MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Cranio-Facial_E13.5_H3K27me3_4_5_0.533_4.450909e-75 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.183118 0.192508 0.538426 0.085948 0.756886 0.066333 0.080346 0.096434 0.137506 0.014069 0.827888 0.020537 0.19656 0.646049 0.0549 0.10249 0.034905 0.922209 0.033407 0.009479 0.045032 0.055213 0.886954 0.012802 0.088572 0.86119 0.034642 0.015597 0.034071 0.06055 0.898264 0.007115 0.015736 0.595718 0.050749 0.337797 0.042486 0.045538 0.896967 0.015009 MOTIF Cranio-Facial_E15.5_H3K27me3_2_8_0.543_6.045131e-67 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.821129 0.025689 0.097438 0.055743 0.102751 0.040686 0.837783 0.018779 0.234613 0.624953 0.04532 0.095115 0.042204 0.897878 0.057242 0.002676 0.136783 0.041249 0.809922 0.012046 0.0 0.936055 0.054338 0.009606 0.013562 0.059025 0.917417 0.009995 0.020335 0.702676 0.066462 0.210527 0.156478 0.041188 0.615558 0.186776 0.079504 0.017901 0.379337 0.523257 MOTIF Cranio-Facial_E15.5_H3K4me2_20_12_0.630_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.058312 0.880453 0.017243 0.043992 0.063031 0.856568 0.00873 0.071671 0.029477 0.023878 0.93783 0.008815 0.013392 0.76754 0.039632 0.179436 0.005087 0.006782 0.988131 0.0 0.38651 0.359542 0.051391 0.202557 0.020436 0.003338 0.925564 0.050661 0.021621 0.013115 0.912847 0.052417 0.0527 0.64474 0.051976 0.250584 0.299397 0.34996 0.114671 0.235972 MOTIF Forebrain_E12.5_H3K4me2_9_10_0.661_2.029218e-313 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.054206 0.891415 0.030892 0.023487 0.396761 0.539467 0.034272 0.029501 0.118811 0.087588 0.76413 0.029472 0.05953 0.651202 0.037248 0.252019 0.010296 0.015518 0.946302 0.027883 0.03999 0.91948 0.01008 0.03045 0.031479 0.006886 0.928898 0.032737 0.124437 0.023871 0.790338 0.061353 0.058104 0.905055 0.015216 0.021625 0.19249 0.406468 0.262017 0.139025 MOTIF Limb_E14.5_H3K4me2_3_18_0.691_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.818627 0.076261 0.053084 0.052029 0.141481 0.06711 0.587378 0.204031 0.146357 0.844294 0.0 0.009349 0.095917 0.830613 0.021693 0.051776 0.029249 0.047414 0.905898 0.01744 0.250298 0.722116 0.0 0.027586 0.028585 0.020487 0.930636 0.020291 0.040355 0.909299 0.034231 0.016115 0.025028 0.036305 0.772854 0.165813 MOTIF Cranio-Facial_E11.5_H3K4me2_21_12_0.660_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.04238 0.927891 0.0 0.029729 0.278501 0.662586 0.008296 0.050618 0.026177 0.020547 0.911368 0.041908 0.044507 0.856514 0.031966 0.067014 0.07537 0.048593 0.701703 0.174333 0.178753 0.566059 0.102136 0.153052 0.016343 0.0 0.92068 0.062977 0.057095 0.010384 0.893671 0.038851 0.036496 0.788369 0.066055 0.109081 MOTIF Liver_E16.5_H3K4me2_8_10_0.630_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.055661 0.882948 0.031903 0.029488 0.146455 0.669821 0.040498 0.143226 0.066344 0.064657 0.82048 0.048519 0.025889 0.927932 0.030421 0.015759 0.058284 0.046612 0.794096 0.101008 0.090829 0.806844 0.037594 0.064733 0.138702 0.017877 0.66533 0.178091 0.017113 0.018992 0.930695 0.0332 0.078523 0.768823 0.086386 