MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Liver_E16.5_H3K4me1_87_32_0.511_1.270159e-10 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.033811 0.966189 0.0 0.0 0.0 0.964083 0.0 0.035917 0.0 0.789394 0.05565 0.154956 0.014505 0.210426 0.745168 0.0299 0.028265 0.94573 0.017626 0.008379 0.912304 0.019386 0.06831 0.0 0.0 0.0 0.982386 0.017614 0.04496 0.928139 0.020503 0.006397 0.026254 0.901846 0.030539 0.041361 MOTIF Kidney_E14.5_H3K4me1_57_23_0.516_4.088986e-20 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.047908 0.836184 0.037716 0.078192 0.13943 0.771812 0.03638 0.052378 0.10646 0.803759 0.019085 0.070696 0.248061 0.426948 0.165549 0.159442 0.014695 0.872462 0.110317 0.002526 0.846504 0.021517 0.067366 0.064613 0.002845 0.005096 0.972332 0.019727 0.031966 0.914199 0.043024 0.010811 0.042216 0.713362 0.076973 0.167448 MOTIF Midbrain_E11.5_H3K4me1_67_23_0.513_1.525468e-14 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.081639 0.711794 0.040658 0.165909 0.115103 0.790103 0.034058 0.060736 0.066035 0.855068 0.020752 0.058145 0.216473 0.501103 0.126318 0.156106 0.017123 0.865503 0.114143 0.003231 0.868629 0.022628 0.044564 0.06418 0.008956 0.007584 0.954603 0.028857 0.027342 0.897544 0.059985 0.015129 0.069254 0.786085 0.017348 0.127312 MOTIF Forebrain_E11.5_H3K4me2_83_89_0.537_1.723282e-162 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.026706 0.962606 0.004489 0.0062 0.012683 0.692511 0.041852 0.252955 0.215036 0.038579 0.701178 0.045207 0.014068 0.960912 0.017937 0.007083 0.726844 0.00606 0.033743 0.233353 0.003978 0.055314 0.909781 0.030927 0.027308 0.730085 0.045677 0.19693 0.0 0.851592 0.044432 0.103976 0.653359 0.152635 0.039798 0.154208 MOTIF Hindbrain_E16.5_H3K4me2_80_58_0.537_6.589153e-84 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.046033 0.843082 0.009978 0.100906 0.240998 0.037675 0.696671 0.024656 0.025639 0.881926 0.068947 0.023487 0.742619 0.031368 0.042715 0.183299 0.007279 0.013522 0.976989 0.00221 0.023957 0.693648 0.048967 0.233428 0.0 0.936589 0.052945 0.010467 0.814242 0.0612 0.030303 0.094254 0.024062 0.808165 0.020214 0.14756 0.24387 0.348873 0.155914 0.251343 MOTIF Heart_E12.5_H3K9ac_40_25_0.556_2.826225e-182 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.112757 0.109131 0.626567 0.151545 0.031034 0.82912 0.046764 0.093082 0.041663 0.769451 0.118577 0.070309 0.068988 0.038192 0.731192 0.161628 0.074757 0.676605 0.227523 0.021115 0.833804 0.024351 0.078062 0.063783 0.002257 0.005682 0.967488 0.024572 0.104035 0.796151 0.037921 0.061893 0.055875 0.881066 0.040464 0.022594 MOTIF Kidney_P0_H3K9ac_54_17_0.564_2.560157e-148 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.021462 0.924538 0.018957 0.035043 0.108525 0.714175 0.060483 0.116817 0.098177 0.053383 0.808835 0.039604 0.029376 0.758188 0.197291 0.015145 0.799139 0.018588 0.068827 0.113447 0.006977 0.023519 0.955412 0.014092 0.057801 0.809698 0.043829 0.088671 0.051082 0.773165 0.054159 0.121594 0.092554 0.804707 0.060951 0.041788 0.206672 0.267597 0.177108 0.348623 MOTIF Neural-Tube_E11.5_H3K9ac_87_83_0.529_3.288001e-27 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.094242 0.845152 0.037868 0.022737 0.041508 0.576263 0.098642 0.283587 0.145927 0.034796 0.686917 0.13236 0.035044 0.952828 0.006211 0.005917 