MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Intestine_E14.5_H3K27me3_30_22_0.541_7.134589e-43
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.046645	0.809354	0.066998	0.077003
0.048371	0.825833	0.04536	0.080435
0.106473	0.625461	0.145968	0.122099
0.133375	0.02168	0.777598	0.067348
0.038831	0.034801	0.91813	0.008237
0.82198	0.032241	0.068651	0.077127
0.017937	0.073675	0.876317	0.032071
0.063058	0.77559	0.092258	0.069094
0.083332	0.837062	0.032968	0.046638
0.248821	0.161601	0.456406	0.133173
0.138189	0.537611	0.279281	0.044919
0.159275	0.239754	0.501837	0.099133

MOTIF	Lung_E15.5_H3K9ac_37_38_0.633_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.036857	0.785809	0.021133	0.156201
0.035951	0.118608	0.796819	0.048622
0.018651	0.037573	0.943776	0.0
0.275944	0.557426	0.016615	0.150016
0.010335	0.021055	0.944378	0.024231
0.198069	0.085684	0.657452	0.058796
0.100306	0.890738	0.006698	0.002257
0.096807	0.093751	0.0366	0.772842
0.011653	0.949441	0.014246	0.024659

MOTIF	Cranio-Facial_E14.5_H3K9ac_33_31_0.603_3.585116e-310
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.245027	0.4725	0.14633	0.136142
0.047927	0.042625	0.890179	0.019269
0.04452	0.106785	0.813149	0.035547
0.774631	0.022128	0.114092	0.089149
0.011122	0.053012	0.867939	0.067928
0.350061	0.504286	0.016372	0.129281
0.055513	0.672887	0.108153	0.163448
0.046463	0.017382	0.862705	0.07345
0.003314	0.93143	0.053334	0.011922
0.019861	0.756934	0.11165	0.111556
0.079105	0.60539	0.206502	0.109004

MOTIF	Forebrain_E12.5_H3K9ac_40_46_0.578_4.661316e-171
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.0572	0.178804	0.501917	0.262078
0.034353	0.00709	0.936133	0.022423
0.141533	0.0	0.841875	0.016592
0.812603	0.06918	0.045045	0.073173
0.015481	0.039892	0.920037	0.02459
0.092047	0.596933	0.081572	0.229448
0.154095	0.662328	0.039752	0.143825
0.013403	0.014675	0.954564	0.017358
0.011691	0.930515	0.044388	0.013406
0.0	0.732065	0.059448	0.208488

MOTIF	Midbrain_E12.5_H3K9ac_57_51_0.569_1.54567e-162
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.126345	0.025299	0.832811	0.015545
0.041989	0.020335	0.905193	0.032484
0.838312	0.03973	0.070865	0.051093
0.010931	0.033306	0.938126	0.017637
0.245948	0.656581	0.026971	0.070499
0.204874	0.585344	0.066461	0.14332
0.043655	0.011766	0.923486	0.021093
0.025587	0.89946	0.055093	0.019859
0.098085	0.748524	0.048626	0.104765

MOTIF	Neural-Tube_E15.5_H3K9ac_44_60_0.612_7.172351e-320
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.182909	0.033762	0.772087	0.011242
0.106939	0.022777	0.848442	0.021842
0.932673	0.0	0.03056	0.036768
0.033703	0.039431	0.867223	0.059643
0.277645	0.485699	0.094357	0.142299
0.03671	0.871465	0.058549	0.033276
0.034894	0.024476	0.926112	0.014519
0.131397	0.814329	0.03659	0.017685
0.031692	0.824094	0.067931	0.076284

MOTIF	Intestine_E16.5_H3K9ac_15_17_0.600_1.00524e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.024919	0.758667	0.195267	0.021147
0.195119	0.046702	0.636969	0.121211
0.067237	0.047831	0.870237	0.014695
0.8165	0.035762	0.101356	0.046382
0.07817	0.027093	0.841891	0.052846
0.212877	0.697233	0.017315	0.072576
0.07441	0.790731	0.07786	0.056999
0.048572	0.016376	0.767555	0.167497
0.006669	0.90578	0.0779	0.00965
0.330183	0.161748	0.278313	0.229757

