MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Kidney_E15.5_H3K27me3_2_6_0.538_2.717997e-101 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.047607 0.770843 0.00687 0.174679 0.124876 0.458504 0.077686 0.338933 0.017655 0.963923 0.014645 0.003777 0.03774 0.048218 0.880817 0.033225 0.101755 0.650109 0.162216 0.08592 0.055944 0.787201 0.098504 0.058351 0.010806 0.032193 0.947496 0.009505 0.041136 0.903466 0.020439 0.034959 0.018641 0.011535 0.969823 0.0 MOTIF Forebrain_E15.5_H3K27me3_4_7_0.539_2.539677e-52 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.031823 0.937034 0.0 0.031144 0.038009 0.848607 0.011993 0.101391 0.017877 0.800858 0.025046 0.156219 0.046908 0.032272 0.877774 0.043045 0.077191 0.505512 0.245306 0.17199 0.102325 0.645231 0.068702 0.183742 0.012129 0.032314 0.935211 0.020345 0.062923 0.811963 0.04117 0.083944 0.034926 0.0 0.902212 0.062862 0.1176 0.020314 0.475629 0.386457 0.037545 0.44276 0.074394 0.445301 MOTIF Cranio-Facial_E14.5_H3K27me3_4_8_0.584_5.862905e-138 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.02282 0.950677 0.0 0.026502 0.058564 0.798689 0.013628 0.129119 0.058603 0.696602 0.04117 0.203625 0.027888 0.020652 0.900596 0.050864 0.079881 0.71357 0.15854 0.048009 0.107863 0.64776 0.068915 0.175462 0.071316 0.059932 0.847011 0.021741 0.074487 0.782902 0.061516 0.081094 0.045017 0.006274 0.919376 0.029334 MOTIF Forebrain_E11.5_H3K27me3_5_8_0.556_6.034894e-89 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.024731 0.939757 0.008941 0.02657 0.031482 0.822101 0.050021 0.096396 0.034698 0.699797 0.039091 0.226414 0.031693 0.033003 0.887937 0.047367 0.073049 0.706733 0.178255 0.041963 0.086479 0.627483 0.07162 0.214417 0.108655 0.019119 0.852779 0.019447 0.110403 0.825294 0.045062 0.019241 0.019155 0.0 0.926476 0.054369 MOTIF Limb_E14.5_H3K27me3_9_11_0.578_3.926296e-81 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.028721 0.933258 0.0 0.03802 0.026922 0.835085 0.033457 0.104536 0.073386 0.770837 0.023728 0.132049 0.039707 0.010944 0.920413 0.028936 0.057414 0.860052 0.040157 0.042377 0.284515 0.451417 0.048378 0.21569 0.060592 0.037305 0.874417 0.027685 0.110152 0.728392 0.071812 0.089644 0.019714 0.0 0.930721 0.049565 MOTIF Cranio-Facial_E12.5_H3K4me2_13_5_0.652_7.57842e-314 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.019741 0.086048 0.102869 0.791342 0.005539 0.0 0.022902 0.971558 0.0 0.979489 0.01357 0.006942 0.031119 0.813933 0.106046 0.048902 0.032364 0.833567 0.06856 0.06551 0.040911 0.044923 0.76512 0.149047 0.030037 0.641919 0.289805 0.038238 0.06824 0.741037 0.074146 0.116577 0.027702 0.043275 0.879997 0.049026 0.083246 0.703442 0.139943 0.073369 0.018218 0.018402 0.908984 0.054396 0.05003 0.909005 0.020329 0.020637 MOTIF Kidney_E15.5_H3K4me2_4_2_0.662_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.267303 0.19139 0.367287 0.174019 0.090727 0.693739 0.036707 0.178827 0.056807 0.719305 0.179179 0.044709 0.093543 0.74515 0.036481 0.124826 0.117591 0.041459 0.784118 0.056833 0.045406 0.836383 0.060897 0.057314 0.06825 0.652085 0.15466 0.125005 0.031046 0.025959 0.89841 0.044586 0.110297 0.811232 0.055938 0.022533 0.019397 0.028888 0.894613 0.057102 0.048194 0.91587 0.018794 0.017142 MOTIF Hindbrain_E12.5_H3K4me2_2_3_0.713_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.036461 0.870534 0.038351 