MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Hindbrain_E15.5_H3K27me3_7_7_0.527_2.29613e-36
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.844424	0.086961	0.025544	0.043071
0.062417	0.048339	0.869919	0.019325
0.058201	0.931134	0.002419	0.008247
0.165726	0.081397	0.59544	0.157437
0.022998	0.933021	0.023403	0.020578
0.121564	0.037875	0.792789	0.047772
0.069185	0.034141	0.761887	0.134787
0.045381	0.68268	0.058956	0.212983
0.072042	0.023187	0.872628	0.032143

MOTIF	Neural-Tube_E14.5_H3K27me3_1_6_0.570_8.502608e-48
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.801816	0.053226	0.072868	0.07209
0.087662	0.103284	0.751319	0.057735
0.05071	0.862026	0.050058	0.037206
0.018878	0.152715	0.726839	0.101568
0.0202	0.947019	0.023193	0.009589
0.153217	0.049585	0.676673	0.120526
0.077131	0.05871	0.807198	0.056961
0.028101	0.827376	0.052428	0.092095
0.048349	0.027497	0.818062	0.106093

MOTIF	Intestine_E15.5_H3K27ac_3_10_0.563_1.395773e-236
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.028784	0.052212	0.831394	0.087609
0.038387	0.784275	0.068117	0.109221
0.036728	0.050063	0.714169	0.19904
0.136925	0.544772	0.21337	0.104932
0.041094	0.901539	0.004915	0.052452
0.035591	0.058126	0.874952	0.031331
0.011933	0.926412	0.022353	0.039302
0.094476	0.038689	0.793383	0.073452
0.049888	0.789701	0.042573	0.117838

MOTIF	Liver_P0_H3K27ac_2_155_0.550_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.051	0.874	0.027	0.048
0.064	0.767	0.106	0.063
0.071	0.104	0.754	0.071
0.074	0.767	0.099	0.06
0.049	0.092	0.772	0.087
0.056	0.813	0.075	0.056
0.059	0.825	0.074	0.042
0.061	0.09	0.792	0.057
0.072	0.824	0.056	0.048
0.048	0.088	0.812	0.052

MOTIF	Midbrain_P0_H3K27ac_1_4_0.591_5.983189e-310
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.115085	0.759573	0.060605	0.064737
0.070826	0.057667	0.766856	0.104651
0.129629	0.763816	0.062175	0.04438
0.091536	0.030182	0.784057	0.094225
0.024583	0.931415	0.011046	0.032956
0.047233	0.758386	0.119454	0.074927
0.07185	0.057778	0.747834	0.122539
0.107412	0.632521	0.165335	0.094733
0.042042	0.021242	0.885155	0.05156

MOTIF	Neural-Tube_E14.5_H3K27ac_1_7_0.585_1.109636e-262
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.052067	0.037781	0.85826	0.051892
0.09849	0.795846	0.055268	0.050395
0.051472	0.035951	0.803514	0.109063
0.145151	0.775285	0.064192	0.015371
0.064626	0.053914	0.731703	0.149757
0.081907	0.805967	0.057761	0.054365
0.024247	0.823874	0.057508	0.094371
0.081357	0.060979	0.798856	0.058808
0.065121	0.832871	0.043134	0.058873

MOTIF	Hindbrain_E12.5_H3K27me3_3_2_0.526_2.306866e-95
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.057439	0.064931	0.819429	0.0582
0.153428	0.683427	0.098534	0.064611
0.119942	0.055659	0.765039	0.05936
0.087475	0.721761	0.137611	0.053153
0.097296	0.83959	0.024442	0.038672
0.033359	0.049964	0.88154	0.035137
0.079832	0.769039	0.101794	0.049334
0.072126	0.040611	0.814101	0.073163
0.016939	0.928395	0.03147	0.023196
0.361812	0.21745	0.13079	0.289948

MOTIF	Liver_E16.5_H3K27me3_3_2_0.629_1.075352e-219
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.027816	0.017836	0.886779	0.067569
0.050768	0.739562	0.161231	0.048439
0.061689	0.067647	0.814895	0.055768
0.050265	0.696449	0.20822	0.045066
0.173714	0.748702	0.016747	0.060837
0.024014	0.020617	0.927716	0.027654
0.100442	0.729443	0.10541	0.064706
0.055	0.098457	0.801159	0.045384
0.073994	0.806003	0.061166	0.058836
0.397323	0.189844	0.028164	0.384668

MOTIF	Neural-Tube_E14.5_H3K27me3_2_5_0.569_3.198547e-54
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.026562	0.076555	0.876347	0.020536
0.203268	0.697006	0.030709	0.069016
0.110814	0.068423	0.753089	0.067674
0.048212	0.815468	0.093652	0.042668
0.082902	0.769176	0.071276	0.076646
0.034532	0.13593	0.765193	0.064346
0.116105	0.59972	0.2374	0.046775
0.047772	0.011679	0.847134	0.093415
0.033427	0.83081	0.068798	0.066965

