MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Liver_E13.5_H3K4me2_7_155_0.630_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.764 0.001 0.181 0.054 0.847 0.052 0.09 0.011 0.528 0.47 0.001 0.001 0.025 0.404 0.03 0.541 0.169 0.716 0.001 0.114 0.001 0.001 0.91 0.088 0.001 0.962 0.001 0.036 0.075 0.037 0.772 0.116 MOTIF Liver_E16.5_H3K4me3_49_169_0.599_1.619694e-215 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.739 0.011 0.082 0.168 0.115 0.001 0.883 0.001 0.133 0.031 0.835 0.001 0.828 0.001 0.17 0.001 0.745 0.125 0.129 0.001 0.657 0.174 0.168 0.001 0.1 0.733 0.163 0.004 0.017 0.868 0.085 0.03 0.059 0.141 0.785 0.015 0.121 0.699 0.163 0.017 0.136 0.001 0.724 0.139 0.075 0.172 0.669 0.084 MOTIF Limb_E14.5_H3K4me3_2_151_0.763_1.093636e-316 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.348 0.123 0.383 0.146 0.788 0.072 0.091 0.049 0.894 0.05 0.055 0.001 0.771 0.093 0.073 0.063 0.257 0.242 0.307 0.193 0.001 0.835 0.08 0.084 0.001 0.065 0.933 0.001 0.001 0.931 0.067 0.001 0.069 0.059 0.816 0.056 0.24 0.314 0.269 0.177 MOTIF Neural-Tube_E14.5_H3K4me3_11_151_0.726_7.202934e-319 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.303 0.233 0.305 0.159 0.885 0.032 0.044 0.039 0.848 0.042 0.071 0.039 0.89 0.045 0.026 0.039 0.433 0.511 0.027 0.029 0.043 0.851 0.065 0.041 0.085 0.06 0.838 0.017 0.006 0.871 0.051 0.072 0.042 0.036 0.873 0.049 0.31 0.25 0.321 0.119 MOTIF Neural-Tube_E15.5_H3K4me3_17_154_0.696_8.156312e-310 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.307 0.229 0.266 0.198 0.881 0.023 0.06 0.036 0.865 0.037 0.069 0.029 0.939 0.038 0.009 0.014 0.453 0.513 0.001 0.033 0.065 0.8 0.063 0.072 0.06 0.056 0.854 0.03 0.069 0.815 0.059 0.057 0.048 0.021 0.879 0.052 0.261 0.223 0.278 0.238 MOTIF Stomach_E14.5_H3K4me3_15_152_0.717_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.709 0.001 0.289 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.689 0.168 0.001 0.142 0.147 0.528 0.157 0.168 0.135 0.672 0.017 0.176 0.195 0.001 0.781 0.023 0.001 0.965 0.033 0.001 0.147 0.001 0.696 0.156 MOTIF Liver_E14.5_H3K27ac_9_160_0.578_9.693444e-89 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.811 0.059 0.08 0.05 0.778 0.079 0.067 0.076 0.85 0.053 0.063 0.034 0.803 0.068 0.079 0.05 0.819 0.076 0.073 0.032 0.051 0.844 0.049 0.056 0.066 0.749 0.06 0.125 0.084 0.048 0.8 0.068 0.111 0.759 0.084 0.046 0.057 0.101 0.787 0.055 MOTIF Midbrain_E11.5_H3K27ac_3_168_0.580_4.225161e-102 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.686 0.102 0.108 0.104 0.105 0.099 0.693 0.103 0.125 0.653 0.122 0.1 0.104 0.101 0.695 0.1 0.097 0.708 0.113 0.082 0.095 0.089 0.692 0.124 0.096 0.1 0.699 0.105 0.124 0.113 0.078 0.685 0.066 0.093 0.074 0.767 0.094 0.097 0.088 0.721 MOTIF Hindbrain_E12.5_H3K9ac_48_168_0.568_1.076028e-99 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.13 0.601 0.133 0.136 0.112 0.127 0.636 0.125 0.115 0.618 0.131 0.136 0.11 0.137 0.614 0.139 0.095 0.09 0.125 0.69 0.081 0.12 0.672 0.127 0.087 0.135 0.109 0.669 0.082 0.115 0.118 0.685 0.067 0.111 0.088 0.734 0.076 0.118 0.103 0.703 0.078 0.121 0.103 0.698 0.094 0.682 0.11 0.114 MOTIF Cranio-Facial_E13.5_H3K9ac_4_155_0.617_2.874777e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.194 0.397 0.219 0.19 0.001 0.133 0.862 0.004 0.001 0.997 0.001 0.001 0.12 0.165 0.593 0.122 0.258 0.001 0.441 0.3 0.05 0.35 0.455 0.145 0.275 0.257 0.227 