MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Intestine_E14.5_H3K27me3_23_9_0.550_1.346443e-52 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.034556 0.942577 0.0 0.022867 0.072095 0.777299 0.027906 0.1227 0.080863 0.102438 0.684413 0.132286 0.017919 0.920298 0.039126 0.022658 0.049944 0.03439 0.85394 0.061727 0.071085 0.050401 0.807117 0.071396 0.078169 0.053483 0.730138 0.138211 0.128354 0.054724 0.743707 0.073215 0.132449 0.776024 0.016477 0.07505 0.396952 0.148527 0.007298 0.447224 MOTIF Limb_E11.5_H3K4me2_80_95_0.529_1.173624e-52 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.015371 0.898295 0.027143 0.05919 0.0 0.958122 0.041878 0.0 0.063591 0.04945 0.022113 0.864846 0.011625 0.056693 0.877268 0.054415 0.130606 0.402072 0.108363 0.358959 0.010923 0.908947 0.060741 0.01939 0.134561 0.782938 0.050743 0.031758 0.270738 0.68698 0.008287 0.033996 0.0 0.0926 0.868541 0.03886 MOTIF Midbrain_E11.5_H3K4me2_33_58_0.633_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.0 0.908114 0.075281 0.016605 0.005326 0.044754 0.929528 0.020392 0.0 0.979554 0.007315 0.013131 0.265073 0.038619 0.618064 0.078243 0.032813 0.061845 0.685461 0.219881 0.068172 0.047188 0.60577 0.27887 0.033148 0.020129 0.794206 0.152517 0.03166 0.900465 0.053388 0.014487 0.857131 0.050903 0.0 0.091966 MOTIF Heart_E16.5_H3K4me2_67_67_0.530_4.488624e-58 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.004545 0.955788 0.019186 0.020481 0.086564 0.0 0.029438 0.883998 0.070822 0.019006 0.611013 0.299158 0.057187 0.850411 0.025949 0.066453 0.097877 0.815301 0.060055 0.026766 0.121539 0.816367 0.037063 0.02503 0.088622 0.552817 0.050366 0.308195 0.019488 0.040317 0.918963 0.021232 0.021324 0.834512 0.116385 0.027779 MOTIF Stomach_P0_H3K4me2_54_35_0.561_8.854731e-255 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.027105 0.933812 0.027204 0.011879 0.109315 0.007304 0.108546 0.774836 0.029317 0.032334 0.751988 0.186362 0.070612 0.740971 0.064886 0.123531 0.097517 0.783873 0.074644 0.043967 0.090119 0.850138 0.030502 0.029242 0.169126 0.648638 0.034592 0.147644 0.023174 0.032197 0.928289 0.01634 0.020779 0.801051 0.167776 0.010394 MOTIF Hindbrain_E12.5_H3K27me3_48_8_0.507_4.075969e-35 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.43059 0.24591 0.0 0.3235 0.756511 0.0 0.201069 0.04242 0.050373 0.009707 0.883636 0.056284 0.14325 0.49683 0.342696 0.017224 0.066283 0.76955 0.138537 0.025631 0.027225 0.911702 0.020212 0.04086 0.052367 0.893199 0.04277 0.011663 0.035302 0.0 0.960823 0.003875 0.022001 0.929347 0.025671 0.022981 0.0 0.011364 0.819208 0.169428 MOTIF Forebrain_E16.5_H3K4me3_47_41_0.608_5.385798e-274 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.012304 0.893487 0.032277 0.061932 0.027333 0.086473 0.760096 0.126099 0.080641 0.06616 0.725821 0.127378 0.020287 0.052066 0.890014 0.037633 0.157337 0.082098 0.560368 0.200197 0.020572 0.829218 0.053859 0.096351 0.04092 0.044043 0.01131 0.903727 0.022908 0.858387 0.024306 0.094398 0.046148 0.808447 0.043058 0.102347 0.213793 0.018555 0.486778 0.280874 MOTIF Liver_E14.5_H3K4me3_47_49_0.615_1.429275e-317 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.004999 0.911807 0.024731 0.058463 0.002348 0.043646 0.918567 0.035439 0.114492 0.103595 0.625832 0.156081 0.053792 0.047577 0.841948 0.056684 0.135988 0.035217 0.756422 0.072373 0.138445 0.818161 0.007298 0.036095 0.046149 0.160565 0.02347 0.769816 0.002858 0.90207 0.064199 0.030872 0.083856 0.712768 0.048924 0.154452 MOTIF Hindbrain_E13.5_H3K4me3_67_42_0.585_6.992513e-205 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.11911 0.231069 0.141353 0.508467 0.005746 0.918892 0.027158 0.048204 0.020687 0.057531 0.733467 0.188315 0.054904 0.097017 0.716349 