MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Midbrain_E14.5_H3K27me3_20_24_0.535_1.57448e-31 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.079666 0.299102 0.415514 0.205719 0.078124 0.75584 0.073083 0.092953 0.08147 0.057833 0.778416 0.082282 0.074331 0.619223 0.134767 0.171678 0.030867 0.746298 0.068335 0.1545 0.022631 0.009116 0.029166 0.939087 0.015955 0.881188 0.017112 0.085744 0.005297 0.866761 0.023008 0.104933 0.11519 0.755815 0.05457 0.074425 0.047032 0.02453 0.879708 0.048731 MOTIF Cranio-Facial_E12.5_H3K27ac_29_19_0.533_1.69129e-43 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.784169 0.074736 0.0 0.141095 0.326532 0.28163 0.305539 0.086299 0.036476 0.007891 0.928963 0.026669 0.074518 0.727196 0.190524 0.007762 0.199009 0.697931 0.059431 0.043629 0.040863 0.03756 0.089003 0.832574 0.0 0.958553 0.012115 0.029331 0.113514 0.844854 0.0185 0.023132 0.021212 0.849506 0.050744 0.078537 0.20071 0.013661 0.773987 0.011643 0.021633 0.856115 0.092164 0.030087 MOTIF Intestine_E16.5_H3K27ac_40_23_0.526_2.550553e-71 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.04557 0.031274 0.848281 0.074874 0.111137 0.798681 0.057565 0.032617 0.008973 0.939449 0.015124 0.036455 0.156772 0.013023 0.035694 0.79451 0.004763 0.958999 0.011662 0.024575 0.148544 0.80011 0.031219 0.020127 0.041051 0.821537 0.043665 0.093747 0.114644 0.029389 0.818019 0.037948 0.122334 0.475581 0.210379 0.191706 0.0 0.016387 0.664716 0.318896 MOTIF Limb_E12.5_H3K27ac_42_21_0.527_2.305128e-73 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.068973 0.906796 0.0 0.024231 0.0 0.037802 0.942251 0.019946 0.137986 0.654605 0.031508 0.175901 0.002301 0.957398 0.015282 0.025019 0.035311 0.082158 0.018396 0.864136 0.016614 0.785954 0.045629 0.151803 0.018152 0.939482 0.018471 0.023896 0.063899 0.498672 0.043184 0.394246 0.109598 0.008764 0.809257 0.07238 MOTIF Midbrain_E14.5_H3K27ac_22_16_0.557_1.762925e-149 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.159109 0.759819 0.045989 0.035083 0.022208 0.013282 0.948725 0.015784 0.00986 0.915914 0.042947 0.031278 0.026579 0.710467 0.04352 0.219434 0.02394 0.020662 0.078536 0.876862 0.0 0.790896 0.006277 0.202827 0.159794 0.707875 0.006819 0.125511 0.010459 0.832446 0.088156 0.068939 0.065319 0.068942 0.855832 0.009908 0.302838 0.065248 0.380949 0.250965 MOTIF Forebrain_E11.5_H3K27ac_25_17_0.556_3.820465e-80 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.025159 0.764619 0.19107 0.019152 0.096909 0.021102 0.755795 0.126195 0.087687 0.76614 0.061067 0.085105 0.081208 0.668746 0.056134 0.193913 0.021844 0.0 0.078712 0.899444 0.00601 0.96722 0.002833 0.023937 0.042622 0.880465 0.029488 0.047426 0.040332 0.726016 0.093982 0.13967 0.099891 0.032779 0.814645 0.052685 MOTIF Neural-Tube_E12.5_H3K27ac_12_11_0.567_4.682054e-56 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.087378 0.7854 0.10087 0.026351 0.041387 0.023292 0.879052 0.056269 0.056143 0.677981 0.179178 0.086698 0.025636 0.806763 0.060048 0.107553 0.048205 0.072623 0.054867 0.824305 0.012436 0.840998 0.05384 0.092726 0.02296 0.781599 0.074558 0.120883 0.06276 0.747937 0.068678 0.120625 0.073099 0.06664 0.823778 0.036483 MOTIF Cranio-Facial_E14.5_H3K4me3_40_54_0.650_3.079728e-311 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.239444 0.60482 0.058984 0.096752 0.010251 0.049905 0.904204 0.03564 0.079197 