0.054654 0.04105 0.80517 0.074791 0.07899 0.05328 0.055889 0.770516 0.120315 0.04924 0.737888 0.201822 0.01105 0.156145 0.631176 0.083924 0.128755 0.020159 0.0924 0.853716 0.033725 0.103771 0.72287 0.110988 0.06237 0.019136 0.027961 0.902793 0.05011 0.073578 0.865156 0.037387 0.023878 0.305497 0.142132 0.455817 0.096554 MOTIF Limb_E12.5_H3K4me2_3_6_0.675_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.070633 0.812698 0.055023 0.061646 0.099703 0.753044 0.05381 0.093442 0.088793 0.045032 0.815098 0.051077 0.025631 0.869541 0.057651 0.047177 0.167444 0.613225 0.104046 0.115286 0.038032 0.097281 0.840581 0.024107 0.101701 0.748925 0.125652 0.023722 0.019448 0.021896 0.901251 0.057406 0.084145 0.821584 0.026815 0.067456 MOTIF Liver_P0_H3K27me3_11_6_0.571_2.133728e-170 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.112471 0.791082 0.059145 0.037301 0.084176 0.054558 0.731584 0.129682 0.063227 0.792873 0.126667 0.017233 0.194457 0.62376 0.052493 0.12929 0.012785 0.005083 0.949912 0.032219 0.13276 0.692901 0.153392 0.020947 0.030569 0.008121 0.848492 0.112817 0.020839 0.939908 0.014775 0.024477 0.038197 0.835294 0.075869 0.05064 MOTIF Midbrain_E12.5_H3K27me3_51_3_0.507_5.446332e-79 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.033732 0.697068 0.255706 0.013494 0.063904 0.038654 0.831994 0.065449 0.100031 0.640751 0.200521 0.058697 0.028909 0.862355 0.05754 0.051195 0.049454 0.031317 0.893186 0.026043 0.009008 0.938287 0.031035 0.02167 0.020728 0.043133 0.891069 0.04507 0.130347 0.58286 0.139348 0.147445 0.019219 0.865241 0.048872 0.066668 MOTIF Forebrain_E15.5_H3K27me3_7_2_0.537_1.667697e-64 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.022446 0.862269 0.033093 0.082192 0.100895 0.799338 0.052517 0.04725 0.088658 0.033594 0.713516 0.164231 0.061973 0.861536 0.059256 0.017235 0.192748 0.570651 0.051473 0.185129 0.018427 0.01417 0.955409 0.011994 0.126403 0.747577 0.050351 0.075669 0.027206 0.019588 0.899268 0.053938 0.019937 0.918614 0.046167 0.015283 0.17956 0.404208 0.261246 0.154986 MOTIF Hindbrain_E11.5_H3K27me3_4_1_0.562_5.919266e-81 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.352362 0.40466 0.0 0.242978 0.02876 0.878183 0.059634 0.033423 0.058828 0.773247 0.113979 0.053947 0.021999 0.044509 0.89695 0.036542 0.068667 0.859442 0.060135 0.011756 0.26876 0.387114 0.127453 0.216673 0.069011 0.017597 0.892018 0.021375 0.107658 0.830519 0.036414 0.025409 0.018876 0.033202 0.896564 0.051358 0.027303 0.926299 0.0251 0.021298 0.109194 0.248272 0.36553 0.277004 MOTIF Limb_E12.5_H3K27me3_17_2_0.514_3.260122e-67 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.120847 0.698753 0.06565 0.11475 0.104088 0.767799 0.022527 0.105585 0.039361 0.040273 0.776386 0.14398 0.067723 0.848666 0.031311 0.0523 0.044252 0.849873 0.054373 0.051502 0.122049 0.045723 0.796502 0.035726 0.036541 0.786763 0.068954 0.107742 0.091823 0.015505 0.865393 0.027279 0.075262 0.85413 0.013717 0.05689 0.360863 0.184568 0.334655 0.119913 MOTIF Forebrain_E16.5_H3K9ac_5_0_0.647_2.493952e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.412637 0.416376 0.075073 0.095914 0.262074 0.073992 0.644693 0.019241 0.288009 0.317791 0.305027 0.089173 0.35798 0.442245 0.067522 0.132253 0.139041 0.779654 0.048242 0.033063 0.044852 0.180183 0.745265 0.0297 0.049944 0.874625 0.045665 0.029767 