MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Cranio-Facial_E15.5_H3K27ac_61_39_0.519_1.507812e-22
letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.036835	0.74527	0.164715	0.053179
0.070407	0.096215	0.158515	0.674863
0.023155	0.114451	0.771639	0.090755
0.003904	0.93637	0.007901	0.051825
0.017897	0.054893	0.129017	0.798193
0.002965	0.836808	0.079573	0.080654
0.061215	0.026873	0.116323	0.79559
0.016025	0.062681	0.894851	0.026444
0.201806	0.649263	0.081168	0.067763
0.209074	0.1053	0.606641	0.078985
0.674585	0.246645	0.032211	0.046559
0.659228	0.302901	0.037872	0.0
0.0	0.92235	0.07765	0.0

MOTIF	Hindbrain_E13.5_H3K27ac_53_50_0.524_7.870101e-38
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.002881	0.79357	0.138573	0.064977
0.070161	0.0473	0.122539	0.760001
0.007831	0.325007	0.510797	0.156365
0.007087	0.947346	0.012182	0.033385
0.027979	0.036799	0.029354	0.905869
0.0	0.931652	0.059229	0.009119
0.046802	0.034281	0.143582	0.775335
0.003718	0.070212	0.906366	0.019704
0.240339	0.599406	0.103879	0.056375
0.0	0.145971	0.779509	0.07452
0.609992	0.345108	0.028906	0.015994

MOTIF	Neural-Tube_E14.5_H3K27ac_37_31_0.542_1.344642e-43
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.035616	0.784427	0.116111	0.063846
0.086036	0.099899	0.105124	0.708941
0.005427	0.12239	0.746568	0.125615
0.005015	0.923267	0.008589	0.063129
0.03803	0.047937	0.027142	0.886891
0.001519	0.886728	0.055915	0.055838
0.045293	0.164003	0.088259	0.702446
0.010986	0.050258	0.911297	0.027458
0.063021	0.582278	0.243674	0.111026
0.004146	0.039585	0.831765	0.124504
0.456331	0.359188	0.013213	0.171268
0.056463	0.282614	0.649314	0.011609

MOTIF	Heart_E15.5_H3K4me1_61_58_0.513_2.324368e-38
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.074703	0.758067	0.131693	0.035537
0.072928	0.123285	0.053586	0.750201
0.018546	0.100754	0.711236	0.169464
0.018539	0.929283	0.014203	0.037975
0.00621	0.00428	0.03243	0.95708
0.001009	0.828992	0.06753	0.102468
0.050883	0.014131	0.071594	0.863392
0.036589	0.230717	0.604933	0.12776
0.091393	0.765567	0.059579	0.08346
0.018533	0.0	0.504086	0.47738
0.021475	0.446926	0.253206	0.278393

MOTIF	Forebrain_E15.5_H3K4me1_40_16_0.529_2.737543e-60
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.045529	0.872656	0.030058	0.051758
0.064369	0.079116	0.038207	0.818307
0.021151	0.179948	0.613986	0.184916
0.007209	0.885445	0.023387	0.083959
0.025744	0.040912	0.080179	0.853166
0.001593	0.922912	0.051201	0.024295
0.055696	0.139756	0.056178	0.74837
0.015989	0.299652	0.666189	0.01817
0.053751	0.761243	0.115131	0.069875
0.014255	0.027403	0.619354	0.338988
0.325844	0.481041	0.040042	0.153073
0.054533	0.016573	0.844996	0.083899

MOTIF	Liver_E13.5_H3K4me1_55_14_0.526_1.265133e-72
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.02071	0.894176	0.062156	0.022959
0.043559	0.032918	0.171705	0.751818
0.012366	0.032165	0.913087	0.042382
0.011497	0.929703	0.037295	0.021506
0.018134	0.06122	0.270246	0.6504
0.004083	0.839469	0.061306	0.095143
0.021742	0.01112	0.203851	0.763287
0.001033	0.221432	0.731734	0.045801
0.021423	0.934197	0.007566	0.036814
0.012794	0.26047	0.559476	0.167259
0.121226	0.797968	0.061549	0.019257
0.0	0.029448	0.759593	0.210958

