MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Forebrain_E13.5_H3K4me2_24_11_0.613_1.327497e-315 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.049351 0.868482 0.064843 0.017324 0.03778 0.89742 0.034187 0.030612 0.08545 0.052857 0.722338 0.139355 0.13046 0.660332 0.082967 0.126241 0.045059 0.029106 0.874521 0.051315 0.103703 0.044648 0.63991 0.211739 0.038691 0.886681 0.02987 0.044758 0.092442 0.035518 0.043416 0.828624 0.015522 0.908887 0.036065 0.039526 0.201427 0.428907 0.228032 0.141633 0.019978 0.257939 0.709016 0.013067 MOTIF Kidney_E14.5_H3K4me2_26_11_0.637_3.580374e-311 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.061859 0.818151 0.030874 0.089115 0.08098 0.841212 0.0411 0.036708 0.05774 0.050551 0.73819 0.153519 0.080402 0.774251 0.047082 0.098264 0.028138 0.023395 0.903736 0.044731 0.074505 0.052523 0.76506 0.107912 0.051774 0.827443 0.038618 0.082165 0.091475 0.06206 0.09209 0.754376 0.004382 0.950224 0.033739 0.011654 0.12476 0.141856 0.279183 0.4542 MOTIF Limb_E11.5_H3K4me2_65_63_0.561_2.741578e-88 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.237174 0.034267 0.70752 0.021039 0.039486 0.087192 0.86055 0.012772 0.902933 0.019325 0.048028 0.029714 0.027237 0.049771 0.883285 0.039707 0.241678 0.672279 0.037399 0.048644 0.242223 0.602214 0.086803 0.06876 0.032384 0.018642 0.899389 0.049585 0.089692 0.870205 0.028598 0.011505 0.029902 0.755046 0.065506 0.149546 0.201134 0.469321 0.0 0.329545 MOTIF Liver_E11.5_H3K4me2_18_8_0.613_9.39765e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.005094 0.869975 0.072512 0.052419 0.088506 0.060151 0.783206 0.068136 0.054955 0.033162 0.888659 0.023224 0.857158 0.054483 0.049799 0.03856 0.024591 0.027136 0.921999 0.026275 0.100766 0.789933 0.029998 0.079302 0.039455 0.75117 0.035963 0.173412 0.09718 0.093518 0.705902 0.1034 0.109146 0.751472 0.083312 0.05607 0.045413 0.507814 0.370425 0.076348 0.220464 0.039053 0.530528 0.209954 MOTIF Hindbrain_P0_H3K4me2_10_11_0.659_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.021443 0.762359 0.142103 0.074095 0.116406 0.036139 0.781544 0.065911 0.053055 0.033527 0.90453 0.008887 0.765143 0.070365 0.092695 0.071797 0.08901 0.044686 0.84656 0.019744 0.119967 0.746878 0.058513 0.074642 0.043486 0.840683 0.0672 0.048631 0.099716 0.158532 0.654159 0.087593 0.070417 0.758755 0.086988 0.08384 0.133528 0.155566 0.62279 0.088115 0.097707 0.3739 0.380349 0.148044 MOTIF Forebrain_E16.5_H3K4me2_27_14_0.626_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.5135 0.0 0.255977 0.230523 0.024372 0.747539 0.151115 0.076974 0.048248 0.030491 0.865693 0.055568 0.06535 0.070167 0.855791 0.008692 0.862574 0.020787 0.063516 0.053124 0.074047 0.046482 0.850231 0.029241 0.116903 0.660214 0.140453 0.082431 0.041503 0.857722 0.045539 0.055236 0.09814 0.117563 0.710579 0.073717 0.08032 0.794513 0.079685 0.045482 MOTIF Liver_E16.5_H3K4me2_28_15_0.604_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.041301 0.808671 0.077542 0.072486 0.106257 0.05981 0.801855 0.032078 0.044993 0.037897 0.902631 0.014479 0.844577 0.064414 0.054661 0.036349 0.038744 0.020009 0.912667 0.02858 0.102435 0.751747 0.108959 0.036858 0.123241 0.634646 0.050544 0.191569 0.067587 0.088495 0.780884 0.063034 0.057197 0.876084 0.044058 0.022661 MOTIF Forebrain_E15.5_H3K4me2_16_11_0.652_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.024183 