MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Hindbrain_E15.5_H3K27ac_78_112_0.514_3.660267e-35 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.536379 0.237867 0.076174 0.14958 0.067721 0.836727 0.067735 0.027817 0.7623 0.081076 0.033842 0.122782 0.119789 0.03042 0.844219 0.005572 0.844483 0.022977 0.083739 0.048802 0.045965 0.041693 0.911956 0.000385 0.143115 0.788348 0.063225 0.005312 0.808585 0.060856 0.05983 0.07073 0.0 0.047136 0.91247 0.040395 MOTIF Neural-Tube_E11.5_H3K27ac_64_107_0.520_7.02006e-20 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.807565 0.028554 0.04237 0.121512 0.043776 0.883874 0.065546 0.006803 0.773492 0.085713 0.037667 0.103128 0.177924 0.170601 0.650576 0.000898 0.789737 0.070373 0.061834 0.078057 0.026322 0.01476 0.955064 0.003853 0.136097 0.781753 0.055567 0.026583 0.771501 0.081476 0.036718 0.110304 0.008241 0.060743 0.888964 0.042052 MOTIF Kidney_E16.5_H3K27ac_73_143_0.513_1.921885e-40 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.004587 0.899973 0.095441 0.0 0.733372 0.017528 0.015217 0.233883 0.157 0.052816 0.790184 0.0 0.924614 0.057067 0.012617 0.005701 0.215653 0.0 0.784347 0.0 0.197281 0.683294 0.080133 0.039292 0.832916 0.017984 0.130116 0.018984 0.046289 0.109382 0.844329 0.0 0.804817 0.117183 0.0518 0.0262 MOTIF Neural-Tube_E13.5_H3K27ac_60_86_0.519_1.136209e-57 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.299028 0.203853 0.070044 0.427075 0.068038 0.754727 0.158477 0.018758 0.881536 0.041166 0.032286 0.045011 0.053107 0.091828 0.850726 0.00434 0.738157 0.111617 0.114731 0.035495 0.10708 0.017779 0.857551 0.017589 0.113878 0.834671 0.039678 0.011773 0.767987 0.052541 0.090236 0.089235 0.026536 0.125846 0.845716 0.001902 0.705339 0.150555 0.071519 0.072587 MOTIF Intestine_E14.5_H3K27ac_93_124_0.507_7.737739e-24 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.024063 0.760705 0.20079 0.014442 0.82094 0.080876 0.055564 0.04262 0.100528 0.052545 0.846928 0.0 0.777514 0.033399 0.147697 0.04139 0.088317 0.027194 0.876235 0.008254 0.178176 0.682168 0.122641 0.017015 0.848574 0.043025 0.062079 0.046323 0.110784 0.07872 0.806903 0.003594 0.856132 0.084187 0.014944 0.044737 MOTIF Intestine_E16.5_H3K27ac_82_130_0.506_2.421613e-24 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.106898 0.703425 0.160465 0.029212 0.896529 0.052362 0.020953 0.030157 0.067767 0.046957 0.885276 0.0 0.850261 0.011512 0.081336 0.056892 0.107628 0.053986 0.828064 0.010322 0.049661 0.748067 0.178541 0.02373 0.820633 0.095882 0.042336 0.041149 0.103782 0.227477 0.665887 0.002853 0.871484 0.061122 0.057124 0.01027 MOTIF Cranio-Facial_E12.5_H3K27ac_66_77_0.516_4.902898e-22 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.180543 0.184528 0.238738 0.396191 0.025283 0.793062 0.164744 0.016911 0.711768 0.114522 0.094161 0.079549 0.089971 0.142917 0.766627 0.000485 0.833166 0.073303 0.061138 0.032392 0.07255 0.01519 0.900876 0.011383 0.086089 0.74152 0.142985 0.029407 0.827046 0.036444 0.073686 0.062824 0.035826 0.095648 0.86538 0.003147 0.75599 0.15222 0.063645 0.028146 MOTIF