MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Liver_E15.5_H3K4me1_83_162_0.513_1.050528e-16 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.092 0.078 0.769 0.061 0.793 0.074 0.067 0.066 0.871 0.05 0.05 0.029 0.838 0.083 0.054 0.025 0.838 0.035 0.068 0.059 0.056 0.068 0.839 0.037 0.075 0.037 0.042 0.846 0.04 0.07 0.855 0.035 0.81 0.072 0.062 0.056 0.89 0.039 0.047 0.024 0.859 0.053 0.07 0.018 0.078 0.791 0.073 0.058 MOTIF Heart_P0_H3K4me3_58_154_0.591_3.899761e-145 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.697 0.001 0.262 0.04 0.997 0.001 0.001 0.001 0.952 0.046 0.001 0.001 0.304 0.375 0.321 0.001 0.164 0.001 0.001 0.834 0.001 0.001 0.997 0.001 0.965 0.033 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.93 0.001 0.001 0.068 0.001 0.409 0.589 0.001 MOTIF Liver_E16.5_H3K4me3_54_159_0.574_3.119323e-115 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.846 0.048 0.064 0.042 0.85 0.05 0.069 0.031 0.862 0.029 0.054 0.055 0.081 0.111 0.764 0.044 0.079 0.031 0.081 0.809 0.067 0.038 0.847 0.048 0.872 0.042 0.043 0.043 0.848 0.052 0.065 0.035 0.853 0.046 0.061 0.04 0.253 0.272 0.287 0.187 0.084 0.755 0.057 0.104 0.128 0.081 0.694 0.097 MOTIF Liver_P0_H3K4me3_45_154_0.597_1.248143e-152 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.357 0.157 0.264 0.221 0.842 0.045 0.067 0.046 0.907 0.033 0.04 0.02 0.889 0.02 0.035 0.056 0.118 0.125 0.658 0.099 0.097 0.037 0.085 0.781 0.128 0.073 0.692 0.107 0.833 0.055 0.045 0.067 0.905 0.03 0.041 0.024 0.855 0.044 0.055 0.046 0.121 0.641 0.131 0.107 0.263 0.224 0.154 0.359 MOTIF Lung_E15.5_H3K4me3_63_162_0.589_1.212414e-129 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.39 0.172 0.248 0.19 0.824 0.054 0.072 0.05 0.895 0.039 0.041 0.025 0.879 0.019 0.039 0.063 0.13 0.108 0.677 0.085 0.103 0.052 0.081 0.764 0.128 0.061 0.746 0.065 0.831 0.066 0.043 0.06 0.878 0.039 0.053 0.03 0.848 0.048 0.066 0.038 0.118 0.656 0.118 0.108 0.253 0.203 0.16 0.384 MOTIF Lung_P0_H3K4me3_37_152_0.644_2.684582e-272 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.223 0.396 0.074 0.307 0.423 0.098 0.386 0.093 0.001 0.516 0.372 0.111 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.865 0.001 0.133 0.432 0.085 0.358 0.124 0.047 0.347 0.247 0.359 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.252 0.001 0.746 MOTIF Stomach_P0_H3K4me3_58_155_0.615_1.132072e-172 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.244 0.185 0.41 0.161 0.718 0.033 0.216 0.033 0.864 0.041 0.051 0.044 0.893 0.033 0.04 0.034 0.435 0.233 0.288 0.044 0.138 0.293 0.058 0.511 0.058 0.048 0.841 0.053 0.888 0.042 0.043 0.027 0.895 0.043 0.035 0.027 0.877 0.041 0.039 0.043 0.175 0.397 0.388 0.041 0.051 0.383 0.067 0.498 MOTIF Intestine_E15.5_H3K4me2_60_153_0.559_7.633861e-105 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.094 0.128 0.578 0.2 0.397 0.271 0.281 0.051 0.914 0.001 0.084 0.001 0.968 0.03 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.247 0.208 0.479 0.066 0.001 0.001 0.023 0.975 0.139 0.015 0.828 0.018 0.819 0.065 0.08 0.036 0.934 0.034 0.031 0.001 0.767 0.03 0.117 0.086 0.186 0.539 0.227 0.048 MOTIF Liver_E11.5_H3K4me2_46_156_0.559_1.725841e-126 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.94 0.035 0.024 0.001 0.983 0.015 0.001 0.001 0.968 0.001 0.012 