0.791528 0.102665 0.081624 0.124292 0.012429 0.785396 0.077883 0.024837 0.042962 0.926981 0.00522 0.84341 0.085045 0.04056 0.030986 0.079046 0.026113 0.879347 0.015494 0.14984 0.708546 0.093594 0.048021 0.117517 0.658029 0.068116 0.156338 0.101861 0.132217 0.704846 0.061076 0.077259 0.728619 0.127247 0.066875 0.204607 0.328085 0.389191 0.078116 0.233059 0.397903 0.109359 0.259678 MOTIF Neural-Tube_E11.5_H3K4me2_19_11_0.661_3.993436e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.013944 0.871468 0.060104 0.054484 0.133339 0.047149 0.740157 0.079355 0.015025 0.046264 0.929096 0.009615 0.847426 0.041557 0.039916 0.071101 0.066673 0.024346 0.872081 0.0369 0.044137 0.840403 0.041675 0.073785 0.064302 0.765778 0.023677 0.146242 0.028412 0.140407 0.737531 0.09365 0.095372 0.737482 0.107177 0.05997 0.192192 0.397063 0.348814 0.061932 MOTIF Heart_P0_H3K4me2_12_10_0.628_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.020435 0.852154 0.025744 0.101668 0.158863 0.118659 0.703157 0.019322 0.1097 0.026256 0.841667 0.022377 0.750641 0.044521 0.140288 0.06455 0.094481 0.024144 0.855412 0.025963 0.202622 0.668787 0.05199 0.076601 0.046091 0.843917 0.058954 0.051037 0.050164 0.028967 0.763067 0.157803 0.041548 0.887556 0.059833 0.011063 0.191544 0.241867 0.391159 0.175429 MOTIF Intestine_E16.5_H3K4me2_29_10_0.617_1.053196e-313 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.014676 0.831636 0.088395 0.065292 0.13493 0.065851 0.71298 0.086238 0.037417 0.055586 0.890528 0.016469 0.816097 0.014331 0.112494 0.057078 0.044973 0.01648 0.923333 0.015213 0.172933 0.672476 0.07389 0.080701 0.034734 0.858483 0.05408 0.052704 0.111136 0.060079 0.709676 0.119109 0.076909 0.821726 0.072619 0.028746 0.321177 0.363206 0.210841 0.104776 MOTIF Neural-Tube_E15.5_H3K4me2_28_14_0.623_5.506932e-313 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.027539 0.750582 0.172075 0.049804 0.145451 0.039296 0.792824 0.022429 0.055188 0.043692 0.889621 0.011499 0.848278 0.007794 0.066232 0.077695 0.032198 0.039624 0.895232 0.032947 0.160218 0.721443 0.038821 0.079518 0.054163 0.796006 0.06841 0.08142 0.116801 0.069604 0.736986 0.076608 0.073693 0.845159 0.053266 0.027882 0.333535 0.376722 0.175296 0.114447 MOTIF Heart_E16.5_H3K4me2_15_159_0.604_3.327187e-312 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.181 0.041 0.622 0.156 0.075 0.363 0.492 0.07 0.095 0.146 0.697 0.062 0.264 0.001 0.734 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.106 0.001 0.854 0.039 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.918 0.08 0.001 0.009 0.001 0.989 0.001 0.442 0.481 0.051 0.026 0.14 0.093 0.539 0.228 0.064 0.442 0.42 0.074 MOTIF Liver_E12.5_H3K4me2_21_20_0.590_2.431549e-318 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.055912 0.868753 0.02878 0.046555 0.006215 0.046595 0.78553 0.16166 0.115949 0.777238 0.019988 0.086825 0.035458 0.023232 0.837508 0.103802 0.161268 0.008795 0.786113 0.043825 0.012445 0.794886 0.055913 0.136755 0.051583 0.032695 0.007183 0.908539 0.011454 0.882938 0.013798 0.09181 0.022056 0.810696 0.048155 0.119094 0.207321 0.363644 0.356762 0.072272 MOTIF Midbrain_E14.5_H3K4me2_45_20_0.603_6.384505e-314 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.18925 0.693803 0.044696 0.072251 0.077005 0.066375 0.711255 0.145366 0.11293 0.706293 0.04154 0.139237 