MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Forebrain_E16.5_H3K27ac_17_162_0.550_3.207189e-69 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 MOTIF Liver_E12.5_H3K27me3_60_154_0.510_7.832237e-07 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.302 0.178 0.214 0.306 0.106 0.11 0.574 0.21 0.12 0.621 0.098 0.161 0.544 0.078 0.122 0.256 0.526 0.077 0.055 0.342 0.205 0.138 0.071 0.586 0.078 0.088 0.151 0.683 0.239 0.074 0.081 0.606 0.614 0.073 0.115 0.198 0.388 0.26 0.137 0.216 MOTIF Cranio-Facial_E11.5_H3K4me2_54_166_0.592_1.525383e-165 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.715 0.09 0.079 0.116 0.099 0.09 0.085 0.726 0.074 0.057 0.066 0.803 0.061 0.061 0.066 0.812 0.093 0.083 0.081 0.743 0.761 0.081 0.072 0.086 0.828 0.062 0.058 0.052 0.758 0.071 0.074 0.097 0.12 0.093 0.097 0.69 0.102 0.045 0.088 0.765 0.115 0.096 0.679 0.11 0.094 0.72 0.09 0.096 MOTIF Midbrain_E15.5_H3K4me2_61_166_0.577_1.96455e-154 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.211 0.01 0.102 0.677 0.062 0.054 0.757 0.127 0.067 0.86 0.036 0.037 0.632 0.125 0.001 0.242 0.214 0.222 0.375 0.188 0.082 0.058 0.031 0.829 0.023 0.015 0.066 0.896 0.097 0.026 0.05 0.827 0.589 0.14 0.143 0.128 0.888 0.032 0.027 0.053 0.855 0.04 0.041 0.064 0.446 0.078 0.197 0.28 MOTIF Hindbrain_E11.5_H3K4me2_61_171_0.583_7.618118e-159 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 MOTIF Midbrain_E14.5_H3K4me2_58_164_0.573_1.852887e-140 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.193 0.052 0.284 0.471 0.067 0.063 0.675 0.195 0.225 0.455 0.13 0.189 0.541 0.143 0.121 0.195 0.269 0.129 0.055 0.547 0.175 0.167 0.091 0.567 0.056 0.049 0.214 0.681 0.224 0.146 0.185 0.446 0.572 0.129 0.111 0.188 0.592 0.191 0.059 0.158 0.646 0.055 0.048 0.251 0.328 0.243 0.238 0.191 MOTIF Midbrain_E16.5_H3K4me2_56_168_0.577_8.491351e-157 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.27 0.134 0.38 0.216 0.035 0.028 0.851 0.086 0.044 0.871 0.049 0.036 0.869 0.038 0.017 0.076 0.032 0.038 0.056 0.874 0.026 0.026 0.026 0.922 0.014 0.021 0.013 0.952 0.069 0.07 0.053 0.808 0.866 0.075 0.032 0.027 0.913 0.04 0.012 0.035 0.921 0.022 0.017 0.04 0.326 0.16 0.294 0.22 MOTIF Forebrain_E13.5_H3K4me2_61_160_0.557_3.526284e-95 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.097 0.646 0.134 0.123 0.106 0.001 0.036 0.857 0.001 0.031 0.911 0.057 0.09 0.798 0.107 0.005 0.352 0.285 0.03 0.333 0.052 0.072 0.051 0.825 0.023 0.033 0.066 0.878 0.001 0.06 0.079 0.86 0.118 0.043 0.051 0.788 0.827 0.058 0.056 0.059 0.853 0.095 0.047 0.005 0.757 0.059 0.053 0.131 MOTIF Neural-Tube_E12.5_H3K4me2_62_168_0.564_2.978248e-125 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.056 0.031 0.082 0.831 0.001 0.085 0.841 0.073 0.091 0.776 0.053 0.08 0.806 0.07 0.067 0.057 0.064 0.083 0.091 0.762 0.15 0.082 0.079 0.689 0.039 0.08 0.041 0.84 0.066 0.088 0.074 0.772 0.798 0.106 0.033 0.063 0.812 0.048 0.08 0.06 0.833 0.001 0.045 0.121 0.23 0.206 0.309 0.255 MOTIF Hindbrain_E16.5_H3K4me2_68_163_0.563_6.097074e-110 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.058 0.797 0.055 0.09 0.068 0.013 0.041 0.878 0.058 0.04 