MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Midbrain_E16.5_H3K27me3_50_72_0.501_0.000639105 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.023922 0.89385 0.020644 0.061583 0.039316 0.023075 0.041495 0.896114 0.004125 0.964587 0.02342 0.007868 0.022373 0.044447 0.067398 0.865781 0.02289 0.016756 0.794232 0.166122 0.106696 0.701422 0.171743 0.020139 0.169415 0.669186 0.128975 0.032424 0.101754 0.819367 0.030019 0.04886 0.049701 0.757841 0.161698 0.03076 0.37093 0.448665 0.180405 0.0 MOTIF Forebrain_E12.5_H3K27me3_57_93_0.506_4.298294e-05 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.073471 0.017133 0.798372 0.111024 0.040235 0.129385 0.80446 0.02592 0.046665 0.074486 0.786393 0.092456 0.042127 0.880623 0.0606 0.01665 0.78385 0.014574 0.01444 0.187136 0.00072 0.235696 0.760168 0.003415 0.766187 0.134085 0.037052 0.062677 0.12507 0.008497 0.819945 0.046489 0.824148 0.08264 0.028356 0.064855 MOTIF Intestine_P0_H3K4me1_73_31_0.504_0.004385896 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.034923 0.847624 0.070321 0.047131 0.053445 0.912223 0.016016 0.018316 0.093008 0.022428 0.067787 0.816777 0.000734 0.773206 0.160666 0.065393 0.051122 0.027411 0.0425 0.878967 0.036126 0.051133 0.837157 0.075583 0.095967 0.713247 0.11528 0.075506 0.119461 0.659634 0.075139 0.145767 0.064487 0.793794 0.067891 0.073828 0.261406 0.096143 0.235654 0.406797 MOTIF Kidney_E14.5_H3K4me1_73_29_0.511_3.99292e-12 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.091943 0.629752 0.16862 0.109686 0.054292 0.884031 0.00801 0.053667 0.081202 0.042824 0.087912 0.788062 0.00268 0.91007 0.068851 0.018399 0.049458 0.011225 0.02764 0.911676 0.008956 0.038483 0.903079 0.049483 0.095559 0.752342 0.095861 0.056239 0.125327 0.673483 0.074453 0.126737 0.061437 0.816123 0.06644 0.055999 0.233402 0.098927 0.229434 0.438237 0.003275 0.272565 0.53591 0.188251 MOTIF Kidney_E15.5_H3K4me1_91_47_0.506_2.683853e-12 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.248757 0.209395 0.443209 0.098639 0.686482 0.050447 0.169902 0.093169 0.105532 0.046217 0.814944 0.033307 0.15059 0.097561 0.69757 0.05428 0.113453 0.068389 0.724346 0.093812 0.055422 0.852792 0.082807 0.008979 0.874427 0.019571 0.014384 0.091617 0.018336 0.13967 0.841993 0.0 0.850114 0.024776 0.051793 0.073318 0.05129 0.010077 0.924819 0.013814 MOTIF Kidney_E16.5_H3K4me1_95_46_0.503_1.330327e-06 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.313678 0.188467 0.296476 0.201379 0.63029 0.077989 0.180949 0.110772 0.062207 0.063041 0.83974 0.035012 0.151901 0.100936 0.688272 0.058891 0.065376 0.060281 0.780164 0.094179 0.088995 0.819735 0.074065 0.017205 0.902404 0.032806 0.019381 0.045409 0.031146 0.120583 0.84819 8.1e-05 0.832656 0.035664 0.055769 0.075911 0.035627 0.010747 0.902058 0.051568 MOTIF Cranio-Facial_E12.5_H3K4me1_86_60_0.507_4.00133e-13 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.672809 0.030022 0.104799 0.192369 0.06103 0.082291 0.832201 0.024477 0.157448 0.057541 0.691226 0.093785 0.037678 0.067196 0.828869 0.066257 0.066364 0.841838 0.07101 0.020787 0.882265 0.031254 0.042554 0.043928 0.030338 0.163482 0.804908 0.001272 0.804917 0.086186 0.046233 0.062664 0.082482 0.019186 0.845864 0.052468 MOTIF Stomach_E14.5_H3K4me1_101_61_0.502_0.0001345161 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.658536 0.057571 0.166696 0.117197 0.100542 0.054384 0.811854 0.033219 0.116968 0.078778 0.720175 0.084079 0.078153 0.065146 0.75135 0.105351 0.05785 0.854028 0.064873 0.02325 0.889066 0.042612 