0.704825 0.027727 0.18825 0.080312 0.108651 0.093101 0.717935 0.05622 0.024504 0.052466 0.866811 0.010672 0.966198 0.0 0.02313 0.0 0.834267 0.086805 0.078927 0.022181 0.914333 0.029979 0.033507 0.117952 0.021772 0.704256 0.15602 MOTIF Midbrain_E16.5_H3K4me3_44_20_0.628_5.477976e-314 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.021178 0.904357 0.022294 0.052171 0.110445 0.825163 0.034367 0.030025 0.033798 0.020075 0.834774 0.111352 0.105507 0.1836 0.699156 0.011737 0.00738 0.017291 0.97233 0.002998 0.922208 0.013773 0.017529 0.04649 0.219795 0.221457 0.538329 0.020419 0.167992 0.063626 0.747228 0.021154 0.044056 0.838752 0.075546 0.041646 0.088432 0.258279 0.453639 0.19965 0.581656 0.100536 0.281319 0.036489 0.296186 0.597525 0.106288 0.0 MOTIF Liver_E16.5_H3K4me3_41_13_0.618_1.378708e-312 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.174269 0.811458 0.014273 0.0 0.014553 0.021528 0.712469 0.251451 0.011871 0.895758 0.063071 0.0293 0.066881 0.842606 0.055107 0.035406 0.048473 0.074449 0.019449 0.857629 0.016781 0.86625 0.015077 0.101892 0.106588 0.620542 0.05066 0.222209 0.009548 0.933199 0.04299 0.014262 0.074154 0.06381 0.820304 0.041732 0.123082 0.256344 0.455559 0.165016 0.027609 0.071885 0.410547 0.489958 0.006821 0.329364 0.642401 0.021414 MOTIF Hindbrain_E11.5_H3K4me3_53_24_0.625_3.78939e-314 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.014152 0.862466 0.043386 0.079996 0.100478 0.730114 0.070296 0.099111 0.0341 0.035152 0.744486 0.186261 0.054367 0.797832 0.067411 0.08039 0.03612 0.831174 0.032726 0.09998 0.046868 0.020619 0.041198 0.891315 0.025186 0.781006 0.0735 0.120307 0.033251 0.831992 0.041074 0.093682 0.029494 0.871722 0.035706 0.063078 0.067236 0.05083 0.524717 0.357217 MOTIF Neural-Tube_E13.5_H3K4me3_47_22_0.627_2.829501e-316 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.012439 0.84142 0.063856 0.082286 0.113008 0.69947 0.071234 0.116288 0.035334 0.059759 0.810321 0.094586 0.048737 0.756892 0.080088 0.114283 0.051841 0.738812 0.059204 0.150142 0.040564 0.030139 0.032292 0.897005 0.030912 0.859429 0.025458 0.0842 0.022591 0.852019 0.024219 0.101171 0.027809 0.807154 0.025095 0.139942 0.058627 0.108608 0.475073 0.357692 MOTIF Neural-Tube_E14.5_H3K4me3_62_15_0.606_1.933295e-194 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.140773 0.215952 0.173326 0.46995 0.014243 0.831555 0.060999 0.093203 0.087927 0.82334 0.030619 0.058114 0.035517 0.049997 0.701986 0.2125 0.039871 0.728329 0.145188 0.086612 0.038648 0.799995 0.054219 0.107138 0.043472 0.010141 0.034864 0.911523 0.01216 0.808835 0.109247 0.069758 0.03467 0.836528 0.029825 0.098976 0.035154 0.874804 0.035681 0.054361 0.058651 0.208586 0.356935 0.375828 MOTIF Hindbrain_E12.5_H3K4me3_18_19_0.686_4.063677e-310 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.097407 0.593344 0.16522 0.144029 0.070468 0.067834 0.766303 0.095396 0.079825 0.731975 0.081355 0.106845 0.069392 0.740047 0.034893 0.155668 0.116304 0.044486 0.074515 0.764695 0.003039 0.909293 0.024702 0.062966 0.011682 0.864354 0.029479 0.094485 0.101972 0.825296 0.043469 0.029264 0.076934 0.024054 0.860712 0.0383 0.043256 0.810055 0.142933 0.003756 MOTIF Hindbrain_E16.5_H3K4me3_37_26_0.629_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.181543 0.376463 0.139841 0.302154 0.098672 0.09293 0.744966 0.063432 0.075689 0.689509 0.044245 