0.086559 0.022057 0.841593 0.049791 0.043 0.047928 0.892261 0.016811 0.119312 0.759135 0.048079 0.073475 0.092437 0.093868 0.680762 0.132932 0.048314 0.056517 0.834231 0.060938 0.079821 0.85567 0.038253 0.026255 MOTIF Hindbrain_E14.5_H3K9ac_4_0_0.668_5.790412e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.334518 0.387328 0.203263 0.074891 0.108861 0.136734 0.636099 0.118305 0.253528 0.488094 0.094694 0.163683 0.450267 0.061963 0.130595 0.357175 0.032111 0.891578 0.054913 0.021398 0.07776 0.197638 0.673383 0.051219 0.046695 0.893953 0.035081 0.02427 0.069787 0.046405 0.763913 0.119894 0.040608 0.05866 0.870163 0.030569 0.127442 0.747806 0.053232 0.07152 0.09102 0.051884 0.724872 0.132225 0.065533 0.066221 0.840857 0.02739 0.031987 0.846665 0.043955 0.077393 MOTIF Liver_E15.5_H3K9ac_3_1_0.651_4.548533e-311 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.291057 0.410564 0.035042 0.263337 0.098743 0.801459 0.076908 0.022889 0.062828 0.144236 0.72607 0.066866 0.024745 0.898121 0.042737 0.034397 0.060831 0.040849 0.827778 0.070541 0.0373 0.172613 0.772757 0.017329 0.119204 0.776848 0.042133 0.061815 0.027671 0.114234 0.754793 0.103302 0.04681 0.163019 0.764681 0.02549 0.030169 0.886877 0.037193 0.045761 0.0 0.025956 0.524949 0.449096 MOTIF Intestine_E14.5_H3K9ac_6_1_0.701_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.207017 0.026359 0.711891 0.054733 0.067634 0.816926 0.092665 0.022775 0.067256 0.199092 0.672576 0.061076 0.030384 0.825989 0.08791 0.055716 0.092019 0.14613 0.63971 0.122141 0.033627 0.049447 0.901781 0.015145 0.094158 0.814444 0.036654 0.054743 0.072896 0.043204 0.775841 0.108059 0.054607 0.167733 0.759441 0.018219 0.028871 0.865085 0.046021 0.060022 MOTIF Lung_E14.5_H3K9ac_3_3_0.666_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.283045 0.03854 0.612701 0.065714 0.058206 0.856978 0.060734 0.024082 0.040334 0.163546 0.70637 0.08975 0.055059 0.890043 0.029648 0.025251 0.081397 0.06365 0.739054 0.115898 0.031554 0.077712 0.850018 0.040716 0.1275 0.725827 0.121292 0.025381 0.091777 0.048945 0.758161 0.101118 0.065387 0.047939 0.85751 0.029164 0.034274 0.85448 0.04968 0.061566 MOTIF Kidney_P0_H3K9ac_1_1_0.662_1.943611e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.378518 0.392553 0.127153 0.101776 0.289545 0.179382 0.478948 0.052124 0.102594 0.846289 0.036058 0.015058 0.068399 0.060403 0.749022 0.122176 0.024141 0.896957 0.026144 0.052759 0.078193 0.054075 0.815026 0.052705 0.051267 0.067326 0.839697 0.041711 0.115932 0.730862 0.035557 0.11765 0.084866 0.122835 0.678878 0.113422 0.058673 0.059362 0.846523 0.035442 0.041489 0.853523 0.041803 0.063186 MOTIF Forebrain_E12.5_H3K9ac_1_1_0.666_1.151417e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.244944 0.238732 0.448441 0.067883 0.086132 0.853405 0.042311 0.018152 0.060491 0.052243 0.787611 0.099655 0.042304 0.880865 0.053033 0.023798 0.084475 0.117265 0.733162 0.065099 0.042577 0.049612 0.862271 0.04554 0.137447 0.701013 0.053401 0.108139 0.086264 0.034451 0.767737 0.111548 0.062044 0.147966 0.741183 0.048807 0.04139 0.868559 0.05846 0.031592 MOTIF Midbrain_E12.5_H3K9ac_2_1_0.673_4.986644e-318 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.239516 0.267507 0.456276 0.036702 0.091602 0.836034 0.05859 0.013773 0.051049 0.052318 0.809404 0.087229 0.093499 0.840204 0.045115 0.021182 0.096324 