0.018558 0.049763 0.009153 0.223066 0.767355 0.000426 0.894055 0.029256 0.014564 0.062125 0.049647 0.013509 0.889263 0.047581 MOTIF Forebrain_E11.5_H3K4me1_63_53_0.518_1.767016e-42 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.889651 0.009165 0.036281 0.064904 0.06427 0.037663 0.889482 0.008585 0.703782 0.143473 0.115659 0.037087 0.135587 0.044155 0.731188 0.08907 0.034925 0.926756 0.036649 0.00167 0.777532 0.022357 0.020741 0.179371 0.097396 0.058892 0.840407 0.003306 0.757245 0.133876 0.049868 0.059012 0.078467 0.04048 0.784949 0.096104 0.204657 0.340526 0.423647 0.03117 0.226716 0.369556 0.377193 0.026535 0.256233 0.409943 0.200646 0.133178 MOTIF Limb_E14.5_H3K4me1_83_165_0.509_1.257708e-17 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.833964 0.043049 0.040513 0.082474 0.06357 0.142868 0.785806 0.007757 0.775197 0.07452 0.073883 0.076399 0.046273 0.059037 0.868355 0.026335 0.0331 0.89464 0.058237 0.014023 0.839026 0.063989 0.048118 0.048868 0.075203 0.186868 0.730792 0.007137 0.852518 0.070518 0.048786 0.028177 0.038671 0.061107 0.867278 0.032945 0.241021 0.532287 0.193366 0.033326 0.28502 0.453026 0.191128 0.070827 0.140178 0.587361 0.161321 0.11114 0.503011 0.093115 0.264285 0.139588 MOTIF Heart_E12.5_H3K4me1_58_49_0.512_1.366829e-22 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.856576 0.030282 0.053447 0.059695 0.056542 0.115915 0.809522 0.018022 0.814749 0.086314 0.069784 0.029153 0.054766 0.058989 0.8261 0.060145 0.063441 0.898863 0.030879 0.006817 0.856677 0.059057 0.028999 0.055267 0.06139 0.232303 0.702327 0.00398 0.748026 0.06625 0.074219 0.111505 0.069533 0.094921 0.813351 0.022195 0.27302 0.200774 0.46491 0.061297 0.047308 0.406487 0.268433 0.277773 MOTIF Hindbrain_E13.5_H3K4me1_62_50_0.515_1.247279e-44 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.736313 0.047914 0.109787 0.105985 0.151237 0.127512 0.715413 0.005838 0.72249 0.083826 0.099848 0.093836 0.089817 0.066076 0.819548 0.024559 0.048449 0.873157 0.065374 0.013021 0.840155 0.061965 0.054686 0.043194 0.078025 0.188496 0.732182 0.001297 0.918984 0.034532 0.015225 0.031258 0.010075 0.050968 0.913352 0.025604 0.266035 0.353035 0.346883 0.034047 MOTIF Hindbrain_E15.5_H3K4me1_73_41_0.510_6.219075e-26 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.801429 0.050515 0.07095 0.077106 0.10802 0.134151 0.753771 0.004058 0.737249 0.114541 0.075549 0.072661 0.103695 0.062261 0.792196 0.041848 0.032063 0.908196 0.058211 0.001529 0.815304 0.068804 0.026413 0.089478 0.063959 0.155581 0.778223 0.002238 0.794921 0.072229 0.060818 0.072031 0.034427 0.061496 0.872598 0.031479 0.141509 0.384796 0.43689 0.036805 MOTIF Forebrain_E13.5_H3K4me1_63_38_0.511_6.312973e-29 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.796244 0.036129 0.106537 0.06109 0.110931 0.122608 0.759889 0.006573 0.741594 0.078828 0.10683 0.072747 0.08158 0.064787 0.825645 0.027988 0.056651 0.885874 0.049342 0.008134 0.822044 0.072201 0.045876 0.059879 0.067815 0.159625 0.770212 0.002347 0.803353 0.07293 0.079115 0.044601 0.042594 0.045145 0.887529 0.024732 0.233046 0.436155 0.296425 0.034374 0.272422 0.263467 0.160092 0.304019 MOTIF Heart_E14.5_H3K4me1_75_39_0.505_1.002632e-11 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.806774 0.008086 0.12023 0.06491 0.060243 0.160201 0.764286 0.015271 0.781478 0.092966 0.078756 0.046801 0.122648 0.084002 0.74657 0.04678 0.041594 0.90002 0.050869 0.007517 0.835 0.042596 0.056663 0.065741 0.015849 0.161653 0.821398 0.0011 0.803037 0.063575 0.057083 0.076305 0.032395 