MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Cranio-Facial_E13.5_H3K4me3_13_151_0.710_3.104602e-316 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.148 0.132 0.132 0.588 0.118 0.133 0.117 0.632 0.131 0.148 0.12 0.601 0.127 0.58 0.145 0.148 0.115 0.624 0.138 0.123 0.13 0.156 0.587 0.127 0.132 0.166 0.571 0.131 0.121 0.647 0.12 0.112 0.119 0.146 0.603 0.132 0.128 0.157 0.57 0.145 MOTIF Heart_E13.5_H3K4me3_8_153_0.682_7.731159e-312 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.143 0.131 0.129 0.597 0.111 0.14 0.124 0.625 0.126 0.153 0.117 0.604 0.121 0.576 0.148 0.155 0.116 0.627 0.137 0.12 0.133 0.166 0.581 0.12 0.132 0.17 0.569 0.129 0.115 0.643 0.127 0.115 0.119 0.148 0.607 0.126 0.126 0.161 0.573 0.14 MOTIF Heart_E15.5_H3K4me3_4_154_0.712_2.33472e-312 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.162 0.185 0.082 0.571 0.038 0.212 0.019 0.731 0.05 0.182 0.033 0.735 0.19 0.417 0.128 0.265 0.089 0.578 0.161 0.172 0.001 0.854 0.126 0.019 0.025 0.087 0.842 0.046 0.018 0.247 0.706 0.029 0.098 0.84 0.021 0.041 0.045 0.067 0.727 0.161 MOTIF Neural-Tube_E14.5_H3K4me3_44_176_0.649_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 MOTIF Heart_E16.5_H3K4me2_27_164_0.581_1.650772e-319 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.222 0.495 0.001 0.282 0.001 0.622 0.222 0.155 0.001 0.001 0.842 0.156 0.001 0.001 0.997 0.001 0.059 0.175 0.683 0.083 0.734 0.001 0.264 0.001 0.723 0.001 0.275 0.001 0.565 0.001 0.178 0.256 MOTIF Cranio-Facial_E15.5_H3K4me2_24_164_0.626_5.051931e-317 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.031 0.087 0.078 0.804 0.067 0.093 0.05 0.79 0.038 0.066 0.092 0.804 0.034 0.829 0.082 0.055 0.05 0.854 0.034 0.062 0.106 0.726 0.075 0.093 0.046 0.064 0.81 0.08 0.049 0.054 0.814 0.083 0.122 0.753 0.042 0.083 0.063 0.064 0.818 0.055 MOTIF Limb_E14.5_H3K4me2_35_168_0.603_1.699586e-321 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.027 0.079 0.001 0.893 0.03 0.116 0.001 0.853 0.034 0.081 0.032 0.853 0.021 0.919 0.022 0.038 0.049 0.845 0.054 0.052 0.078 0.873 0.048 0.001 0.061 0.047 0.891 0.001 0.044 0.001 0.934 0.021 MOTIF Forebrain_E14.5_H3K27me3_19_162_0.532_1.766467e-22 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.04 0.083 0.052 0.825 0.05 0.091 0.117 0.742 0.038 0.066 0.049 0.847 0.027 0.835 0.064 0.074 0.05 0.849 0.049 0.052 0.068 0.802 0.045 0.085 0.103 0.065 0.714 0.118 0.053 0.05 0.862 0.035 0.085 0.74 0.103 0.072 0.057 0.098 0.787 0.058 MOTIF Kidney_E15.5_H3K9ac_3_156_0.713_3.825752e-311 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.195 0.577 0.113 0.115 0.107 0.081 0.646 0.166 0.056 0.64 0.244 0.06 0.173 0.469 0.191 0.168 0.03 0.15 0.79 0.03 0.132 0.552 0.212 0.104 0.192 0.083 0.587 0.138 0.688 0.046 0.229 0.037 0.67 0.119 0.167 0.044 0.633 0.041 0.21 0.116 MOTIF Kidney_E16.5_H3K9ac_11_157_0.612_4.673513e-313 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.018 0.284 0.058 0.64 0.008 0.111 0.001 0.88 0.02 0.227 0.001 0.752 0.028 0.773 0.043 0.156 0.156 0.57 0.151 0.123 0.019 0.838 0.142 0.001 0.066 0.255 0.598 0.081 0.008 0.192 0.795 0.005 0.119 0.728 0.114 0.039 0.089 0.136 0.677 0.098 MOTIF Lung_E15.5_H3K9ac_33_174_0.643_5.187807e-294 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.069 0.725 0.095 0.111 0.079 0.035 0.83 0.056 0.058 0.793 0.078 0.071 0.056 0.782 0.058 0.104 0.052 0.068 0.787 0.093 0.072 0.025 0.814 0.089 0.085 0.041 0.841 0.033 0.861 0.055 0.053 0.031 0.769 