0.118709 0.725507 0.05946 0.038293 0.052463 0.871764 0.037481 0.132376 0.722594 0.035374 0.109656 0.081621 0.056413 0.754703 0.107263 0.055898 0.177003 0.752265 0.014834 0.041944 0.862245 0.065578 0.030233 MOTIF Cranio-Facial_E15.5_H3K9ac_3_7_0.719_1.089184e-311 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.053876 0.882404 0.046163 0.017558 0.064625 0.053219 0.780032 0.102123 0.104109 0.855734 0.024747 0.01541 0.072553 0.062801 0.774924 0.089722 0.051493 0.062604 0.876516 0.009387 0.18243 0.644885 0.033381 0.139303 0.11009 0.068974 0.771777 0.04916 0.048339 0.084311 0.767812 0.099538 0.033719 0.850509 0.043873 0.071899 MOTIF Heart_E15.5_H3K9ac_2_3_0.672_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.089546 0.842893 0.035707 0.031854 0.054128 0.188751 0.662811 0.09431 0.059157 0.858568 0.051075 0.0312 0.088683 0.046434 0.784969 0.079913 0.037001 0.076607 0.870933 0.01546 0.112479 0.772308 0.039337 0.075876 0.086694 0.097827 0.687986 0.127493 0.0627 0.071041 0.830547 0.035711 0.041206 0.8586 0.048124 0.052069 MOTIF Liver_E11.5_H3K9ac_1_2_0.632_2.844005e-315 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.100929 0.804878 0.058221 0.035972 0.051519 0.167944 0.752773 0.027764 0.064205 0.818969 0.095432 0.021394 0.104806 0.039373 0.802571 0.05325 0.036558 0.064561 0.864741 0.034139 0.131027 0.741394 0.042419 0.08516 0.082907 0.051705 0.752065 0.113323 0.068453 0.072978 0.795209 0.06336 0.081142 0.855758 0.037572 0.025529 MOTIF Hindbrain_E11.5_H3K9ac_1_3_0.681_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.068135 0.88174 0.020241 0.029884 0.055342 0.06646 0.799384 0.078814 0.031183 0.885904 0.044783 0.03813 0.095896 0.078773 0.726297 0.099034 0.038573 0.145436 0.795656 0.020335 0.112558 0.794926 0.053406 0.039111 0.087532 0.091698 0.699131 0.121639 0.058585 0.131085 0.759248 0.051082 0.049556 0.829864 0.052591 0.067988 MOTIF Kidney_E15.5_H3K9ac_1_1_0.727_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.058629 0.828673 0.07492 0.037778 0.043492 0.098422 0.777746 0.08034 0.066079 0.862573 0.042727 0.028621 0.08201 0.101715 0.765036 0.051239 0.03678 0.110751 0.82261 0.029859 0.097721 0.765592 0.073889 0.062798 0.079197 0.104096 0.731059 0.085648 0.053975 0.142517 0.745452 0.058056 0.046751 0.84893 0.064054 0.040266 MOTIF Midbrain_E14.5_H3K9ac_3_3_0.670_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.077719 0.852075 0.031481 0.038726 0.06371 0.155529 0.700878 0.079884 0.054133 0.856218 0.06505 0.0246 0.072667 0.112255 0.697129 0.117949 0.032725 0.074914 0.856608 0.035752 0.09978 0.781699 0.041971 0.07655 0.082683 0.0518 0.766814 0.098703 0.056653 0.153232 0.747028 0.043087 0.038563 0.857127 0.045031 0.05928 MOTIF Heart_P0_H3K9ac_2_1_0.652_2.086255e-311 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.26219 0.397542 0.165441 0.174827 0.083287 0.831241 0.06537 0.020102 0.059737 0.136318 0.724424 0.079521 0.092922 0.834636 0.048894 0.023548 0.077237 0.053795 0.785437 0.083531 0.027953 0.055505 0.897732 0.018809 0.101077 0.804071 0.036084 0.058769 0.063761 0.156606 0.678962 0.100671 0.040496 0.094938 0.834388 0.030178 0.043635 0.855837 0.04509 0.055437 MOTIF Midbrain_E15.5_H3K9ac_2_0_0.715_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.377761 0.355756 0.099393 0.16709 0.084053 0.802353 0.082757 0.030837 0.041966 0.136977 0.760465 0.060591 