0.13173 0.150409 0.059756 0.712675 0.07716 0.043247 0.016774 0.72856 0.211419 0.009002 0.926564 0.037634 0.0268 0.031268 0.033331 0.028308 0.907093 0.047223 0.876456 0.062244 0.014077 0.092155 0.776172 0.036666 0.095008 MOTIF Forebrain_E13.5_H3K4me3_82_41_0.537_3.259271e-51 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.003664 0.932728 0.016399 0.047209 0.071659 0.116129 0.624697 0.187515 0.064147 0.075855 0.799645 0.060353 0.026738 0.090425 0.804908 0.07793 0.087973 0.041028 0.658173 0.212827 0.039995 0.798655 0.066929 0.09442 0.023577 0.079367 0.039979 0.857077 0.020372 0.901207 0.036384 0.042038 0.056013 0.823817 0.042381 0.077788 0.618667 0.116252 0.0 0.265081 MOTIF Forebrain_E12.5_H3K4me3_53_41_0.608_6.377378e-245 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.00584 0.917433 0.019136 0.057591 0.049574 0.079681 0.745777 0.124967 0.067756 0.064713 0.805403 0.062128 0.032447 0.068078 0.847258 0.052217 0.077376 0.035459 0.679358 0.207807 0.091831 0.82175 0.036475 0.049944 0.045392 0.068843 0.067554 0.818211 0.0455 0.771227 0.094792 0.088481 0.068594 0.830168 0.027522 0.073716 MOTIF Hindbrain_E11.5_H3K4me3_62_41_0.609_2.240237e-186 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.003926 0.949442 0.015827 0.030805 0.065915 0.079907 0.707135 0.147043 0.126358 0.088609 0.703823 0.08121 0.12499 0.069494 0.746326 0.05919 0.040171 0.04063 0.77031 0.14889 0.088997 0.855854 0.038446 0.016703 0.017547 0.031157 0.09244 0.858857 0.021406 0.843696 0.079108 0.055789 0.080404 0.783057 0.040755 0.095784 MOTIF Lung_P0_H3K4me3_65_50_0.568_1.744635e-154 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.003887 0.892811 0.011501 0.091801 0.101389 0.138734 0.569643 0.190234 0.069586 0.038429 0.763806 0.128179 0.013476 0.07192 0.905854 0.00875 0.111579 0.029458 0.780498 0.078465 0.030938 0.816166 0.044619 0.108276 0.017727 0.071139 0.037284 0.87385 0.046122 0.865457 0.030174 0.058246 0.025312 0.841427 0.05136 0.081902 MOTIF Cranio-Facial_E13.5_H3K4me3_45_25_0.627_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.325202 0.295534 0.242496 0.136767 0.064579 0.070802 0.842479 0.02214 0.848786 0.056166 0.045689 0.049359 0.039797 0.035825 0.853374 0.071004 0.079708 0.709641 0.103524 0.107126 0.01802 0.905841 0.033046 0.043093 0.098191 0.791921 0.057322 0.052567 0.16429 0.558798 0.206644 0.070269 0.029455 0.013272 0.956613 0.00066 0.031528 0.855443 0.101653 0.011377 MOTIF Midbrain_E16.5_H3K4me3_30_17_0.669_2.089008e-319 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.29062 0.146103 0.511148 0.052129 0.080811 0.07429 0.824196 0.020703 0.788522 0.086754 0.042152 0.082572 0.01979 0.020536 0.901992 0.057682 0.12123 0.737601 0.032065 0.109105 0.066562 0.815752 0.06364 0.054046 0.101321 0.615214 0.174214 0.109251 0.047533 0.811133 0.095148 0.046186 0.02072 0.010092 0.94657 0.022618 0.064001 0.833141 0.094496 0.008361 MOTIF Hindbrain_E12.5_H3K4me3_50_37_0.604_9.02404e-233 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.037235 0.074829 0.840112 0.047824 0.865903 0.012495 0.051064 0.070538 0.035924 0.009296 0.896236 0.058545 0.136207 0.810402 0.022147 0.031244 0.054992 0.84523 0.050541 0.049236 0.092162 0.663999 0.162142 0.081697 0.206445 0.694406 0.047077 0.052071 0.057937 0.014799 0.92072 0.006544 0.023391 0.667459 0.292918 0.016232 MOTIF Kidney_P0_H3K4me3_47_30_0.636_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.07797 0.066645 0.831154 0.024231 0.775795 0.103177 0.050044 0.070984 0.02804 0.025962 0.86052 0.085478 0.093937 0.793362 0.016542 0.096159 0.098944 0.777443 0.079125 0.044488 0.084094 0.779467 0.059821 0.076618 0.135632 0.718664 0.063038 0.082666 0.034083 0.012195 0.951075 0.002648 0.025942 0.87333 0.096448 0.004281 MOTIF