0.068 0.108 0.055 0.799 0.064 0.068 0.069 MOTIF Lung_E16.5_H3K9ac_7_155_0.620_3.050449e-312 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.139 0.595 0.136 0.13 0.116 0.122 0.626 0.136 0.125 0.599 0.148 0.128 0.125 0.604 0.143 0.128 0.118 0.164 0.596 0.122 0.138 0.149 0.579 0.134 0.162 0.139 0.572 0.127 0.604 0.125 0.146 0.125 0.627 0.117 0.139 0.117 0.597 0.121 0.144 0.138 MOTIF Cranio-Facial_E13.5_H3K9ac_10_150_0.609_9.769654e-320 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.302 0.069 0.062 0.567 0.009 0.072 0.018 0.901 0.009 0.237 0.02 0.734 0.085 0.643 0.151 0.121 0.041 0.808 0.113 0.038 0.077 0.179 0.533 0.211 0.079 0.251 0.574 0.096 0.019 0.977 0.002 0.002 0.002 0.13 0.768 0.1 0.056 0.298 0.51 0.136 MOTIF Hindbrain_E11.5_H3K9ac_2_153_0.668_1.746492e-312 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.256 0.199 0.232 0.313 0.153 0.131 0.139 0.577 0.148 0.163 0.131 0.558 0.16 0.484 0.165 0.191 0.137 0.55 0.176 0.137 0.139 0.187 0.534 0.14 0.152 0.181 0.512 0.155 0.129 0.603 0.136 0.132 0.107 0.154 0.59 0.149 0.204 0.267 0.28 0.248 MOTIF Hindbrain_E14.5_H3K9ac_9_153_0.649_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.148 0.123 0.125 0.604 0.121 0.126 0.122 0.631 0.13 0.144 0.132 0.594 0.123 0.571 0.153 0.153 0.125 0.613 0.141 0.121 0.13 0.143 0.596 0.131 0.131 0.166 0.568 0.135 0.113 0.647 0.123 0.117 0.12 0.153 0.594 0.133 0.127 0.155 0.581 0.137 MOTIF Forebrain_E14.5_H3K9ac_17_157_0.632_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.172 0.689 0.073 0.066 0.104 0.095 0.712 0.089 0.075 0.761 0.107 0.057 0.094 0.724 0.091 0.091 0.062 0.038 0.844 0.056 0.112 0.058 0.751 0.079 0.748 0.065 0.138 0.049 0.769 0.027 0.11 0.094 MOTIF Heart_P0_H3K9ac_10_152_0.627_5.922537e-311 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.639 0.131 0.1 0.13 0.115 0.125 0.119 0.641 0.063 0.097 0.08 0.76 0.068 0.112 0.1 0.72 0.09 0.714 0.094 0.102 0.085 0.745 0.088 0.082 0.092 0.099 0.715 0.094 0.082 0.124 0.716 0.078 0.12 0.68 0.102 0.098 0.096 0.113 0.672 0.119 MOTIF Limb_E12.5_H3K9ac_10_150_0.621_5.778166e-310 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.147 0.65 0.101 0.102 0.092 0.103 0.699 0.106 0.083 0.694 0.139 0.084 0.083 0.714 0.12 0.083 0.086 0.085 0.741 0.088 0.104 0.092 0.712 0.092 0.734 0.078 0.118 0.07 0.781 0.064 0.087 0.068 0.653 0.102 0.125 0.12 0.147 0.116 0.117 0.62 MOTIF Heart_E12.5_H3K9ac_22_159_0.583_9.509701e-310 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.09 0.607 0.131 0.172 0.148 0.128 0.596 0.128 0.272 0.453 0.087 0.189 0.025 0.781 0.107 0.087 0.149 0.168 0.638 0.045 0.148 0.169 0.351 0.333 0.576 0.066 0.108 0.25 0.619 0.147 0.066 0.168 0.23 0.169 0.371 0.23 0.045 0.107 0.17 0.678 0.271 0.355 0.143 0.23 0.216 0.275 0.234 0.274 MOTIF Liver_P0_H3K9ac_6_151_0.620_2.659286e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.126 0.619 0.135 0.12 0.12 0.124 0.62 0.136 0.123 0.602 0.155 0.12 0.104 0.634 0.159 0.103 0.1 0.144 0.65 0.106 0.142 0.14 0.595 0.123 0.583 0.139 0.154 0.124 0.595 0.151 0.144 0.11 0.155 0.153 0.538 0.154 0.134 0.153 0.151 0.562 MOTIF Forebrain_E11.5_H3K9ac_13_153_0.627_7.582136e-311 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.224 0.339 0.25 0.187 0.15 0.338 0.341 0.171 0.141 0.328 0.401 0.131 0.184 0.467 0.283 0.066 0.187 0.201 0.452 0.16 0.359 0.078 0.458 0.105 0.456 0.138 0.321 0.085 0.892 0.001 0.104 0.003 0.769 0.004 0.224 0.003 0.308 0.227 0.218 0.246 MOTIF