0.066268 MOTIF Heart_P0_H3K4me2_7_4_0.634_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.145091 0.76499 0.076703 0.013216 0.031309 0.037723 0.798353 0.132615 0.019877 0.849037 0.051956 0.07913 0.09188 0.032935 0.68951 0.185674 0.01956 0.832826 0.036932 0.110682 0.131076 0.02157 0.787993 0.05936 0.072275 0.032631 0.771018 0.124075 0.018591 0.895829 0.055982 0.029598 0.048775 0.866364 0.05315 0.03171 0.11826 0.357424 0.368152 0.156164 MOTIF Midbrain_E16.5_H3K4me2_6_2_0.672_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.468731 0.180992 0.107617 0.24266 0.098353 0.80419 0.071065 0.026391 0.030951 0.06425 0.879063 0.025736 0.086842 0.8154 0.042485 0.055272 0.054381 0.036588 0.811094 0.097937 0.063046 0.839944 0.036142 0.060868 0.116773 0.04253 0.686228 0.154469 0.065208 0.071948 0.767853 0.094991 0.076776 0.838032 0.06033 0.024861 0.055521 0.857794 0.031255 0.055431 0.084223 0.38114 0.310285 0.224352 MOTIF Hindbrain_E12.5_H3K4me2_5_2_0.698_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.035863 0.862748 0.044115 0.057274 0.05572 0.070857 0.83767 0.035754 0.108399 0.82763 0.037802 0.026168 0.031327 0.036935 0.858893 0.072844 0.088138 0.804616 0.029418 0.077827 0.046439 0.039062 0.776279 0.13822 0.068066 0.088785 0.756894 0.086254 0.092567 0.699404 0.099658 0.108371 0.021003 0.930403 0.015859 0.032734 0.32123 0.156409 0.254739 0.267623 0.074232 0.456381 0.398242 0.071145 MOTIF Cranio-Facial_E11.5_H3K4me2_2_3_0.721_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.105281 0.816509 0.04375 0.03446 0.029251 0.033066 0.854603 0.08308 0.067064 0.88095 0.023037 0.028949 0.042679 0.031449 0.847136 0.078736 0.090097 0.797453 0.03898 0.07347 0.124844 0.043611 0.684663 0.146882 0.065935 0.097095 0.719179 0.117791 0.107383 0.813976 0.042044 0.036598 0.021397 0.883797 0.044454 0.050352 0.402567 0.173981 0.28554 0.137911 MOTIF Neural-Tube_E11.5_H3K4me2_4_5_0.720_1.441816e-312 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.090309 0.759047 0.087531 0.063113 0.035063 0.052924 0.877997 0.034016 0.021168 0.903101 0.047082 0.028648 0.056169 0.057302 0.781466 0.105062 0.099882 0.777933 0.030415 0.09177 0.122048 0.043609 0.694813 0.13953 0.06976 0.041197 0.757886 0.131158 0.02848 0.854921 0.034931 0.081668 0.066612 0.876411 0.032631 0.024346 0.20749 0.176834 0.323729 0.291947 MOTIF Intestine_E14.5_H3K4me2_5_4_0.665_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.033336 0.866817 0.034045 0.065802 0.033247 0.08073 0.796866 0.089157 0.099128 0.751631 0.094486 0.054755 0.060925 0.046484 0.790976 0.101615 0.087286 0.778967 0.058249 0.075497 0.150757 0.037623 0.745862 0.065758 0.022585 0.029077 0.861393 0.086945 0.067719 0.852117 0.042571 0.037593 0.032447 0.863969 0.070631 0.032953 0.117087 0.25358 0.213081 0.416252 MOTIF Liver_P0_H3K4me2_4_4_0.626_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.118293 0.803469 0.055097 0.023141 0.022744 0.046915 0.833977 0.096364 0.03903 0.868904 0.036816 0.05525 0.024055 0.04292 0.81275 0.120275 0.029052 0.841467 0.047963 0.081518 0.03766 0.056279 0.787175 0.118886 0.068336 0.020647 0.76583 0.145187 