Hindbrain_E14.5_H3K27ac_81_77_0.514_1.122899e-27 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.314417 0.099278 0.38401 0.202294 0.038674 0.778777 0.169423 0.013126 0.817851 0.088044 0.032286 0.061819 0.116575 0.136288 0.744693 0.002443 0.864525 0.052545 0.071293 0.011637 0.068648 0.008472 0.919702 0.003178 0.132986 0.747251 0.086012 0.033752 0.770746 0.047887 0.106759 0.074608 0.040535 0.148171 0.801232 0.010062 0.78123 0.099734 0.091255 0.027781 MOTIF Hindbrain_E11.5_H3K27ac_65_89_0.518_2.526095e-20 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.03823 0.853412 0.091951 0.016407 0.713068 0.109802 0.091206 0.085924 0.055379 0.180328 0.763961 0.000332 0.81427 0.05264 0.054202 0.078889 0.059058 0.007599 0.92903 0.004314 0.127493 0.775506 0.078366 0.018635 0.82596 0.025947 0.080526 0.067567 0.053995 0.054202 0.887018 0.004785 0.740293 0.078652 0.10185 0.079205 0.062558 0.347526 0.550691 0.039226 MOTIF Midbrain_P0_H3K27ac_83_123_0.514_1.294374e-31 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.054567 0.773233 0.160586 0.011614 0.751141 0.065591 0.076826 0.106441 0.098622 0.127778 0.770515 0.003085 0.843202 0.018546 0.065366 0.072886 0.042468 0.010019 0.942349 0.005164 0.099515 0.768003 0.115876 0.016606 0.794569 0.030269 0.077747 0.097415 0.041476 0.088386 0.866197 0.003941 0.736225 0.108251 0.079339 0.076185 MOTIF Limb_E15.5_H3K27ac_87_101_0.511_1.157788e-31 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.059496 0.862136 0.0724 0.005969 0.675902 0.058945 0.103816 0.161337 0.060363 0.165302 0.770377 0.003957 0.846899 0.041054 0.049469 0.062578 0.120528 0.017988 0.85567 0.005815 0.053929 0.744769 0.177686 0.023616 0.834175 0.043034 0.063415 0.059376 0.049458 0.17508 0.775462 0.0 0.853624 0.05108 0.070271 0.025024 MOTIF Forebrain_E12.5_H3K27ac_59_86_0.518_7.727365e-38 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.045349 0.812838 0.130143 0.011671 0.855084 0.06248 0.030742 0.051694 0.095252 0.148805 0.749754 0.00619 0.736619 0.065307 0.163573 0.034502 0.076261 0.013468 0.90334 0.006932 0.100935 0.752772 0.135384 0.01091 0.838838 0.048853 0.06061 0.051699 0.031241 0.135136 0.831544 0.002078 0.722231 0.1741 0.057834 0.045835 MOTIF Midbrain_E16.5_H3K27ac_73_121_0.520_8.94888e-57 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.032976 0.893597 0.066827 0.0066 0.825248 0.034833 0.01218 0.127739 0.123091 0.182805 0.694104 0.0 0.807511 0.031373 0.07977 0.081346 0.095584 0.011325 0.887451 0.005641 0.076789 0.819992 0.082519 0.020701 0.813005 0.01924 0.09725 0.070505 0.091724 0.192923 0.715352 0.0 0.778499 0.084674 0.060187 0.07664 MOTIF Neural-Tube_E14.5_H3K27ac_79_120_0.513_9.171252e-32 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.043493 0.911358 0.041922 0.003227 0.76522 0.094808 0.025072 0.1149 0.085697 0.149435 0.763123 0.001745 0.743066 0.038307 0.133799 0.084827 0.064434 0.005187 0.92136 0.009019 0.067914 0.759711 0.161103 0.011271 0.786832 0.026174 0.102454 0.08454 0.044575 0.15453 0.800894 0.0 0.772647 0.101194 0.056341 0.069818 MOTIF Hindbrain_E11.5_H3K27ac_52_64_0.530_1.225045e-30 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.057441 