Cranio-Facial_E14.5_H3K9ac_15_156_0.629_1.305698e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.236 0.14 0.179 0.446 0.121 0.081 0.197 0.601 0.096 0.232 0.042 0.63 0.017 0.208 0.086 0.689 0.089 0.296 0.089 0.526 0.177 0.349 0.118 0.357 0.153 0.503 0.161 0.183 0.037 0.687 0.222 0.054 0.001 0.205 0.746 0.048 0.189 0.31 0.283 0.218 MOTIF Limb_E11.5_H3K9ac_37_159_0.576_1.168653e-121 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.123 0.142 0.131 0.604 0.108 0.13 0.13 0.632 0.118 0.128 0.128 0.626 0.126 0.154 0.122 0.598 0.126 0.147 0.135 0.592 0.136 0.569 0.137 0.158 0.135 0.569 0.138 0.158 0.122 0.584 0.16 0.134 0.128 0.602 0.158 0.112 0.119 0.134 0.624 0.123 MOTIF Heart_E16.5_H3K9ac_9_151_0.595_1.718101e-310 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.082 0.277 0.12 0.521 0.077 0.261 0.023 0.639 0.002 0.607 0.102 0.289 0.225 0.508 0.017 0.25 0.174 0.258 0.362 0.206 0.174 0.474 0.215 0.137 0.197 0.49 0.208 0.105 0.001 0.305 0.629 0.065 0.125 0.623 0.223 0.029 0.022 0.192 0.622 0.164 MOTIF Hindbrain_P0_H3K9ac_3_152_0.680_6.343941e-311 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.18 0.191 0.151 0.479 0.067 0.219 0.041 0.673 0.112 0.233 0.095 0.56 0.136 0.276 0.216 0.372 0.1 0.67 0.009 0.221 0.114 0.18 0.489 0.217 0.072 0.554 0.259 0.115 0.118 0.596 0.188 0.098 0.017 0.124 0.778 0.081 0.143 0.481 0.238 0.138 MOTIF Cranio-Facial_E12.5_H3K9ac_4_151_0.644_1.002603e-314 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.136 0.173 0.151 0.54 0.064 0.156 0.045 0.735 0.096 0.161 0.061 0.682 0.112 0.232 0.167 0.489 0.116 0.663 0.063 0.158 0.104 0.161 0.569 0.166 0.117 0.549 0.191 0.143 0.125 0.572 0.19 0.113 0.051 0.152 0.669 0.128 0.152 0.531 0.185 0.132 MOTIF Forebrain_P0_H3K9ac_3_154_0.681_2.045633e-310 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.175 0.15 0.134 0.541 0.12 0.133 0.071 0.676 0.13 0.15 0.103 0.617 0.137 0.217 0.194 0.452 0.133 0.658 0.036 0.173 0.143 0.166 0.534 0.157 0.104 0.589 0.205 0.102 0.137 0.589 0.166 0.108 0.04 0.107 0.767 0.086 0.133 0.576 0.168 0.123 MOTIF Forebrain_E12.5_H3K9ac_8_151_0.648_2.864781e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.145 0.14 0.13 0.585 0.121 0.138 0.119 0.622 0.131 0.147 0.117 0.605 0.126 0.173 0.144 0.557 0.13 0.624 0.103 0.143 0.129 0.141 0.584 0.146 0.116 0.599 0.155 0.13 0.134 0.596 0.145 0.125 0.102 0.13 0.647 0.121 0.13 0.58 0.164 0.126 MOTIF Midbrain_E15.5_H3K9ac_7_156_0.686_1.230474e-313 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.146 0.138 0.133 0.583 0.127 0.142 0.117 0.614 0.122 0.145 0.117 0.616 0.125 0.158 0.15 0.567 0.121 0.627 0.108 0.144 0.132 0.133 0.593 0.142 0.128 0.59 0.144 0.138 0.139 0.578 0.143 0.14 0.115 0.129 0.635 0.121 0.13 0.595 0.143 0.132 MOTIF Midbrain_E12.5_H3K9ac_4_152_0.659_8.450894e-319 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.132 0.156 0.576 0.136 0.117 0.628 0.145 0.11 0.126 0.156 0.6 0.118 0.126 0.151 0.596 0.127 0.13 0.627 0.132 0.111 0.124 0.135 0.615 0.126 0.15 0.144 0.579 0.127 0.584 0.126 0.163 0.127 0.613 0.112 0.159 0.116 0.582 0.134 0.143 0.141 MOTIF Neural-Tube_E11.5_H3K9ac_34_166_0.604_3.275284e-216 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.642 0.141 0.132 0.085 0.679 0.096 0.138 0.087 0.094 0.102 0.727 0.077 0.126 0.637 0.13 0.107 0.138 0.107 0.626 0.129 0.102 0.113 0.694 0.091 0.129 0.626 0.129 0.116 0.135 0.093 0.644 0.128 0.103 0.105 0.721 0.071 0.655 0.115 0.145 0.085 0.68 0.105 0.144 0.071 0.672 0.11 0.127 0.091