MOTIF	Cranio-Facial_E12.5_H3K27me3_1_150_0.543_1.5568e-140
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.124	0.601	0.178	0.097
0.134	0.254	0.34	0.272
0.029	0.3	0.67	0.001
0.192	0.474	0.164	0.17
0.001	0.039	0.959	0.001
0.039	0.879	0.081	0.001
0.001	0.092	0.906	0.001
0.001	0.901	0.086	0.012

MOTIF	Forebrain_E16.5_H3K27me3_1_150_0.551_1.412046e-105
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.159	0.494	0.167	0.18
0.215	0.231	0.391	0.163
0.077	0.352	0.541	0.03
0.174	0.469	0.174	0.183
0.001	0.045	0.953	0.001
0.022	0.914	0.063	0.001
0.043	0.113	0.843	0.001
0.069	0.757	0.148	0.026

MOTIF	Liver_E13.5_H3K27me3_4_150_0.545_2.519408e-244
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.221	0.402	0.139	0.237
0.139	0.366	0.292	0.204
0.165	0.389	0.313	0.133
0.133	0.453	0.298	0.116
0.09	0.261	0.607	0.042
0.174	0.521	0.183	0.122
0.029	0.152	0.701	0.118
0.077	0.796	0.111	0.016
0.07	0.177	0.602	0.151
0.176	0.426	0.173	0.225

MOTIF	Hindbrain_E13.5_H3K27me3_68_150_0.504_1.080392e-81
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.18	0.287	0.351	0.183
0.134	0.617	0.136	0.113
0.113	0.152	0.593	0.142
0.072	0.732	0.134	0.062
0.14	0.593	0.127	0.14
0.113	0.172	0.611	0.104
0.114	0.619	0.152	0.115
0.111	0.155	0.616	0.118
0.107	0.615	0.158	0.12
0.121	0.154	0.592	0.133
0.068	0.719	0.128	0.085
0.216	0.342	0.227	0.216

MOTIF	Limb_E13.5_H3K27me3_8_150_0.521_1.527225e-98
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.054	0.228	0.677	0.041
0.108	0.758	0.09	0.044
0.028	0.104	0.831	0.037
0.064	0.806	0.109	0.021
0.054	0.155	0.745	0.046
0.034	0.712	0.233	0.021
0.17	0.26	0.402	0.168
0.032	0.287	0.614	0.067
0.098	0.664	0.157	0.081
0.076	0.133	0.661	0.13

MOTIF	Midbrain_E12.5_H3K27me3_28_150_0.509_1.111662e-105
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.116	0.638	0.156	0.09
0.085	0.2	0.599	0.116
0.107	0.597	0.255	0.041
0.162	0.349	0.347	0.142
0.048	0.296	0.614	0.042
0.064	0.687	0.175	0.074
0.025	0.135	0.767	0.073
0.069	0.769	0.131	0.031
0.082	0.122	0.697	0.099
0.083	0.563	0.251	0.103

MOTIF	Heart_E15.5_H3K27me3_2_150_0.529_3.912614e-54
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.045	0.169	0.742	0.044
0.113	0.732	0.108	0.047
0.079	0.078	0.768	0.075
0.041	0.787	0.171	0.001
0.267	0.223	0.218	0.292
0.006	0.228	0.752	0.014
0.082	0.788	0.038	0.092
0.007	0.074	0.866	0.053
0.016	0.84	0.133	0.011
0.129	0.165	0.514	0.192

MOTIF	Limb_E15.5_H3K27me3_4_150_0.537_4.811291e-105
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.027	0.084	0.855	0.034
0.043	0.919	0.029	0.009
0.017	0.028	0.927	0.028
0.035	0.83	0.134	0.001
0.251	0.301	0.353	0.095
0.002	0.124	0.855	0.019
0.042	0.902	0.001	0.055
0.023	0.001	0.975	0.001
0.028	0.862	0.091	0.019
0.017	0.056	0.832	0.095

MOTIF	Lung_E15.5_H3K27me3_1_2_0.570_1.580302e-175
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.126623	0.769802	0.068456	0.035119
0.038581	0.084408	0.818724	0.058287
0.094189	0.792356	0.086406	0.027049
0.050421	0.039479	0.858292	0.051808
0.017069	0.946766	0.014327	0.021838
0.132417	0.564084	0.11907	0.184429
0.063389	0.09669	0.734661	0.105259
0.094028	0.76488	0.081222	0.05987
0.04521	0.074669	0.83334	0.046782