MOTIF	Hindbrain_E15.5_H3K9ac_8_11_0.693_1.973891e-319
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.041959	0.829535	0.053117	0.075388
0.116697	0.060925	0.718131	0.104247
0.074788	0.058486	0.854641	0.012085
0.800915	0.068752	0.065317	0.065016
0.032461	0.015211	0.930863	0.021465
0.143329	0.759709	0.04333	0.053632
0.0402	0.75776	0.053712	0.148328
0.084051	0.064208	0.772037	0.079703
0.069084	0.802763	0.080729	0.047424
0.058469	0.206654	0.509567	0.225311
0.192784	0.269463	0.347483	0.19027

MOTIF	Kidney_P0_H3K9ac_15_9_0.635_3.708361e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.027983	0.844193	0.071748	0.056076
0.120979	0.079246	0.690367	0.109407
0.019511	0.029694	0.937215	0.013581
0.787959	0.078182	0.060495	0.073365
0.045791	0.036584	0.860333	0.057292
0.120004	0.772264	0.033881	0.073851
0.063825	0.764491	0.027963	0.143721
0.034274	0.047861	0.793817	0.124048
0.113128	0.803991	0.064288	0.018593
0.111363	0.334682	0.454556	0.099398

MOTIF	Hindbrain_E16.5_H3K9ac_22_17_0.609_6.143558e-319
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.013585	0.861349	0.035761	0.089305
0.17615	0.018442	0.719177	0.086232
0.060739	0.047644	0.874858	0.016759
0.850299	0.021782	0.057704	0.070215
0.091217	0.027235	0.822469	0.059079
0.157716	0.800208	0.023757	0.018319
0.053337	0.823753	0.066409	0.0565
0.146646	0.115046	0.652083	0.086226
0.044475	0.827847	0.101447	0.026231
0.32442	0.179441	0.367505	0.128634

MOTIF	Neural-Tube_E12.5_H3K9ac_27_16_0.615_3.117704e-311
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.020447	0.839472	0.050082	0.089999
0.193963	0.02548	0.678396	0.102161
0.040638	0.058713	0.894864	0.005784
0.827142	0.027044	0.076729	0.069085
0.054072	0.013919	0.907424	0.024586
0.20449	0.75143	0.02431	0.01977
0.05746	0.798068	0.079904	0.064568
0.123313	0.126044	0.716904	0.033738
0.07257	0.815218	0.096141	0.016072
0.390323	0.323635	0.191339	0.094703

MOTIF	Intestine_P0_H3K9ac_16_11_0.637_1.10004e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.088533	0.803654	0.074694	0.03312
0.110826	0.043849	0.82246	0.022866
0.060055	0.040397	0.886444	0.013104
0.825395	0.032477	0.103809	0.038319
0.054428	0.01896	0.900189	0.026423
0.121948	0.767756	0.043155	0.067142
0.102487	0.665611	0.065434	0.166468
0.063518	0.093723	0.77398	0.068778
0.059915	0.839117	0.077418	0.023551
0.363211	0.151896	0.332896	0.151997

MOTIF	Limb_E12.5_H3K9ac_12_13_0.620_3.498192e-318
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.085887	0.793969	0.060083	0.060061
0.068347	0.023977	0.874226	0.033449
0.06449	0.048973	0.874543	0.011995
0.862044	0.046717	0.05067	0.040569
0.053907	0.011186	0.927755	0.007152
0.168062	0.735707	0.026915	0.069316
0.111823	0.604745	0.097319	0.186113
0.05612	0.111165	0.74049	0.092225
0.071801	0.818914	0.086782	0.022503
0.323059	0.229178	0.255638	0.192124

MOTIF	Kidney_E14.5_H3K9ac_22_20_0.631_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.070473	0.773898	0.068458	0.087171
0.040165	0.023662	0.85738	0.078793
0.073778	0.046082	0.85536	0.02478
0.816024	0.051423	0.084319	0.048234
0.011617	0.022473	0.940925	0.024984
0.146003	0.717268	0.059449	0.07728
0.037824	0.847655	0.054257	0.060264
0.100239	0.111299	0.655771	0.132691
0.101013	0.76328	0.078165	0.057543

MOTIF	Limb_E11.5_H3K9ac_15_15_0.609_6.480634e-258
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.081706	0.670927	0.162094	0.085273
0.077111	0.007342	0.877716	0.037832
0.057916	0.040614	0.881801	0.019669
0.888439	0.050634	0.028175	0.032752
0.062952	0.033018	0.880876	0.023153
0.138522	0.790459	0.04888	0.022139
0.115178	0.757959	0.062928	0.063935
0.087368	0.13537	0.683409	0.093853
0.045974	0.808629	0.097715	0.047681