MOTIF	Kidney_E15.5_H3K4me1_43_44_0.520_5.673579e-55
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.207736	0.396789	0.20109	0.194385
0.409872	0.198443	0.191945	0.199741
0.132922	0.308577	0.505436	0.053064
0.030884	0.923513	0.023402	0.022201
0.821371	0.088274	0.035808	0.054547
0.174826	0.074958	0.749005	0.001212
0.930071	0.022046	0.03002	0.017863
0.048529	0.025405	0.925233	0.000833
0.175082	0.761606	0.047637	0.015674
0.767816	0.054829	0.135804	0.041551
0.046887	0.141878	0.793369	0.017865
0.073667	0.169133	0.666893	0.090307

MOTIF	Kidney_E16.5_H3K4me1_66_40_0.512_1.528562e-23
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.368904	0.315866	0.185507	0.129723
0.108262	0.254397	0.395	0.242342
0.02612	0.920496	0.033694	0.01969
0.791382	0.068922	0.063247	0.07645
0.096114	0.244823	0.656312	0.00275
0.900286	0.02477	0.029766	0.045178
0.086012	0.011831	0.901151	0.001007
0.163205	0.772095	0.04987	0.01483
0.781356	0.063113	0.103396	0.052135
0.033535	0.118284	0.828601	0.01958
0.049509	0.184057	0.708537	0.057897

MOTIF	Heart_E11.5_H3K4me1_42_41_0.518_8.722716e-27
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.023144	0.779782	0.165287	0.031787
0.075232	0.041645	0.039718	0.843405
0.011436	0.101456	0.756411	0.130697
0.018092	0.908141	0.011632	0.062136
0.043427	0.067317	0.050313	0.838943
0.004359	0.7567	0.165377	0.073564
0.073582	0.045684	0.047605	0.833128
0.018512	0.134947	0.808838	0.037703
0.135519	0.664256	0.127369	0.072856
0.200709	0.341898	0.376777	0.080616

MOTIF	Forebrain_E13.5_H3K4me1_37_30_0.525_3.025279e-72
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.034654	0.783585	0.097627	0.084135
0.085293	0.077306	0.129967	0.707434
0.034208	0.131663	0.751106	0.083023
0.00337	0.942564	0.005659	0.048407
0.033959	0.058087	0.027806	0.880148
0.004864	0.789075	0.117576	0.088485
0.11309	0.059977	0.04799	0.778943
0.016892	0.067622	0.882554	0.032932
0.0873	0.748295	0.046824	0.117582
0.322097	0.305553	0.219748	0.152603

MOTIF	Heart_E12.5_H3K4me1_37_32_0.518_5.853969e-52
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.050195	0.843599	0.097646	0.00856
0.08091	0.019936	0.150889	0.748265
0.009297	0.068889	0.878908	0.042906
0.00233	0.901188	0.02398	0.072502
0.047516	0.026967	0.094342	0.831175
0.022588	0.811439	0.129272	0.036701
0.146824	0.053285	0.055074	0.744816
0.01757	0.057119	0.828364	0.096947
0.101635	0.745083	0.056257	0.097025
0.3909	0.292854	0.147597	0.16865

MOTIF	Intestine_E16.5_H3K4me1_58_51_0.515_9.778699e-35
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.069731	0.891394	0.029666	0.00921
0.075352	0.050535	0.036398	0.837715
0.027503	0.024202	0.887671	0.060623
0.011354	0.930527	0.021697	0.036423
0.026001	0.023555	0.116771	0.833673
0.006196	0.72314	0.185265	0.0854
0.12101	0.031494	0.051914	0.795582
0.021632	0.162298	0.726423	0.089647
0.153336	0.620826	0.057988	0.16785
0.126327	0.403787	0.316435	0.153452

MOTIF	Forebrain_E16.5_H3K4me1_65_69_0.514_2.834062e-36
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.011806	0.865415	0.091915	0.030864
0.063419	0.038458	0.024983	0.873141
0.028661	0.200851	0.612148	0.158341
0.005321	0.924642	0.011088	0.05895
0.019384	0.036185	0.03578	0.908651
0.000243	0.803146	0.078935	0.117676
0.103786	0.024732	0.058819	0.812663
0.016559	0.226376	0.704357	0.052707
0.030983	0.789513	0.034773	0.144731

