MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Stomach_E14.5_H3K27me3_13_45_0.555_9.077416e-27 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.734721 0.0 0.265279 0.0 0.070683 0.282558 0.0 0.64676 0.233223 0.766777 0.0 0.0 0.04905 0.018936 0.737256 0.194758 0.0 0.964952 0.035048 0.0 0.516027 0.0 0.056463 0.42751 0.0 0.0 0.961031 0.038969 0.009256 0.945035 0.0 0.045708 0.0 0.078606 0.834404 0.08699 MOTIF Hindbrain_E15.5_H3K4me2_13_161_0.653_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.001 0.738 0.001 0.26 0.001 0.756 0.099 0.144 0.028 0.047 0.924 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.622 0.001 0.122 0.255 0.001 0.282 0.716 0.001 0.133 0.422 0.231 0.213 0.095 0.001 0.819 0.085 MOTIF Liver_E15.5_H3K4me2_35_167_0.590_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.092 0.647 0.001 0.26 0.137 0.104 0.61 0.149 0.001 0.936 0.062 0.001 0.235 0.001 0.001 0.763 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.865 0.001 0.133 0.165 0.095 0.693 0.047 0.482 0.001 0.516 0.001 MOTIF Intestine_E16.5_H3K4me2_10_14_0.644_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.059073 0.855231 0.057221 0.028475 0.153357 0.05967 0.639944 0.147029 0.013898 0.9341 0.049691 0.002311 0.814766 0.034122 0.094182 0.05693 0.003084 0.060278 0.871354 0.065285 0.113758 0.769914 0.053218 0.06311 0.088189 0.052344 0.813349 0.046118 0.122209 0.788216 0.038157 0.051418 0.090546 0.034376 0.641986 0.233092 MOTIF Midbrain_E14.5_H3K4me2_7_10_0.669_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.031895 0.787807 0.059386 0.120912 0.175058 0.13827 0.55612 0.130551 0.02465 0.912297 0.044166 0.018887 0.744833 0.062331 0.057496 0.13534 0.017162 0.067153 0.903973 0.011712 0.159213 0.73079 0.064619 0.045378 0.016889 0.061812 0.897854 0.023445 0.089705 0.739853 0.083068 0.087375 0.119561 0.06089 0.752309 0.06724 MOTIF Cranio-Facial_E15.5_H3K4me2_45_16_0.598_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.056698 0.82448 0.100704 0.018118 0.04748 0.723619 0.043814 0.185087 0.151637 0.106277 0.656063 0.086023 0.025153 0.918413 0.031999 0.024435 0.817931 0.037864 0.054759 0.089446 0.001326 0.032024 0.932518 0.034132 0.157665 0.641364 0.101347 0.099624 0.037575 0.029252 0.884363 0.048809 0.057688 0.847372 0.036129 0.058811 MOTIF Neural-Tube_E12.5_H3K4me2_36_23_0.603_3.371866e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.101245 0.838329 0.042462 0.017965 0.042971 0.754814 0.055628 0.146587 0.044836 0.151015 0.664805 0.139344 0.040126 0.915827 0.041086 0.002961 0.789503 0.036185 0.059242 0.115071 0.003075 0.015538 0.951547 0.029841 0.184902 0.66192 0.040803 0.112375 0.038425 0.032969 0.891821 0.036785 0.049999 0.746943 0.060056 0.143001 MOTIF Midbrain_E16.5_H3K4me2_34_16_0.609_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.090409 0.796123 0.05587 0.057598 0.039634 0.899136 0.018494 0.042735 0.13864 0.046081 0.668598 0.146681 0.027905 0.900363 0.057573 0.014158 0.786557 0.047934 0.084688 0.080821 0.002463 0.045892 0.924911 0.026735 0.190252 0.680097 0.039967 0.089684 0.021057 0.038297 0.774757 0.165889 0.103153 0.808508 0.041629 0.04671 MOTIF Neural-Tube_E13.5_H3K4me2_39_23_0.609_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.050359 