0.190557 0.068763 0.683903 0.050498 0.196835 0.07754 0.046191 0.041409 0.83486 0.003128 0.946235 0.029725 0.020912 0.012743 0.887923 0.010602 0.088732 0.144571 0.759523 0.061795 0.034111 0.023002 0.017183 0.872437 0.087377 0.012192 0.840224 0.102701 0.044882 MOTIF Midbrain_E12.5_H3K4me3_49_19_0.623_6.210405e-321 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.026496 0.048247 0.844811 0.080446 0.023321 0.791638 0.05609 0.128951 0.014192 0.827987 0.036667 0.121154 0.104675 0.028655 0.054849 0.811821 0.004349 0.944096 0.035015 0.01654 0.05874 0.803064 0.092405 0.045791 0.128134 0.800806 0.045242 0.025817 0.066964 0.014489 0.825661 0.092886 0.055478 0.701216 0.231774 0.011532 0.400719 0.156923 0.34633 0.096028 MOTIF Hindbrain_E13.5_H3K4me3_31_16_0.662_2.227248e-320 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.067563 0.416425 0.387051 0.128961 0.085623 0.080764 0.668663 0.16495 0.027136 0.797624 0.065197 0.110044 0.061281 0.714351 0.112928 0.111441 0.113634 0.030959 0.034237 0.82117 0.003642 0.894607 0.043852 0.057898 0.037825 0.870593 0.036196 0.055385 0.102074 0.741925 0.043786 0.112214 0.045643 0.033101 0.859236 0.062019 0.039917 0.86609 0.08354 0.010453 0.242452 0.259536 0.405335 0.092677 MOTIF Stomach_E16.5_H3K4me3_38_15_0.631_2.358077e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.07025 0.042972 0.747668 0.139109 0.047893 0.748603 0.086028 0.117476 0.046672 0.808929 0.032008 0.112392 0.072656 0.02334 0.07352 0.830484 0.005307 0.842256 0.070084 0.082353 0.048365 0.846484 0.034742 0.070408 0.102788 0.825983 0.043047 0.028182 0.079362 0.015225 0.818949 0.086464 0.058227 0.813929 0.089845 0.037999 0.168682 0.17445 0.511984 0.144885 MOTIF Limb_E13.5_H3K4me3_44_16_0.640_2.136381e-315 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.01355 0.645491 0.340959 0.0 0.138098 0.027492 0.220149 0.614261 0.081429 0.799809 0.051067 0.067694 0.046273 0.053994 0.874143 0.02559 0.06865 0.858472 0.033329 0.039549 0.020886 0.692376 0.075098 0.211639 0.101112 0.055146 0.02243 0.821312 0.001654 0.882645 0.01745 0.098251 0.027131 0.810387 0.029305 0.133177 0.043116 0.757693 0.053038 0.146152 0.048242 0.052856 0.731335 0.167567 MOTIF Midbrain_E12.5_H3K4me3_32_15_0.670_2.74119e-313 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.044686 0.55599 0.399323 0.0 0.043052 0.052099 0.319138 0.585711 0.068962 0.81696 0.05002 0.064057 0.073803 0.081003 0.833615 0.01158 0.125603 0.790076 0.051666 0.032656 0.010255 0.821763 0.057855 0.110127 0.130189 0.055065 0.033044 0.781701 0.025687 0.788227 0.147671 0.038414 0.053084 0.883879 0.035822 0.027215 0.112421 0.791752 0.050702 0.045125 0.02783 0.012382 0.841504 0.118285 MOTIF Stomach_E15.5_H3K4me3_16_15_0.696_3.247041e-311 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.197367 0.39017 0.280457 0.132007 0.061324 0.830273 0.062464 0.04594 0.092153 0.040011 0.795392 0.072443 0.108035 0.584517 0.20451 0.102938 0.022089 0.872083 0.056363 0.049466 0.119062 0.032565 0.019268 0.829105 0.021118 0.849972 0.024648 0.104263 0.006421 0.880512 0.026036 0.087031 0.033963 0.793427 0.131439 0.04117 0.093452 0.046368 0.814149 0.04603 MOTIF Stomach_E16.5_H3K4me3_29_14_0.659_6.557648e-314 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.123089 0.138159 0.446597 0.292155 0.118375 0.744682 0.09763 0.039313 0.062654 0.049696 0.849274 0.038375 0.095642 0.48716 0.235781 0.181417 