0.063423 0.86663 0.037552 0.317619 0.295642 0.361936 0.024803 0.274185 0.379447 0.139195 0.207173 MOTIF Heart_E11.5_H3K4me1_68_37_0.511_6.390144e-12 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.708928 0.023485 0.166197 0.101389 0.097928 0.122959 0.761775 0.017338 0.683059 0.082478 0.12402 0.110442 0.092777 0.042773 0.82669 0.03776 0.033635 0.896401 0.060412 0.009551 0.82973 0.056624 0.053727 0.05992 0.068841 0.095142 0.832839 0.003177 0.816072 0.058481 0.047597 0.077851 0.013235 0.016821 0.928847 0.041098 0.213635 0.393293 0.345632 0.04744 0.240539 0.434223 0.195433 0.129806 MOTIF Midbrain_E13.5_H3K4me1_74_36_0.513_2.484093e-33 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.823968 0.035227 0.082199 0.058607 0.139368 0.106316 0.743849 0.010467 0.657866 0.074928 0.185142 0.082064 0.080549 0.072917 0.811008 0.035527 0.04254 0.886453 0.060124 0.010883 0.838507 0.05566 0.028599 0.077233 0.059151 0.131675 0.806533 0.002641 0.821403 0.072522 0.04644 0.059634 0.03478 0.044856 0.897566 0.022797 0.255391 0.396521 0.317327 0.030761 0.262284 0.444954 0.14101 0.151753 MOTIF Neural-Tube_E12.5_H3K4me1_86_41_0.509_3.90341e-18 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.798129 0.043379 0.093969 0.064522 0.124401 0.062019 0.801909 0.011672 0.639978 0.088426 0.181106 0.09049 0.121781 0.080807 0.768728 0.028684 0.03591 0.878167 0.071735 0.014188 0.852407 0.055204 0.047517 0.044872 0.074587 0.121915 0.802687 0.000811 0.867726 0.027617 0.061878 0.042778 0.008914 0.052056 0.917526 0.021504 0.266704 0.339088 0.370321 0.023887 0.371809 0.322855 0.21888 0.086455 MOTIF Limb_E13.5_H3K4me1_84_36_0.510_1.932585e-27 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.835369 0.035304 0.060939 0.068388 0.157276 0.118798 0.718031 0.005895 0.727337 0.094133 0.101379 0.077152 0.102958 0.102954 0.7614 0.032688 0.029119 0.908727 0.053874 0.00828 0.81291 0.041699 0.020535 0.124856 0.020221 0.149708 0.828112 0.001959 0.820912 0.075369 0.047242 0.056477 0.028217 0.054947 0.894219 0.022617 0.257114 0.363728 0.347718 0.03144 0.209326 0.329657 0.287523 0.173494 MOTIF Midbrain_E15.5_H3K4me1_83_34_0.511_7.165096e-31 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.786894 0.039557 0.113198 0.06035 0.117399 0.115852 0.755927 0.010822 0.654675 0.110123 0.154057 0.081145 0.094819 0.099566 0.755859 0.049757 0.067021 0.868649 0.053258 0.011072 0.794128 0.058897 0.067008 0.079968 0.044156 0.17582 0.777794 0.002231 0.817978 0.062814 0.048052 0.071156 0.022755 0.070936 0.87803 0.028278 0.226963 0.351841 0.390043 0.031153 0.209272 0.298167 0.368198 0.124363 MOTIF Neural-Tube_E13.5_H3K4me1_81_48_0.509_9.828598e-22 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.715613 0.045093 0.137727 0.101567 0.124277 0.131547 0.739475 0.004701 0.699405 0.084692 0.124675 0.091228 0.10274 0.070982 0.801337 0.024941 0.040574 0.879405 0.071581 0.008439 0.916731 0.037051 0.019609 0.026608 0.085577 0.101129 0.810839 0.002455 0.82061 0.081053 0.040234 0.058102 0.0519 0.071767 0.851491 0.024842 0.343592 0.228273 0.394748 0.033386 0.232459 0.283655 0.2752 0.208686 MOTIF Neural-Tube_E15.5_H3K4me1_55_32_0.517_7.034478e-54 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.165791 0.70384 0.12771 0.002659 0.743076 0.013936 0.091982 0.151006 0.041876 0.156258 0.792721 0.009145 0.762519 0.113206 0.060708 0.063567 0.091157 0.072166 0.815806 0.020871 0.047888 0.87689 0.056425 0.018797 0.808431 0.083065 0.070164 0.038341 0.072557 0.177405 0.746517 0.003521 0.798596 0.09886 0.033982 0.068561 0.006682 0.046008 