0.074936 0.865253 0.033304 0.026507 0.06147 0.722548 0.173378 0.042604 MOTIF Liver_E14.5_H3K4me2_3_5_0.639_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.076526 0.821569 0.046381 0.055524 0.052096 0.04877 0.788499 0.110635 0.084532 0.804932 0.048505 0.062032 0.011245 0.025544 0.855452 0.107759 0.094877 0.788731 0.038967 0.077425 0.037412 0.068128 0.787778 0.106682 0.07447 0.098799 0.745054 0.081678 0.105743 0.838745 0.036042 0.01947 0.068796 0.846138 0.030518 0.054549 MOTIF Neural-Tube_E14.5_H3K4me2_3_4_0.709_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.100756 0.818587 0.05559 0.025067 0.073488 0.061847 0.839115 0.02555 0.081367 0.764169 0.098532 0.055933 0.017259 0.045327 0.831338 0.106075 0.132262 0.822054 0.015362 0.030322 0.09977 0.029896 0.812173 0.05816 0.059681 0.099348 0.745286 0.095685 0.081697 0.842979 0.048516 0.026808 0.048508 0.791397 0.109245 0.05085 MOTIF Neural-Tube_E15.5_H3K4me2_1_4_0.681_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.162571 0.763644 0.048126 0.025658 0.025427 0.049309 0.838247 0.087017 0.180828 0.738295 0.056758 0.02412 0.012114 0.023292 0.932775 0.031819 0.030133 0.897536 0.0 0.072331 0.154179 0.028949 0.765338 0.051534 0.071787 0.098903 0.708933 0.120377 0.109654 0.827719 0.032574 0.030053 0.014728 0.802541 0.149017 0.033714 MOTIF Cranio-Facial_E15.5_H3K4me2_19_11_0.633_8.274267e-314 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.032109 0.818631 0.14926 0.0 0.895313 0.006944 0.044327 0.053416 0.005075 0.061466 0.815592 0.117866 0.359334 0.401628 0.118203 0.120836 0.035223 0.919878 0.033118 0.011782 0.035402 0.058694 0.880855 0.025049 0.154318 0.771861 0.016474 0.057347 0.006613 0.025538 0.948145 0.019704 0.020008 0.888283 0.033643 0.058066 0.128843 0.261271 0.056139 0.553747 0.0 0.284305 0.715695 0.0 MOTIF Hindbrain_E13.5_H3K4me2_23_28_0.628_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.208146 0.679874 0.072043 0.039938 0.756725 0.029787 0.093929 0.119558 0.021123 0.032682 0.868797 0.077398 0.080655 0.834896 0.024334 0.060116 0.04022 0.909731 0.026899 0.02315 0.037488 0.016863 0.803489 0.142159 0.169424 0.633599 0.103719 0.093258 0.003947 0.014995 0.933513 0.047545 0.071075 0.90619 0.007498 0.015237 MOTIF Lung_E16.5_H3K4me2_39_38_0.587_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.029775 0.870194 0.087258 0.012774 0.86102 0.007424 0.0 0.131556 0.034531 0.005012 0.921291 0.039165 0.181021 0.741789 0.053026 0.024163 0.0 0.820481 0.146882 0.032637 0.19553 0.09756 0.665434 0.041475 0.015703 0.876919 0.062981 0.044396 0.123847 0.032311 0.625954 0.217888 0.027306 0.933529 0.0 0.039164 MOTIF Midbrain_E12.5_H3K4me2_19_26_0.625_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.019305 0.9069 0.062419 0.011376 0.876604 0.003746 0.042866 0.076785 0.007231 0.054996 0.890238 0.047535 0.209505 0.689552 0.034045 0.066898 0.039278 0.719501 0.222964 0.018257 0.132847 0.063205 0.745304 0.058644 0.035772 0.82114 0.051638 0.091451 0.026685 0.016214 0.715496 0.241606 0.030567 0.853643 0.02911 0.08668 MOTIF Stomach_P0_H3K4me2_24_48_0.623_1.585901e-318 