0.047846 0.037783 0.856852 0.057519 0.086943 0.048192 0.805448 0.059418 0.011819 0.858358 0.044269 0.085554 0.019688 0.060438 0.057144 0.862729 0.005971 0.926809 0.027848 0.039372 0.127501 0.741038 0.097687 0.033775 0.100551 0.655605 0.01335 0.230493 MOTIF Cranio-Facial_E14.5_H3K4me2_22_11_0.631_2.208515e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.237326 0.040687 0.594681 0.127306 0.089405 0.830136 0.062233 0.018225 0.048098 0.063871 0.773188 0.114843 0.071935 0.799036 0.06723 0.061799 0.120171 0.06721 0.7673 0.04532 0.066394 0.058082 0.736607 0.138917 0.012191 0.801301 0.107034 0.079473 0.061785 0.06793 0.013973 0.856312 0.010002 0.924349 0.020143 0.045506 0.060041 0.787319 0.04848 0.10416 MOTIF Stomach_P0_H3K4me2_25_19_0.621_3.198474e-317 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.098139 0.837141 0.045999 0.018722 0.068682 0.018658 0.772617 0.140042 0.05101 0.817024 0.099638 0.032327 0.197937 0.066949 0.644265 0.090849 0.018111 0.0474 0.877912 0.056576 0.016807 0.872283 0.020254 0.090656 0.066695 0.04831 0.058276 0.826719 0.043883 0.884175 0.022006 0.049936 0.077475 0.686381 0.069218 0.166925 MOTIF Liver_E16.5_H3K27ac_16_11_0.548_2.033742e-157 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.010813 0.826175 0.063404 0.099608 0.17988 0.05742 0.735183 0.027516 0.039295 0.03743 0.907672 0.015603 0.813435 0.040244 0.087536 0.058785 0.038282 0.014502 0.89074 0.056476 0.127577 0.756476 0.041604 0.074343 0.033529 0.741739 0.01727 0.207462 0.019228 0.04639 0.814187 0.120195 0.132263 0.81549 0.03894 0.013307 0.088933 0.430825 0.413356 0.066886 0.25224 0.369745 0.133247 0.244768 MOTIF Hindbrain_E13.5_H3K4me3_20_18_0.695_1.627738e-311 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.100106 0.792534 0.082507 0.024854 0.036899 0.864249 0.051138 0.047714 0.045771 0.03857 0.818348 0.097311 0.111976 0.030817 0.843345 0.013862 0.878175 0.021147 0.073122 0.027555 0.14725 0.044785 0.735065 0.0729 0.159772 0.675907 0.011784 0.152537 0.02158 0.890678 0.046484 0.041259 0.023382 0.058143 0.859136 0.05934 0.125148 0.261369 0.399633 0.21385 0.028059 0.052577 0.657109 0.262255 MOTIF Cranio-Facial_E11.5_H3K4me3_28_17_0.682_1.358889e-314 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.035546 0.795074 0.071614 0.097766 0.03478 0.848966 0.079802 0.036452 0.156282 0.066541 0.674431 0.102746 0.03605 0.047156 0.806847 0.109947 0.055443 0.836947 0.033524 0.074085 0.094138 0.026348 0.033065 0.84645 0.004533 0.779547 0.135625 0.080296 0.053944 0.82898 0.031726 0.085349 0.102002 0.057205 0.8041 0.036694 MOTIF Liver_P0_H3K4me3_33_19_0.643_1.947607e-320 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.0193 0.855307 0.06136 0.064033 0.021177 0.911161 0.035511 0.032151 0.04591 0.119195 0.732638 0.102257 0.067658 0.039461 0.866859 0.026022 0.838543 0.038153 0.044111 0.079193 0.066919 0.036134 0.819121 0.077827 0.098893 0.826744 0.049781 0.024583 0.134421 0.635185 0.064774 0.165619 0.032692 0.075679 0.802466 0.089163 MOTIF Kidney_E14.5_H3K4me3_42_42_0.627_1.161052e-312 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.026927 0.031566 0.93471 0.006796 0.046039 0.077679 0.836186 0.040095 0.818965 0.030201 0.112643 0.03819 0.018603 0.049649 0.926118 0.00563 0.258879 0.60696 0.04353 0.090631 0.131941 0.655969 0.088826 0.123264 0.029799 0.019662 0.875398 0.075141 0.115128 0.77111 0.104827 0.008936 