MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Intestine_E15.5_H3K27ac_87_58_0.508_4.466157e-11
letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.787683	0.036728	0.049098	0.126491
0.068016	0.036034	0.87635	0.019599
0.729329	0.16963	0.037418	0.063622
0.078317	0.258244	0.622162	0.041277
0.071896	0.833134	0.022887	0.072084
0.002724	0.971676	0.021904	0.003696
0.839709	0.050831	0.059096	0.050364
0.007527	0.274449	0.690334	0.02769
0.06309	0.03898	0.86978	0.02815
0.580502	0.004913	0.408731	0.005854
0.29411	0.242244	0.117705	0.345941
0.096867	0.069527	0.686621	0.146985
0.018094	0.937458	0.025656	0.018792

MOTIF	Stomach_E16.5_H3K27ac_74_43_0.511_1.406238e-11
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.034208	0.842511	0.071355	0.051926
0.19308	0.724962	0.029621	0.052337
0.014335	0.442555	0.49952	0.043589
0.038598	0.14372	0.009597	0.808086
0.012549	0.024185	0.963266	0.0
0.019289	0.020466	0.893638	0.066607
0.007668	0.933447	0.038483	0.020403
0.008652	0.075552	0.014977	0.900819
0.065209	0.85266	0.011302	0.070829
0.0	0.143706	0.033194	0.823101

MOTIF	Cranio-Facial_E15.5_H3K4me1_96_46_0.504_2.740445e-08
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.788776	0.023127	0.068503	0.119593
0.182374	0.030223	0.769863	0.017541
0.621466	0.084523	0.181799	0.112212
0.051217	0.168193	0.745059	0.035532
0.072013	0.852476	0.027681	0.04783
0.008025	0.968397	0.017469	0.006108
0.80445	0.116101	0.025908	0.053541
0.018924	0.130277	0.802373	0.048427
0.031721	0.031498	0.904402	0.032379
0.3744	0.0	0.6256	0.0

MOTIF	Intestine_E14.5_H3K4me1_91_29_0.506_1.925554e-07
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.162129	0.31473	0.162715	0.360426
0.023055	0.545094	0.42766	0.00419
0.773697	0.020639	0.069909	0.135755
0.116953	0.026136	0.847288	0.009623
0.667724	0.08015	0.178189	0.073937
0.033671	0.155526	0.737708	0.073096
0.050034	0.881453	0.028264	0.040248
0.015873	0.957948	0.016483	0.009696
0.800779	0.096591	0.034192	0.068438
0.095463	0.104338	0.745671	0.054528
0.01585	0.035725	0.925179	0.023246
0.120474	0.303725	0.435866	0.139935

MOTIF	Lung_P0_H3K4me1_99_59_0.502_0.0008054584
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.440562	0.325311	0.149567	0.08456
0.058492	0.521379	0.408138	0.011992
0.879503	0.019107	0.025708	0.075682
0.098701	0.043021	0.815176	0.043103
0.722107	0.108342	0.075718	0.093833
0.097801	0.178354	0.693041	0.030804
0.152609	0.750178	0.048139	0.049074
0.061101	0.905574	0.017921	0.015404
0.904492	0.027209	0.026553	0.041746
0.033664	0.116056	0.836392	0.013887
0.02888	0.045582	0.875612	0.049925

MOTIF	Lung_E16.5_H3K4me1_64_41_0.509_1.262147e-13
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.791117	0.002377	0.110612	0.095894
0.108136	0.042559	0.783577	0.065728
0.856691	0.058002	0.050269	0.035037
0.041066	0.174959	0.718126	0.065848
0.033641	0.929622	0.021785	0.014952
0.017437	0.953437	0.017626	0.0115
0.867374	0.095361	0.016553	0.020711
0.156154	0.191255	0.618494	0.034096
0.027821	0.017138	0.944349	0.010691
0.369605	0.189865	0.174635	0.265895