0.776768 0.072936 0.099937 0.028226 0.909315 0.011657 0.050802 0.120162 0.055864 0.662802 0.161172 0.031799 0.900394 0.050585 0.017221 0.830576 0.036133 0.071073 0.062218 0.0 0.132572 0.821487 0.045941 0.231126 0.672746 0.024135 0.071992 0.022183 0.057379 0.803096 0.117342 0.021482 0.821455 0.040773 0.11629 MOTIF Neural-Tube_E11.5_H3K27me3_13_152_0.566_2.56721e-38 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.044 0.14 0.001 0.815 0.083 0.783 0.081 0.053 0.001 0.057 0.9 0.042 0.01 0.977 0.001 0.012 0.93 0.001 0.001 0.068 0.001 0.001 0.997 0.001 0.103 0.798 0.063 0.036 0.035 0.035 0.84 0.09 MOTIF Hindbrain_E12.5_H3K4me2_34_162_0.608_5.013337e-310 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.033 0.066 0.058 0.843 0.058 0.056 0.067 0.819 0.046 0.087 0.058 0.809 0.092 0.775 0.05 0.083 0.077 0.08 0.734 0.109 0.053 0.806 0.095 0.046 0.79 0.044 0.059 0.107 0.044 0.057 0.847 0.052 0.056 0.858 0.046 0.04 0.119 0.094 0.721 0.066 MOTIF Intestine_E16.5_H3K4me2_41_158_0.600_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.053 0.859 0.041 0.047 0.001 0.085 0.885 0.029 0.011 0.971 0.017 0.001 0.092 0.031 0.021 0.856 0.001 0.019 0.972 0.008 0.062 0.795 0.09 0.053 0.06 0.065 0.852 0.023 0.888 0.001 0.095 0.016 MOTIF Cranio-Facial_E15.5_H3K4me2_37_158_0.608_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.041 0.834 0.063 0.062 0.026 0.064 0.909 0.001 0.009 0.95 0.027 0.014 0.078 0.021 0.001 0.9 0.024 0.001 0.955 0.02 0.084 0.767 0.093 0.056 0.038 0.048 0.883 0.031 0.861 0.05 0.05 0.039 MOTIF Liver_E16.5_H3K4me2_20_160_0.615_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.027 0.903 0.042 0.028 0.057 0.041 0.901 0.001 0.001 0.911 0.038 0.05 0.059 0.051 0.043 0.847 0.016 0.019 0.948 0.017 0.052 0.84 0.051 0.057 0.05 0.032 0.889 0.029 0.844 0.059 0.065 0.032 MOTIF Hindbrain_E14.5_H3K4me2_13_157_0.646_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.001 0.296 0.161 0.542 0.001 0.703 0.204 0.092 0.112 0.117 0.691 0.08 0.001 0.997 0.001 0.001 0.786 0.001 0.001 0.212 0.095 0.001 0.903 0.001 0.091 0.755 0.131 0.023 0.21 0.001 0.7 0.089 MOTIF Lung_E14.5_H3K4me2_12_154_0.633_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.257 0.699 0.043 0.001 0.024 0.001 0.85 0.125 0.012 0.942 0.045 0.001 0.19 0.001 0.001 0.808 0.001 0.058 0.921 0.02 0.001 0.875 0.081 0.043 0.14 0.068 0.791 0.001 0.483 0.101 0.309 0.106 MOTIF Midbrain_E15.5_H3K4me2_10_159_0.662_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.039 0.364 0.255 0.341 0.125 0.743 0.001 0.131 0.147 0.049 0.803 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.721 0.001 0.001 0.277 0.012 0.031 0.956 0.001 0.058 0.816 0.068 0.058 0.123 0.076 0.711 0.09 MOTIF Hindbrain_E11.5_H3K4me2_31_157_0.647_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.055 0.704 0.092 0.149 0.052 0.065 0.882 0.001 0.161 0.837 0.001 0.001 0.496 0.001 0.001 0.502 0.001 0.001 0.997 0.001 0.051 0.7 0.119 0.13 0.141 0.045 0.714 0.1 0.782 0.001 0.079 0.138 MOTIF Midbrain_E11.5_H3K4me2_34_160_0.629_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.118 0.809 0.072 0.001 0.068 0.077 0.803 0.052 0.092 0.885 0.022 0.001 0.751 0.001 0.001 0.247 0.001 0.001 0.977 0.021 0.001 0.784 0.131 0.084 0.001 0.151 0.742 0.106 