MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Forebrain_P0_H3K27me3_23_160_0.521_9.364041e-16 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.048 0.501 0.245 0.206 0.054 0.012 0.192 0.742 0.095 0.035 0.318 0.552 0.012 0.265 0.267 0.456 0.196 0.414 0.249 0.14 0.054 0.301 0.414 0.231 0.207 0.378 0.312 0.103 0.254 0.012 0.494 0.24 0.28 0.011 0.693 0.016 0.204 0.229 0.414 0.153 MOTIF Heart_P0_H3K27me3_12_170_0.530_4.245043e-15 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.116 0.092 0.103 0.689 0.058 0.728 0.077 0.137 0.056 0.674 0.051 0.219 0.179 0.415 0.312 0.094 0.165 0.455 0.218 0.162 0.133 0.079 0.583 0.205 0.13 0.557 0.186 0.127 0.82 0.058 0.077 0.045 0.607 0.142 0.195 0.056 0.799 0.061 0.065 0.075 MOTIF Heart_E16.5_H3K27me3_14_167_0.533_1.088785e-21 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.078 0.112 0.087 0.723 0.086 0.095 0.097 0.722 0.09 0.069 0.121 0.72 0.089 0.122 0.682 0.107 0.112 0.68 0.106 0.102 0.137 0.094 0.662 0.107 0.097 0.672 0.128 0.103 0.102 0.083 0.695 0.12 0.074 0.099 0.746 0.081 0.699 0.1 0.106 0.095 MOTIF Kidney_E14.5_H3K27me3_10_160_0.545_5.573616e-41 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.137 0.131 0.164 0.568 0.109 0.648 0.139 0.104 0.126 0.634 0.13 0.11 0.125 0.159 0.577 0.139 0.13 0.59 0.139 0.141 0.13 0.132 0.601 0.137 0.143 0.572 0.16 0.125 0.62 0.152 0.104 0.124 0.618 0.145 0.128 0.109 0.573 0.149 0.148 0.13 MOTIF Midbrain_E16.5_H3K27me3_9_165_0.531_4.173417e-23 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.109 0.148 0.131 0.612 0.115 0.134 0.13 0.621 0.131 0.119 0.146 0.604 0.13 0.147 0.587 0.136 0.135 0.594 0.143 0.128 0.135 0.134 0.602 0.129 0.138 0.595 0.143 0.124 0.135 0.127 0.601 0.137 0.115 0.149 0.594 0.142 0.135 0.134 0.142 0.589 MOTIF Liver_P0_H3K27me3_10_166_0.574_8.49263e-103 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.057 0.76 0.08 0.103 0.092 0.774 0.063 0.071 0.062 0.103 0.779 0.056 0.052 0.749 0.138 0.061 0.061 0.121 0.745 0.073 0.735 0.177 0.036 0.052 0.772 0.09 0.062 0.076 0.687 0.09 0.154 0.069 MOTIF Hindbrain_E16.5_H3K4me3_28_173_0.655_7.147483e-310 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.086 0.795 0.052 0.067 0.066 0.785 0.075 0.074 0.094 0.055 0.808 0.043 0.064 0.802 0.067 0.067 0.037 0.083 0.819 0.061 0.805 0.049 0.087 0.059 0.812 0.071 0.064 0.053 0.753 0.092 0.091 0.064 0.795 0.041 0.086 0.078 0.062 0.054 0.824 0.06 MOTIF Lung_E15.5_H3K4me3_7_154_0.734_2.853467e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.026 0.093 0.086 0.795 0.044 0.078 0.063 0.815 0.073 0.041 0.049 0.837 0.07 0.802 0.077 0.051 0.108 0.081 0.705 0.106 0.072 0.824 0.04 0.064 0.083 0.06 0.778 0.079 0.03 0.071 0.832 0.067 0.105 0.776 0.061 0.058 0.063 0.035 0.841 0.061 MOTIF Midbrain_E15.5_H3K4me3_8_153_0.736_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.072 0.834 0.044 0.05 0.039 0.06 0.807 0.094 0.024 0.914 0.047 0.015 0.128 0.703 0.049 0.12 0.053 0.102 0.801 0.044 0.101 0.739 0.098 0.062 0.101 0.063 0.769 0.067 0.856 0.05 0.058 0.036 0.788 0.068 0.077 0.067 0.791 0.066 0.091 0.052 MOTIF Cranio-Facial_E12.5_H3K4me2_9_157_0.660_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.113 0.155 0.142 0.59 0.07 0.162 0.124 0.644 0.11 0.164 0.144 0.582 0.09 0.629 0.141 0.14 0.12 0.561 0.16 0.159 0.138 0.612 0.128 0.122 0.14 0.166 0.557 0.137 0.121 0.188 0.596 0.095 0.137 0.633 0.116 0.114 0.139 0.102 0.596 0.163 MOTIF