0.89885 0.005928 0.037781 0.054583 0.160139 0.051914 0.733364 0.086981 0.067462 0.745463 0.100094 0.003053 0.948253 0.007816 0.040878 0.044205 0.037457 0.058751 0.859586 0.000761 0.817139 0.10304 0.07906 0.028742 0.110001 0.129763 0.731494 0.011487 0.018833 0.930167 0.039513 0.024708 0.611183 0.014282 0.349827 0.0 0.051241 0.092265 0.856494 MOTIF Heart_E12.5_H3K27ac_80_102_0.508_5.709719e-21 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.085017 0.827471 0.058551 0.028961 0.940868 0.004035 0.02675 0.028347 0.069277 0.202309 0.711671 0.016743 0.900408 0.039161 0.047643 0.012788 0.100699 0.020232 0.875741 0.003328 0.076731 0.848797 0.061907 0.012566 0.819097 0.066466 0.035379 0.079059 0.02201 0.133838 0.762048 0.082104 0.212944 0.147831 0.571232 0.067993 MOTIF Heart_E15.5_H3K27ac_89_75_0.506_2.648476e-22 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.176829 0.314522 0.359054 0.149595 0.053106 0.752731 0.15904 0.035123 0.840669 0.071773 0.024392 0.063165 0.079719 0.203943 0.71443 0.001909 0.894413 0.037395 0.04149 0.026702 0.06804 0.016058 0.91342 0.002482 0.057321 0.876421 0.058377 0.007881 0.808039 0.069278 0.037337 0.085346 0.02018 0.112757 0.808505 0.058558 0.183965 0.131273 0.604054 0.080709 MOTIF Intestine_P0_H3K27ac_73_91_0.508_4.993009e-10 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.035475 0.707452 0.242417 0.014655 0.064596 0.060722 0.029575 0.845106 0.004435 0.013347 0.754819 0.227399 0.013202 0.935944 0.00446 0.046394 0.007449 0.024712 0.120527 0.847313 0.0 0.875568 0.053154 0.071278 0.040013 0.062138 0.047038 0.850811 0.011644 0.0514 0.760875 0.176081 0.181493 0.650705 0.051916 0.115886 0.0 0.552057 0.315182 0.13276 MOTIF Forebrain_E15.5_H3K27ac_48_41_0.527_1.856053e-46 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.071812 0.799385 0.066615 0.062188 0.093496 0.023239 0.293595 0.58967 0.008709 0.036629 0.649446 0.305215 0.001544 0.879578 0.014277 0.104602 0.021074 0.030688 0.033601 0.914636 0.000628 0.922821 0.059827 0.016724 0.043199 0.026561 0.169859 0.760381 0.016508 0.060052 0.897841 0.025598 0.034756 0.92491 0.025283 0.015051 0.270409 0.145817 0.081644 0.502131 MOTIF Heart_E16.5_H3K27ac_28_25_0.531_1.947401e-52 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.035939 0.826505 0.107612 0.029943 0.091527 0.124688 0.077329 0.706456 0.009535 0.106838 0.739072 0.144555 0.010077 0.935968 0.008033 0.045922 0.043885 0.042022 0.030584 0.883508 0.004133 0.722799 0.215479 0.057589 0.0997 0.116822 0.128348 0.65513 0.028066 0.037734 0.905374 0.028826 0.030605 0.808572 0.05007 0.110754 0.199046 0.12286 0.398 0.280094 0.02309 0.395248 0.5205 0.061162 0.021009 0.0 0.557938 0.421053 MOTIF Cranio-Facial_E11.5_H3K27ac_65_77_0.520_1.223278e-17 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.035326 0.787198 0.142248 0.035228 0.033612 0.080692 0.105162 0.780534 0.052447 0.044424 0.855464 0.047665 0.00224 0.965476 0.014557 0.017727 0.116149 0.060291 0.089978 0.733582 0.001889 0.928163 0.044046 0.025902 0.042117 0.047912 0.039507 0.870465 0.022589 0.084649 0.863487 0.029276 0.190981 0.469388 0.106424 0.233207 