020459 0.063498 0.916936 0.015272 0.004294 0.027432 0.025163 0.935924 0.011482 0.044011 0.696509 0.020224 0.239257 0.018636 0.497336 0.459727 0.024301 0.046009 0.056966 0.866766 0.030259 MOTIF Stomach_E14.5_H3K4me3_79_88_0.538_3.480929e-48 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.002759 0.823398 0.037179 0.136664 0.230899 0.062976 0.081295 0.62483 0.172763 0.776577 0.031093 0.019567 0.0 0.945294 0.033837 0.020869 0.885786 0.040091 0.03124 0.042884 0.006219 0.040528 0.807187 0.146066 0.051395 0.898213 0.017861 0.032531 0.215834 0.093589 0.657978 0.032599 0.020329 0.964842 0.004291 0.010539 0.218792 0.390206 0.148592 0.24241 MOTIF Hindbrain_E13.5_H3K4me3_58_61_0.593_1.033598e-273 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.0 0.93936 0.06064 0.0 0.879628 0.066181 0.0 0.054192 0.0 0.076641 0.914033 0.009326 0.327169 0.648179 0.01802 0.006633 0.340733 0.0 0.659267 0.0 0.078684 0.905594 0.015722 0.0 0.147742 0.221473 0.616343 0.014442 0.0 0.025944 0.959843 0.014212 0.873033 0.031196 0.041206 0.054565 MOTIF Hindbrain_E12.5_H3K4me3_73_51_0.553_4.014292e-81 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.51449 0.0 0.044173 0.441337 0.136443 0.825872 0.037685 0.0 0.918952 0.0 0.050443 0.030605 0.003456 0.067737 0.919459 0.009348 0.033159 0.932322 0.019628 0.01489 0.153006 0.100441 0.744297 0.002256 0.034047 0.708093 0.079052 0.178808 0.118141 0.021517 0.650814 0.209528 0.0 0.055016 0.931373 0.013611 0.825688 0.022233 0.078303 0.073777 0.0 0.773426 0.059969 0.166604 MOTIF Midbrain_E12.5_H3K4me3_54_63_0.613_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.011236 0.966347 0.022417 0.0 0.833762 0.021401 0.021605 0.123231 0.00875 0.037129 0.859377 0.094744 0.015299 0.871604 0.022444 0.090653 0.144326 0.015156 0.679613 0.160905 0.152822 0.707779 0.055423 0.083976 0.185214 0.039328 0.728089 0.047369 0.005206 0.094207 0.886485 0.014102 0.790171 0.110432 0.047299 0.052098