MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Cranio-Facial_E13.5_H3K27me3_18_154_0.517_5.980577e-09
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.001	0.997	0.001	0.001
0.037	0.001	0.961	0.001
0.001	0.947	0.001	0.051
0.001	0.001	0.001	0.997
0.001	0.001	0.001	0.997
0.001	0.001	0.001	0.997
0.997	0.001	0.001	0.001
0.997	0.001	0.001	0.001

MOTIF	Intestine_E16.5_H3K4me1_2_163_0.539_5.523464e-130
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.001	0.569	0.429	0.001
0.001	0.997	0.001	0.001
0.001	0.001	0.997	0.001
0.001	0.997	0.001	0.001
0.001	0.001	0.001	0.997
0.001	0.001	0.001	0.997
0.001	0.001	0.001	0.997
0.997	0.001	0.001	0.001
0.997	0.001	0.001	0.001
0.997	0.001	0.001	0.001

MOTIF	Midbrain_E11.5_H3K4me1_1_155_0.572_5.399045e-234
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.001	0.997	0.001	0.001
0.001	0.001	0.997	0.001
0.001	0.837	0.161	0.001
0.335	0.001	0.216	0.448
0.001	0.001	0.001	0.997
0.001	0.001	0.001	0.997
0.997	0.001	0.001	0.001
0.997	0.001	0.001	0.001

MOTIF	Intestine_E16.5_H3K27ac_17_155_0.540_1.309808e-54
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.001	0.001	0.019	0.979
0.001	0.028	0.057	0.914
0.001	0.027	0.081	0.891
0.832	0.103	0.022	0.043
0.723	0.156	0.001	0.12
0.954	0.005	0.02	0.021
0.064	0.073	0.862	0.001
0.001	0.942	0.001	0.056

MOTIF	Heart_E11.5_H3K4me1_9_156_0.536_2.378556e-89
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.023	0.019	0.036	0.922
0.012	0.037	0.025	0.926
0.001	0.044	0.093	0.862
0.858	0.057	0.037	0.048
0.787	0.109	0.023	0.081
0.967	0.014	0.001	0.018
0.061	0.037	0.901	0.001
0.001	0.894	0.069	0.036

MOTIF	Heart_E12.5_H3K4me1_10_158_0.530_9.293317e-97
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.026	0.001	0.034	0.939
0.014	0.044	0.024	0.918
0.001	0.037	0.123	0.839
0.848	0.071	0.029	0.052
0.776	0.092	0.023	0.109
0.968	0.03	0.001	0.001
0.047	0.038	0.914	0.001
0.001	0.893	0.064	0.042

MOTIF	Limb_E13.5_H3K4me1_4_140_0.548_2.293747e-210
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.079216	0.033146	0.868449	0.019188
0.128042	0.250433	0.300217	0.321308
0.006349	0.135673	0.848965	0.009013
0.003343	0.850866	0.111715	0.034076
0.021231	0.070272	0.011588	0.896909
0.179791	0.013618	0.231054	0.575536
0.037287	0.011561	0.022089	0.929063
0.774352	0.034439	0.090978	0.100232
0.903797	0.036211	0.034208	0.025784
0.962784	0.007657	0.015197	0.014363
0.658592	0.222983	0.089253	0.029172

MOTIF	Limb_E14.5_H3K4me1_2_146_0.549_1.543469e-152
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.013679	0.130214	0.822896	0.03321
0.006393	0.874492	0.087374	0.031742
0.013092	0.077063	0.010362	0.899483
0.189183	0.028568	0.230693	0.551555
0.031029	0.005552	0.004276	0.959142
0.761256	0.028911	0.12102	0.088813
0.925647	0.039076	0.003103	0.032173
0.95826	0.008492	0.016226	0.017023
0.688682	0.21929	0.068905	0.023123
0.279058	0.37399	0.174548	0.172404

MOTIF	Liver_E15.5_H3K4me1_65_165_0.522_2.727859e-28
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.064	0.001	0.934	0.001
0.001	0.839	0.159	0.001
0.001	0.001	0.5	0.498
0.183	0.047	0.052	0.718
0.054	0.001	0.159	0.786
0.894	0.056	0.049	0.001
0.914	0.001	0.052	0.033
0.914	0.001	0.045	0.04