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.943167 0.056833 0.0 0.0 0.017998 0.110896 0.871107 0.0 0.227474 0.772526 0.0 0.0 0.01169 0.792892 0.154062 0.041357 0.263834 0.0 0.736166 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.039658 0.0 0.867159 0.093183 0.009348 0.848508 0.014406 0.127738 0.13588 0.038 0.053272 0.772848 MOTIF Forebrain_P0_H3K4me3_36_168_0.660_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 MOTIF Kidney_E16.5_H3K4me3_37_20_0.641_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.099262 0.75379 0.053374 0.093574 0.052055 0.165294 0.655804 0.126847 0.122978 0.721485 0.034297 0.121239 0.044641 0.011219 0.8848 0.059341 0.014776 0.045635 0.916073 0.023517 0.06685 0.79588 0.099297 0.037972 0.101148 0.097477 0.01166 0.789715 0.010496 0.045763 0.872177 0.071564 0.087625 0.778936 0.046277 0.087162 MOTIF Liver_E13.5_H3K27me3_3_12_0.549_9.331598e-145 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.045042 0.730757 0.027169 0.197032 0.70621 0.175316 0.076583 0.04189 0.013253 0.021604 0.672785 0.292358 0.012406 0.839297 0.055199 0.093098 0.035605 0.773925 0.184777 0.005694 0.038957 0.041792 0.90737 0.01188 0.016903 0.956135 0.0 0.026962 0.019007 0.021746 0.959247 0.0 0.15579 0.792428 0.040502 0.01128 MOTIF Forebrain_E13.5_H3K27me3_3_12_0.531_2.772106e-50 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.328536 0.21466 0.314293 0.142511 0.242475 0.634163 0.056211 0.06715 0.879823 0.044521 0.028451 0.047205 0.128686 0.043716 0.666044 0.161554 0.025549 0.847735 0.042074 0.084642 0.028635 0.841352 0.088072 0.041942 0.041271 0.009307 0.936774 0.012647 0.120428 0.806904 0.043124 0.029544 0.011689 0.010459 0.949096 0.028755 0.118393 0.803655 0.047937 0.030015 MOTIF Cranio-Facial_E14.5_H3K27me3_17_13_0.558_7.27602e-74 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.111491 0.796068 0.090603 0.001838 0.85805 0.007791 0.076759 0.057401 0.075085 0.041188 0.767765 0.115961 0.02388 0.823805 0.060319 0.091996 0.017694 0.872616 0.052454 0.057236 0.042216 0.073349 0.873816 0.010619 0.224068 0.712621 0.023869 0.039442 0.010094 0.021925 0.810905 0.157076 0.099254 0.766915 0.033145 0.100686 0.10774 0.353816 0.278537 0.259907 MOTIF Stomach_E15.5_H3K27me3_10_17_0.552_1.843444e-43 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.084428 0.759978 0.097372 0.058222 0.855557 0.001882 0.093995 0.048566 0.010973 0.03887 0.881175 0.068982 0.119106 0.733386 0.107597 0.039911 0.035284 0.845189 0.063475 0.056053 0.132465 0.077474 0.769797 0.020263 0.164919 0.783826 0.032163 0.019092 0.016806 0.017631 0.852918 0.112644 0.092824 0.797245 0.057129 0.052803 MOTIF Heart_P0_H3K27me3_10_20_0.535_9.372453e-37 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.213027 0.714898 0.043174 0.028901 0.137819 0.745603 0.039308 0.07727 0.750999 0.035838 0.050582 0.162581 0.088283 0.074517 0.815099 0.022102 0.244641 0.612296 0.007161 0.135903 0.011054 0.943135 0.036416 0.009396 0.051852 0.047163 0.868043 0.032942 0.023595 0.953509 0.022896 0.0 0.036469 0.0 0.915818 0.047713 MOTIF Liver_E11.5_H3K27ac_10_17_0.562_7.074221e-135 