MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Cranio-Facial_E13.5_H3K4me3_57_165_0.595_1.413072e-161 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.007 0.03 0.178 0.785 0.135 0.078 0.16 0.627 0.286 0.425 0.082 0.207 0.68 0.149 0.122 0.049 0.008 0.306 0.598 0.088 0.034 0.016 0.059 0.891 0.068 0.112 0.018 0.802 0.011 0.033 0.003 0.953 0.257 0.132 0.02 0.591 0.621 0.232 0.106 0.041 0.844 0.119 0.027 0.01 0.713 0.038 0.158 0.091 MOTIF Forebrain_E14.5_H3K4me3_61_172_0.603_1.600956e-159 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.022 0.046 0.149 0.783 0.036 0.027 0.189 0.748 0.127 0.014 0.079 0.78 0.716 0.021 0.051 0.212 0.901 0.03 0.007 0.062 0.808 0.031 0.054 0.107 0.66 0.012 0.097 0.231 0.186 0.588 0.169 0.057 0.011 0.03 0.058 0.901 0.15 0.186 0.533 0.131 0.595 0.077 0.088 0.24 0.825 0.061 0.046 0.068 MOTIF Cranio-Facial_E15.5_H3K4me3_62_168_0.589_4.005281e-153 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.205 0.199 0.165 0.431 0.05 0.044 0.049 0.857 0.064 0.042 0.086 0.808 0.751 0.071 0.09 0.088 0.918 0.025 0.037 0.02 0.928 0.034 0.028 0.01 0.876 0.024 0.039 0.061 0.102 0.116 0.684 0.098 0.095 0.063 0.091 0.751 0.124 0.098 0.657 0.121 0.771 0.083 0.057 0.089 0.407 0.18 0.214 0.2 MOTIF Forebrain_E12.5_H3K4me3_62_168_0.585_1.00255e-124 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.214 0.223 0.188 0.375 0.047 0.047 0.046 0.86 0.071 0.038 0.117 0.774 0.686 0.077 0.094 0.143 0.912 0.035 0.045 0.008 0.945 0.018 0.027 0.01 0.918 0.007 0.031 0.044 0.119 0.131 0.65 0.1 0.087 0.041 0.114 0.758 0.13 0.105 0.634 0.131 0.727 0.102 0.076 0.095 0.405 0.195 0.195 0.204 MOTIF Limb_E12.5_H3K4me3_54_159_0.601_3.971024e-171 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.11 0.175 0.059 0.656 0.015 0.119 0.076 0.79 0.018 0.025 0.124 0.833 0.643 0.083 0.018 0.256 0.953 0.017 0.015 0.015 0.958 0.016 0.015 0.011 0.936 0.004 0.035 0.025 0.166 0.249 0.379 0.206 0.033 0.152 0.223 0.592 0.034 0.016 0.628 0.322 0.627 0.16 0.109 0.104 0.724 0.234 0.019 0.023 MOTIF Limb_E14.5_H3K4me3_61_164_0.606_1.461597e-185 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.092 0.082 0.08 0.746 0.071 0.076 0.098 0.755 0.093 0.072 0.082 0.753 0.718 0.092 0.092 0.098 0.76 0.095 0.074 0.071 0.76 0.087 0.085 0.068 0.762 0.081 0.069 0.088 0.09 0.083 0.744 0.083 0.072 0.11 0.09 0.728 0.102 0.088 0.09 0.72 0.81 0.056 0.059 0.075 0.745 0.094 0.097 0.064 MOTIF Liver_E11.5_H3K4me3_59_164_0.589_3.489593e-141 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.073 0.069 0.145 0.713 0.035 0.112 0.15 0.703 0.219 0.167 0.146 0.468 0.632 0.003 0.001 0.364 0.001 0.254 0.744 0.001 0.185 0.001 0.001 0.813 0.077 0.073 0.088 0.762 0.001 0.001 0.002 0.996 0.207 0.047 0.125 0.621 0.702 0.094 0.085 0.119 0.974 0.012 0.013 0.001 0.734 0.039 0.218 0.009 MOTIF Kidney_P0_H3K4me3_56_162_0.600_1.194635e-141 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.091 0.08 0.08 0.749 0.072 0.079 