MOTIF	Neural-Tube_E13.5_H3K4me1_100_52_0.502_7.007195e-07
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.765917	0.023524	0.072591	0.137967
0.198723	0.027925	0.764508	0.008845
0.644737	0.015306	0.116345	0.223613
0.067169	0.081175	0.823125	0.028531
0.059675	0.853862	0.042585	0.043877
0.015479	0.95891	0.011151	0.01446
0.823376	0.116817	0.022589	0.037218
0.018129	0.184544	0.722713	0.074614
0.030225	0.068058	0.883509	0.018208
0.469623	0.19197	0.237857	0.10055

MOTIF	Cranio-Facial_E12.5_H3K4me1_60_43_0.514_9.494919e-26
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.020178	0.848436	0.130407	0.000979
0.741234	0.079429	0.054099	0.125237
0.088057	0.088836	0.796818	0.026289
0.619285	0.159602	0.120605	0.100508
0.037697	0.183061	0.772325	0.006918
0.10208	0.690172	0.118963	0.088785
0.012977	0.890965	0.088814	0.007244
0.099013	0.113436	0.094889	0.692662
0.046509	0.221544	0.651314	0.080633
0.100702	0.462343	0.097577	0.339377

MOTIF	Forebrain_E11.5_H3K4me1_47_44_0.524_1.538943e-55
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.023819	0.923364	0.039393	0.013424
0.768286	0.019351	0.04364	0.168724
0.089443	0.101768	0.801685	0.007105
0.700712	0.091329	0.056961	0.150997
0.034667	0.157522	0.798326	0.009485
0.069342	0.826439	0.064015	0.040203
0.064131	0.873843	0.05154	0.010485
0.097881	0.137756	0.049408	0.714955
0.017096	0.242819	0.701297	0.038789
0.206966	0.225267	0.386284	0.181482

MOTIF	Limb_E11.5_H3K4me1_62_31_0.518_7.107012e-24
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.020723	0.875274	0.090744	0.013259
0.774532	0.025088	0.079611	0.120769
0.061076	0.079351	0.845559	0.014014
0.807095	0.066222	0.065197	0.061485
0.029077	0.081357	0.874327	0.015238
0.036476	0.773329	0.146391	0.043805
0.036156	0.901549	0.05272	0.009574
0.165604	0.155873	0.045256	0.633267
0.053793	0.124289	0.755322	0.066595
0.174733	0.31908	0.387129	0.119058

MOTIF	Midbrain_E16.5_H3K4me1_62_28_0.514_1.577427e-21
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.0181	0.924258	0.055258	0.002384
0.809802	0.028375	0.063817	0.098006
0.082099	0.053133	0.859202	0.005566
0.741336	0.093001	0.060726	0.104938
0.030337	0.108151	0.847271	0.014241
0.049068	0.836348	0.065133	0.049451
0.048049	0.873981	0.067135	0.010835
0.203453	0.15378	0.079351	0.563416
0.025369	0.169128	0.757547	0.047956
0.143252	0.317476	0.390131	0.14914

MOTIF	Hindbrain_E11.5_H3K4me1_38_22_0.535_2.735029e-88
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.309559	0.107797	0.400562	0.182081
0.027322	0.901347	0.061963	0.009367
0.764403	0.037074	0.099891	0.098631
0.071155	0.092653	0.829627	0.006565
0.756719	0.123425	0.040905	0.07895
0.019774	0.121564	0.840417	0.018245
0.049242	0.841637	0.066715	0.042406
0.065049	0.84394	0.075303	0.015708
0.201318	0.113833	0.056981	0.627869
0.019162	0.166691	0.779705	0.034441
0.170614	0.451846	0.246544	0.130995

MOTIF	Hindbrain_E16.5_H3K4me1_45_13_0.525_1.543111e-48
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.336538	0.111737	0.379173	0.172553
0.016047	0.917758	0.05686	0.009335
0.813689	0.036984	0.060236	0.089091
0.059522	0.082465	0.853174	0.004838
0.784228	0.08599	0.041591	0.088191
0.027149	0.080497	0.875377	0.016978
0.043163	0.743248	0.157583	0.056006
0.053509	0.842287	0.080896	0.023309
0.180646	0.143417	0.075033	0.600904
0.042515	0.156804	0.758107	0.042574
0.206412	0.353525	0.343645	0.096418

