MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Hindbrain_E12.5_H3K27ac_16_165_0.554_5.371801e-95 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.92 0.022 0.029 0.029 0.992 0.001 0.001 0.006 0.892 0.027 0.045 0.036 0.001 0.974 0.024 0.001 0.935 0.001 0.011 0.053 0.03 0.028 0.941 0.001 0.096 0.859 0.001 0.044 0.11 0.202 0.538 0.15 MOTIF Limb_E11.5_H3K27ac_6_154_0.564_6.469584e-65 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.939 0.001 0.029 0.031 0.982 0.001 0.001 0.016 0.916 0.001 0.034 0.049 0.021 0.952 0.014 0.013 0.944 0.009 0.011 0.036 0.042 0.012 0.924 0.022 0.053 0.903 0.001 0.043 0.056 0.221 0.502 0.221 MOTIF Cranio-Facial_E11.5_H3K27ac_9_158_0.565_4.570473e-60 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.25 0.585 0.081 0.084 0.079 0.258 0.567 0.096 0.191 0.474 0.275 0.059 0.153 0.052 0.53 0.265 0.13 0.541 0.181 0.148 0.115 0.106 0.033 0.746 0.152 0.049 0.798 0.001 0.1 0.07 0.037 0.793 0.001 0.012 0.013 0.974 0.034 0.133 0.001 0.832 MOTIF Heart_E14.5_H3K27ac_15_156_0.540_2.587833e-75 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.521 0.098 0.207 0.174 0.764 0.174 0.042 0.02 0.672 0.011 0.258 0.059 0.099 0.749 0.016 0.136 0.724 0.068 0.075 0.133 0.159 0.112 0.691 0.038 0.317 0.5 0.048 0.135 0.101 0.124 0.539 0.236 0.033 0.681 0.118 0.168 0.173 0.181 0.192 0.454 MOTIF Neural-Tube_E13.5_H3K27ac_7_165_0.560_9.519971e-155 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.287 0.352 0.178 0.183 0.265 0.145 0.528 0.062 0.234 0.465 0.205 0.096 0.087 0.023 0.519 0.371 0.056 0.703 0.147 0.094 0.031 0.162 0.113 0.694 0.126 0.071 0.793 0.01 0.207 0.133 0.003 0.657 0.071 0.048 0.081 0.8 0.183 0.161 0.051 0.605 MOTIF Neural-Tube_E12.5_H3K27ac_16_172_0.565_4.873546e-53 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.067 0.12 0.715 0.098 0.112 0.669 0.134 0.085 0.105 0.108 0.648 0.139 0.061 0.702 0.126 0.111 0.107 0.108 0.107 0.678 0.107 0.103 0.669 0.121 0.093 0.124 0.048 0.735 0.074 0.074 0.112 0.74 0.097 0.078 0.083 0.742 0.081 0.114 0.105 0.7 MOTIF Heart_E12.5_H3K27ac_2_167_0.550_1.810365e-94 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.161 0.572 0.128 0.139 0.13 0.12 0.625 0.125 0.133 0.592 0.142 0.133 0.134 0.122 0.598 0.146 0.114 0.61 0.14 0.136 0.138 0.14 0.146 0.576 0.12 0.136 0.598 0.146 0.135 0.138 0.116 0.611 0.118 0.142 0.135 0.605 0.143 0.124 0.12 0.613 MOTIF Forebrain_E13.5_H3K27ac_2_163_0.567_8.784791e-145 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.146 0.576 0.147 0.131 0.134 0.143 0.595 0.128 0.131 0.601 0.146 0.122 0.13 0.122 0.582 0.166 0.114 0.609 0.139 0.138 0.124 0.138 0.142 0.596 0.126 0.127 0.577 0.17 0.139 0.141 0.105 0.615 0.115 0.124 0.133 0.628 0.14 0.125 0.115 