0.084 0.765 0.087 0.071 0.089 0.753 0.097 0.717 0.082 0.104 0.743 0.099 0.064 0.094 0.081 0.705 0.101 0.113 0.086 0.07 0.04 0.804 0.056 0.066 0.087 0.791 0.098 0.077 0.083 0.742 0.706 0.092 0.088 0.114 0.764 0.077 0.088 0.071 0.759 0.082 0.071 0.088 MOTIF Lung_E16.5_H3K4me3_51_158_0.591_1.013591e-152 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.092 0.075 0.075 0.758 0.068 0.105 0.096 0.731 0.118 0.084 0.106 0.692 0.724 0.071 0.106 0.099 0.802 0.08 0.071 0.047 0.821 0.032 0.067 0.08 0.125 0.11 0.677 0.088 0.102 0.073 0.1 0.725 0.112 0.079 0.722 0.087 0.777 0.066 0.088 0.069 0.792 0.073 0.076 0.059 0.778 0.069 0.078 0.075 MOTIF Stomach_E16.5_H3K4me3_59_159_0.596_1.232224e-169 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.051 0.077 0.026 0.846 0.013 0.051 0.039 0.897 0.073 0.083 0.075 0.769 0.144 0.64 0.046 0.17 0.705 0.11 0.064 0.121 0.097 0.564 0.163 0.176 0.035 0.036 0.005 0.924 0.032 0.033 0.036 0.899 0.043 0.078 0.038 0.841 0.162 0.565 0.105 0.168 0.709 0.125 0.059 0.107 0.645 0.134 0.116 0.105 MOTIF Hindbrain_E12.5_H3K4me3_61_170_0.581_3.208118e-122 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 MOTIF Hindbrain_E11.5_H3K4me3_60_161_0.610_1.886523e-162 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.003 0.263 0.101 0.633 0.007 0.001 0.001 0.991 0.001 0.003 0.001 0.995 0.501 0.089 0.001 0.409 0.896 0.053 0.001 0.05 0.912 0.001 0.086 0.001 0.724 0.001 0.204 0.071 0.001 0.284 0.714 0.001 0.262 0.16 0.237 0.341 0.523 0.066 0.177 0.234 0.83 0.168 0.001 0.001 0.587 0.166 0.054 0.193 MOTIF Hindbrain_E16.5_H3K4me3_55_159_0.602_1.177171e-178 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.155 0.271 0.375 0.2 0.187 0.001 0.128 0.684 0.001 0.158 0.133 0.708 0.125 0.13 0.113 0.632 0.425 0.223 0.197 0.155 0.135 0.629 0.235 0.001 0.112 0.001 0.001 0.886 0.001 0.001 0.001 0.997 0.244 0.001 0.067 0.688 0.719 0.041 0.04 0.2 0.96 0.001 0.038 0.001 0.799 0.076 0.031 0.094 MOTIF Midbrain_E12.5_H3K4me3_66_166_0.588_4.329043e-121 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.076 0.075 0.068 0.781 0.011 0.012 0.09 0.887 0.139 0.122 0.1 0.639 0.659 0.137 0.075 0.129 0.827 0.053 0.028 0.092 0.818 0.001 0.086 0.095 0.175 0.005 0.674 0.146 0.17 0.136 0.616 0.078 0.839 0.072 0.056 0.033 0.883 0.031 0.061 0.025 0.752 0.084 0.084 0.08 0.149 0.568 0.145 0.138 MOTIF Midbrain_E14.5_H3K4me3_77_175_0.570_2.13602e-74 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.154 0.027 0.158 0.661 0.041 0.029 0.039 0.891 0.215 0.024 0.216 0.545 0.677 0.172 0.038 0.113 0.748 0.026 0.174 0.052 0.77 0.017 0.139 0.074 0.065 0.025 0.745 0.165 0.061 0.229 0.531 0.179 0.791 0.044 0.024 0.141 0.892 0.028 0.036 0.044 0.554 0.12 0.184 0.142 0.235 0.661 0.05 0.054 MOTIF Heart_P0_H3K27ac_38_157_0.526_3.045408e-28 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.777 0.001 0.064 0.158 0.046 0.189 0.634 0.131 0.049 0.138 0.047 0.766 0.112 0.094 0.164 0.63 0.589 0.12 0.115 0.176 