MOTIF	Cranio-Facial_E12.5_H3K4me1_47_50_0.518_1.568869e-31
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.058184	0.7312	0.139731	0.070885
0.038543	0.077994	0.088906	0.794556
0.016322	0.189207	0.647098	0.147373
0.004046	0.880723	0.021287	0.093945
0.014661	0.064715	0.052784	0.86784
0.002804	0.859107	0.067304	0.070785
0.060909	0.022452	0.039227	0.877412
0.011117	0.151376	0.814521	0.022986
0.10351	0.737081	0.058263	0.101146

MOTIF	Intestine_E14.5_H3K4me1_46_25_0.520_1.184021e-37
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.041219	0.84321	0.076142	0.03943
0.066317	0.064068	0.119021	0.750593
0.014787	0.144023	0.705693	0.135497
0.005079	0.913884	0.023128	0.057909
0.026327	0.035783	0.052351	0.885539
0.007227	0.798733	0.131338	0.062702
0.04912	0.06596	0.027434	0.857485
0.01868	0.132101	0.819578	0.029641
0.100766	0.640181	0.102386	0.156668
0.303162	0.084766	0.328605	0.283467

MOTIF	Limb_E13.5_H3K4me1_34_40_0.525_1.055046e-92
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.0258	0.805692	0.108578	0.059929
0.045564	0.068434	0.106829	0.779172
0.017641	0.08683	0.779922	0.115607
0.003941	0.876964	0.018257	0.100838
0.046846	0.075952	0.055725	0.821477
0.000941	0.830868	0.060069	0.108122
0.041817	0.04312	0.066049	0.849015
0.026827	0.164517	0.764466	0.044191
0.114246	0.778967	0.052075	0.054712
0.313552	0.099851	0.388489	0.198107

MOTIF	Midbrain_E12.5_H3K4me1_46_33_0.520_6.551356e-38
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.008062	0.906948	0.027986	0.057005
0.09449	0.061033	0.111448	0.733029
0.009804	0.177599	0.623441	0.189156
0.008916	0.865332	0.028765	0.096987
0.033558	0.067054	0.107023	0.792365
0.002174	0.947366	0.03417	0.01629
0.054521	0.092424	0.019551	0.833504
0.017746	0.134914	0.823631	0.023709
0.115164	0.727253	0.098816	0.058767
0.423293	0.083791	0.325989	0.166927

MOTIF	Hindbrain_E15.5_H3K4me1_38_92_0.527_2.309255e-88
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.022897	0.87866	0.08929	0.009153
0.845035	0.076671	0.027017	0.051276
0.165751	0.121882	0.712367	0.0
0.898595	0.022481	0.062969	0.015955
0.07991	0.003022	0.912058	0.00501
0.188377	0.664072	0.119726	0.027825
0.820501	0.029393	0.083489	0.066618
0.017647	0.110273	0.782783	0.089297
0.210313	0.658289	0.05241	0.078988

MOTIF	Kidney_E14.5_H3K4me1_50_111_0.517_1.205785e-25
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.018586	0.761117	0.214944	0.005354
0.916341	0.020673	0.022134	0.040852
0.148569	0.053197	0.796493	0.001741
0.902473	0.0299	0.047213	0.020415
0.147211	0.015548	0.832716	0.004524
0.202818	0.650537	0.121988	0.024656
0.827895	0.037844	0.064275	0.069986
0.007634	0.116952	0.81726	0.058154
0.121284	0.722351	0.090803	0.065562

MOTIF	Limb_E15.5_H3K4me1_67_48_0.513_7.271684e-21
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.0626	0.780712	0.083464	0.073224
0.067113	0.13648	0.13817	0.658237
0.035309	0.194235	0.550136	0.22032
0.004224	0.896223	0.002112	0.097441
0.021694	0.053426	0.040488	0.884392
0.001061	0.952654	0.033226	0.01306
0.041969	0.067196	0.045621	0.845214
0.049789	0.164254	0.752182	0.033775
0.048814	0.896182	0.022122	0.032881