0.62 MOTIF Hindbrain_E14.5_H3K27ac_4_163_0.581_9.86941e-205 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.15 0.579 0.141 0.13 0.131 0.122 0.618 0.129 0.122 0.62 0.142 0.116 0.133 0.111 0.602 0.154 0.117 0.604 0.141 0.138 0.129 0.14 0.14 0.591 0.134 0.132 0.563 0.171 0.149 0.142 0.117 0.592 0.121 0.132 0.132 0.615 0.146 0.125 0.114 0.615 MOTIF Midbrain_E15.5_H3K27ac_1_167_0.587_2.001562e-250 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.153 0.582 0.136 0.129 0.125 0.126 0.62 0.129 0.11 0.622 0.151 0.117 0.12 0.114 0.612 0.154 0.113 0.601 0.138 0.148 0.133 0.143 0.14 0.584 0.127 0.13 0.564 0.179 0.151 0.158 0.11 0.581 0.12 0.139 0.136 0.605 0.135 0.124 0.112 0.629 MOTIF Hindbrain_E15.5_H3K27ac_7_159_0.574_4.993783e-204 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.127 0.659 0.107 0.107 0.1 0.102 0.707 0.091 0.105 0.673 0.123 0.099 0.098 0.073 0.706 0.123 0.081 0.693 0.124 0.102 0.093 0.107 0.102 0.698 0.095 0.094 0.708 0.103 0.107 0.108 0.07 0.715 0.083 0.099 0.1 0.718 0.103 0.096 0.079 0.722 MOTIF Stomach_P0_H3K27ac_2_170_0.557_2.907842e-108 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.128 0.657 0.101 0.114 0.101 0.095 0.701 0.103 0.13 0.654 0.111 0.105 0.094 0.096 0.696 0.114 0.093 0.686 0.109 0.112 0.107 0.087 0.098 0.708 0.08 0.1 0.712 0.108 0.096 0.092 0.085 0.727 0.074 0.09 0.093 0.743 0.11 0.099 0.074 0.717 MOTIF Hindbrain_E11.5_H3K4me1_2_158_0.558_3.538368e-143 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.114 0.578 0.255 0.053 0.084 0.001 0.914 0.001 0.014 0.931 0.013 0.042 0.034 0.001 0.001 0.964 0.024 0.067 0.899 0.01 0.001 0.021 0.042 0.936 0.018 0.035 0.001 0.946 0.03 0.036 0.016 0.918 MOTIF Neural-Tube_E14.5_H3K4me2_62_169_0.573_9.021118e-138 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.88 0.045 0.074 0.001 0.916 0.001 0.067 0.016 0.771 0.033 0.073 0.123 0.001 0.966 0.032 0.001 0.951 0.001 0.011 0.037 0.001 0.042 0.908 0.049 0.001 0.969 0.001 0.029 0.089 0.08 0.736 0.095 MOTIF Heart_E13.5_H3K4me2_5_153_0.626_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.146 0.649 0.041 0.164 0.004 0.16 0.772 0.064 0.013 0.879 0.077 0.031 0.101 0.025 0.553 0.321 0.037 0.411 0.491 0.061 0.373 0.041 0.089 0.496 0.111 0.151 0.658 0.08 0.517 0.198 0.104 0.181 MOTIF Neural-Tube_E11.5_H3K4me2_1_153_0.729_1.539089e-318 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.133 0.719 0.062 0.086 0.001 0.016 0.982 0.001 0.001 0.934 0.064 0.001 0.131 0.05 0.621 0.198 0.12 0.2 0.538 0.142 0.231 0.216 0.14 0.413 0.204 0.137 0.45 0.209 0.425 0.189 0.176 0.21 0.172 0.178 0.11 0.54 0.055 0.054 0.1 0.791 MOTIF Forebrain_E16.5_H3K4me2_1_155_0.690_1.846298e-310 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.102 