0.019 0.046 0.09 0.853 0.011 0.042 0.023 0.028 0.907 0.033 0.018 0.92 0.029 0.909 0.032 0.01 0.049 0.964 0.015 0.001 0.02 0.966 0.01 0.001 0.023 0.001 0.777 0.203 0.019 MOTIF Lung_E15.5_H3K4me2_59_156_0.570_7.536611e-129 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.227 0.325 0.296 0.152 0.458 0.001 0.448 0.094 0.685 0.132 0.182 0.001 0.533 0.142 0.001 0.324 0.222 0.276 0.458 0.044 0.001 0.001 0.105 0.893 0.168 0.001 0.765 0.066 0.997 0.001 0.001 0.001 0.966 0.001 0.001 0.032 0.952 0.001 0.046 0.001 MOTIF Kidney_E16.5_H3K4me2_61_174_0.569_3.882297e-151 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 MOTIF Heart_E16.5_H3K4me2_54_152_0.550_7.298547e-98 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.099 0.046 0.121 0.734 0.13 0.079 0.729 0.062 0.85 0.052 0.04 0.058 0.892 0.04 0.038 0.03 0.922 0.009 0.014 0.055 0.07 0.097 0.807 0.026 0.057 0.057 0.046 0.84 0.062 0.056 0.823 0.059 0.871 0.035 0.034 0.06 0.825 0.075 0.051 0.049 0.854 0.064 0.02 0.062 0.044 0.686 0.218 0.052 MOTIF Heart_E13.5_H3K4me2_47_162_0.557_1.331113e-134 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.064 0.166 0.201 0.569 0.087 0.027 0.167 0.719 0.167 0.133 0.502 0.198 0.734 0.108 0.124 0.034 0.894 0.054 0.022 0.03 0.901 0.001 0.049 0.049 0.157 0.168 0.621 0.054 0.107 0.033 0.188 0.672 0.139 0.028 0.745 0.088 0.831 0.036 0.096 0.037 0.852 0.063 0.028 0.057 0.822 0.052 0.061 0.065 MOTIF Heart_E15.5_H3K4me2_57_158_0.563_2.947767e-144 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.057 0.032 0.051 0.86 0.058 0.037 0.061 0.844 0.045 0.13 0.053 0.772 0.051 0.821 0.038 0.09 0.713 0.162 0.051 0.074 0.044 0.585 0.203 0.168 0.064 0.053 0.004 0.879 0.065 0.061 0.077 0.797 0.071 0.115 0.084 0.73 0.216 0.581 0.016 0.187 0.761 0.082 0.047 0.11 0.621 0.16 0.115 0.104 MOTIF Kidney_E14.5_H3K4me2_72_166_0.554_9.583506e-81 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.077 0.073 0.073 0.777 0.058 0.071 0.07 0.801 0.071 0.088 0.068 0.773 0.105 0.705 0.074 0.116 0.743 0.093 0.052 0.112 0.079 0.704 0.099 0.118 0.084 0.067 0.037 0.812 0.056 0.071 0.078 0.795 0.071 0.084 0.087 0.758 0.117 0.669 0.097 0.117 0.756 0.1 0.055 0.089 0.708 0.091 0.113 0.088 MOTIF Hindbrain_P0_H3K4me2_82_170_0.550_3.874038e-85 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.092 0.074 0.066 0.768 0.069 0.074 0.078 0.779 0.068 0.076 0.071 0.785 0.092 0.725 0.077 0.106 0.736 0.117 0.059 0.088 0.1 0.687 0.098 0.115 0.089 0.068 0.036 0.807 0.065 0.071 0.075 0.789 0.082 0.086 0.082 0.75 0.115 0.679 0.095 0.111 0.773 0.091 0.053 0.083 0.723 0.097 0.094 0.086 MOTIF Limb_E15.5_H3K4me2_68_162_0.549_8.115336e-76 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.078 0.077 0.071 0.774 0.063 0.084 0.073 0.78 0.076 0.084 0.075 0.765 0.102 0.72 0.067 0.111 0.767 0.101 0.049 0.083 0.099 0.679 0.108 0.114 0.083 0.065 0.042 0.81 0.05 0.069 0.076 0.805 0.079 0.09 0.081 0.75 0.121 0.677 0.102 0.1 0.765 0.092 0.046 0.097 0.712 0.102 0.097 0.089 MOTIF Cranio-Facial_E14.5_H3K4me2_67_167_0.552_3.061968e-77 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.089 0.085 0.063 0.763 0.059 0.07 0.068 0.803 0.071 0.084 0.07 0.775 0.096 0.732 0.07 0.102 0.731 0.118 0.048 0.103 0.093 0.669 0.117 0.121 0.086 0.067 0.043 0.804 0.057 0.063 0.072 0.808 0.069 0.095 0.077 0.759 0.109 0.677 