MOTIF	Liver_E14.5_H3K9ac_31_17_0.597_2.083847e-311
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.013794	0.842413	0.091347	0.052446
0.107184	0.073722	0.754073	0.065022
0.044682	0.037817	0.879357	0.038144
0.847043	0.044006	0.076238	0.032713
0.078965	0.024229	0.872408	0.024398
0.084749	0.859927	0.038236	0.017087
0.107524	0.673213	0.045197	0.174066
0.079439	0.09178	0.732639	0.096142
0.071072	0.83744	0.085814	0.005675

MOTIF	Lung_P0_H3K9ac_21_16_0.659_1.095662e-310
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.022347	0.86154	0.073258	0.042855
0.054377	0.037938	0.85733	0.050355
0.075949	0.064297	0.844047	0.015707
0.809471	0.070038	0.077083	0.043408
0.035458	0.022786	0.912658	0.029098
0.134728	0.786345	0.023429	0.055499
0.14174	0.627779	0.09247	0.138012
0.077478	0.122754	0.73439	0.065378
0.084492	0.822417	0.069782	0.023309

MOTIF	Liver_E11.5_H3K9ac_26_13_0.594_5.876547e-312
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.01164	0.851318	0.086399	0.050643
0.100844	0.029448	0.784867	0.084841
0.03343	0.03707	0.911351	0.018149
0.815221	0.061745	0.061593	0.061441
0.060123	0.020014	0.89864	0.021223
0.142206	0.764556	0.025872	0.067367
0.056785	0.765779	0.027473	0.149963
0.065273	0.175059	0.654087	0.10558
0.083929	0.827007	0.042706	0.046358
0.209317	0.494643	0.211807	0.084234

MOTIF	Midbrain_E11.5_H3K9ac_19_16_0.619_1.95942e-312
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.043344	0.717451	0.170189	0.069016
0.138854	0.038862	0.761007	0.061276
0.037856	0.046364	0.908331	0.007449
0.855487	0.02028	0.073154	0.05108
0.030279	0.034882	0.901743	0.033096
0.165957	0.750512	0.032693	0.050838
0.059169	0.829889	0.033343	0.077599
0.106167	0.05941	0.719972	0.114451
0.126851	0.76637	0.066078	0.0407

MOTIF	Forebrain_E16.5_H3K9ac_20_12_0.619_3.252928e-320
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.034768	0.835693	0.07325	0.056289
0.121409	0.030253	0.769812	0.078526
0.028742	0.041762	0.923222	0.006275
0.840057	0.031164	0.085112	0.043668
0.081059	0.025487	0.873285	0.020168
0.136389	0.743852	0.083852	0.035906
0.051759	0.780295	0.049275	0.118671
0.077851	0.153896	0.670909	0.097343
0.091032	0.760842	0.086241	0.061886

MOTIF	Midbrain_E15.5_H3K9ac_18_12_0.658_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.015181	0.868416	0.062629	0.053774
0.097267	0.053039	0.778701	0.070992
0.022586	0.044339	0.921753	0.011322
0.801905	0.062126	0.071226	0.064742
0.039656	0.026071	0.899892	0.03438
0.121337	0.744352	0.077271	0.057039
0.045902	0.793603	0.042083	0.118412
0.094349	0.10245	0.708396	0.094804
0.088901	0.795112	0.067735	0.048253

MOTIF	Stomach_E16.5_H3K9ac_25_15_0.586_1.191835e-319
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.038168	0.840118	0.07853	0.043183
0.175707	0.022432	0.714014	0.087846
0.023528	0.022296	0.944995	0.00918
0.873734	0.061552	0.019956	0.044757
0.064586	0.055784	0.857292	0.022339
0.125897	0.762313	0.065159	0.046631
0.056822	0.749871	0.037264	0.156043
0.105365	0.096194	0.684013	0.114429
0.125101	0.760737	0.076353	0.037809