MOTIF	Stomach_E14.5_H3K4me1_55_38_0.514_1.850515e-17
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.049218	0.661275	0.1927	0.096807
0.071786	0.104606	0.116571	0.707036
0.02043	0.089352	0.669667	0.220551
0.008245	0.828858	0.020335	0.142562
0.017399	0.050969	0.101913	0.829718
0.003465	0.888351	0.050311	0.057872
0.037401	0.129073	0.070017	0.763509
0.018549	0.045884	0.899234	0.036334
0.023777	0.898864	0.019321	0.058038
0.019685	0.355855	0.002541	0.621919

MOTIF	Heart_P0_H3K4me1_59_51_0.506_1.566657e-06
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.324599	0.251091	0.37404	0.050269
0.224589	0.670829	0.067594	0.036988
0.800992	0.0187	0.063691	0.116616
0.096571	0.130594	0.747819	0.025016
0.69145	0.093683	0.178991	0.035875
0.100665	0.059599	0.797321	0.042416
0.049037	0.856898	0.064251	0.029813
0.864629	0.049285	0.032718	0.053369
0.081545	0.12375	0.792086	0.002619
0.825257	0.062815	0.047182	0.064745
0.017637	0.045711	0.908453	0.028198

MOTIF	Limb_E13.5_H3K4me1_80_95_0.512_1.49149e-52
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.096596	0.722045	0.165051	0.016307
0.853212	0.027724	0.047149	0.071915
0.081502	0.055771	0.855188	0.007539
0.711564	0.011575	0.220851	0.05601
0.082767	0.009428	0.895607	0.012198
0.138957	0.737092	0.101099	0.022853
0.862141	0.016129	0.055173	0.066557
0.033773	0.152146	0.798238	0.015844
0.778621	0.095054	0.077539	0.048786

MOTIF	Midbrain_E11.5_H3K4me1_74_101_0.513_4.149191e-31
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.062002	0.793179	0.129966	0.014852
0.900273	0.02383	0.027146	0.048751
0.057717	0.041118	0.898029	0.003136
0.831742	0.038842	0.080675	0.048741
0.067582	0.012651	0.905314	0.014454
0.155055	0.674901	0.144991	0.025053
0.674469	0.127051	0.121006	0.077474
0.10638	0.119807	0.756159	0.017653
0.799639	0.076227	0.077515	0.046619

MOTIF	Cranio-Facial_E14.5_H3K4me1_78_107_0.512_2.224177e-21
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.071891	0.869504	0.030914	0.027691
0.853856	0.043561	0.018224	0.084359
0.098884	0.184848	0.714782	0.001485
0.826355	0.029601	0.062915	0.081128
0.120147	0.023361	0.848487	0.008004
0.138872	0.702638	0.12894	0.02955
0.880742	0.021086	0.033048	0.065124
0.038764	0.188273	0.770447	0.002517
0.758878	0.072463	0.095992	0.072666

MOTIF	Forebrain_E16.5_H3K4me1_61_105_0.514_3.934175e-50
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.050574	0.863248	0.06537	0.020808
0.840673	0.054253	0.041044	0.06403
0.11954	0.185999	0.694322	0.000138
0.851533	0.026147	0.078257	0.044064
0.105135	0.008552	0.877378	0.008935
0.113088	0.730926	0.135008	0.020978
0.857625	0.013364	0.083879	0.045131
0.040411	0.149126	0.805396	0.005067
0.745588	0.059816	0.096385	0.098211

MOTIF	Forebrain_E11.5_H3K4me1_51_113_0.523_1.984939e-71
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.00792	0.829052	0.13317	0.029858
0.785029	0.067201	0.03496	0.11281
0.118164	0.054956	0.825242	0.001638
0.813044	0.041533	0.070095	0.075328
0.094789	0.015379	0.881975	0.007856
0.118475	0.680742	0.152804	0.04798
0.831217	0.030971	0.061978	0.075834
0.075205	0.123437	0.801358	0.0
0.792279	0.110391	0.040311	0.057019