0.845 0.057 0.063 0.85 0.054 0.033 0.757 0.092 0.068 0.083 0.065 0.053 0.087 0.795 0.051 0.052 0.044 0.853 0.046 0.03 0.039 0.885 0.064 0.082 0.045 0.809 0.827 0.043 0.048 0.082 0.886 0.043 0.043 0.028 0.82 0.056 0.044 0.08 MOTIF Hindbrain_P0_H3K4me2_73_162_0.562_5.986817e-103 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.073 0.783 0.06 0.084 0.04 0.023 0.042 0.895 0.048 0.053 0.829 0.07 0.067 0.787 0.064 0.082 0.825 0.066 0.051 0.058 0.074 0.057 0.063 0.806 0.046 0.054 0.033 0.867 0.032 0.038 0.046 0.884 0.087 0.057 0.069 0.787 0.821 0.039 0.041 0.099 0.875 0.05 0.028 0.047 0.842 0.046 0.034 0.078 MOTIF Midbrain_E13.5_H3K4me2_68_170_0.560_6.42418e-93 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.089 0.048 0.096 0.767 0.078 0.085 0.727 0.11 0.116 0.701 0.089 0.094 0.73 0.099 0.062 0.109 0.093 0.075 0.1 0.732 0.092 0.066 0.073 0.769 0.054 0.065 0.059 0.822 0.11 0.108 0.068 0.714 0.758 0.089 0.07 0.083 0.814 0.079 0.055 0.052 0.789 0.039 0.074 0.098 0.125 0.086 0.679 0.11 MOTIF Neural-Tube_E13.5_H3K4me2_62_172_0.552_5.959001e-100 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 MOTIF Liver_E15.5_H3K27me3_46_154_0.518_3.395362e-10 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.034 0.091 0.034 0.841 0.027 0.068 0.091 0.814 0.208 0.028 0.177 0.587 0.628 0.104 0.032 0.236 0.921 0.027 0.023 0.029 0.818 0.019 0.03 0.133 0.562 0.022 0.182 0.234 0.034 0.121 0.041 0.804 0.033 0.226 0.695 0.046 0.201 0.619 0.152 0.028 0.711 0.183 0.075 0.031 0.229 0.132 0.179 0.461 MOTIF Kidney_E14.5_H3K27me3_30_164_0.521_4.255781e-07 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.082 0.056 0.067 0.795 0.086 0.076 0.781 0.057 0.067 0.793 0.074 0.066 0.803 0.065 0.066 0.066 0.071 0.069 0.068 0.792 0.065 0.057 0.054 0.824 0.069 0.06 0.065 0.806 0.068 0.05 0.057 0.825 0.446 0.053 0.456 0.045 0.842 0.043 0.059 0.056 0.86 0.045 0.04 0.055 0.439 0.05 0.47 0.042 MOTIF Kidney_E16.5_H3K27me3_26_167_0.524_2.645918e-08 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.099 0.039 0.113 0.749 0.07 0.122 0.638 0.17 0.089 0.781 0.089 0.041 0.707 0.092 0.047 0.154 0.126 0.034 0.029 0.811 0.061 0.075 0.044 0.82 0.033 0.055 0.035 0.877 0.155 0.096 0.105 0.644 0.757 0.122 0.066 0.055 0.76 0.153 0.039 0.048 0.833 0.003 0.075 0.089 0.177 0.046 0.624 0.153 MOTIF Forebrain_E13.5_H3K4me3_77_166_0.564_1.912647e-86 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.248 0.217 0.212 0.324 0.123 0.11 0.106 0.661 0.101 0.108 0.105 0.686 0.135 0.117 0.116 0.632 0.625 0.119 0.12 0.136 0.692 0.103 0.107 0.098 0.685 0.103 0.112 0.1 0.66 0.095 0.122 0.123 0.166 0.109 0.573 0.152 0.143 0.134 0.576 0.147 0.158 0.572 0.125 0.145 0.315 0.218 0.197 0.27 MOTIF Heart_E12.5_H3K4me3_72_169_0.561_8.466018e-77 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.089 0.703 0.09 0.118 0.121 0.05 0.061 0.768 0.083 0.089 0.728 0.1 0.107 0.694 0.087 0.112 0.709 0.105 0.075 0.111 0.084 0.087 0.091 0.738 0.062 0.066 0.057 0.815 0.053 0.072 0.061 0.814 0.093 0.092 0.069 0.746 0.749 0.083 0.069 0.099 0.787 0.072 0.07 0.071 0.751 0.078 0.079 0.092 MOTIF Heart_P0_H3K4me3_79_170_0.550_3.796172e-76 