0.021097 0.891268 0.039718 0.047917 0.049404 0.041315 0.02254 0.886741 0.019051 0.865952 0.026174 0.088822 0.028347 0.865335 0.027525 0.078793 0.093364 0.802049 0.058404 0.046184 0.055193 0.038959 0.795854 0.109995 MOTIF Forebrain_E14.5_H3K4me3_34_20_0.680_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.185002 0.188691 0.183036 0.44327 0.064701 0.85458 0.063807 0.016911 0.039652 0.079273 0.714742 0.166333 0.105083 0.689772 0.048759 0.156386 0.021801 0.710976 0.048024 0.219198 0.058461 0.035401 0.038885 0.867254 0.014684 0.838389 0.070141 0.076786 0.010463 0.947971 0.006963 0.034602 0.125515 0.796558 0.048492 0.029434 0.035725 0.023647 0.824948 0.115681 MOTIF Heart_E12.5_H3K4me3_23_20_0.660_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.088841 0.77478 0.036663 0.099716 0.033316 0.047516 0.876908 0.04226 0.090602 0.835098 0.030989 0.043311 0.019252 0.735324 0.068738 0.176686 0.096899 0.076139 0.051734 0.775227 0.016522 0.870322 0.084253 0.028903 0.048145 0.869952 0.052968 0.028935 0.119725 0.570135 0.156686 0.153455 0.028056 0.029374 0.916557 0.026013 MOTIF Liver_P0_H3K4me3_39_30_0.623_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.093825 0.842183 0.045875 0.018116 0.104608 0.053095 0.782121 0.060175 0.100662 0.791619 0.072151 0.035568 0.014789 0.876114 0.064535 0.044562 0.0492 0.037541 0.042914 0.870345 0.009241 0.850086 0.018953 0.12172 0.036656 0.928582 0.022985 0.011778 0.161383 0.591248 0.032292 0.215077 0.023302 0.01707 0.770294 0.189334 MOTIF Limb_E12.5_H3K4me3_27_14_0.647_1.208668e-317 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.501845 0.0 0.420264 0.077891 0.016768 0.790024 0.131335 0.061874 0.106532 0.043568 0.80676 0.04314 0.072451 0.692182 0.059309 0.176059 0.022523 0.867497 0.03638 0.0736 0.057989 0.063601 0.013058 0.865352 0.030858 0.917144 0.025815 0.026183 0.045016 0.758654 0.08138 0.114949 0.031214 0.816694 0.133476 0.018615 0.101534 0.058062 0.756592 0.083812 MOTIF Limb_E14.5_H3K4me3_28_12_0.680_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.066307 0.818403 0.074691 0.0406 0.067313 0.057903 0.735884 0.1389 0.04227 0.660952 0.233294 0.063483 0.025725 0.879252 0.047146 0.047877 0.067049 0.043572 0.050295 0.839084 0.012503 0.882906 0.037657 0.066934 0.03261 0.775848 0.10029 0.091252 0.025006 0.808155 0.064172 0.102667 0.086345 0.036373 0.759551 0.117731 0.027221 0.267763 0.636754 0.068261 MOTIF Cranio-Facial_E13.5_H3K4me3_28_18_0.668_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.317033 0.022508 0.422317 0.238143 0.079062 0.793208 0.042259 0.085472 0.021531 0.0429 0.779679 0.15589 0.117247 0.691181 0.065707 0.125865 0.106225 0.701096 0.044833 0.147847 0.044588 0.02799 0.080125 0.847297 0.006937 0.888969 0.016158 0.087937 0.05316 0.903578 0.024164 0.019098 0.116575 0.789436 0.059501 0.034488 0.091378 0.038311 0.809629 0.060682 MOTIF Heart_E14.5_H3K4me3_32_27_0.639_1.935818e-312 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.156912 0.717589 0.028665 0.096833 0.114145 0.045677 0.797909 0.042269 0.106706 0.746068 0.094184 0.053043 0.018723 0.901674 0.040953 0.03865 0.156573 0.025824 0.026662 0.790941 0.005976 0.873269 0.037479 0.083276 0.047203 0.792348 0.038934 0.121514 0.154511 0.763873 0.060637 0.020979 0.034392 0.031273 0.799162 0.135173 MOTIF Liver_E13.5_H3K4me3_37_22_0.624_1.89604e-311 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.080084 