MOTIF	Limb_E11.5_H3K4me1_60_107_0.518_2.029099e-22
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.07241	0.787038	0.103701	0.036851
0.859388	0.018634	0.022474	0.099504
0.074674	0.065405	0.857911	0.00201
0.876725	0.047141	0.034557	0.041578
0.125226	0.018231	0.849417	0.007126
0.116949	0.652138	0.2118	0.019113
0.805773	0.031303	0.088831	0.074093
0.066917	0.118608	0.812145	0.00233
0.724977	0.121804	0.105309	0.04791

MOTIF	Stomach_P0_H3K4me1_84_107_0.513_1.052347e-18
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.048054	0.802905	0.117787	0.031254
0.829773	0.018689	0.074432	0.077106
0.067361	0.098414	0.831394	0.002832
0.878007	0.025229	0.041096	0.055668
0.076091	0.015083	0.89997	0.008855
0.186691	0.629433	0.142295	0.041581
0.817144	0.008201	0.120689	0.053965
0.031288	0.128633	0.834575	0.005505
0.72168	0.121313	0.108592	0.048415

MOTIF	Lung_E16.5_H3K9ac_70_66_0.524_9.910742e-56
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.005333	0.041789	0.836086	0.116793
0.047244	0.894001	0.053284	0.005472
0.218702	0.011004	0.608543	0.16175
0.003386	0.903845	0.089179	0.003591
0.869206	0.028259	0.03835	0.064186
0.007578	0.41721	0.575212	0.0
0.778091	0.043525	0.030502	0.147881
0.068089	0.013425	0.9043	0.014186
0.054721	0.794708	0.047206	0.103365
0.835949	0.103964	0.0	0.060087

MOTIF	Hindbrain_P0_H3K9ac_70_93_0.549_5.859555e-71
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.259947	0.131241	0.456246	0.152567
0.075215	0.581835	0.034946	0.308003
0.026316	0.05968	0.800122	0.113881
0.0	0.913194	0.086806	0.0
0.879305	0.020851	0.052638	0.047207
0.005384	0.053026	0.941589	0.0
0.879059	0.075454	0.02474	0.020746
0.085198	0.01086	0.879061	0.024881
0.294937	0.634344	0.056314	0.014405

MOTIF	Lung_E15.5_H3K9ac_72_70_0.548_8.658345e-39
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.020179	0.056488	0.795163	0.128171
0.029979	0.628256	0.059967	0.281797
0.202945	0.055584	0.647575	0.093897
0.006273	0.88826	0.104119	0.001348
0.891286	0.012574	0.044935	0.051204
0.003002	0.031193	0.965805	0.0
0.804614	0.096675	0.0	0.098712
0.062045	0.044462	0.876464	0.017029
0.048725	0.806582	0.037382	0.10731
0.095975	0.408489	0.335493	0.160043
0.468969	0.277571	0.193257	0.060203

MOTIF	Kidney_E16.5_H3K9ac_70_54_0.540_3.34047e-41
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.102732	0.0	0.715355	0.181913
0.318755	0.405204	0.162636	0.113405
0.283156	0.033993	0.659695	0.023156
0.275388	0.645242	0.040422	0.038948
0.038047	0.025218	0.841209	0.095526
0.005194	0.938676	0.054403	0.001727
0.717067	0.011817	0.04647	0.224646
0.0	0.043292	0.956708	0.0
0.911742	0.025978	0.029564	0.032716
0.100966	0.018694	0.804322	0.076018
0.047596	0.87639	0.044421	0.031593
0.50263	0.241061	0.186523	0.069786

MOTIF	Midbrain_E15.5_H3K9ac_65_37_0.548_2.595053e-42
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.307021	0.026298	0.666681	0.0
0.216267	0.503769	0.18238	0.097583
0.021551	0.123429	0.699896	0.155124
0.158985	0.68129	0.068854	0.090872
0.143024	0.043616	0.694116	0.119244
0.007791	0.931804	0.059072	0.001334
0.861833	0.027094	0.041565	0.069508
0.003126	0.146883	0.849991	0.0
0.89191	0.078973	0.007009	0.022108
0.014773	0.008958	0.947632	0.028638
0.069736	0.828415	0.045301	0.056548
0.328562	0.315714	0.139194	0.216529