Stomach_E14.5_H3K4me3_39_28_0.662_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.065673 0.070822 0.800325 0.06318 0.808061 0.079634 0.053192 0.059114 0.012658 0.009426 0.926674 0.051242 0.108738 0.755129 0.051098 0.085036 0.088301 0.727399 0.059149 0.125151 0.017952 0.801128 0.111126 0.069794 0.141361 0.726789 0.077614 0.054236 0.026986 0.013452 0.955091 0.004472 0.027386 0.801942 0.16735 0.003323 MOTIF Heart_E11.5_H3K4me3_30_12_0.651_1.194611e-315 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.156059 0.479404 0.364537 0.0 0.266456 0.385741 0.187296 0.160506 0.00333 0.346898 0.645298 0.004475 0.897344 0.00482 0.029782 0.068054 0.014895 0.042406 0.780606 0.162093 0.205555 0.689837 0.039828 0.064779 0.159131 0.703567 0.091653 0.045649 0.025284 0.87263 0.075551 0.026535 0.235781 0.675313 0.064055 0.024851 0.067335 0.004263 0.921702 0.0067 0.038878 0.835874 0.064027 0.06122 0.027142 0.013089 0.951327 0.008442 MOTIF Forebrain_P0_H3K4me3_38_19_0.657_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.092207 0.694775 0.184973 0.028046 0.751622 0.011862 0.150757 0.085758 0.03343 0.022475 0.867316 0.076779 0.075498 0.82651 0.030862 0.06713 0.064072 0.778091 0.042183 0.115654 0.055017 0.810782 0.032854 0.101347 0.037652 0.768166 0.142063 0.052118 0.041352 0.029746 0.902864 0.026039 0.076273 0.781108 0.130953 0.011666 MOTIF Intestine_P0_H3K4me3_33_12_0.648_5.29772e-312 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.084646 0.770824 0.121383 0.023148 0.773466 0.050683 0.111861 0.06399 0.011728 0.028651 0.909555 0.050067 0.060887 0.793552 0.081577 0.063984 0.080249 0.737206 0.070926 0.111618 0.059884 0.767434 0.087556 0.085125 0.106564 0.741002 0.123699 0.028735 0.051738 0.011807 0.916094 0.020361 0.032024 0.769474 0.186539 0.011962 MOTIF Cranio-Facial_E15.5_H3K4me3_39_30_0.633_9.112279e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.862489 0.048049 0.01654 0.072922 0.016825 0.018829 0.773989 0.190357 0.158701 0.755896 0.045934 0.03947 0.114781 0.794294 0.055975 0.03495 0.021362 0.873617 0.073083 0.031938 0.170645 0.483686 0.107703 0.237967 0.013304 0.023438 0.963259 0.0 0.088866 0.850085 0.054478 0.00657 0.019217 0.010845 0.941157 0.028781 MOTIF Liver_E13.5_H3K4me3_40_27_0.605_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.884375 0.038248 0.054034 0.023343 0.021712 0.029846 0.913445 0.034997 0.095036 0.842575 0.016974 0.045415 0.123268 0.77967 0.055667 0.041395 0.088144 0.817692 0.06882 0.025344 0.063447 0.607357 0.113473 0.215722 0.103462 0.01712 0.879418 0.0 0.178674 0.709134 0.014276 0.097915 0.044727 0.007308 0.930558 0.017407 MOTIF Limb_E15.5_H3K4me3_35_17_0.649_1.5293e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.040033 0.262706 0.321843 0.375418 0.411626 0.038968 0.475629 0.073777 0.853959 0.018735 0.053285 0.074021 0.01699 0.155909 0.813473 0.013627 0.038126 0.811483 0.023306 0.127085 0.232212 0.682899 0.060825 0.024064 0.151281 0.682856 0.070332 0.095531 0.027234 0.915132 0.041528 0.016105 0.136656 0.026645 0.836699 0.0 0.02509 0.737829 0.220248 0.016833 0.016445 0.008596 0.966354 0.008605 MOTIF Stomach_E15.5_H3K4me3_31_32_0.660_1.62116e-311 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.907098 0.049698 0.0 0.043203 0.014787 0.035745 0.933248 0.016219 0.319252 0.396433 0.03359 0.250725 0.190954 0.752438 0.013093 0.043515 0.032665 0.883551 0.049273 0.034511 0.014831 0.934715 0.034878 0.015577 0.206318 0.010577 0.772991 0.010114 0.029904 0.8422 0.120724 0.007171 0.017483 0.132236 0.840432 0.009849 MOTIF Cranio-Facial_E11.5_H3K27ac_17_6_0.558_1.480437e-57 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.056247 0.791685 0.081603 0.070466 0.054356 0.859982 0.015065 0.070597 0.081688 0.090392 0.722963 0.104956 0.019151 0.924904 