0.042008 0.880998 0.051025 0.025969 0.080443 0.105019 0.760491 0.054048 0.030379 0.140211 0.810946 0.018465 0.108115 0.769028 0.070265 0.052592 0.091107 0.110319 0.70182 0.096754 0.046122 0.108323 0.807667 0.037888 0.044866 0.854438 0.063756 0.03694 MOTIF Hindbrain_E12.5_H3K9ac_3_1_0.654_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.168768 0.480974 0.295037 0.055221 0.119576 0.798645 0.051018 0.030761 0.036176 0.164657 0.739943 0.059223 0.044513 0.839385 0.091892 0.02421 0.064076 0.111462 0.723698 0.100764 0.032899 0.04574 0.87994 0.041421 0.09845 0.830306 0.042016 0.029229 0.088419 0.135542 0.673684 0.102355 0.057217 0.147079 0.763912 0.031792 0.036678 0.854941 0.073923 0.034457 MOTIF Midbrain_P0_H3K9ac_2_1_0.667_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.179811 0.44156 0.333091 0.045538 0.063522 0.852742 0.049432 0.034304 0.060276 0.151106 0.693373 0.095245 0.041412 0.848235 0.083773 0.02658 0.097712 0.149226 0.681914 0.071148 0.029533 0.038398 0.885025 0.047045 0.100584 0.832595 0.037418 0.029403 0.085671 0.112584 0.693517 0.108228 0.051135 0.15497 0.761824 0.032071 0.0446 0.85975 0.057615 0.038035 MOTIF Forebrain_E13.5_H3K9ac_1_7_0.644_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.08283 0.810483 0.05329 0.053396 0.15534 0.716178 0.048259 0.080223 0.110589 0.034243 0.703255 0.151913 0.046785 0.882062 0.052892 0.018261 0.062074 0.773632 0.1283 0.035994 0.029572 0.057804 0.87532 0.037304 0.138303 0.683251 0.15444 0.024007 0.017225 0.01399 0.919996 0.048789 0.08705 0.837049 0.068163 0.007738 MOTIF Liver_P0_H3K9ac_2_3_0.629_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.06696 0.820744 0.046077 0.066219 0.085911 0.779607 0.052529 0.081953 0.114865 0.045465 0.737405 0.102264 0.037374 0.834779 0.084639 0.043208 0.1406 0.548574 0.193438 0.117388 0.059311 0.119749 0.790022 0.030918 0.09237 0.778704 0.104971 0.023956 0.033903 0.055348 0.862177 0.048572 0.02893 0.909975 0.03271 0.028386 0.235046 0.190768 0.447584 0.126602 MOTIF Hindbrain_P0_H3K9ac_1_2_0.700_5.06133e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.074315 0.67935 0.189144 0.057191 0.043716 0.855548 0.032863 0.067873 0.136252 0.038929 0.773949 0.05087 0.024971 0.674152 0.244463 0.056414 0.069689 0.759754 0.134414 0.036142 0.02043 0.018337 0.929095 0.032138 0.124608 0.745022 0.059577 0.070793 0.044611 0.014688 0.900778 0.039924 0.111188 0.826834 0.039765 0.022213 0.305052 0.069383 0.486198 0.139368 MOTIF Midbrain_E16.5_H3K9ac_4_1_0.645_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.076162 0.775977 0.097534 0.050327 0.100381 0.802255 0.067817 0.029547 0.044333 0.053791 0.849013 0.052863 0.046962 0.802392 0.13893 0.011716 0.179192 0.691716 0.084948 0.044144 0.027923 0.010793 0.931434 0.02985 0.112479 0.610346 0.194137 0.083038 0.017529 0.027638 0.918426 0.036407 0.083171 0.817011 0.055048 0.04477 0.367012 0.245113 0.25842 0.129455 MOTIF Neural-Tube_E14.5_H3K9ac_2_3_0.689_7.943652e-318 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.063406 0.742385 0.088093 0.106116 0.067288 0.807094 0.058093 0.067525 0.123962 0.039409 0.785543 0.051085 0.055046 0.747706 0.182308 0.01494 0.162724 0.722809 0.081087 0.03338 0.023981 0.033473 0.913993 0.028553 0.110757 0.70315 0.161005 0.025088 0.016362 0.02193 0.933246 0.028462 0.059693 0.867521 0.051886 0.020899 0.424599 0.117776 0.314604 0.143021