0.724611 0.112458 0.082847 0.09947 0.067125 0.647207 0.186197 0.019005 0.845028 0.056069 0.079898 0.018299 0.880112 0.039028 0.062561 0.050538 0.046949 0.0057 0.896813 0.020641 0.862109 0.054734 0.062516 0.047685 0.802627 0.057417 0.09227 0.081664 0.778292 0.092027 0.048017 0.119739 0.021042 0.781845 0.077375 MOTIF Cranio-Facial_E11.5_H3K4me3_26_18_0.687_2.983377e-313 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.06008 0.863912 0.039766 0.036242 0.031268 0.04946 0.778242 0.14103 0.037023 0.660973 0.195668 0.106336 0.021699 0.786489 0.055582 0.13623 0.04786 0.041202 0.046359 0.864579 0.005332 0.921307 0.041748 0.031614 0.023332 0.874635 0.024874 0.077158 0.128064 0.693369 0.057407 0.121159 0.076798 0.030092 0.773745 0.119365 MOTIF Lung_P0_H3K4me3_30_22_0.655_4.083183e-312 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.023059 0.889366 0.023945 0.06363 0.111045 0.03791 0.745996 0.105049 0.068252 0.737568 0.092809 0.101371 0.013864 0.819612 0.036615 0.129909 0.108234 0.041662 0.012765 0.837339 0.024215 0.900807 0.03661 0.038369 0.042773 0.803848 0.03594 0.117439 0.084225 0.761861 0.048309 0.105605 0.101153 0.053417 0.668891 0.176539 MOTIF Forebrain_E11.5_H3K4me3_38_22_0.671_1.676816e-313 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.0814 0.73915 0.111324 0.068127 0.035753 0.089772 0.799703 0.074772 0.086352 0.729065 0.06528 0.119302 0.066782 0.767301 0.056028 0.109888 0.114306 0.032869 0.039294 0.813532 0.002734 0.866623 0.01804 0.112603 0.05398 0.863094 0.027659 0.055266 0.037773 0.85992 0.068295 0.034011 0.06368 0.029209 0.71852 0.18859 MOTIF Neural-Tube_E15.5_H3K4me3_23_19_0.674_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.079925 0.813693 0.03748 0.068902 0.076331 0.049498 0.73634 0.137832 0.038506 0.767578 0.081911 0.112005 0.074326 0.729234 0.056321 0.140119 0.093202 0.033878 0.050626 0.822293 0.002302 0.926253 0.020667 0.050778 0.044595 0.842889 0.037769 0.074746 0.091338 0.806495 0.060716 0.041451 0.073576 0.039437 0.763079 0.123908 MOTIF Cranio-Facial_E15.5_H3K4me3_12_14_0.702_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.072407 0.84222 0.033257 0.052116 0.089215 0.045447 0.798549 0.066789 0.079254 0.752277 0.085121 0.083348 0.062723 0.734648 0.048199 0.154431 0.084191 0.037462 0.062092 0.816255 0.021522 0.815938 0.071791 0.090749 0.009022 0.872061 0.049607 0.069311 0.089671 0.735068 0.138865 0.036395 0.065295 0.038441 0.845266 0.050998 MOTIF Stomach_P0_H3K4me3_18_16_0.696_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.092572 0.749184 0.045393 0.112851 0.040841 0.050138 0.826579 0.082441 0.087676 0.772792 0.071509 0.068024 0.04801 0.71788 0.079113 0.154997 0.078135 0.067051 0.055011 0.799803 0.022692 0.847519 0.058161 0.071629 0.0478 0.813752 0.051667 0.086781 0.031462 0.833647 0.107839 0.027053 0.080337 0.036102 0.809415 0.074145 MOTIF Forebrain_E15.5_H3K9ac_32_13_0.612_2.183228e-311 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.047527 0.759806 0.119446 0.073222 0.075064 0.075421 0.849515 0.0 0.071303 0.627646 0.260622 0.040428 0.020693 0.791855 0.070471 0.116981 0.074585 0.004342 0.040354 0.880718 0.001875 0.939941 0.022587 0.035597 0.028759 0.902697 0.028689 0.039854 0.072527 0.668162 0.216882 0.042429 0.017878 0.020602 0.87961 0.081911 0.719261 0.047302 0.186508 0.046929 0.021154 0.815923 0.12133 0.041592 0.018777 0.501208 0.039501 0.440514