0.749563 0.054905 0.0627 0.132832 0.0 0.021745 0.929434 0.048821 0.039792 0.835563 0.034714 0.089931 0.0 0.916739 0.037645 0.045616 0.821913 0.015479 0.0 0.162608 MOTIF Hindbrain_E13.5_H3K9ac_51_24_0.561_4.042421e-153 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.105741 0.77585 0.028451 0.089958 0.025145 0.809224 0.066209 0.099422 0.027302 0.734058 0.058243 0.180397 0.156513 0.024656 0.771205 0.047626 0.065402 0.654575 0.27433 0.005693 0.857928 0.020495 0.074755 0.046822 0.005981 0.022754 0.953711 0.017554 0.063533 0.82097 0.056101 0.059396 0.016775 0.817016 0.042557 0.123652 MOTIF Limb_E12.5_H3K9ac_41_18_0.574_5.834361e-191 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.065412 0.749705 0.053653 0.131229 0.073194 0.7844 0.062853 0.079553 0.045326 0.750801 0.060337 0.143535 0.107054 0.040148 0.803703 0.049094 0.042969 0.728162 0.218625 0.010245 0.808906 0.024145 0.11152 0.055428 0.005146 0.022268 0.958006 0.014581 0.055782 0.770509 0.117048 0.05666 0.019087 0.810253 0.051356 0.119305 MOTIF Limb_E14.5_H3K9ac_53_22_0.570_2.570348e-133 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.043477 0.812418 0.049903 0.094202 0.01716 0.806295 0.109337 0.067209 0.131508 0.661343 0.04171 0.16544 0.087066 0.05297 0.769762 0.090202 0.044591 0.751568 0.198965 0.004876 0.836579 0.032229 0.060548 0.070644 0.004273 0.023646 0.955158 0.016923 0.049187 0.846578 0.055008 0.049227 0.059215 0.75974 0.054093 0.126953 MOTIF Forebrain_E12.5_H3K9ac_48_24_0.567_1.066034e-295 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.036464 0.823993 0.052457 0.087086 0.055105 0.724531 0.13579 0.084574 0.128446 0.726372 0.030288 0.114894 0.098204 0.056844 0.758038 0.086914 0.05117 0.769413 0.174499 0.004918 0.815126 0.033759 0.074243 0.076872 0.011702 0.027658 0.944211 0.016429 0.054155 0.887741 0.039879 0.018226 0.04348 0.788656 0.040474 0.127391 MOTIF Midbrain_E12.5_H3K9ac_52_18_0.573_1.6514e-294 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.032066 0.842501 0.046176 0.079257 0.072021 0.735635 0.107284 0.08506 0.116315 0.717702 0.039138 0.126845 0.108749 0.081894 0.733172 0.076185 0.041977 0.779193 0.162618 0.016212 0.799379 0.049186 0.076327 0.075108 0.011839 0.030301 0.94303 0.01483 0.053996 0.894245 0.033245 0.018514 0.040894 0.794411 0.031128 0.133567 MOTIF Forebrain_E15.5_H3K9ac_49_22_0.583_5.397381e-198 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.051843 0.833112 0.039255 0.07579 0.024358 0.839508 0.062795 0.073339 0.136233 0.654378 0.061537 0.147852 0.081758 0.022896 0.86917 0.026176 0.046933 0.702875 0.238605 0.011587 0.796022 0.044595 0.07246 0.086923 0.00419 0.022168 0.959709 0.013932 0.072725 0.744176 0.12504 0.058058 0.084089 0.801827 0.066994 0.04709 MOTIF Hindbrain_E15.5_H3K9ac_56_26_0.593_2.19745e-280 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.087796 0.77109 0.043184 0.097929 0.019704 0.832206 0.066962 0.081128 0.116831 0.70387 0.045032 0.134268 0.074015 0.04386 0.841501 0.040624 0.050447 0.719047 0.229243 0.001262 0.777917 0.029775 0.096152 0.096156 0.004717 0.02621 0.913682 0.055392 0.050261 0.850114 0.045007 0.054619 0.088387 0.804349 0.06376 0.043505 MOTIF Limb_E13.5_H3K9ac_48_20_0.562_4.160724e-201 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.059918 0.801591 0.034725 0.103765 0.024154 0.754085 0.15028 