MOTIF	Intestine_E14.5_H3K4me1_2_158_0.554_9.717321e-162
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.182	0.243	0.402	0.173
0.137	0.569	0.128	0.166
0.118	0.127	0.599	0.156
0.123	0.541	0.145	0.191
0.114	0.099	0.122	0.665
0.102	0.097	0.163	0.638
0.125	0.153	0.109	0.613
0.575	0.133	0.153	0.139
0.613	0.119	0.125	0.143
0.459	0.184	0.214	0.142

MOTIF	Liver_E11.5_H3K4me1_5_161_0.535_1.030252e-66
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.165	0.523	0.149	0.163
0.149	0.148	0.567	0.136
0.125	0.552	0.162	0.161
0.138	0.093	0.127	0.642
0.104	0.123	0.126	0.647
0.137	0.12	0.116	0.627
0.615	0.124	0.117	0.144
0.644	0.137	0.114	0.105
0.65	0.085	0.134	0.131
0.199	0.169	0.472	0.16

MOTIF	Hindbrain_E14.5_H3K4me1_8_155_0.544_2.635649e-112
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.1	0.7

MOTIF	Heart_E15.5_H3K4me1_7_160_0.542_6.397319e-141
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.108	0.107	0.684	0.101
0.101	0.685	0.082	0.132
0.152	0.109	0.598	0.141
0.107	0.661	0.108	0.124
0.095	0.076	0.082	0.747
0.072	0.091	0.109	0.728
0.099	0.09	0.101	0.71
0.719	0.101	0.097	0.083
0.744	0.074	0.089	0.093
0.721	0.085	0.086	0.108

MOTIF	Lung_E15.5_H3K4me1_5_157_0.547_4.592409e-148
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.107	0.076	0.075	0.742
0.078	0.082	0.086	0.754
0.118	0.103	0.089	0.69
0.715	0.084	0.099	0.102
0.741	0.111	0.082	0.066
0.77	0.078	0.065	0.087
0.133	0.116	0.642	0.109
0.139	0.608	0.121	0.132
0.132	0.099	0.668	0.101
0.11	0.671	0.107	0.112

MOTIF	Lung_E16.5_H3K4me1_2_162_0.548_8.284928e-135
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.119	0.115	0.126	0.64
0.119	0.12	0.116	0.645
0.161	0.13	0.134	0.575
0.581	0.142	0.122	0.155
0.717	0.168	0.061	0.054
0.675	0.119	0.081	0.125
0.19	0.119	0.537	0.154
0.195	0.482	0.151	0.172
0.16	0.127	0.575	0.138
0.142	0.572	0.153	0.133

MOTIF	Forebrain_E12.5_H3K4me1_13_160_0.541_1.33185e-119
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.064	0.808	0.045	0.083
0.027	0.051	0.024	0.898
0.027	0.063	0.038	0.872
0.052	0.13	0.072	0.746
0.718	0.095	0.113	0.074
0.833	0.069	0.046	0.052
0.897	0.03	0.038	0.035
0.053	0.035	0.869	0.043
0.109	0.73	0.065	0.096
0.124	0.127	0.63	0.119

MOTIF	Stomach_E16.5_H3K4me1_6_162_0.540_7.237672e-99
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.155	0.548	0.169	0.128
0.15	0.155	0.607	0.088
0.047	0.687	0.105	0.161
0.029	0.008	0.009	0.954
0.025	0.121	0.137	0.717
0.13	0.118	0.037	0.715
0.621	0.142	0.098	0.139
0.741	0.122	0.113	0.024
0.777	0.013	0.097	0.113
0.17	0.057	0.637	0.136

MOTIF	Heart_P0_H3K27me3_30_154_0.517_2.210253e-06
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.066	0.761	0.076	0.097
0.087	0.721	0.088	0.104
0.067	0.091	0.766	0.076
0.048	0.827	0.08	0.045
0.001	0.034	0.001	0.964
0.071	0.015	0.03	0.884
0.049	0.125	0.001	0.825
0.8	0.028	0.081	0.091
0.866	0.073	0.059	0.002
0.91	0.014	0.047	0.029
0.022	0.06	0.839	0.079
0.125	0.837	0.012	0.026