0.24 0.001 0.18 0.109 0.71 0.001 0.258 0.018 0.723 0.183 0.149 0.243 0.425 MOTIF Forebrain_E14.5_H3K9ac_24_158_0.615_2.950667e-310 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.628 0.1 0.133 0.139 0.764 0.087 0.144 0.005 0.607 0.128 0.153 0.112 0.155 0.13 0.591 0.124 0.111 0.654 0.112 0.123 0.164 0.18 0.003 0.653 0.085 0.669 0.126 0.12 0.009 0.136 0.834 0.021 0.005 0.976 0.012 0.007 0.123 0.12 0.646 0.111 MOTIF Hindbrain_E11.5_H3K9ac_17_156_0.637_6.671927e-312 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.137 0.599 0.135 0.129 0.106 0.126 0.647 0.121 0.111 0.638 0.14 0.111 0.135 0.135 0.602 0.128 0.12 0.149 0.587 0.144 0.147 0.147 0.151 0.555 0.127 0.147 0.563 0.163 0.131 0.152 0.132 0.585 0.118 0.135 0.137 0.61 0.119 0.129 0.136 0.616 MOTIF Intestine_P0_H3K9ac_3_155_0.669_9.202652e-311 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.134 0.65 0.117 0.099 0.071 0.123 0.683 0.123 0.105 0.685 0.128 0.082 0.039 0.11 0.689 0.162 0.185 0.17 0.231 0.413 0.46 0.196 0.149 0.195 0.165 0.16 0.513 0.162 0.102 0.174 0.118 0.606 0.07 0.131 0.117 0.682 0.15 0.117 0.114 0.619 MOTIF Heart_E11.5_H3K9ac_17_169_0.588_1.490575e-203 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.168 0.605 0.17 0.057 0.087 0.132 0.655 0.126 0.114 0.281 0.208 0.397 0.288 0.081 0.13 0.501 0.24 0.189 0.345 0.225 0.203 0.235 0.081 0.481 0.067 0.157 0.218 0.558 0.181 0.141 0.13 0.548 MOTIF Heart_P0_H3K9ac_18_164_0.611_4.582988e-255 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.112 0.692 0.098 0.098 0.089 0.094 0.731 0.086 0.11 0.681 0.113 0.096 0.091 0.094 0.698 0.117 0.07 0.125 0.113 0.692 0.097 0.094 0.1 0.709 0.102 0.121 0.656 0.121 0.084 0.121 0.088 0.707 0.087 0.106 0.092 0.715 0.102 0.091 0.09 0.717 MOTIF Kidney_E16.5_H3K9ac_1_152_0.635_3.281722e-313 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.156 0.621 0.118 0.105 0.064 0.125 0.745 0.066 0.122 0.646 0.157 0.075 0.063 0.088 0.661 0.188 0.119 0.199 0.178 0.504 0.181 0.14 0.155 0.524 0.172 0.162 0.427 0.24 0.15 0.173 0.106 0.571 0.075 0.132 0.116 0.677 0.149 0.134 0.093 0.624 MOTIF Lung_E14.5_H3K9ac_4_156_0.664_1.053612e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.126 0.632 0.126 0.116 0.052 0.067 0.815 0.066 0.131 0.641 0.119 0.109 0.097 0.096 0.633 0.174 0.13 0.163 0.186 0.521 0.158 0.166 0.164 0.512 0.18 0.189 0.405 0.226 0.133 0.172 0.143 0.552 0.083 0.139 0.12 0.658 0.142 0.128 0.1 0.63 MOTIF Heart_E14.5_H3K9ac_6_158_0.608_2.768821e-311 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.184 0.578 0.155 0.083 0.056 0.122 0.735 0.087 0.175 0.495 0.187 0.143 0.032 0.117 0.587 0.264 0.194 0.2 0.212 0.394 0.21 0.137 0.371 0.282 0.349 0.242 0.145 0.264 0.193 0.151 0.113 0.543 0.014 0.11 0.002 0.874 0.153 0.139 0.033 0.675 MOTIF Limb_E13.5_H3K9ac_20_155_0.600_1.499567e-312 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.694 0.102 0.106 0.098 0.737 0.09 0.107 0.066 0.711 0.095 0.082 0.112 0.103 0.122 0.118 0.657 0.094 0.682 0.118 0.106 0.122 0.666 0.108 0.104 0.106 0.693 0.1 0.101 0.08 0.089 0.738 0.093 0.089 0.72 0.099 0.092 0.093 0.107 0.703 0.097 MOTIF Hindbrain_E13.5_H3K9ac_4_152_0.609_3.433516e-313 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.563 0.135 0.155 0.147 0.739 0.094 0.099 0.068 0.602 0.136 0.094 0.168 0.172 0.161 0.166 0.501 0.172 0.503 0.163 0.162 0.177 0.496 0.168 0.159 0.127 0.59 0.157 0.126 0.061 0.094 0.753 0.092 0.105 0.694 