MOTIF	Midbrain_E12.5_H3K4me1_45_30_0.521_4.161972e-49
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.331624	0.103174	0.433382	0.131819
0.022023	0.839852	0.134409	0.003716
0.759971	0.042547	0.099635	0.097847
0.084796	0.066325	0.841082	0.007797
0.740225	0.119952	0.055301	0.084522
0.025588	0.108017	0.855398	0.010998
0.043211	0.806719	0.077155	0.072915
0.014341	0.871368	0.089308	0.024982
0.117948	0.141428	0.038181	0.702444
0.027683	0.211273	0.690955	0.07009
0.142088	0.373212	0.306772	0.177927

MOTIF	Neural-Tube_E12.5_H3K4me1_68_31_0.513_5.767326e-25
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.354816	0.137415	0.451873	0.055896
0.011273	0.907211	0.078776	0.00274
0.811222	0.040485	0.042502	0.105791
0.075041	0.094432	0.824504	0.006022
0.749694	0.120226	0.072924	0.057156
0.025268	0.144903	0.828489	0.00134
0.038584	0.803042	0.064939	0.093434
0.089135	0.84314	0.046709	0.021016
0.100662	0.179699	0.060687	0.658952
0.035292	0.259627	0.645068	0.060012
0.212864	0.270302	0.339253	0.177581

MOTIF	Neural-Tube_E11.5_H3K4me1_87_36_0.505_4.912157e-12
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.07094	0.82382	0.099687	0.005553
0.7429	0.046719	0.118575	0.091807
0.141724	0.043341	0.807019	0.007917
0.818847	0.026327	0.133292	0.021534
0.012127	0.038135	0.945774	0.003964
0.043216	0.832697	0.082056	0.042031
0.026634	0.89415	0.073458	0.005758
0.681393	0.096955	0.03297	0.188681
0.023591	0.155704	0.781517	0.039188
0.184762	0.519512	0.246558	0.049168

MOTIF	Lung_E14.5_H3K4me1_74_36_0.506_6.719064e-13
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.035797	0.819569	0.111461	0.033174
0.731205	0.034233	0.105738	0.128824
0.150859	0.036907	0.80243	0.009805
0.83396	0.016219	0.074975	0.074846
0.01361	0.056043	0.912281	0.018066
0.066331	0.791169	0.066605	0.075895
0.077285	0.892746	0.014678	0.015291
0.671968	0.111738	0.034774	0.18152
0.057076	0.157513	0.72702	0.05839
0.341004	0.220493	0.168114	0.27039

MOTIF	Hindbrain_E15.5_H3K4me1_70_29_0.512_1.357603e-27
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.113812	0.21045	0.366466	0.309272
0.045045	0.834608	0.10662	0.013727
0.709225	0.049482	0.08943	0.151864
0.100045	0.059787	0.833124	0.007044
0.785122	0.027295	0.135969	0.051614
0.014982	0.052472	0.914272	0.018273
0.066353	0.801853	0.071519	0.060275
0.043673	0.921102	0.028504	0.00672
0.651156	0.151012	0.058829	0.139002
0.075443	0.107964	0.756979	0.059614

MOTIF	Neural-Tube_E14.5_H3K4me1_83_50_0.504_3.271421e-08
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.034341	0.851427	0.08901	0.025222
0.770187	0.043397	0.069759	0.116656
0.110606	0.057136	0.826209	0.006049
0.752912	0.022855	0.127286	0.096947
0.010332	0.048176	0.936378	0.005115
0.066687	0.808377	0.061839	0.063096
0.044862	0.89431	0.032216	0.028612
0.628555	0.149191	0.052361	0.169893
0.080003	0.108999	0.749995	0.061002

MOTIF	Midbrain_E13.5_H3K4me1_104_55_0.504_2.440971e-10
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.133895	0.155693	0.3609	0.349512
0.030371	0.800492	0.151472	0.017666
0.695145	0.062896	0.090629	0.15133
0.138212	0.034973	0.821446	0.005369
0.738545	0.02184	0.108329	0.131287
0.009957	0.045647	0.934692	0.009704
0.045943	0.862847	0.065051	0.026159
0.02251	0.858489	0.045138	0.073863
0.829742	0.075926	0.041904	0.052428
0.039452	0.183912	0.698766	0.07787
0.030791	0.221161	0.611788	0.13626