0.017726 0.162781 0.492848 0.326645 MOTIF Midbrain_E14.5_H3K27ac_26_20_0.553_1.197987e-97 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.048491 0.797047 0.123929 0.030533 0.079378 0.122066 0.18293 0.615626 0.013817 0.041772 0.849715 0.094697 0.010805 0.918234 0.029447 0.041514 0.03785 0.041802 0.109808 0.81054 0.000755 0.748932 0.156532 0.093782 0.028959 0.143984 0.078233 0.748823 0.014346 0.045835 0.916075 0.023743 0.022776 0.784272 0.026714 0.166238 0.177751 0.094112 0.367495 0.360642 0.021008 0.22764 0.352457 0.398896 MOTIF Forebrain_E14.5_H3K27ac_41_41_0.534_1.67591e-37 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.039693 0.723365 0.206876 0.030067 0.060574 0.0904 0.184899 0.664127 0.015493 0.055203 0.804624 0.12468 0.006312 0.904086 0.010038 0.079564 0.022513 0.046614 0.037746 0.893127 0.004693 0.907833 0.073689 0.013785 0.051786 0.130067 0.109769 0.708379 0.009362 0.143867 0.83069 0.016081 0.092575 0.761441 0.090607 0.055377 0.315061 0.122372 0.430426 0.132141 MOTIF Midbrain_E11.5_H3K27ac_51_56_0.534_3.802082e-38 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.042869 0.788519 0.124367 0.044245 0.054597 0.052824 0.132703 0.759876 0.02486 0.072911 0.868758 0.033472 0.004598 0.892952 0.008583 0.093867 0.026492 0.055762 0.027453 0.890293 0.002286 0.815911 0.073245 0.108558 0.043051 0.143639 0.093518 0.719792 0.002564 0.062418 0.918092 0.016927 0.161207 0.495124 0.168517 0.175151 0.15709 0.099124 0.543954 0.199832 MOTIF Heart_E12.5_H3K27ac_40_53_0.522_1.828235e-37 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.057792 0.719323 0.160968 0.061917 0.061124 0.095474 0.253159 0.590243 0.016518 0.052938 0.845443 0.085102 0.019034 0.926023 0.007312 0.047632 0.019621 0.017477 0.068925 0.893977 0.001681 0.858133 0.060478 0.079708 0.08223 0.015345 0.101537 0.800888 0.008438 0.047625 0.908089 0.035849 0.173479 0.642767 0.029084 0.154669 0.171073 0.153337 0.334755 0.340835 MOTIF Hindbrain_E16.5_H3K27ac_43_58_0.541_4.953983e-83 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.052965 0.73702 0.179075 0.03094 0.051838 0.134628 0.167408 0.646126 0.016327 0.051765 0.799157 0.132751 0.000581 0.943334 0.007156 0.04893 0.043102 0.061398 0.052846 0.842655 0.001929 0.803091 0.128141 0.066838 0.096963 0.02144 0.107104 0.774493 0.003545 0.04827 0.937243 0.010942 0.091362 0.693458 0.08973 0.12545 MOTIF Kidney_E15.5_H3K27ac_69_57_0.513_4.450691e-25 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.038202 0.737752 0.177903 0.046143 0.066824 0.088295 0.095986 0.748895 0.014806 0.179438 0.681137 0.124619 0.00432 0.942366 0.007081 0.046234 0.023075 0.043772 0.035625 0.897527 0.001831 0.85046 0.073724 0.073984 0.058715 0.059538 0.056252 0.825494 0.013478 0.092454 0.855064 0.039004 0.083077 0.590487 0.121363 0.205073 MOTIF Midbrain_E12.5_H3K27ac_58_55_0.528_2.383328e-52 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.052911 0.713536 0.197696 0.035857 0.054887 0.084396 0.121789 0.738927 0.011908 0.066767 0.798293 0.123031 0.0009 0.934896 0.004107 0.060097 0.01688 0.056544 0.028854 0.897721 0.000897 0.824706 0.075917 0.098479 0.06284 