MOTIF	Lung_E14.5_H3K27me3_35_174_0.518_0.0003128745
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.025	0.761	0.137	0.077
0.282	0.469	0.113	0.135
0.135	0.22	0.456	0.189
0.095	0.759	0.087	0.059
0.035	0.031	0.006	0.928
0.006	0.081	0.087	0.826
0.054	0.222	0.055	0.669
0.732	0.13	0.105	0.033
0.802	0.15	0.047	0.001
0.911	0.001	0.055	0.033
0.082	0.085	0.765	0.068
0.09	0.758	0.09	0.062

MOTIF	Kidney_E14.5_H3K27me3_20_176_0.528_5.893282e-11
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.085	0.72	0.096	0.099
0.105	0.68	0.102	0.113
0.085	0.128	0.659	0.128
0.114	0.687	0.115	0.084
0.024	0.098	0.084	0.794
0.07	0.066	0.126	0.738
0.111	0.119	0.106	0.664
0.643	0.123	0.121	0.113
0.691	0.135	0.118	0.056
0.714	0.095	0.105	0.086

MOTIF	Midbrain_P0_H3K27me3_33_171_0.519_1.046505e-06
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.07	0.753	0.097	0.08
0.105	0.691	0.072	0.132
0.125	0.101	0.645	0.129
0.081	0.739	0.094	0.086
0.06	0.084	0.028	0.828
0.068	0.086	0.08	0.766
0.071	0.083	0.081	0.765
0.732	0.096	0.1	0.072
0.776	0.072	0.087	0.065
0.792	0.05	0.082	0.076
0.093	0.08	0.749	0.078
0.062	0.764	0.094	0.08

MOTIF	Heart_E11.5_H3K27me3_18_164_0.520_8.463536e-23
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.161	0.537	0.141	0.161
0.157	0.145	0.54	0.158
0.148	0.551	0.151	0.15
0.154	0.134	0.122	0.59
0.063	0.135	0.166	0.636
0.136	0.154	0.153	0.557
0.597	0.097	0.157	0.149
0.808	0.019	0.159	0.014
0.678	0.014	0.139	0.169
0.151	0.147	0.549	0.153

MOTIF	Lung_P0_H3K27me3_33_166_0.535_2.627385e-10
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.06	0.036	0.037	0.867
0.065	0.069	0.066	0.8
0.043	0.073	0.071	0.813
0.847	0.068	0.037	0.048
0.859	0.048	0.049	0.044
0.852	0.041	0.073	0.034
0.109	0.054	0.733	0.104
0.097	0.752	0.064	0.087
0.107	0.069	0.701	0.123
0.066	0.782	0.076	0.076

MOTIF	Liver_E12.5_H3K27me3_41_160_0.514_4.494552e-09
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.053	0.78	0.066	0.101
0.091	0.055	0.045	0.809
0.031	0.059	0.06	0.85
0.045	0.058	0.05	0.847
0.815	0.044	0.071	0.07
0.87	0.055	0.032	0.043
0.854	0.065	0.033	0.048
0.091	0.049	0.799	0.061
0.09	0.726	0.098	0.086
0.124	0.055	0.653	0.168

MOTIF	Lung_E15.5_H3K4me3_33_156_0.663_3.544427e-320
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.1	0.88	0.001	0.019
0.001	0.001	0.975	0.023
0.001	0.807	0.191	0.001
0.154	0.197	0.001	0.648
0.001	0.308	0.169	0.522
0.369	0.204	0.077	0.35
0.688	0.13	0.181	0.001
0.572	0.001	0.243	0.184

MOTIF	Hindbrain_E16.5_H3K4me3_26_157_0.664_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.152	0.583	0.127	0.138
0.133	0.132	0.566	0.169
0.126	0.12	0.151	0.603
0.158	0.125	0.149	0.568
0.633	0.126	0.128	0.113
0.671	0.132	0.114	0.083
0.564	0.163	0.142	0.131
0.126	0.149	0.579	0.146
0.129	0.625	0.119	0.127
0.14	0.113	0.608	0.139