0.071481 0.069592 0.712522 0.052462 0.165424 0.141422 0.0501 0.766666 0.041812 0.062503 0.729309 0.202552 0.005636 0.844225 0.028138 0.065991 0.061645 0.005502 0.026634 0.950808 0.017055 0.065417 0.808557 0.068263 0.057763 0.047333 0.844163 0.05488 0.053624 MOTIF Hindbrain_E11.5_H3K9ac_47_16_0.576_1.03705e-172 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.093428 0.762724 0.044316 0.099532 0.021933 0.836387 0.120247 0.021433 0.128679 0.67636 0.041246 0.153715 0.091224 0.036214 0.844385 0.028177 0.044623 0.68698 0.251702 0.016696 0.82041 0.022463 0.091428 0.065699 0.006957 0.024258 0.950929 0.017856 0.056822 0.838987 0.037002 0.067189 0.039269 0.76109 0.053446 0.146195 MOTIF Forebrain_E16.5_H3K9ac_44_30_0.571_1.713016e-133 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.036884 0.771089 0.043208 0.14882 0.023561 0.857725 0.035522 0.083192 0.141008 0.687666 0.046158 0.125168 0.102836 0.030815 0.81681 0.049539 0.0585 0.705408 0.233315 0.002777 0.852532 0.013115 0.064475 0.069878 0.008055 0.017772 0.952442 0.021731 0.075852 0.812099 0.067406 0.044643 0.045889 0.743058 0.062153 0.1489 MOTIF Kidney_P0_H3K9ac_55_26_0.563_1.117498e-109 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.073741 0.752007 0.054467 0.119786 0.023511 0.859944 0.044993 0.071552 0.12884 0.671143 0.043376 0.156641 0.102644 0.031224 0.840867 0.025265 0.061602 0.691094 0.232546 0.014758 0.829854 0.027234 0.077929 0.064983 0.009607 0.017697 0.96433 0.008366 0.063056 0.847559 0.041474 0.047912 0.041387 0.811107 0.03728 0.110226 MOTIF Liver_E11.5_H3K9ac_49_28_0.552_1.500348e-181 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.04241 0.831506 0.035393 0.090692 0.02513 0.866788 0.045972 0.062109 0.104866 0.701558 0.050301 0.143275 0.092757 0.044944 0.776415 0.085884 0.040202 0.759115 0.195357 0.005326 0.804341 0.020081 0.105928 0.06965 0.004766 0.033439 0.950498 0.011297 0.070384 0.757165 0.112901 0.05955 0.020315 0.797584 0.058582 0.12352 MOTIF Midbrain_E14.5_H3K9ac_59_23_0.565_1.445536e-146 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.080862 0.780426 0.040908 0.097804 0.020509 0.921828 0.037911 0.019752 0.104071 0.692072 0.045167 0.158691 0.098351 0.041786 0.776475 0.083388 0.060917 0.678887 0.255777 0.004418 0.80343 0.018808 0.08134 0.096423 0.006074 0.030103 0.94441 0.019414 0.050426 0.780212 0.111904 0.057457 0.038063 0.825514 0.056118 0.080305 MOTIF Neural-Tube_E12.5_H3K9ac_43_14_0.590_7.056038e-244 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.056452 0.704018 0.139146 0.100384 0.024097 0.882174 0.030314 0.063415 0.105452 0.650138 0.113149 0.131262 0.057106 0.075095 0.807907 0.059892 0.046062 0.790404 0.150064 0.01347 0.719785 0.041777 0.13187 0.106568 0.014218 0.022033 0.926153 0.037596 0.042961 0.897189 0.03846 0.02139 0.068237 0.815092 0.070288 0.046383 MOTIF Kidney_E16.5_H3K9ac_49_32_0.561_9.081157e-125 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.031869 0.053123 0.755211 0.159798 0.127434 0.721448 0.028166 0.122952 0.045143 0.866068 0.06529 0.023499 0.166401 0.710645 0.04012 0.082834 0.173797 0.036703 0.747389 0.04211 0.004292 0.783125 0.212583 0.0 0.824779 0.027091 0.04588 0.102251 0.006105 0.017744 0.963194 0.012957 0.128848 0.754917 0.064251 0.051983 MOTIF Heart_E11.5_H3K9ac_38_32_0.558_4.569509e-148 