0.104 0.11 0.769 0.1 0.048 0.083 0.708 0.101 0.107 0.084 MOTIF Stomach_E16.5_H3K4me2_69_159_0.557_1.115547e-107 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.087 0.084 0.068 0.761 0.061 0.078 0.061 0.8 0.08 0.085 0.073 0.762 0.09 0.736 0.073 0.101 0.749 0.1 0.058 0.093 0.08 0.68 0.118 0.122 0.079 0.065 0.037 0.819 0.055 0.073 0.072 0.8 0.071 0.09 0.072 0.767 0.108 0.67 0.099 0.123 0.752 0.105 0.057 0.086 0.705 0.116 0.094 0.085 MOTIF Heart_E16.5_H3K9ac_53_158_0.545_1.621531e-90 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.914 0.036 0.049 0.001 0.982 0.016 0.001 0.001 0.117 0.151 0.699 0.033 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.954 0.044 0.906 0.034 0.045 0.015 0.904 0.06 0.025 0.011 0.938 0.018 0.043 0.001 MOTIF Liver_E13.5_H3K27ac_49_172_0.528_2.136981e-29 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.672 0.113 0.122 0.093 0.091 0.111 0.691 0.107 0.07 0.114 0.075 0.741 0.06 0.104 0.076 0.76 0.086 0.121 0.084 0.709 0.138 0.628 0.097 0.137 0.093 0.101 0.712 0.094 0.113 0.657 0.126 0.104 0.084 0.099 0.13 0.687 0.099 0.108 0.069 0.724 MOTIF Liver_P0_H3K27ac_5_157_0.547_4.933017e-92 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.318 0.135 0.36 0.186 0.002 0.209 0.745 0.044 0.034 0.061 0.001 0.904 0.012 0.039 0.049 0.9 0.031 0.02 0.044 0.905 0.001 0.942 0.026 0.031 0.38 0.062 0.538 0.02 0.029 0.608 0.27 0.093 0.001 0.034 0.019 0.946 0.053 0.036 0.011 0.9 MOTIF Stomach_P0_H3K27ac_6_165_0.548_3.696978e-84 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.089 0.105 0.092 0.714 0.087 0.098 0.074 0.741 0.099 0.106 0.076 0.719 0.106 0.682 0.105 0.107 0.122 0.102 0.678 0.098 0.095 0.694 0.1 0.111 0.079 0.102 0.096 0.723 0.08 0.123 0.109 0.688 0.114 0.657 0.102 0.127 0.095 0.103 0.702 0.1 MOTIF Kidney_P0_H3K4me2_45_153_0.582_2.078856e-186 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.743 0.043 0.168 0.046 0.777 0.11 0.073 0.04 0.256 0.189 0.44 0.116 0.108 0.121 0.133 0.638 0.059 0.034 0.86 0.047 0.86 0.032 0.05 0.058 0.915 0.024 0.028 0.033 0.817 0.067 0.071 0.045 0.125 0.614 0.174 0.087 0.076 0.235 0.455 0.234 MOTIF Limb_E12.5_H3K4me2_32_166_0.600_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 MOTIF Forebrain_E14.5_H3K4me2_51_158_0.584_4.203392e-183 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.167 0.148 0.537 0.148 0.117 0.603 0.207 0.073 0.485 0.063 0.396 0.056 0.523 0.063 0.206 0.208 0.19 0.094 0.094 0.622 0.077 0.171 0.144 0.608 0.393 0.444 0.055 0.107 0.466 0.099 0.185 0.25 0.21 0.117 0.08 0.593 0.134 0.159 0.122 0.585 MOTIF Hindbrain_E14.5_H3K4me2_32_154_0.619_4.664597e-312 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.13 0.172 0.567 0.131 0.108 0.654 0.121 0.117 0.163 0.103 0.624 0.11 0.536 0.144 0.16 0.16 0.154 0.123 0.129 0.594 0.139 0.122 0.12 0.619 0.586 0.136 0.123 0.155 0.604 0.119 0.121 0.156 0.16 0.123 0.112 0.605 0.14 0.13 0.12 0.61 MOTIF Kidney_E15.5_H3K4me2_19_151_0.620_1.29393e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.144 0.191 0.524 0.141 0.088 0.674 0.107 0.131 0.195 0.057 0.646 0.102 0.382 0.172 0.216 0.23 0.144 0.084 0.136 0.636 0.182 0.073 0.092 0.653 0.586 0.129 0.088 0.197 0.643 0.105 0.077 0.175 0.187 0.128 0.077 0.608 0.137 0.131 0.083 0.649 MOTIF Hindbrain_E12.5_H3K4me2_43_156_0.589_7.405286e-208 