0.851 0.001 0.147 0.001 MOTIF Midbrain_P0_H3K4me2_35_155_0.616_5.726101e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.16 0.627 0.158 0.055 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.456 0.001 0.001 0.542 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.937 0.001 0.061 0.149 0.218 0.435 0.198 0.641 0.001 0.001 0.357 MOTIF Intestine_E15.5_H3K9ac_36_165_0.601_2.932008e-178 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.239 0.331 0.241 0.189 0.237 0.203 0.477 0.083 0.22 0.519 0.114 0.147 0.391 0.001 0.001 0.607 0.001 0.001 0.997 0.001 0.07 0.729 0.165 0.036 0.264 0.001 0.679 0.056 0.791 0.001 0.078 0.13 MOTIF Hindbrain_P0_H3K9ac_10_160_0.643_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.053 0.828 0.073 0.046 0.001 0.093 0.905 0.001 0.091 0.792 0.001 0.116 0.452 0.001 0.001 0.546 0.001 0.001 0.997 0.001 0.069 0.699 0.102 0.13 0.175 0.168 0.656 0.001 0.686 0.122 0.096 0.096 MOTIF Hindbrain_E15.5_H3K9ac_34_159_0.637_7.303014e-317 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.048 0.055 0.001 0.896 0.044 0.774 0.07 0.112 0.054 0.074 0.818 0.054 0.008 0.977 0.001 0.014 0.951 0.001 0.025 0.023 0.042 0.023 0.893 0.042 0.03 0.891 0.052 0.027 0.047 0.05 0.854 0.049 MOTIF Kidney_E14.5_H3K9ac_20_172_0.633_2.396549e-318 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.124 0.536 0.187 0.153 0.088 0.171 0.74 0.001 0.029 0.895 0.075 0.001 0.144 0.143 0.001 0.712 0.001 0.001 0.997 0.001 0.096 0.693 0.07 0.141 0.101 0.001 0.85 0.048 0.574 0.001 0.26 0.165 MOTIF Forebrain_E11.5_H3K9ac_8_155_0.632_2.327207e-310 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.228 0.286 0.116 0.37 0.135 0.21 0.169 0.486 0.002 0.327 0.017 0.654 0.163 0.501 0.01 0.326 0.212 0.197 0.453 0.138 0.123 0.515 0.361 0.001 0.506 0.035 0.028 0.431 0.066 0.296 0.637 0.001 0.213 0.785 0.001 0.001 0.095 0.167 0.565 0.173 MOTIF Forebrain_E14.5_H3K9ac_21_153_0.628_1.934737e-310 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.114 0.113 0.098 0.675 0.084 0.11 0.086 0.72 0.087 0.114 0.093 0.706 0.11 0.694 0.08 0.116 0.115 0.084 0.714 0.087 0.114 0.7 0.117 0.069 0.679 0.106 0.098 0.117 0.098 0.104 0.703 0.095 0.101 0.72 0.079 0.1 0.1 0.105 0.688 0.107 MOTIF Midbrain_E11.5_H3K9ac_16_160_0.627_2.142372e-312 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.121 0.12 0.093 0.666 0.083 0.093 0.097 0.727 0.098 0.102 0.088 0.712 0.109 0.69 0.086 0.115 0.112 0.088 0.698 0.102 0.111 0.684 0.123 0.082 0.708 0.091 0.086 0.115 0.106 0.098 0.71 0.086 0.092 0.723 0.092 0.093 0.105 0.108 0.683 0.104 MOTIF Midbrain_E13.5_H3K9ac_13_167_0.612_2.415026e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.121 0.132 0.084 0.663 0.084 0.105 0.104 0.707 0.074 0.129 0.096 0.701 0.105 0.683 0.088 0.124 0.118 0.084 0.703 0.095 0.098 0.696 0.128 0.078 0.684 0.101 0.091 0.124 0.089 0.091 0.742 0.078 0.09 0.734 0.086 0.09 0.1 0.108 0.685 0.107 MOTIF Neural-Tube_E15.5_H3K9ac_8_155_0.676_1.218824e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.144 0.148 0.132 0.576 0.126 0.143 0.118 0.613 0.123 0.158 0.144 0.575 0.126 0.617 0.116 0.141 0.121 0.112 0.645 0.122 0.137 0.586 0.153 0.124 0.544 0.153 0.151 0.152 0.143 0.143 0.585 0.129 0.129 0.64 0.118 0.113 0.126 0.124 0.62 0.13