MOTIF	Kidney_E16.5_H3K4me3_28_157_0.660_6.241396e-310
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.151	0.585	0.124	0.14
0.124	0.124	0.585	0.167
0.127	0.12	0.149	0.604
0.152	0.135	0.152	0.561
0.634	0.133	0.122	0.111
0.653	0.137	0.128	0.082
0.584	0.161	0.129	0.126
0.121	0.147	0.593	0.139
0.133	0.604	0.126	0.137
0.141	0.117	0.599	0.143

MOTIF	Liver_P0_H3K4me3_35_164_0.642_4.343081e-313
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.15	0.578	0.128	0.144
0.124	0.123	0.594	0.159
0.131	0.123	0.137	0.609
0.147	0.132	0.149	0.572
0.637	0.127	0.13	0.106
0.639	0.138	0.133	0.09
0.565	0.168	0.139	0.128
0.125	0.148	0.58	0.147
0.133	0.615	0.115	0.137
0.132	0.117	0.612	0.139

MOTIF	Neural-Tube_E14.5_H3K4me3_34_163_0.667_6.806711e-311
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.091	0.71	0.091	0.108
0.102	0.095	0.685	0.118
0.101	0.11	0.107	0.682
0.087	0.099	0.116	0.698
0.716	0.093	0.101	0.09
0.711	0.117	0.102	0.07
0.7	0.099	0.097	0.104
0.09	0.109	0.702	0.099
0.095	0.711	0.086	0.108
0.108	0.094	0.685	0.113

MOTIF	Intestine_E15.5_H3K4me3_60_161_0.593_1.135859e-158
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.107	0.748	0.061	0.084
0.091	0.058	0.788	0.063
0.061	0.818	0.055	0.066
0.04	0.038	0.089	0.833
0.059	0.041	0.068	0.832
0.075	0.101	0.063	0.761
0.839	0.056	0.061	0.044
0.784	0.088	0.07	0.058
0.816	0.052	0.068	0.064
0.071	0.097	0.781	0.051

MOTIF	Liver_E16.5_H3K4me3_35_157_0.629_5.175643e-276
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.12	0.739	0.052	0.089
0.12	0.052	0.759	0.069
0.143	0.494	0.159	0.203
0.087	0.131	0.224	0.558
0.074	0.129	0.138	0.659
0.161	0.119	0.126	0.594
0.539	0.142	0.138	0.181
0.607	0.179	0.108	0.106
0.595	0.16	0.128	0.117
0.226	0.187	0.408	0.179

MOTIF	Neural-Tube_E15.5_H3K4me3_46_159_0.612_4.685613e-257
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.139	0.6	0.116	0.145
0.132	0.121	0.635	0.112
0.148	0.56	0.137	0.155
0.129	0.126	0.144	0.601
0.106	0.122	0.131	0.641
0.14	0.122	0.126	0.612
0.589	0.132	0.131	0.148
0.636	0.138	0.117	0.109
0.614	0.135	0.121	0.13
0.187	0.14	0.512	0.161

MOTIF	Cranio-Facial_E14.5_H3K27me3_10_152_0.564_2.568427e-55
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.126	0.187	0.537	0.15
0.067	0.788	0.037	0.108
0.031	0.037	0.931	0.001
0.079	0.516	0.283	0.122
0.172	0.038	0.205	0.585
0.001	0.058	0.025	0.916
0.052	0.091	0.278	0.579
0.482	0.08	0.161	0.276
0.554	0.066	0.288	0.092
0.347	0.114	0.199	0.34

MOTIF	Forebrain_E12.5_H3K9ac_7_155_0.653_8.250627e-313
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.101	0.897	0.001	0.001
0.001	0.001	0.997	0.001
0.017	0.889	0.093	0.001
0.114	0.183	0.435	0.267
0.206	0.199	0.268	0.327
0.425	0.206	0.184	0.184
0.896	0.054	0.001	0.049
0.736	0.009	0.206	0.049

MOTIF	Stomach_E14.5_H3K9ac_32_158_0.656_2.217671e-261
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.001	0.942	0.001	0.056
0.067	0.001	0.931	0.001
0.021	0.757	0.151	0.071
0.036	0.149	0.057	0.758
0.001	0.116	0.195	0.688
0.146	0.167	0.16	0.527
0.719	0.166	0.049	0.066
0.676	0.097	0.196	0.031