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.316 0.179 0.236 0.269 0.146 0.116 0.601 0.137 0.146 0.603 0.129 0.122 0.675 0.085 0.088 0.152 0.135 0.125 0.593 0.147 0.126 0.119 0.106 0.649 0.104 0.111 0.123 0.662 0.143 0.119 0.12 0.618 0.622 0.12 0.121 0.137 0.662 0.116 0.116 0.106 0.668 0.104 0.113 0.115 0.331 0.207 0.226 0.236 MOTIF Intestine_E14.5_H3K27me3_34_164_0.531_1.196229e-10 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.052 0.861 0.032 0.055 0.047 0.09 0.047 0.816 0.001 0.072 0.082 0.845 0.047 0.046 0.063 0.844 0.865 0.041 0.048 0.046 0.921 0.047 0.016 0.016 0.886 0.032 0.028 0.054 0.828 0.03 0.087 0.055 0.05 0.016 0.034 0.9 0.056 0.042 0.816 0.086 0.07 0.768 0.061 0.101 0.142 0.125 0.656 0.077 MOTIF Cranio-Facial_E11.5_H3K27me3_33_170_0.538_2.817329e-11 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.161 0.515 0.106 0.218 0.159 0.117 0.525 0.199 0.137 0.647 0.167 0.049 0.591 0.119 0.048 0.242 0.057 0.104 0.062 0.777 0.037 0.175 0.03 0.758 0.062 0.1 0.065 0.773 0.204 0.286 0.108 0.402 0.605 0.187 0.112 0.096 0.657 0.131 0.134 0.078 MOTIF Heart_E14.5_H3K27me3_22_167_0.516_4.521816e-08 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 MOTIF Heart_E11.5_H3K27me3_23_172_0.517_1.20333e-13 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.107 0.035 0.049 0.809 0.053 0.066 0.062 0.819 0.771 0.077 0.085 0.067 0.879 0.048 0.039 0.034 0.848 0.058 0.068 0.026 0.841 0.053 0.048 0.058 0.108 0.057 0.08 0.755 0.035 0.066 0.847 0.052 0.095 0.77 0.05 0.085 0.148 0.091 0.664 0.097 MOTIF Hindbrain_P0_H3K4me2_39_172_0.604_1.530234e-312 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.097 0.099 0.095 0.709 0.088 0.656 0.12 0.136 0.12 0.114 0.669 0.097 0.68 0.107 0.133 0.08 0.761 0.071 0.093 0.075 0.727 0.093 0.103 0.077 0.113 0.097 0.111 0.679 0.07 0.102 0.738 0.09 0.092 0.713 0.101 0.094 0.118 0.082 0.67 0.13 MOTIF Neural-Tube_E14.5_H3K4me2_33_159_0.624_2.423022e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.079 0.08 0.119 0.722 0.087 0.105 0.121 0.687 0.651 0.113 0.13 0.106 0.769 0.072 0.11 0.049 0.745 0.069 0.09 0.096 0.652 0.106 0.109 0.133 0.14 0.116 0.135 0.609 0.102 0.131 0.637 0.13 0.072 0.822 0.029 0.077 0.123 0.068 0.706 0.103 MOTIF Midbrain_E15.5_H3K9ac_64_171_0.549_2.05453e-39 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.221 0.17 0.098 0.511 0.043 0.04 0.063 0.854 0.075 0.093 0.038 0.794 0.815 0.007 0.074 0.104 0.209 0.095 0.654 0.042 0.851 0.041 0.06 0.048 0.839 0.058 0.057 0.046 0.135 0.003 0.085 0.777 0.067 0.07 0.718 0.145 0.091 0.742 0.104 0.063 0.886 0.032 0.001 0.081 0.426 0.169 0.195 0.21 MOTIF Hindbrain_E14.5_H3K9ac_43_169_0.581_5.93891e-141 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.055 0.047 0.717 0.181 0.001 0.87 0.128 0.001 0.626 0.303 0.001 0.07 0.001 0.01 0.325 0.664 0.07 0.093 0.013 0.824 0.297 0.048 0.011 0.644 0.211 0.049 0.001 0.739 0.856 0.001 0.044 0.099 0.775 0.154 0.001 0.07 0.523 0.009 0.061 0.407 MOTIF Forebrain_E14.5_H3K9ac_59_166_0.556_2.240546e-63 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.096 0.518 0.217 0.169 0.408 0.008 0.007 0.577 0.019 0.021 0.929 0.031 0.027 0.903 0.045 0.025 0.466 0.188 