0.926852 0.020458 0.122301 0.316185 0.530203 0.031311 0.416694 0.274477 0.16696 0.141869 MOTIF Limb_E12.5_H3K4me1_89_47_0.504_6.331915e-11 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.231555 0.212292 0.50965 0.046503 0.839547 0.052963 0.050276 0.057214 0.137669 0.140621 0.714758 0.006952 0.663199 0.073623 0.206164 0.057014 0.132886 0.06712 0.768057 0.031938 0.05185 0.891283 0.051812 0.005054 0.867023 0.032605 0.019378 0.080995 0.075885 0.082331 0.839974 0.00181 0.825264 0.065856 0.048202 0.060678 0.03398 0.067438 0.872211 0.026371 MOTIF Midbrain_E12.5_H3K4me1_78_38_0.508_6.020828e-21 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.247899 0.179866 0.546977 0.025258 0.836383 0.044664 0.063079 0.055874 0.133065 0.101366 0.756929 0.008641 0.647878 0.089343 0.180703 0.082076 0.069391 0.086815 0.819967 0.023827 0.045229 0.887201 0.058286 0.009285 0.80469 0.05709 0.045479 0.092741 0.039913 0.123302 0.832775 0.00401 0.809734 0.080827 0.06683 0.042608 0.033982 0.039889 0.882732 0.043396 0.279377 0.337122 0.355575 0.027926 MOTIF Limb_E15.5_H3K4me1_86_44_0.505_3.328434e-19 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.098546 0.21858 0.634912 0.047961 0.790429 0.054835 0.067705 0.087031 0.153688 0.125626 0.716404 0.004282 0.681223 0.11577 0.118884 0.084123 0.111955 0.090478 0.775431 0.022136 0.023758 0.924123 0.04505 0.00707 0.90027 0.022258 0.023835 0.053637 0.014377 0.139773 0.843636 0.002214 0.807135 0.080765 0.056018 0.056082 0.046421 0.041292 0.861691 0.050596 0.329888 0.26928 0.353297 0.047535 MOTIF Neural-Tube_E11.5_H3K4me1_80_56_0.508_1.946944e-07 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.086366 0.17527 0.691995 0.046368 0.827226 0.02334 0.069145 0.080288 0.11623 0.133982 0.743894 0.005894 0.694139 0.132226 0.080665 0.092971 0.085468 0.068518 0.793596 0.052417 0.022576 0.918388 0.056885 0.002151 0.790011 0.086801 0.020633 0.102556 0.051477 0.147234 0.797456 0.003832 0.839282 0.042794 0.058404 0.059521 0.033977 0.047199 0.880175 0.038649 0.336443 0.260612 0.372737 0.030208 MOTIF Heart_E15.5_H3K4me1_79_47_0.508_5.422654e-23 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.059274 0.293869 0.587376 0.059481 0.866952 0.029009 0.035905 0.068134 0.060195 0.141494 0.770089 0.028223 0.80981 0.101331 0.0569 0.031959 0.067373 0.058835 0.824257 0.049535 0.05152 0.912844 0.031108 0.004528 0.846697 0.069317 0.017926 0.066059 0.071686 0.200141 0.724947 0.003226 0.779375 0.084507 0.059128 0.07699 0.089314 0.064839 0.822756 0.023091 0.343058 0.325235 0.290024 0.041682 0.203972 0.100424 0.449194 0.246411 MOTIF Heart_E16.5_H3K4me1_62_53_0.510_7.650155e-47 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.876386 0.029077 0.029601 0.064936 0.100154 0.16418 0.723728 0.011938 0.790045 0.09236 0.073175 0.04442 0.085919 0.098367 0.769176 0.046538 0.042965 0.90604 0.048511 0.002484 0.868603 0.061074 0.015946 0.054376 0.071909 0.109733 0.814489 0.003869 0.768698 0.062382 0.072943 0.095977 0.038199 0.070817 0.871635 0.019348 0.329833 0.370182 0.253801 0.046184 0.196139 0.149037 0.247462 0.407362 MOTIF Stomach_E16.5_H3K4me1_72_71_0.509_8.866205e-20 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.743032 0.044424 0.12325 0.089294 0.095564 0.149728 0.751789 0.002919 0.751154 0.121183 0.037853 0.08981 0.127853 0.082765 0.759586 0.029797 0.049458 0.869811 0.068068 0.012664 0.855705 0.075014 0.028634 0.040647 0.101847 0.124163 0.772912 0.001078 0.851608 0.063596 0.045095 0.039701 0.01065 0.046427 0.903205 0.039718 0.445479 0.368983 0.116593 0.068944