Heart_E13.5_H3K4me2_11_157_0.612_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.151 0.152 0.085 0.612 0.03 0.164 0.037 0.769 0.034 0.159 0.119 0.688 0.144 0.497 0.141 0.218 0.166 0.511 0.144 0.179 0.136 0.587 0.159 0.118 0.148 0.19 0.541 0.121 0.104 0.205 0.572 0.119 0.157 0.62 0.138 0.085 0.164 0.079 0.575 0.182 MOTIF Cranio-Facial_E13.5_H3K4me2_14_156_0.625_7.687661e-320 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.166 0.192 0.003 0.639 0.003 0.216 0.005 0.776 0.002 0.238 0.004 0.756 0.121 0.504 0.167 0.208 0.092 0.691 0.004 0.213 0.143 0.531 0.175 0.151 0.143 0.2 0.492 0.165 0.107 0.166 0.548 0.179 0.184 0.609 0.17 0.037 0.182 0.12 0.535 0.163 MOTIF Heart_P0_H3K4me2_18_162_0.624_2.887622e-317 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.201 0.194 0.074 0.531 0.008 0.251 0.024 0.717 0.001 0.216 0.104 0.679 0.001 0.623 0.216 0.16 0.191 0.562 0.001 0.246 0.153 0.513 0.16 0.174 0.12 0.182 0.581 0.117 0.086 0.212 0.534 0.168 0.256 0.566 0.07 0.108 0.223 0.023 0.561 0.193 MOTIF Forebrain_E15.5_H3K4me2_27_158_0.634_6.26748e-310 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.123 0.253 0.073 0.551 0.057 0.158 0.08 0.705 0.013 0.274 0.058 0.655 0.013 0.34 0.022 0.625 0.101 0.488 0.119 0.292 0.048 0.614 0.05 0.288 0.087 0.56 0.189 0.164 0.021 0.397 0.462 0.12 0.036 0.616 0.324 0.024 0.114 0.258 0.52 0.108 MOTIF Midbrain_E16.5_H3K4me2_5_156_0.680_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.225 0.276 0.192 0.307 0.093 0.191 0.14 0.576 0.052 0.311 0.117 0.52 0.076 0.279 0.139 0.506 0.1 0.366 0.228 0.305 0.17 0.44 0.178 0.212 0.074 0.565 0.263 0.098 0.002 0.208 0.754 0.036 0.056 0.74 0.159 0.045 0.243 0.163 0.378 0.217 MOTIF Heart_E14.5_H3K4me2_11_158_0.611_1.355222e-320 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.18 0.285 0.065 0.47 0.071 0.246 0.099 0.584 0.067 0.248 0.124 0.561 0.149 0.445 0.098 0.308 0.126 0.456 0.227 0.191 0.001 0.64 0.297 0.062 0.128 0.312 0.559 0.001 0.201 0.091 0.576 0.132 MOTIF Hindbrain_E14.5_H3K4me2_16_166_0.644_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.177 0.224 0.1 0.5 0.075 0.215 0.029 0.681 0.025 0.219 0.005 0.751 0.017 0.58 0.129 0.274 0.09 0.592 0.182 0.136 0.001 0.699 0.292 0.008 0.008 0.256 0.726 0.01 0.202 0.178 0.503 0.117 MOTIF Neural-Tube_E13.5_H3K4me2_27_167_0.626_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.049 0.197 0.135 0.619 0.021 0.481 0.001 0.497 0.045 0.229 0.012 0.714 0.001 0.585 0.255 0.159 0.1 0.639 0.06 0.201 0.001 0.694 0.304 0.001 0.149 0.29 0.56 0.001 0.063 0.026 0.806 0.105 MOTIF Stomach_E15.5_H3K4me2_26_166_0.628_1.657894e-315 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.105 0.175 0.132 0.588 0.01 0.288 0.001 0.701 0.068 0.257 0.16 0.515 0.112 0.715 0.156 0.017 0.138 0.638 0.081 0.143 0.001 0.518 0.393 0.088 0.117 0.191 0.691 0.001 0.171 0.001 0.695 0.133 MOTIF Heart_E12.5_H3K4me2_12_166_0.613_2.864885e-311 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.204 0.209 0.029 0.558 0.202 0.267 0.014 0.517 0.203 0.182 0.155 0.46 0.225 0.559 0.175 0.041 0.181 0.356 0.286 0.177 0.005 0.75 0.122 0.123 0.143 0.251 0.524 0.082 0.149 0.202 0.488 0.161 MOTIF Liver_E13.5_H3K4me2_15_166_0.610_5.040786e-312 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.132 0.592 0.146 0.13 0.132 0.59 0.147 0.131 0.116 0.127 0.639 0.118 0.126 0.616 0.138 0.12 0.141 0.118 0.608 0.133 0.591 0.134 0.153 0.122 0.618 0.123 0.136 0.123 0.599 0.138 0.131 0.132 0.589 0.142 0.131 0.138 0.158 