MOTIF	Forebrain_E12.5_H3K27me3_72_150_0.502_1.489937e-89
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.12	0.197	0.56	0.123
0.119	0.623	0.148	0.11
0.105	0.141	0.638	0.116
0.107	0.628	0.173	0.092
0.124	0.197	0.547	0.132
0.112	0.218	0.561	0.109
0.137	0.582	0.154	0.127
0.098	0.145	0.653	0.104
0.117	0.618	0.159	0.106
0.125	0.154	0.592	0.129

MOTIF	Hindbrain_E15.5_H3K27me3_12_150_0.526_2.159414e-82
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.114	0.591	0.177	0.118
0.095	0.182	0.615	0.108
0.11	0.631	0.168	0.091
0.122	0.17	0.581	0.127
0.106	0.566	0.223	0.105
0.122	0.567	0.189	0.122
0.087	0.194	0.616	0.103
0.101	0.638	0.163	0.098
0.108	0.165	0.614	0.113
0.116	0.578	0.204	0.102

MOTIF	Heart_E11.5_H3K27me3_10_150_0.528_1.256723e-76
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.057	0.101	0.794	0.048
0.081	0.746	0.103	0.07
0.075	0.096	0.765	0.064
0.082	0.742	0.111	0.065
0.08	0.109	0.729	0.082
0.043	0.79	0.133	0.034
0.118	0.668	0.116	0.098
0.068	0.123	0.728	0.081
0.079	0.757	0.096	0.068
0.063	0.091	0.78	0.066
0.058	0.761	0.1	0.081
0.093	0.108	0.708	0.091

MOTIF	Forebrain_E13.5_H3K27me3_12_150_0.520_1.938636e-120
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.092	0.689	0.132	0.087
0.054	0.175	0.705	0.066
0.075	0.761	0.109	0.055
0.064	0.118	0.75	0.068
0.067	0.715	0.16	0.058
0.107	0.172	0.608	0.113
0.058	0.185	0.675	0.082
0.093	0.677	0.137	0.093
0.074	0.125	0.711	0.09
0.079	0.708	0.149	0.064

MOTIF	Heart_E16.5_H3K27me3_6_150_0.543_1.279575e-105
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.073	0.784	0.084	0.059
0.061	0.077	0.796	0.066
0.017	0.833	0.085	0.065
0.064	0.064	0.816	0.056
0.063	0.623	0.231	0.083
0.09	0.123	0.666	0.121
0.015	0.049	0.874	0.062
0.065	0.718	0.158	0.059
0.036	0.06	0.839	0.065
0.064	0.807	0.077	0.052

MOTIF	Midbrain_E15.5_H3K27me3_7_150_0.537_1.181101e-96
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.058	0.786	0.104	0.052
0.072	0.1	0.774	0.054
0.02	0.828	0.098	0.054
0.024	0.091	0.85	0.035
0.037	0.744	0.161	0.058
0.093	0.088	0.71	0.109
0.02	0.067	0.87	0.043
0.061	0.754	0.12	0.065
0.045	0.071	0.807	0.077
0.035	0.88	0.051	0.034

MOTIF	Neural-Tube_E15.5_H3K27me3_23_150_0.515_3.474395e-77
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.171	0.305	0.304	0.22
0.015	0.087	0.883	0.015
0.073	0.781	0.101	0.045
0.021	0.083	0.837	0.059
0.042	0.834	0.1	0.024
0.036	0.131	0.749	0.084
0.009	0.841	0.144	0.006
0.099	0.703	0.106	0.092
0.045	0.116	0.807	0.032
0.052	0.778	0.127	0.043
0.057	0.088	0.785	0.07
0.068	0.467	0.398	0.068

MOTIF	Liver_E12.5_H3K27me3_4_4_0.527_5.786741e-85
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.162621	0.018318	0.386539	0.432522
0.192046	0.016013	0.776156	0.015786
0.214797	0.593598	0.029061	0.162544
0.014547	0.022773	0.935603	0.027077
0.023023	0.876761	0.029812	0.070404
0.160648	0.04332	0.731964	0.064068
0.0163	0.835989	0.043725	0.103986
0.054598	0.843607	0.060448	0.041348
0.156275	0.056735	0.735942	0.051048
0.010411	0.943447	0.029069	0.017073
0.190592	0.239185	0.193026	0.377197

MOTIF	Hindbrain_E15.5_H3K27me3_2_3_0.534_9.264527e-73
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.046474	0.054679	0.88026	0.018587
0.113978	0.728064	0.089901	0.068057
0.0445	0.031814	0.855517	0.068169
0.093873	0.796484	0.07766	0.031982
0.09046	0.05175	0.820304	0.037486
0.04549	0.790729	0.103843	0.059938
0.184496	0.603741	0.0641	0.147664
0.047786	0.075737	0.822467	0.054009
0.028069	0.897142	0.027512	0.047277
0.286526	0.219053	0.367569	0.126852