0.071225 0.628708 0.08233 0.217737 0.140148 0.357999 0.252933 0.248921 MOTIF Liver_E15.5_H3K4me3_47_55_0.612_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.20886 0.042588 0.728059 0.020492 0.043712 0.016185 0.912399 0.027704 0.766399 0.064948 0.154464 0.014189 0.01885 0.034438 0.939555 0.007157 0.117177 0.79151 0.025255 0.066057 0.143734 0.680381 0.050659 0.125227 0.019338 0.0 0.942659 0.038003 0.086059 0.83504 0.059658 0.019242 0.026322 0.673055 0.1776 0.123023 MOTIF Forebrain_E15.5_H3K4me3_13_11_0.710_9.495942e-321 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.029836 0.883679 0.07398 0.012505 0.127599 0.058327 0.726854 0.087221 0.0291 0.049969 0.912866 0.008066 0.796932 0.052293 0.065566 0.085209 0.02764 0.03168 0.892933 0.047746 0.141428 0.790803 0.030293 0.037476 0.040526 0.787253 0.041654 0.130568 0.102245 0.110283 0.650507 0.136965 0.09291 0.834662 0.05978 0.012648 0.112925 0.174364 0.65859 0.054121 0.07527 0.403177 0.381556 0.139997 MOTIF Forebrain_P0_H3K4me3_10_15_0.726_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.025736 0.772534 0.112636 0.089093 0.032888 0.023856 0.855089 0.088167 0.111604 0.038003 0.835618 0.014775 0.855508 0.032863 0.070975 0.040654 0.077547 0.028528 0.878048 0.015877 0.202192 0.668644 0.049336 0.079829 0.041236 0.822403 0.087149 0.049212 0.107062 0.077005 0.72251 0.093423 0.126366 0.761705 0.066326 0.045603 0.116691 0.162704 0.592713 0.127892 MOTIF Heart_E15.5_H3K4me3_18_14_0.680_1.040729e-311 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.003923 0.831243 0.141913 0.022921 0.051491 0.032617 0.855631 0.06026 0.055928 0.042545 0.889086 0.012441 0.824366 0.061733 0.060883 0.053018 0.09502 0.043421 0.828255 0.033305 0.139072 0.770389 0.034877 0.055662 0.035022 0.801459 0.105846 0.057673 0.109902 0.118262 0.65352 0.118316 0.088632 0.769848 0.063393 0.078126 0.192993 0.282941 0.444424 0.079641 0.01165 0.646028 0.284402 0.05792 MOTIF Cranio-Facial_E12.5_H3K4me3_13_7_0.714_4.996251e-316 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.054969 0.772728 0.101242 0.071061 0.093809 0.117717 0.768618 0.019856 0.043877 0.041166 0.901764 0.013193 0.816576 0.036201 0.093841 0.053382 0.051772 0.047218 0.862445 0.038565 0.126541 0.681337 0.117082 0.07504 0.08797 0.757261 0.09583 0.058939 0.022786 0.043824 0.863358 0.070033 0.059278 0.87159 0.05415 0.014982 0.2593 0.323415 0.164655 0.25263 MOTIF Hindbrain_E14.5_H3K4me3_31_16_0.673_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.132609 0.736872 0.06515 0.065369 0.118128 0.055393 0.748987 0.077491 0.015713 0.023127 0.959767 0.001392 0.864431 0.025327 0.052845 0.057397 0.017166 0.02709 0.914915 0.040829 0.103982 0.787398 0.043713 0.064907 0.04692 0.747602 0.047022 0.158456 0.081898 0.187992 0.680014 0.050095 0.070868 0.830022 0.076246 0.022864 0.192377 0.499771 0.208339 0.099513 MOTIF Liver_E13.5_H3K4me3_12_11_0.668_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.103775 0.755521 0.077318 0.063386 0.069833 0.029169 0.878191 0.022807 0.028151 0.046069 0.913958 0.011822 0.826027 0.036919 0.074819 0.062235 0.040331 0.034608 0.885345 0.039717 0.128401 0.75088 0.05608 0.064638 0.118296 0.699782 0.068158 0.113764 0.075546 0.124664 0.702773 0.097016 0.068327 0.799178 0.083128 0.049367 0.17391 0.357331 0.378289 0.09047 MOTIF Neural-Tube_E13.5_H3K4me3_20_8_0.703_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.063706 