MOTIF	Intestine_E15.5_H3K9ac_46_38_0.585_7.700043e-142
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.009402	0.761088	0.1007	0.12881
0.016174	0.511349	0.037646	0.434831
0.054078	0.008665	0.907816	0.029441
0.029092	0.024553	0.878604	0.06775
0.941417	0.045752	0.0	0.012831
0.032499	0.018293	0.928802	0.020406
0.049939	0.84655	0.061314	0.042197
0.021241	0.92638	0.017304	0.035076
0.201144	0.064419	0.476824	0.257613

MOTIF	Forebrain_E11.5_H3K9ac_26_18_0.604_7.805154e-275
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.101412	0.858357	0.032257	0.007974
0.026656	0.855897	0.084411	0.033035
0.044293	0.028333	0.708552	0.218822
0.173735	0.029953	0.733639	0.062673
0.877986	0.037372	0.06217	0.022472
0.011502	0.031353	0.954307	0.002838
0.041547	0.710421	0.008474	0.239558
0.020085	0.879421	0.04377	0.056724
0.028667	0.060801	0.873875	0.036657
0.143885	0.094457	0.645793	0.115865
0.430697	0.04061	0.279218	0.249475

MOTIF	Neural-Tube_E13.5_H3K9ac_16_16_0.603_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.027562	0.767998	0.063703	0.140736
0.040211	0.849177	0.081782	0.02883
0.056153	0.006695	0.902695	0.034457
0.124858	0.027156	0.821312	0.026673
0.855779	0.052271	0.04399	0.047961
0.121675	0.021076	0.815684	0.041565
0.235007	0.692014	0.058586	0.014393
0.035373	0.696642	0.040697	0.227287
0.086148	0.053708	0.83898	0.021164
0.125201	0.44729	0.189131	0.238378

MOTIF	Liver_E15.5_H3K9ac_39_39_0.576_1.447257e-238
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.025114	0.881272	0.077858	0.015755
0.064611	0.764781	0.029908	0.1407
0.064388	0.0	0.830221	0.105392
0.066192	0.041668	0.861122	0.031019
0.899304	0.037597	0.013683	0.049416
0.00741	0.0229	0.918012	0.051678
0.027936	0.887235	0.025504	0.059324
0.103972	0.619617	0.0132	0.26321
0.142024	0.095005	0.606956	0.156015

MOTIF	Stomach_E14.5_H3K9ac_31_21_0.657_6.923251e-311
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.012692	0.864929	0.029692	0.092687
0.137355	0.611435	0.083272	0.167938
0.193032	0.030236	0.727493	0.049238
0.105022	0.080455	0.788422	0.026101
0.878103	0.022182	0.07771	0.022005
0.013038	0.0489	0.933736	0.004326
0.160105	0.641396	0.050287	0.148211
0.047163	0.869062	0.044097	0.039678
0.054809	0.070887	0.842365	0.031939
0.271884	0.268598	0.280815	0.178703

MOTIF	Limb_E11.5_H3K9ac_34_37_0.580_5.056929e-161
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.061094	0.863348	0.039654	0.035904
0.019518	0.903036	0.033478	0.043968
0.190115	0.038619	0.648148	0.123118
0.128704	0.018421	0.827209	0.025665
0.828397	0.008347	0.055682	0.107574
0.019332	0.020366	0.927926	0.032376
0.024969	0.770585	0.022582	0.181864
0.04988	0.845374	0.061959	0.042787
0.056991	0.058194	0.659997	0.224817

MOTIF	Lung_E16.5_H3K9ac_29_27_0.586_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.053968	0.819041	0.032246	0.094746
0.014694	0.822261	0.053382	0.109664
0.25829	0.041056	0.604226	0.096427
0.042037	0.025189	0.910197	0.022578
0.740734	0.04426	0.094388	0.120618
0.013068	0.027177	0.938012	0.021742
0.132552	0.705234	0.038193	0.124021
0.037943	0.85065	0.057027	0.05438
0.045366	0.075183	0.757578	0.121874

MOTIF	Stomach_P0_H3K9ac_30_11_0.596_5.419217e-238
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.014307	0.927653	0.033045	0.024995
0.025748	0.784389	0.083562	0.106301
0.189376	0.026592	0.715473	0.068559
0.097135	0.040534	0.824001	0.03833
0.865612	0.021837	0.078683	0.033868
0.013616	0.033527	0.918883	0.033974
0.178026	0.679401	0.051394	0.091179
0.033033	0.877091	0.042035	0.04784
0.051376	0.087036	0.672126	0.189462
0.074097	0.331724	0.565994	0.028185