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.16 0.124 0.133 0.583 0.612 0.112 0.121 0.155 0.568 0.145 0.141 0.146 0.148 0.154 0.133 0.565 0.148 0.143 0.537 0.172 0.624 0.138 0.119 0.119 0.661 0.114 0.119 0.106 0.591 0.129 0.139 0.141 0.14 0.617 0.117 0.126 0.116 0.121 0.641 0.122 MOTIF Cranio-Facial_E11.5_H3K4me2_16_160_0.672_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.247 0.246 0.247 0.26 0.162 0.561 0.139 0.138 0.13 0.132 0.592 0.146 0.157 0.153 0.153 0.537 0.136 0.137 0.135 0.592 0.153 0.154 0.152 0.541 0.156 0.563 0.129 0.152 0.136 0.142 0.564 0.158 0.16 0.164 0.16 0.516 0.252 0.23 0.23 0.289 MOTIF Stomach_E14.5_H3K4me2_16_158_0.656_1.87389e-314 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.431 0.196 0.196 0.177 0.153 0.665 0.122 0.06 0.098 0.067 0.671 0.164 0.145 0.176 0.157 0.522 0.087 0.105 0.11 0.698 0.13 0.174 0.166 0.53 0.144 0.656 0.075 0.125 0.133 0.112 0.614 0.141 0.115 0.171 0.163 0.551 0.139 0.094 0.104 0.663 MOTIF Intestine_P0_H3K27ac_33_154_0.532_6.14153e-38 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.287 0.401 0.03 0.281 0.459 0.001 0.454 0.086 0.093 0.393 0.471 0.042 0.001 0.161 0.035 0.803 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.861 0.001 0.137 0.67 0.089 0.001 0.24 0.057 0.484 0.355 0.103 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.129 0.001 0.869 0.06 0.438 0.001 0.501 MOTIF Liver_E15.5_H3K27ac_85_161_0.514_8.04661e-11 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.089 0.716 0.102 0.093 0.778 0.062 0.07 0.09 0.085 0.115 0.724 0.076 0.064 0.09 0.074 0.772 0.066 0.082 0.074 0.778 0.104 0.082 0.073 0.741 0.095 0.712 0.089 0.104 0.73 0.105 0.058 0.107 0.081 0.724 0.095 0.1 0.089 0.083 0.043 0.785 0.065 0.069 0.08 0.786 0.078 0.096 0.072 0.754 MOTIF Liver_E13.5_H3K9ac_65_156_0.531_1.134517e-21 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.628 0.003 0.119 0.25 0.979 0.014 0.005 0.002 0.996 0.001 0.002 0.001 0.23 0.355 0.297 0.118 0.23 0.002 0.002 0.766 0.215 0.003 0.781 0.001 0.508 0.257 0.008 0.227 0.425 0.566 0.003 0.006 0.693 0.001 0.005 0.301 0.182 0.229 0.516 0.073 0.156 0.266 0.181 0.397 0.35 0.123 0.218 0.309 MOTIF Kidney_P0_H3K9ac_59_169_0.554_7.289828e-59 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.18 0.401 0.165 0.254 0.249 0.085 0.573 0.093 0.039 0.762 0.106 0.093 0.017 0.104 0.009 0.87 0.005 0.067 0.045 0.883 0.017 0.033 0.069 0.881 0.089 0.745 0.051 0.115 0.619 0.168 0.062 0.151 0.099 0.556 0.16 0.185 0.047 0.102 0.019 0.832 0.005 0.099 0.025 0.871 0.032 0.136 0.055 0.777 MOTIF Liver_E12.5_H3K9ac_50_166_0.545_1.315367e-45 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.178 0.083 0.105 0.634 0.743 0.085 0.094 0.078 0.875 0.044 0.027 0.054 0.89 0.001 0.04 0.069 0.159 0.151 0.641 0.049 0.129 0.006 0.106 0.759 0.141 0.089 0.69 0.08 0.704 0.1 0.069 0.127 0.893 0.076 0.022 0.009 0.869 0.001 0.06 0.07 0.144 0.133 0.576 0.147 0.104 0.147 0.087 0.662 MOTIF Liver_P0_H3K9ac_52_155_0.551_4.765078e-61 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.271 0.278 0.183 0.268 0.731 0.048 0.097 0.124 0.09 0.139 0.669 0.102 0.028 0.06 0.029 0.883 0.025 0.059 0.042 0.874 0.062 0.046 0.04 0.852 0.093 0.71 0.071 0.126 0.82 0.069 0.037 0.074 0.083 0.705 0.1 0.112 0.051 0.035 0.009 0.905 0.045 0.051 0.053 0.851 0.165 0.241 0.142 0.453