0.047 0.861 0.043 0.049 0.062 0.001 0.001 0.936 0.138 0.115 0.557 0.19 0.269 0.168 0.108 0.455 0.597 0.142 0.149 0.112 0.687 0.133 0.131 0.049 0.757 0.103 0.073 0.067 MOTIF Liver_E13.5_H3K27ac_68_165_0.521_1.324269e-25 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.079 0.075 0.065 0.781 0.077 0.077 0.071 0.775 0.089 0.085 0.082 0.744 0.104 0.707 0.094 0.095 0.802 0.081 0.03 0.087 0.737 0.098 0.1 0.065 0.828 0.03 0.071 0.071 0.107 0.089 0.722 0.082 0.098 0.094 0.096 0.712 0.746 0.095 0.065 0.094 0.764 0.069 0.088 0.079 0.131 0.681 0.091 0.097 MOTIF Heart_E15.5_H3K36me3_91_168_0.514_1.507274e-14 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.08 0.051 0.057 0.812 0.084 0.05 0.061 0.805 0.837 0.027 0.045 0.091 0.065 0.788 0.067 0.08 0.058 0.066 0.026 0.85 0.046 0.028 0.051 0.875 0.059 0.041 0.039 0.861 0.811 0.054 0.057 0.078 0.833 0.064 0.054 0.049 0.85 0.036 0.066 0.048 0.866 0.037 0.045 0.052 0.816 0.033 0.075 0.076 MOTIF Liver_E11.5_H3K36me3_102_159_0.524_7.120786e-20 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.771 0.068 0.074 0.087 0.105 0.692 0.099 0.104 0.104 0.066 0.049 0.781 0.108 0.064 0.088 0.74 0.758 0.068 0.078 0.096 0.092 0.733 0.072 0.103 0.086 0.083 0.043 0.788 0.081 0.072 0.089 0.758 0.112 0.078 0.081 0.729 0.751 0.075 0.076 0.098 0.722 0.09 0.08 0.108 0.778 0.071 0.068 0.083 MOTIF Intestine_P0_H3K4me3_58_166_0.593_1.35771e-144 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.105 0.122 0.398 0.375 0.029 0.102 0.106 0.763 0.168 0.07 0.077 0.685 0.693 0.128 0.174 0.005 0.1 0.681 0.129 0.09 0.037 0.086 0.001 0.876 0.028 0.064 0.073 0.835 0.121 0.085 0.05 0.744 0.278 0.397 0.137 0.187 0.945 0.038 0.01 0.007 0.892 0.032 0.026 0.05 0.918 0.001 0.08 0.001 MOTIF Limb_E11.5_H3K4me3_65_167_0.582_3.920416e-103 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 MOTIF Liver_E13.5_H3K4me3_60_171_0.553_1.163805e-82 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 MOTIF Midbrain_E15.5_H3K4me3_73_164_0.570_3.681456e-113 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 MOTIF Heart_E14.5_H3K4me3_65_171_0.575_2.093492e-131 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 MOTIF Stomach_E15.5_H3K4me3_66_175_0.580_1.42365e-130 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 MOTIF Stomach_P0_H3K4me3_74_163_0.584_3.6704e-131 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.202 0.168 0.234 0.397 0.282 0.001 0.213 0.504 0.351 0.219 0.149 0.28 0.757 0.241 0.001 0.001 0.001 0.678 0.32 0.001 0.081 0.199 0.016 0.704 0.001 0.001 0.001 0.997 0.189 0.146 0.196 0.469 0.397 0.162 0.185 0.256 0.711 0.001 0.226 0.062 0.764 0.001 0.211 0.024 0.499 0.11 0.287 0.104 MOTIF Cranio-Facial_E11.5_H3K9ac_66_170_0.552_2.63131e-47 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.213 0.229 0.224 0.334 0.118 0.131 0.113 0.638 0.122 0.138 0.124 0.616 0.58 0.136 0.134 0.15 0.131 0.611 0.115 0.143 0.116 0.119 0.063 0.702 0.087 0.117 0.115 0.681 