MOTIF	Cranio-Facial_E14.5_H3K4me1_88_31_0.508_2.71054e-14
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.09876	0.237595	0.410758	0.252887
0.060597	0.88083	0.038993	0.019579
0.749884	0.016582	0.117037	0.116496
0.119071	0.03253	0.843368	0.005031
0.843114	0.022883	0.05576	0.078243
0.015989	0.033997	0.92054	0.029474
0.062808	0.791137	0.080131	0.065924
0.093441	0.830621	0.055769	0.020168
0.677484	0.149395	0.04316	0.129961
0.091483	0.13774	0.732137	0.03864
0.19051	0.272581	0.495936	0.040973

MOTIF	Kidney_E14.5_H3K4me1_79_27_0.508_2.137671e-10
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.103862	0.152416	0.443813	0.299909
0.023252	0.871562	0.089929	0.015257
0.783732	0.043838	0.062605	0.109825
0.096955	0.050497	0.833645	0.018903
0.779144	0.02617	0.154427	0.040258
0.012454	0.02643	0.943401	0.017715
0.047261	0.819527	0.067217	0.065995
0.064245	0.84202	0.025526	0.068208
0.644297	0.10727	0.09387	0.154563
0.036162	0.130582	0.773183	0.060074
0.106492	0.398217	0.437795	0.057496

MOTIF	Heart_E14.5_H3K4me1_61_30_0.508_1.026646e-29
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.041288	0.875889	0.063614	0.019209
0.762549	0.034001	0.078313	0.125136
0.127589	0.042787	0.808196	0.021429
0.796028	0.015561	0.140539	0.047873
0.01198	0.034537	0.945683	0.0078
0.053984	0.783008	0.093343	0.069664
0.058316	0.849383	0.044699	0.047602
0.677348	0.114533	0.084813	0.123306
0.039247	0.122903	0.772456	0.065394
0.228222	0.253516	0.457915	0.060347

MOTIF	Limb_E13.5_H3K4me1_89_37_0.508_3.323679e-19
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.038682	0.891899	0.049454	0.019964
0.749755	0.018173	0.100503	0.131569
0.137067	0.046268	0.803816	0.01285
0.793031	0.016441	0.14772	0.042808
0.014595	0.034497	0.928357	0.02255
0.05339	0.811148	0.07106	0.064401
0.070842	0.876443	0.018009	0.034706
0.702122	0.113784	0.073655	0.11044
0.042287	0.147344	0.74998	0.060389
0.193786	0.138699	0.555494	0.112021

MOTIF	Hindbrain_P0_H3K4me1_64_19_0.512_9.509905e-15
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.104648	0.275296	0.341897	0.278159
0.048565	0.822201	0.122006	0.007228
0.726537	0.055016	0.104346	0.1141
0.114843	0.098705	0.781005	0.005447
0.817181	0.01648	0.06295	0.103389
0.013755	0.036967	0.936135	0.013142
0.053168	0.824124	0.086899	0.035809
0.047353	0.869145	0.065945	0.017557
0.731362	0.124856	0.038442	0.10534
0.089192	0.099412	0.761586	0.04981
0.072281	0.326789	0.437883	0.163046

MOTIF	Intestine_P0_H3K4me1_69_26_0.507_9.043228e-05
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.107189	0.35283	0.295946	0.244035
0.046351	0.84512	0.08938	0.019149
0.696043	0.037085	0.112185	0.154686
0.112487	0.068006	0.793418	0.026089
0.836311	0.022115	0.069251	0.072323
0.017263	0.048851	0.908075	0.025811
0.038457	0.852038	0.055073	0.054432
0.043391	0.870546	0.062798	0.023265
0.69616	0.111727	0.025759	0.166353
0.05639	0.136061	0.755531	0.052019
0.064607	0.411458	0.362863	0.161072