MOTIF	Neural-Tube_E13.5_H3K27me3_2_3_0.528_1.288462e-113
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.022874	0.073978	0.865885	0.037263
0.085047	0.768149	0.060985	0.085819
0.030797	0.033477	0.841567	0.094159
0.093585	0.77735	0.084663	0.044402
0.092051	0.062293	0.800537	0.045119
0.061342	0.833144	0.054936	0.050578
0.201217	0.590885	0.044312	0.163586
0.076849	0.045999	0.83687	0.040282
0.032861	0.884239	0.02992	0.05298

MOTIF	Heart_P0_H3K4me3_6_1_0.715_1.866037e-319
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.043925	0.914462	0.020519	0.021094
0.023047	0.04162	0.872282	0.063051
0.071642	0.745637	0.158355	0.024367
0.023608	0.087771	0.787496	0.101126
0.071774	0.80314	0.074037	0.051048
0.042203	0.68323	0.19287	0.081697
0.095489	0.040949	0.799927	0.063635
0.04132	0.829945	0.04727	0.081465
0.037328	0.818378	0.061557	0.082738
0.434997	0.415798	0.043741	0.105465
0.150185	0.095773	0.459453	0.294589
0.010886	0.770155	0.194744	0.024216

MOTIF	Hindbrain_E12.5_H3K4me3_4_2_0.787_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.04645	0.879867	0.041386	0.032298
0.029324	0.016706	0.889749	0.064222
0.074352	0.794372	0.116592	0.014684
0.077991	0.014272	0.846868	0.060869
0.061981	0.765367	0.114821	0.057831
0.136324	0.604452	0.153951	0.105274
0.025973	0.036526	0.824776	0.112725
0.01648	0.831078	0.117131	0.035311
0.068781	0.819139	0.065426	0.046654
0.410915	0.329876	0.151987	0.107223

MOTIF	Kidney_E14.5_H3K4me3_2_3_0.773_2.025867e-319
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.052829	0.057476	0.834707	0.054988
0.134014	0.739538	0.063861	0.062587
0.054883	0.022188	0.897145	0.025784
0.088802	0.819756	0.082954	0.008488
0.031286	0.044458	0.747449	0.176807
0.114888	0.691932	0.104645	0.088534
0.04356	0.85645	0.04601	0.05398
0.041344	0.031196	0.794693	0.132768
0.09378	0.84215	0.042488	0.021582
0.116865	0.512358	0.061526	0.30925
0.147073	0.321706	0.312173	0.219049
0.353594	0.234343	0.335454	0.076609

MOTIF	Midbrain_E16.5_H3K4me3_1_4_0.779_2.52321e-316
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.046746	0.906195	0.007644	0.039415
0.095978	0.165826	0.702132	0.036064
0.015388	0.053283	0.880615	0.050714
0.124386	0.768485	0.033242	0.073887
0.12436	0.055252	0.612563	0.207825
0.092885	0.104014	0.773725	0.029376
0.047192	0.9028	0.016028	0.03398
0.086522	0.049659	0.806334	0.057485
0.069676	0.879247	0.040984	0.010092
0.247931	0.028984	0.577991	0.145095

MOTIF	Cranio-Facial_E13.5_H3K4me3_3_6_0.759_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.032602	0.016001	0.845523	0.105874
0.048946	0.907792	0.016804	0.026458
0.021401	0.013292	0.920115	0.045191
0.112722	0.775461	0.05827	0.053548
0.090709	0.041424	0.675683	0.192184
0.022992	0.9282	0.030132	0.018676
0.196017	0.541997	0.07435	0.187637
0.065505	0.048006	0.860232	0.026257
0.033929	0.856337	0.055848	0.053886
0.194968	0.33071	0.323567	0.150755

MOTIF	Hindbrain_E12.5_H3K4me3_3_4_0.793_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.331816	0.25273	0.260113	0.155342
0.039319	0.066065	0.834076	0.06054
0.044753	0.90491	0.028764	0.021573
0.021469	0.028252	0.914456	0.035823
0.111108	0.722131	0.104163	0.062598
0.056011	0.034096	0.784601	0.125291
0.070355	0.840386	0.035219	0.05404
0.15737	0.632908	0.073511	0.136211
0.057684	0.081499	0.82695	0.033867
0.025032	0.791359	0.141217	0.042391

MOTIF	Stomach_E15.5_H3K4me3_2_14_0.758_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.035198	0.014516	0.765244	0.185042
0.053318	0.877999	0.044703	0.02398
0.018125	0.010022	0.928344	0.043509
0.284345	0.573624	0.095068	0.046963
0.192273	0.020928	0.605456	0.181343
0.032531	0.90718	0.041076	0.019212
0.076015	0.784834	0.064633	0.074518
0.019335	0.04047	0.914937	0.025257
0.023174	0.802823	0.024803	0.1492