0.139 0.556 0.147 MOTIF Midbrain_E12.5_H3K4me2_11_154_0.649_5.314904e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.154 0.331 0.303 0.211 0.112 0.559 0.143 0.186 0.106 0.027 0.66 0.207 0.054 0.417 0.259 0.27 0.092 0.077 0.442 0.389 0.367 0.179 0.344 0.109 0.679 0.049 0.188 0.084 0.845 0.069 0.029 0.057 0.467 0.102 0.162 0.269 0.251 0.172 0.205 0.371 MOTIF Hindbrain_E16.5_H3K4me2_13_158_0.648_2.177313e-318 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.083 0.266 0.141 0.51 0.01 0.129 0.045 0.816 0.017 0.03 0.018 0.935 0.041 0.146 0.152 0.661 0.103 0.72 0.017 0.16 0.169 0.195 0.563 0.073 0.001 0.954 0.022 0.023 0.061 0.122 0.8 0.017 0.141 0.162 0.611 0.086 0.579 0.099 0.13 0.192 MOTIF Stomach_P0_H3K4me2_7_156_0.659_3.475358e-311 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.125 0.103 0.075 0.697 0.03 0.061 0.021 0.888 0.052 0.16 0.015 0.773 0.051 0.292 0.036 0.621 0.128 0.657 0.042 0.173 0.107 0.241 0.58 0.072 0.001 0.965 0.033 0.001 0.013 0.054 0.903 0.03 0.168 0.151 0.633 0.048 0.502 0.164 0.198 0.136 MOTIF Midbrain_E14.5_H3K27me3_21_174_0.535_6.961937e-21 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.084 0.801 0.002 0.113 0.098 0.162 0.047 0.693 0.066 0.154 0.087 0.693 0.079 0.118 0.057 0.746 0.109 0.111 0.131 0.649 0.113 0.668 0.053 0.166 0.127 0.126 0.628 0.119 0.08 0.711 0.111 0.098 0.128 0.111 0.655 0.106 0.035 0.12 0.754 0.091 MOTIF Lung_E16.5_H3K27me3_21_175_0.557_2.941853e-33 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.107 0.116 0.102 0.675 0.064 0.784 0.084 0.068 0.135 0.663 0.086 0.116 0.089 0.142 0.681 0.088 0.086 0.741 0.096 0.077 0.12 0.094 0.7 0.086 0.688 0.138 0.102 0.072 0.703 0.101 0.097 0.099 0.67 0.102 0.134 0.094 0.694 0.099 0.109 0.098 MOTIF Stomach_E15.5_H3K27me3_20_169_0.543_6.15705e-20 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.127 0.175 0.153 0.545 0.062 0.645 0.156 0.137 0.125 0.603 0.143 0.129 0.116 0.189 0.603 0.092 0.165 0.502 0.211 0.122 0.178 0.099 0.564 0.159 0.603 0.144 0.194 0.059 0.703 0.113 0.128 0.056 0.685 0.126 0.132 0.057 0.55 0.14 0.17 0.14 MOTIF Stomach_E16.5_H3K27me3_5_164_0.565_3.24952e-45 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.118 0.183 0.151 0.548 0.055 0.188 0.154 0.603 0.071 0.162 0.151 0.616 0.077 0.211 0.172 0.54 0.132 0.63 0.109 0.129 0.106 0.209 0.572 0.113 0.065 0.684 0.19 0.061 0.121 0.121 0.643 0.115 0.075 0.194 0.701 0.03 0.465 0.167 0.204 0.164 MOTIF Liver_E14.5_H3K27me3_31_170_0.564_3.848849e-42 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.059 0.05 0.062 0.829 0.045 0.091 0.092 0.772 0.042 0.046 0.05 0.862 0.042 0.068 0.071 0.819 0.054 0.792 0.053 0.101 0.093 0.094 0.68 0.133 0.062 0.793 0.077 0.068 0.102 0.05 0.757 0.091 0.043 0.059 0.883 0.015 0.817 0.043 0.029 0.111 MOTIF Lung_P0_H3K27me3_15_170_0.559_9.973361e-25 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.06 0.027 0.073 0.84 0.029 0.826 0.077 0.068 0.073 0.793 0.056 0.078 0.11 0.057 0.79 0.043 0.083 0.707 0.096 0.114 0.066 0.066 0.828 0.04 0.806 0.02 0.076 0.098 0.809 0.072 0.063 0.056 0.829 0.079 0.048 0.044 0.779 0.07 0.094 0.057 MOTIF Stomach_E15.5_H3K9ac_30_166_0.637_3.26722e-186 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.062 0.79 0.074 0.074 0.099 0.714 0.118 0.069 0.107 0.058 0.788 0.047 0.108 0.743 0.073 0.076 0.076 0.069 0.831 0.024 0.845 0.04 0.074 0.041 0.736 0.141 0.036 0.087 0.771 0.059 0.084 0.086 0.861 0.03 0.055 0.054 0.008 0.029 0.924 0.039