0.050104 0.083915 0.803141 0.010532 0.084609 0.883855 0.021004 0.129458 0.5345 0.120516 0.215527 MOTIF Midbrain_E16.5_H3K27ac_50_45_0.531_9.283383e-61 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.037153 0.803767 0.116915 0.042165 0.116967 0.120797 0.124037 0.638199 0.015811 0.119988 0.735568 0.128632 0.003398 0.97443 0.005707 0.016465 0.045042 0.054966 0.03095 0.869041 0.001954 0.761271 0.151194 0.08558 0.055119 0.042158 0.082689 0.820033 0.009828 0.072195 0.89139 0.026587 0.031035 0.761166 0.129501 0.078298 0.390152 0.091291 0.109943 0.408614 MOTIF Kidney_E16.5_H3K27ac_60_122_0.517_3.445204e-30 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.0 0.939995 0.046463 0.013542 0.015005 0.065346 0.054263 0.865385 0.084047 0.041215 0.576423 0.298315 0.003899 0.872115 0.0 0.123987 0.036374 0.042452 0.048238 0.872937 0.0 0.826851 0.028603 0.144545 0.028621 0.005332 0.200392 0.765655 0.044852 0.068316 0.849658 0.037173 0.042202 0.815043 0.079553 0.063202 MOTIF Cranio-Facial_E14.5_H3K27ac_63_75_0.521_1.527351e-32 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.0552 0.756122 0.129067 0.059611 0.041887 0.167401 0.105512 0.685199 0.043669 0.069807 0.712097 0.174427 4.7e-05 0.893274 0.004399 0.10228 0.044408 0.035875 0.059985 0.859733 0.0 0.833153 0.049518 0.11733 0.021507 0.027347 0.125059 0.826087 0.015586 0.092552 0.844966 0.046896 0.020488 0.845314 0.054572 0.079627 MOTIF Stomach_E14.5_H3K27ac_90_110_0.511_9.741789e-23 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.004542 0.731176 0.205877 0.058405 0.05701 0.056496 0.034067 0.852427 0.063353 0.057475 0.589086 0.290086 0.002816 0.867482 0.010404 0.119297 0.083543 0.059846 0.021317 0.835293 0.0 0.817965 0.115083 0.066952 0.052681 0.025746 0.110646 0.810927 0.005699 0.064088 0.90865 0.021563 0.032481 0.849163 0.019007 0.099348 MOTIF Cranio-Facial_E13.5_H3K4me2_90_107_0.510_1.5908e-32 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.039696 0.569298 0.322765 0.068241 0.065678 0.199143 0.080289 0.65489 0.045415 0.094446 0.835792 0.024347 0.00168 0.921441 0.005674 0.071205 0.02005 0.045659 0.036765 0.897526 0.0 0.922233 0.065834 0.011933 0.064933 0.02679 0.067528 0.840749 0.025909 0.033039 0.94039 0.000662 0.15306 0.648881 0.173127 0.024932 MOTIF Heart_E13.5_H3K4me2_76_92_0.516_9.737774e-35 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.0325 0.909915 0.028818 0.028767 0.056975 0.043564 0.062442 0.83702 0.039519 0.223113 0.552107 0.18526 0.01283 0.960855 0.002635 0.023681 0.018078 0.017558 0.028817 0.935547 0.0 0.877756 0.048083 0.074161 0.051884 0.05234 0.045016 0.850759 0.02416 0.072202 0.87242 0.031218 0.227808 0.589583 0.094081 0.088528 0.0 0.120215 0.879785 0.0 MOTIF Hindbrain_E12.5_H3K4me2_100_119_0.504_2.358804e-23 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.005856 0.933731 0.045426 0.014987 0.908189 0.02876 0.010655 0.052397 0.206391 0.034514 0.759095 0.0 0.749775 0.059486 0.087682 0.103057 0.030379 0.073107 0.892936 0.003578 0.065286 0.83624 0.042527 0.055947 0.757452 0.068679 0.144415 0.029454 0.007589 0.041793 0.769153 0.181465 0.00723 0.955767 0.030679 0.006324