MOTIF	Midbrain_P0_H3K4me1_75_26_0.513_7.271473e-19
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.011914	0.940241	0.04449	0.003355
0.893338	0.013471	0.042811	0.050379
0.111857	0.04411	0.837239	0.006794
0.746053	0.027102	0.12937	0.097476
0.011295	0.108031	0.870612	0.010062
0.065824	0.835962	0.05335	0.044865
0.081447	0.849109	0.019259	0.050186
0.570726	0.126323	0.124712	0.178239
0.081319	0.116858	0.751671	0.050152
0.054235	0.263908	0.4988	0.183058

MOTIF	Forebrain_P0_H3K4me1_91_23_0.503_6.680583e-07
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.028321	0.884106	0.068131	0.019442
0.766788	0.038511	0.095865	0.098836
0.119975	0.111008	0.761653	0.007365
0.787059	0.022105	0.123596	0.06724
0.012429	0.088986	0.890868	0.007716
0.069159	0.810839	0.077569	0.042434
0.037654	0.88499	0.051692	0.025663
0.682804	0.104519	0.081502	0.131175
0.073941	0.094573	0.781659	0.049827
0.052147	0.436038	0.370362	0.141453

MOTIF	Intestine_E15.5_H3K4me1_62_30_0.515_2.169653e-50
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.026588	0.880368	0.072054	0.02099
0.777247	0.03823	0.06176	0.122763
0.1109	0.064018	0.802422	0.02266
0.766891	0.023931	0.18023	0.028948
0.014062	0.052672	0.899888	0.033378
0.045896	0.829698	0.074135	0.050271
0.036954	0.915807	0.022033	0.025206
0.625129	0.128343	0.060156	0.186373
0.068737	0.101326	0.781142	0.048795
0.081364	0.262763	0.48995	0.165923

MOTIF	Limb_E15.5_H3K4me1_68_28_0.513_1.470073e-41
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.033812	0.859119	0.084544	0.022525
0.763524	0.045176	0.072155	0.119145
0.108694	0.080514	0.794441	0.01635
0.771647	0.024103	0.132426	0.071824
0.011136	0.038313	0.917244	0.033306
0.052143	0.829158	0.066244	0.052456
0.052161	0.908015	0.01784	0.021985
0.686032	0.118096	0.071414	0.124457
0.073367	0.097225	0.791604	0.037805
0.097132	0.315105	0.452838	0.134924

MOTIF	Midbrain_E15.5_H3K4me1_102_173_0.507_6.78287e-30
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.05907	0.821173	0.108038	0.011718
0.798793	0.026169	0.034772	0.140266
0.107966	0.069527	0.788237	0.03427
0.834671	0.006162	0.055043	0.104124
0.02411	0.052095	0.910234	0.013561
0.046541	0.876604	0.049279	0.027576
0.084899	0.85841	0.038941	0.01775
0.678105	0.098104	0.035876	0.187916
0.089415	0.142345	0.701532	0.066709
0.077587	0.276751	0.42584	0.219822

MOTIF	Stomach_P0_H3K4me1_80_35_0.516_2.82897e-25
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.036531	0.875533	0.078038	0.009899
0.809661	0.041828	0.086169	0.062343
0.108557	0.03631	0.814987	0.040146
0.769844	0.022921	0.0837	0.123536
0.014732	0.043089	0.925655	0.016524
0.039333	0.822245	0.082941	0.055481
0.03197	0.889509	0.064737	0.013784
0.68757	0.160784	0.032492	0.119153
0.087638	0.143494	0.719232	0.049636
0.106494	0.264782	0.467188	0.161537

MOTIF	Stomach_E16.5_H3K9ac_104_114_0.502_1.2451e-12
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.018355	0.756332	0.064739	0.160574
0.19565	0.494345	0.275652	0.034353
0.0	0.958195	0.041805	0.0
0.03169	0.079717	0.029519	0.859074
0.0	0.033406	0.966594	0.0
0.027965	0.0	0.933295	0.038739
0.009815	0.710542	0.279643	0.0
0.084219	0.0	0.0	0.915781
0.043959	0.724925	0.033864	0.197253