0.835879 0.071798 0.028617 0.132673 0.097929 0.745031 0.024368 0.031961 0.049982 0.90995 0.008106 0.794092 0.058249 0.081202 0.066457 0.029409 0.042322 0.894191 0.034078 0.095554 0.783356 0.070931 0.05016 0.098327 0.718387 0.044486 0.138799 0.058689 0.132742 0.736678 0.071891 0.055807 0.827578 0.082223 0.034392 0.146109 0.452769 0.331083 0.070038 MOTIF Liver_E11.5_H3K4me3_28_17_0.660_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.014298 0.79668 0.145409 0.043613 0.053666 0.032815 0.838806 0.074712 0.084908 0.050464 0.853711 0.010916 0.871929 0.054944 0.040595 0.032532 0.058601 0.047057 0.839553 0.054789 0.10747 0.790518 0.03629 0.065722 0.101843 0.679739 0.040436 0.177981 0.056126 0.11186 0.728496 0.103517 0.09564 0.832261 0.066447 0.005651 MOTIF Forebrain_E13.5_H3K4me3_17_13_0.703_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.078666 0.712133 0.129554 0.079646 0.042206 0.029777 0.874196 0.053821 0.059245 0.058425 0.860956 0.021374 0.800913 0.080706 0.056969 0.061412 0.04784 0.059534 0.845884 0.046742 0.123023 0.740005 0.077326 0.059645 0.098281 0.791261 0.053287 0.057171 0.076956 0.088731 0.75833 0.075983 0.077782 0.812987 0.080534 0.028697 MOTIF Forebrain_E12.5_H3K4me3_19_12_0.696_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.082284 0.795601 0.063956 0.058158 0.089628 0.048448 0.818279 0.043645 0.039361 0.076659 0.866625 0.017354 0.826802 0.059292 0.062703 0.051204 0.016722 0.02237 0.930793 0.030114 0.106449 0.743514 0.092055 0.057982 0.09857 0.744686 0.037292 0.119452 0.071157 0.105478 0.720771 0.102594 0.07642 0.815224 0.072256 0.036101 MOTIF Limb_E15.5_H3K4me3_18_12_0.689_9.495134e-311 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.039154 0.838987 0.058925 0.062934 0.086585 0.029942 0.813998 0.069475 0.036272 0.063107 0.870571 0.030051 0.809467 0.076429 0.058465 0.055639 0.023413 0.008689 0.93781 0.030089 0.110678 0.793273 0.040897 0.055152 0.109266 0.72789 0.034384 0.128461 0.087389 0.095137 0.708795 0.108678 0.078547 0.775859 0.094393 0.051201 MOTIF Neural-Tube_E15.5_H3K4me3_18_13_0.694_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.088205 0.80621 0.047992 0.057593 0.083594 0.026799 0.833049 0.056558 0.043855 0.082394 0.857826 0.015925 0.787086 0.060534 0.087766 0.064614 0.051546 0.017737 0.908161 0.022556 0.114607 0.801933 0.029267 0.054193 0.130277 0.69769 0.03461 0.137423 0.094579 0.113408 0.702846 0.089166 0.084074 0.80697 0.072864 0.036091 MOTIF Lung_E16.5_H3K4me3_21_12_0.665_1.391437e-319 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.037261 0.825478 0.064214 0.073047 0.050441 0.027192 0.892957 0.02941 0.037168 0.058565 0.88834 0.015928 0.894791 0.05435 0.022108 0.028752 0.049385 0.015871 0.916236 0.018507 0.107808 0.754242 0.06025 0.0777 0.097632 0.682116 0.036349 0.183904 0.094713 0.118327 0.709272 0.077687 0.088364 0.808443 0.076971 0.026223 0.287694 0.333953 0.238912 0.139441 MOTIF Stomach_P0_H3K4me3_24_8_0.683_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.084564 0.771728 0.07581 0.067898 0.090848 0.0888 0.801052 0.0193 0.036382 0.060193 0.889881 0.013543 0.831227 0.044533 0.076519 0.047721 0.048157 0.019226 0.897207 0.03541 0.10167 0.772055 0.06141 0.064865 0.133471 0.705366 0.037441 0.123722 0.069879 0.098194 0.761378 0.070549 0.05555 0.841759 0.084588 0.018103 0.362645 0.275162 0.215848 0.146346