0.002 0.345 0.108 0.142 0.168 0.582 0.149 0.147 0.01 0.694 0.016 0.019 0.023 0.942 0.242 0.124 0.142 0.491 0.828 0.017 0.021 0.134 0.69 0.14 0.016 0.154 0.705 0.021 0.012 0.262 MOTIF Midbrain_E13.5_H3K9ac_46_170_0.562_1.941811e-105 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.27 0.259 0.175 0.296 0.086 0.063 0.05 0.801 0.036 0.065 0.069 0.83 0.093 0.052 0.062 0.793 0.751 0.066 0.079 0.104 0.858 0.043 0.048 0.051 0.852 0.033 0.056 0.059 0.79 0.064 0.071 0.075 0.11 0.032 0.098 0.76 0.068 0.109 0.733 0.09 0.095 0.764 0.061 0.08 0.423 0.223 0.013 0.341 MOTIF Midbrain_E16.5_H3K9ac_47_169_0.570_4.71803e-110 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.257 0.162 0.223 0.358 0.122 0.119 0.604 0.155 0.146 0.592 0.14 0.122 0.585 0.137 0.093 0.185 0.134 0.107 0.132 0.627 0.103 0.104 0.092 0.701 0.097 0.11 0.107 0.686 0.148 0.121 0.133 0.598 0.613 0.123 0.123 0.141 0.692 0.123 0.093 0.092 0.675 0.093 0.108 0.124 0.3 0.19 0.267 0.243 MOTIF Forebrain_E16.5_H3K9ac_47_165_0.569_4.730179e-92 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.229 0.296 0.221 0.254 0.142 0.089 0.118 0.651 0.11 0.12 0.626 0.144 0.131 0.618 0.127 0.124 0.601 0.139 0.089 0.171 0.127 0.115 0.118 0.64 0.103 0.106 0.099 0.692 0.096 0.122 0.107 0.675 0.144 0.132 0.12 0.604 0.607 0.133 0.123 0.137 0.643 0.12 0.119 0.118 0.347 0.206 0.205 0.241 MOTIF Hindbrain_P0_H3K9ac_55_172_0.577_3.173519e-124 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 MOTIF Hindbrain_E15.5_H3K9ac_67_166_0.564_1.36317e-77 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.127 0.082 0.109 0.682 0.116 0.111 0.634 0.139 0.122 0.642 0.111 0.125 0.654 0.118 0.089 0.139 0.122 0.109 0.109 0.66 0.098 0.095 0.085 0.722 0.093 0.1 0.097 0.71 0.126 0.112 0.106 0.656 0.67 0.108 0.098 0.124 0.704 0.107 0.095 0.094 0.674 0.105 0.109 0.112 0.153 0.591 0.12 0.136 MOTIF Neural-Tube_E11.5_H3K9ac_70_170_0.552_5.985271e-52 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.118 0.627 0.118 0.137 0.132 0.084 0.088 0.696 0.108 0.111 0.655 0.126 0.128 0.636 0.12 0.116 0.636 0.128 0.094 0.142 0.111 0.111 0.118 0.66 0.094 0.101 0.089 0.716 0.093 0.103 0.106 0.698 0.126 0.117 0.11 0.647 0.653 0.117 0.11 0.12 0.69 0.114 0.104 0.092 0.685 0.099 0.104 0.112 MOTIF Neural-Tube_E13.5_H3K9ac_51_163_0.557_7.956522e-92 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.098 0.699 0.087 0.116 0.117 0.042 0.052 0.789 0.073 0.086 0.744 0.097 0.092 0.711 0.091 0.106 0.706 0.118 0.058 0.118 0.088 0.077 0.092 0.743 0.067 0.062 0.061 0.81 0.065 0.071 0.067 0.797 0.108 0.086 0.078 0.728 0.733 0.084 0.077 0.106 0.778 0.081 0.076 0.065 0.759 0.072 0.082 0.087 MOTIF Forebrain_E15.5_H3K9ac_54_161_0.576_7.836142e-94 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.136 0.13 0.569 0.165 0.115 0.146 0.112 0.627 0.116 0.081 0.106 0.697 0.112 0.101 0.62 0.167 0.125 0.643 0.109 0.123 0.648 0.12 0.085 0.147 0.119 0.092 0.103 0.686 0.092 0.078 0.078 0.752 0.076 0.091 0.088 0.745 0.141 0.102 0.1 0.657 0.662 0.109 0.103 0.126 0.693 0.093 0.102 0.112 MOTIF Neural-Tube_E15.5_H3K9ac_72_171_0.559_4.037875e-87 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1