0.116 0.123 0.112 0.649 0.136 0.604 0.135 0.125 0.651 0.138 0.081 0.13 0.623 0.122 0.138 0.117 0.308 0.224 0.243 0.225 MOTIF Heart_E15.5_H3K9ac_64_162_0.557_3.077575e-57 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.213 0.25 0.198 0.339 0.048 0.085 0.078 0.789 0.077 0.001 0.076 0.846 0.101 0.081 0.713 0.105 0.795 0.057 0.082 0.066 0.898 0.051 0.05 0.001 0.919 0.001 0.042 0.038 0.102 0.053 0.763 0.082 0.102 0.1 0.101 0.697 0.771 0.067 0.08 0.082 0.81 0.053 0.072 0.065 0.311 0.204 0.249 0.236 MOTIF Kidney_E16.5_H3K9ac_47_158_0.562_8.183603e-92 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.152 0.188 0.231 0.428 0.036 0.074 0.056 0.834 0.092 0.095 0.046 0.767 0.607 0.114 0.149 0.13 0.081 0.759 0.068 0.092 0.023 0.047 0.002 0.928 0.006 0.064 0.069 0.861 0.067 0.006 0.054 0.873 0.119 0.082 0.688 0.111 0.797 0.093 0.051 0.059 0.885 0.031 0.043 0.041 0.4 0.157 0.271 0.172 MOTIF Liver_E14.5_H3K9ac_45_173_0.556_1.72379e-57 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.033 0.029 0.024 0.914 0.01 0.026 0.019 0.945 0.16 0.051 0.152 0.637 0.717 0.109 0.153 0.021 0.785 0.162 0.023 0.03 0.845 0.007 0.027 0.121 0.422 0.09 0.475 0.014 0.038 0.245 0.025 0.692 0.591 0.018 0.189 0.202 0.774 0.029 0.169 0.028 0.217 0.529 0.194 0.06 0.028 0.029 0.282 0.661 MOTIF Heart_E14.5_H3K9ac_51_162_0.545_3.491875e-71 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.121 0.133 0.596 0.15 0.097 0.111 0.092 0.7 0.09 0.101 0.099 0.71 0.12 0.103 0.111 0.666 0.664 0.095 0.109 0.132 0.711 0.117 0.094 0.078 0.763 0.043 0.099 0.095 0.137 0.096 0.656 0.111 0.142 0.121 0.127 0.61 0.643 0.127 0.12 0.11 0.683 0.101 0.11 0.106 0.158 0.595 0.124 0.123 MOTIF Liver_P0_H3K9ac_47_164_0.558_2.158387e-66 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.025 0.053 0.041 0.881 0.027 0.076 0.047 0.85 0.123 0.093 0.099 0.685 0.738 0.076 0.068 0.118 0.887 0.059 0.023 0.031 0.891 0.001 0.071 0.037 0.176 0.093 0.649 0.082 0.148 0.063 0.097 0.692 0.623 0.121 0.093 0.163 0.733 0.085 0.124 0.058 0.134 0.604 0.131 0.131 0.127 0.092 0.01 0.771 MOTIF Liver_E15.5_H3K9ac_48_164_0.552_3.268037e-50 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.094 0.62 0.089 0.197 0.016 0.15 0.002 0.832 0.054 0.058 0.052 0.836 0.153 0.075 0.076 0.696 0.691 0.108 0.083 0.118 0.898 0.044 0.042 0.016 0.9 0.006 0.015 0.079 0.095 0.068 0.638 0.199 0.013 0.067 0.096 0.824 0.15 0.172 0.089 0.589 0.705 0.01 0.113 0.172 0.172 0.07 0.674 0.084 MOTIF Kidney_E15.5_H3K9ac_60_176_0.587_1.909497e-129 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 MOTIF Lung_E14.5_H3K9ac_43_161_0.582_9.623233e-142 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.011 0.199 0.262 0.528 0.18 0.024 0.129 0.667 0.427 0.103 0.133 0.337 0.789 0.021 0.163 0.027 0.028 0.602 0.327 0.043 0.012 0.109 0.041 0.838 0.047 0.004 0.01 0.939 0.018 0.012 0.096 0.874 0.383 0.115 0.112 0.39 0.819 0.078 0.006 0.097 0.88 0.003 0.109 0.008 0.767 0.064 0.116 0.053