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.017911 0.077887 0.786608 0.117595 0.070818 0.763248 0.055463 0.110471 0.115204 0.70015 0.065294 0.119352 0.036695 0.741691 0.049674 0.17194 0.168043 0.056187 0.730382 0.045388 0.002387 0.931448 0.06382 0.002345 0.809939 0.038913 0.036929 0.114219 0.0 0.018507 0.977312 0.004181 0.132843 0.787581 0.058118 0.021458 MOTIF Heart_E14.5_H3K9ac_41_31_0.556_3.093203e-171 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.023538 0.08273 0.770331 0.1234 0.077049 0.796226 0.04315 0.083576 0.116748 0.696413 0.065069 0.12177 0.043848 0.756081 0.042948 0.157124 0.150737 0.052023 0.682056 0.115183 0.003057 0.91894 0.074251 0.003752 0.806593 0.054493 0.042435 0.096479 0.0 0.027575 0.96693 0.005495 0.03619 0.796269 0.11784 0.0497 MOTIF Cranio-Facial_E13.5_H3K9ac_27_27_0.584_1.765808e-249 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.029915 0.035585 0.814678 0.119822 0.091989 0.783261 0.030089 0.09466 0.129444 0.664429 0.054993 0.151135 0.039013 0.841449 0.066503 0.053035 0.078206 0.051069 0.746336 0.124389 0.001372 0.76507 0.231349 0.002209 0.781513 0.048769 0.046368 0.123349 0.00616 0.015139 0.94881 0.029891 0.123517 0.807091 0.047918 0.021474 MOTIF Hindbrain_P0_H3K9ac_42_27_0.594_1.769791e-220 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.029293 0.036628 0.822356 0.111723 0.079175 0.761511 0.053835 0.10548 0.087412 0.754544 0.055634 0.10241 0.039889 0.753989 0.066374 0.139748 0.093373 0.08118 0.79697 0.028477 0.001955 0.767151 0.227721 0.003172 0.815432 0.052606 0.042781 0.089181 0.005645 0.016403 0.955031 0.022921 0.064946 0.833208 0.041042 0.060804 MOTIF Midbrain_E13.5_H3K9ac_34_27_0.578_2.139055e-197 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.024619 0.083682 0.748228 0.143471 0.070443 0.794675 0.030185 0.104697 0.03041 0.785253 0.055493 0.128844 0.040029 0.750597 0.044598 0.164775 0.139801 0.051867 0.736117 0.072216 0.002292 0.818079 0.178702 0.000927 0.770003 0.052757 0.055246 0.121995 0.002289 0.016913 0.969255 0.011544 0.061673 0.808217 0.047206 0.082904 MOTIF Neural-Tube_E14.5_H3K9ac_49_34_0.581_2.937006e-159 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.042362 0.067384 0.730738 0.159515 0.030629 0.91941 0.012545 0.037416 0.107654 0.733172 0.048446 0.110728 0.025543 0.851057 0.067938 0.055461 0.132717 0.032378 0.738051 0.096854 0.009502 0.686925 0.303573 0.0 0.854295 0.024632 0.05245 0.068623 0.009806 0.015219 0.969402 0.005573 0.061136 0.685665 0.161558 0.091641 MOTIF Heart_E12.5_H3K9ac_41_46_0.553_2.737048e-167 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.016 0.059964 0.885509 0.038527 0.10518 0.711198 0.019302 0.164319 0.17523 0.580082 0.074818 0.16987 0.024064 0.946947 0.025692 0.003297 0.239829 0.090345 0.634299 0.035528 0.005495 0.891454 0.10171 0.001342 0.85266 0.049536 0.038861 0.058943 0.001682 0.015117 0.924099 0.059102 0.173141 0.770788 0.016721 0.039349 MOTIF Stomach_P0_H3K9ac_48_44_0.573_1.618836e-182 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.011142 0.056765 0.724661 0.207432 0.026794 0.737549 0.039188 0.196469 0.043284 0.676371 0.068186 0.212159 0.037029 0.875638 0.049648 0.037685 0.212439 0.046688 0.699813 0.04106 0.006042 0.953809 0.019625 0.020524 0.806804 0.042226 0.038094 0.112876 0.00133 0.01467 0.969014 0.014986 0.101529 0.75934 0.053269 0.085862