0.699 0.099 0.1 0.011 0.045 0.926 0.018 0.004 0.9 0.092 0.004 0.151 0.181 0.583 0.085 0.11 0.191 0.467 0.231 0.086 0.16 0.306 0.448 0.117 0.23 0.383 0.27 0.105 0.202 0.16 0.533 0.006 0.045 0.104 0.845 0.071 0.109 0.162 0.658 MOTIF Liver_E16.5_H3K4me2_17_155_0.618_3.563698e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.119 0.696 0.086 0.099 0.055 0.083 0.754 0.108 0.045 0.873 0.026 0.056 0.112 0.164 0.61 0.114 0.076 0.16 0.592 0.172 0.206 0.129 0.183 0.482 0.184 0.138 0.669 0.009 0.106 0.086 0.092 0.716 0.008 0.011 0.077 0.904 0.1 0.101 0.074 0.725 MOTIF Intestine_E14.5_H3K4me2_12_153_0.655_3.651145e-321 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.135 0.613 0.127 0.125 0.111 0.121 0.658 0.11 0.111 0.651 0.132 0.106 0.122 0.142 0.61 0.126 0.13 0.158 0.563 0.149 0.168 0.148 0.146 0.538 0.141 0.136 0.543 0.18 0.145 0.15 0.125 0.58 0.112 0.124 0.129 0.635 0.131 0.13 0.13 0.609 MOTIF Lung_P0_H3K4me2_11_156_0.643_4.41605e-311 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.093 0.714 0.093 0.1 0.076 0.089 0.751 0.084 0.069 0.752 0.105 0.074 0.099 0.11 0.686 0.105 0.107 0.134 0.626 0.133 0.126 0.109 0.114 0.651 0.105 0.096 0.671 0.128 0.097 0.105 0.102 0.696 0.073 0.094 0.089 0.744 0.096 0.093 0.104 0.707 MOTIF Heart_E16.5_H3K4me2_2_155_0.632_8.224258e-310 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.106 0.8 0.067 0.027 0.037 0.023 0.913 0.027 0.024 0.853 0.085 0.038 0.044 0.032 0.73 0.194 0.089 0.2 0.15 0.561 0.074 0.126 0.085 0.715 0.15 0.177 0.459 0.214 0.075 0.153 0.034 0.738 0.02 0.039 0.045 0.896 0.085 0.047 0.036 0.832 MOTIF Midbrain_E14.5_H3K4me2_15_153_0.653_4.028879e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.544 0.07 0.118 0.268 0.502 0.235 0.113 0.15 0.554 0.061 0.342 0.043 0.106 0.619 0.231 0.044 0.687 0.118 0.144 0.051 0.521 0.228 0.121 0.13 0.238 0.549 0.089 0.124 0.042 0.149 0.734 0.075 0.05 0.752 0.106 0.092 0.194 0.063 0.577 0.166 MOTIF Heart_E15.5_H3K4me2_30_160_0.593_4.685599e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.097 0.768 0.065 0.07 0.097 0.065 0.742 0.096 0.087 0.782 0.076 0.055 0.068 0.031 0.793 0.108 0.054 0.797 0.075 0.074 0.103 0.026 0.047 0.824 0.088 0.055 0.808 0.049 0.058 0.067 0.067 0.808 0.035 0.06 0.054 0.851 0.062 0.05 0.06 0.828 MOTIF Intestine_P0_H3K4me2_6_157_0.632_1.661924e-310 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.151 0.595 0.129 0.125 0.115 0.039 0.705 0.141 0.139 0.618 0.149 0.094 0.143 0.061 0.641 0.155 0.104 0.592 0.154 0.15 0.192 0.123 0.164 0.521 0.201 0.081 0.706 0.012 0.183 0.184 0.154 0.479 0.132 0.143 0.129 0.596 0.174 0.125 0.14 0.561 MOTIF Heart_E12.5_H3K4me2_3_154_0.640_5.144295e-318 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.224 