0.127 0.074 0.153 0.142 0.559 0.146 MOTIF Midbrain_E16.5_H3K9ac_9_153_0.627_1.048646e-315 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.6 0.131 0.137 0.132 0.635 0.129 0.125 0.111 0.594 0.136 0.117 0.153 0.151 0.152 0.142 0.555 0.132 0.571 0.151 0.146 0.137 0.58 0.145 0.138 0.131 0.589 0.15 0.13 0.105 0.139 0.643 0.113 0.119 0.639 0.137 0.105 0.134 0.139 0.594 0.133 MOTIF Heart_E15.5_H3K9ac_5_155_0.662_7.958571e-310 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.482 0.073 0.176 0.268 0.632 0.121 0.187 0.06 0.743 0.014 0.19 0.053 0.553 0.181 0.105 0.161 0.563 0.305 0.061 0.071 0.229 0.364 0.203 0.204 0.134 0.613 0.008 0.245 0.015 0.137 0.69 0.158 0.01 0.97 0.013 0.007 0.127 0.092 0.624 0.157 MOTIF Cranio-Facial_E15.5_H3K9ac_2_152_0.721_1.875497e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.564 0.142 0.175 0.119 0.662 0.114 0.155 0.069 0.67 0.083 0.158 0.089 0.642 0.127 0.134 0.097 0.454 0.196 0.155 0.195 0.23 0.217 0.163 0.39 0.109 0.656 0.058 0.177 0.064 0.157 0.643 0.136 0.103 0.682 0.116 0.099 0.147 0.096 0.636 0.121 MOTIF Limb_E11.5_H3K9ac_1_152_0.644_6.647069e-310 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.133 0.609 0.083 0.175 0.039 0.087 0.771 0.103 0.04 0.745 0.168 0.047 0.115 0.073 0.632 0.18 0.344 0.066 0.329 0.261 0.143 0.232 0.329 0.295 0.119 0.184 0.187 0.51 0.046 0.137 0.064 0.753 0.021 0.16 0.089 0.73 0.082 0.2 0.116 0.602 MOTIF Liver_E15.5_H3K9ac_7_162_0.636_8.112033e-312 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.473 0.144 0.28 0.103 0.698 0.111 0.19 0.001 0.86 0.004 0.13 0.006 0.789 0.119 0.084 0.008 0.499 0.277 0.145 0.08 0.262 0.51 0.09 0.138 0.012 0.775 0.115 0.098 0.009 0.102 0.885 0.004 0.088 0.804 0.101 0.007 0.093 0.116 0.664 0.127 MOTIF Lung_E15.5_H3K9ac_26_158_0.662_1.991254e-311 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.107 0.682 0.105 0.106 0.092 0.094 0.713 0.101 0.079 0.738 0.105 0.078 0.08 0.091 0.706 0.123 0.666 0.101 0.128 0.105 0.105 0.113 0.66 0.122 0.108 0.111 0.105 0.676 0.084 0.099 0.081 0.736 0.072 0.108 0.08 0.74 0.103 0.12 0.094 0.683 MOTIF Cranio-Facial_E12.5_H3K9ac_3_152_0.656_7.97433e-312 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.226 0.259 0.274 0.241 0.137 0.563 0.156 0.144 0.102 0.165 0.601 0.132 0.119 0.609 0.154 0.118 0.134 0.17 0.574 0.122 0.147 0.17 0.509 0.174 0.157 0.169 0.153 0.521 0.137 0.147 0.152 0.564 0.15 0.161 0.146 0.543 0.234 0.262 0.244 0.259 MOTIF Liver_E13.5_H3K9ac_8_155_0.611_4.432865e-312 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.691 0.098 0.126 0.085 0.761 0.089 0.101 0.049 0.691 0.121 0.098 0.09 0.093 0.747 0.089 0.071 0.077 0.759 0.059 0.105 0.05 0.071 0.846 0.033 0.092 0.792 0.095 0.021 0.098 0.087 0.713 0.102 MOTIF Liver_E14.5_H3K9ac_22_164_0.604_9.400933e-193 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.806 0.069 0.08 0.045 0.794 0.072 0.08 0.054 0.796 0.064 0.095 0.045 0.816 0.07 0.062 0.052 0.794 0.11 0.061 0.035 0.079 0.784 0.059 0.078 0.086 0.769 0.067 0.078 0.067 0.056 0.821 0.056 0.075 0.842 0.045 0.038 0.083 0.086 0.78 0.051 MOTIF Neural-Tube_E12.5_H3K9ac_7_165_0.642_2.302121e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.698 0.101 0.106 0.095 0.756 0.081 0.087 0.076 0.739 0.095 0.09 0.076 0.665 0.128 0.114 0.093 0.117 0.674 0.106 0.103 0.117 0.704 0.077 0.102 0.085 0.119 0.703 0.093 0.107 0.697 0.108 0.088 0.11 0.097 0.683 0.11 0.107 0.68 0.108 0.105