0.034796 0.021149 0.062505 0.045126 0.843164 0.049205 0.058792 0.081711 0.766296 0.093202 0.111709 0.03499 0.750062 0.10324 0.104353 0.051981 0.771292 0.072374 0.113616 0.804934 0.034768 0.046681 0.247618 0.148717 0.194578 0.409087 MOTIF Intestine_P0_H3K27ac_38_16_0.527_4.226376e-46 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.022568 0.827284 0.055302 0.094847 0.723284 0.047233 0.05379 0.175693 0.001259 0.011103 0.966964 0.020674 0.117606 0.77359 0.038215 0.070589 0.142541 0.64963 0.046273 0.161557 0.027433 0.930868 0.031739 0.00996 0.108484 0.737508 0.047716 0.106292 0.029895 0.016415 0.928078 0.025612 0.22995 0.629777 0.05466 0.085613 0.042374 0.0 0.957626 0.0 MOTIF Limb_E13.5_H3K9ac_14_29_0.607_4.283549e-321 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.873417 0.076952 0.0 0.049631 0.010867 0.035223 0.773698 0.180213 0.093297 0.694084 0.06026 0.152359 0.012488 0.708713 0.027207 0.251592 0.203674 0.76311 0.021654 0.011562 0.045635 0.895668 0.058698 0.0 0.011795 0.039259 0.938495 0.010451 0.053218 0.856162 0.053741 0.036878 0.128463 0.0 0.853195 0.018343 MOTIF Forebrain_E15.5_H3K9ac_33_25_0.610_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.791767 0.022187 0.060748 0.125298 0.009404 0.018554 0.883037 0.089005 0.02168 0.873847 0.014508 0.089964 0.04758 0.742704 0.136145 0.073572 0.069913 0.8179 0.050051 0.062137 0.23599 0.656995 0.080192 0.026824 0.10774 0.0 0.89226 0.0 0.167426 0.733309 0.043748 0.055518 0.038649 0.003672 0.933396 0.024283 MOTIF Intestine_E14.5_H3K9ac_21_19_0.649_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.869627 0.0 0.041798 0.088575 0.016068 0.056207 0.896595 0.031131 0.158562 0.668493 0.157216 0.015729 0.106185 0.762873 0.099325 0.031617 0.105167 0.703008 0.058597 0.133228 0.154627 0.699439 0.124428 0.021506 0.012782 0.006665 0.980553 0.0 0.12258 0.817576 0.031523 0.02832 0.062203 0.032196 0.873748 0.031853 MOTIF Limb_E15.5_H3K9ac_17_9_0.641_7.120543e-300 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.779975 0.061627 0.055298 0.1031 0.023048 0.117445 0.691033 0.168473 0.036126 0.883539 0.037095 0.04324 0.186247 0.706929 0.053499 0.053325 0.119724 0.741902 0.048156 0.090218 0.101314 0.787545 0.032721 0.07842 0.020567 0.028636 0.940216 0.010582 0.103584 0.785885 0.096628 0.013903 0.031575 0.005599 0.953689 0.009136 0.321175 0.333866 0.09557 0.249389 0.379028 0.163278 0.295677 0.162017 MOTIF Liver_E11.5_H3K9ac_12_10_0.616_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.009709 0.033657 0.891426 0.065207 0.083549 0.771384 0.068446 0.076621 0.074142 0.821179 0.051906 0.052774 0.023473 0.630686 0.251035 0.094805 0.095827 0.742207 0.136078 0.025888 0.02123 0.023941 0.892185 0.062644 0.145963 0.704171 0.096839 0.053027 0.022563 0.0 0.962297 0.015139 0.054772 0.8446 0.076017 0.024611 MOTIF Limb_E13.5_H3K9ac_6_4_0.613_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.004498 0.037259 0.895022 0.063221 0.067307 0.787902 0.068219 0.076571 0.086666 0.718826 0.067745 0.126763 0.07142 0.749503 0.090648 0.08843 0.121928 0.73628 0.109568 0.032223 0.060757 0.025891 0.851257 0.062095 0.078528 0.795797 0.082024 0.043651 0.029516 0.008308 0.94116 0.021016 0.063334 0.783548 0.083582 0.069537 0.201282 0.027639 0.354096 0.416983 MOTIF Midbrain_E15.5_H3K9ac_12_3_0.670_6.381097e-317 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.021478 0.033888 0.887846 0.056789 0.075338 0.792323 0.054773 0.077566 0.075601 0.828626 0.047086 0.048686 0.083812 0.632595 0.18963 0.093963 0.118543 0.733173 0.123698 0.024586 0.019728 0.038883 0.854994 0.086395 0.103656 0.776706 0.079768 0.039869 0.023588 0.01782 0.923029 0.035563 0.052351 0.884714 0.046063 0.016871 0.262201 0.040459 0.319194 0.378146 0.011253 0.419687 0.388409 0.180651