0.561 0.091 0.124 0.017 0.115 0.751 0.117 0.088 0.697 0.113 0.102 0.078 0.006 0.685 0.231 0.062 0.527 0.21 0.201 0.174 0.167 0.243 0.415 0.179 0.157 0.46 0.204 0.168 0.222 0.069 0.541 0.019 0.232 0.078 0.671 0.176 0.103 0.073 0.648 MOTIF Hindbrain_P0_H3K4me2_18_153_0.650_3.946873e-314 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.184 0.627 0.101 0.088 0.153 0.141 0.598 0.108 0.119 0.569 0.161 0.151 0.143 0.05 0.632 0.175 0.128 0.595 0.137 0.14 0.172 0.111 0.135 0.582 0.079 0.172 0.583 0.166 0.137 0.193 0.119 0.551 0.112 0.151 0.119 0.618 0.114 0.154 0.103 0.629 MOTIF Kidney_E15.5_H3K4me2_8_156_0.637_1.032597e-321 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.157 0.6 0.11 0.133 0.12 0.145 0.627 0.108 0.141 0.579 0.151 0.129 0.137 0.118 0.61 0.135 0.125 0.596 0.133 0.146 0.166 0.132 0.165 0.537 0.148 0.13 0.584 0.138 0.171 0.202 0.022 0.605 0.054 0.136 0.126 0.684 0.152 0.132 0.137 0.579 MOTIF Neural-Tube_E12.5_H3K4me2_6_153_0.663_3.388799e-312 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.21 0.58 0.12 0.09 0.086 0.114 0.789 0.011 0.017 0.757 0.168 0.058 0.146 0.099 0.642 0.113 0.092 0.511 0.172 0.225 0.222 0.009 0.159 0.61 0.165 0.218 0.405 0.212 0.201 0.237 0.064 0.498 0.013 0.148 0.076 0.763 0.15 0.093 0.163 0.594 MOTIF Intestine_E15.5_H3K4me2_14_157_0.630_4.854352e-310 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.6 0.122 0.127 0.151 0.624 0.125 0.129 0.122 0.609 0.125 0.148 0.118 0.156 0.547 0.143 0.154 0.13 0.128 0.128 0.614 0.132 0.166 0.139 0.563 0.122 0.618 0.112 0.148 0.122 0.144 0.609 0.125 0.119 0.637 0.127 0.117 0.153 0.121 0.577 0.149 MOTIF Intestine_E16.5_H3K4me2_1_155_0.682_1.730385e-311 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.203 0.143 0.148 0.506 0.525 0.144 0.161 0.17 0.562 0.142 0.153 0.143 0.165 0.502 0.144 0.189 0.149 0.16 0.158 0.533 0.119 0.54 0.178 0.163 0.109 0.655 0.127 0.109 0.038 0.071 0.827 0.064 0.124 0.707 0.096 0.073 0.131 0.1 0.642 0.127 MOTIF Liver_E14.5_H3K4me2_6_159_0.626_6.491183e-319 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.162 0.174 0.558 0.106 0.139 0.66 0.099 0.102 0.179 0.017 0.729 0.075 0.404 0.186 0.242 0.168 0.303 0.574 0.092 0.031 0.086 0.118 0.627 0.169 0.037 0.303 0.091 0.569 0.162 0.104 0.205 0.529 0.583 0.112 0.187 0.118 0.563 0.102 0.216 0.119 MOTIF Stomach_E14.5_H3K4me2_13_154_0.661_2.121995e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.253 0.228 0.24 0.279 0.141 0.282 0.314 0.263 0.425 0.007 0.259 0.308 0.593 0.193 0.01 0.204 0.786 0.005 0.006 0.203 0.242 0.313 0.102 0.343 0.211 0.168 0.24 0.381 0.178 0.429 0.205 0.187 0.006 0.742 0.245 0.007 0.003 0.004 0.811 0.182 0.215 0.354 0.314 0.117 0.286 0.315 0.278 0.121