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.226387 0.584871 0.043911 0.144831 0.889738 0.056546 0.014626 0.03909 0.005574 0.048485 0.93972 0.006221 0.253911 0.562412 0.05424 0.129437 0.034138 0.897502 0.06114 0.00722 0.052431 0.030117 0.910001 0.007451 0.118871 0.799691 0.043529 0.037909 0.002202 0.045257 0.931213 0.021329 0.179172 0.740022 0.062456 0.01835 0.182201 0.215556 0.230585 0.371658 MOTIF Forebrain_P0_H3K4me3_14_24_0.717_4.339884e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.931806 0.0 0.0 0.068194 0.085872 0.129766 0.748228 0.036134 0.151248 0.822472 0.01561 0.01067 0.065612 0.630538 0.04013 0.26372 0.02321 0.043483 0.906303 0.027004 0.05795 0.788122 0.068674 0.085254 0.02556 0.013962 0.946546 0.013933 0.131188 0.741284 0.011254 0.116274 0.007358 0.058514 0.760903 0.173225 MOTIF Cranio-Facial_E15.5_H3K4me3_35_40_0.635_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.018285 0.808387 0.138525 0.034803 0.846329 0.031624 0.090303 0.031744 0.0 0.015062 0.932517 0.052421 0.187761 0.691324 0.045765 0.07515 0.056108 0.910153 0.017682 0.016057 0.219812 0.030215 0.740147 0.009826 0.294101 0.554406 0.049948 0.101545 0.021678 0.050123 0.918095 0.010104 0.010813 0.871678 0.103385 0.014123 MOTIF Heart_E11.5_H3K4me3_26_35_0.659_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.013508 0.818796 0.07728 0.090415 0.907976 0.0 0.047548 0.044477 0.0 0.056177 0.939674 0.004149 0.355981 0.508756 0.042272 0.092991 0.036054 0.915305 0.040756 0.007885 0.220906 0.016335 0.722555 0.040204 0.003518 0.864263 0.052058 0.080161 0.043108 0.037336 0.888466 0.031091 0.099213 0.787132 0.105509 0.008147 MOTIF Kidney_P0_H3K4me3_10_155_0.716_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.025 0.057 0.382 0.536 0.022 0.807 0.075 0.096 0.053 0.135 0.766 0.046 0.09 0.78 0.103 0.027 0.038 0.087 0.605 0.27 0.043 0.074 0.445 0.439 0.001 0.991 0.007 0.001 0.392 0.023 0.001 0.584 MOTIF Heart_E15.5_H3K9ac_32_68_0.609_5.80162e-299 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.794403 0.068837 0.108796 0.027964 0.015175 0.084497 0.887383 0.012945 0.184741 0.815259 0.0 0.0 0.013668 0.908613 0.077719 0.0 0.134665 0.037522 0.605453 0.222361 0.0 1.0 0.0 0.0 0.229966 0.0 0.756615 0.013419 0.047068 0.754676 0.0 0.198256 0.034074 0.086405 0.056121 0.8234 MOTIF Hindbrain_E16.5_H3K9ac_31_36_0.591_8.392642e-250 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.015309 0.956118 0.025049 0.003524 0.787982 0.024422 0.029433 0.158164 0.011804 0.01908 0.898027 0.071089 0.230223 0.657061 0.079983 0.032734 0.030218 0.938619 0.004812 0.026351 0.048396 0.0 0.700177 0.251427 0.011074 0.96351 0.0 0.025416 0.028681 0.022109 0.677381 0.27183 0.073012 0.849758 0.0 0.07723 MOTIF Neural-Tube_E12.5_H3K9ac_17_39_0.629_9.23121e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.122499 0.841966 0.016433 0.019103 0.779493 0.016637 0.059016 0.144854 0.009134 0.036897 0.868207 0.085762 0.150096 0.754493 0.081594 0.013817 0.062082 0.85793 0.032523 0.047465 0.0326 0.041275 0.907443 0.018682 0.190844 0.664879 0.04369 0.100586 0.005881 0.028079 0.940076 0.025964 0.177091 0.595462 0.081188 0.14626