MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Forebrain_E13.5_H3K27me3_24_46_0.514_6.205343e-51 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.030014 0.114594 0.738456 0.116936 0.023871 0.072461 0.898533 0.005135 0.092421 0.098682 0.069986 0.73891 0.07413 0.021424 0.891381 0.013065 0.037789 0.011522 0.928877 0.021812 0.01399 0.930313 0.028154 0.027543 0.092852 0.019809 0.237347 0.649992 0.006252 0.869429 0.067497 0.056822 0.591567 0.195846 0.056915 0.155672 0.011205 0.768333 0.007368 0.213094 0.828041 0.0 0.132098 0.039862 0.050067 0.273902 0.676031 0.0 MOTIF Liver_E15.5_H3K27me3_64_112_0.511_3.738386e-53 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.069725 0.164363 0.108996 0.656916 0.08358 0.021518 0.863231 0.03167 0.058041 0.002126 0.918457 0.021375 0.002167 0.784754 0.18332 0.029759 0.14906 0.008004 0.117774 0.725163 0.003298 0.936402 0.043842 0.016458 0.618046 0.197934 0.036835 0.147186 0.004159 0.892411 0.10343 0.0 0.803183 0.028171 0.152495 0.016151 MOTIF Hindbrain_E14.5_H3K9me3_27_6_0.525_4.666749e-23 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.053753 0.924367 0.008079 0.013801 0.033756 0.054209 0.000643 0.911391 0.152846 0.026996 0.787283 0.032875 0.062237 0.001965 0.16643 0.769368 0.181789 0.013974 0.777084 0.027153 0.876238 0.013603 0.089379 0.02078 0.139667 0.061195 0.779572 0.019566 0.084578 0.811905 0.061867 0.04165 0.031041 0.81961 0.011246 0.138104 0.853618 0.050546 0.037825 0.058011 0.144974 0.214912 0.432001 0.208113 0.318277 0.636266 0.035992 0.009465 0.710627 0.0 0.003776 0.285596 MOTIF Liver_P0_H3K9me3_13_27_0.538_5.80097e-33 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.08651 0.047046 0.04513 0.821314 0.092383 0.017955 0.845437 0.044225 0.030586 0.059906 0.89203 0.017477 0.021737 0.870371 0.016104 0.091787 0.034833 0.177719 0.035954 0.751495 0.010035 0.712571 0.009636 0.267758 0.848541 0.125685 0.007869 0.017905 0.018175 0.795815 0.095358 0.090652 0.884623 0.034312 0.053723 0.027342 0.06701 0.041678 0.735829 0.155482 0.55024 0.034053 0.051233 0.364474 0.075964 0.31354 0.351041 0.259455 0.055464 0.3044 0.312099 0.328037 MOTIF Hindbrain_E11.5_H3K9me3_33_123_0.524_0.0001633161 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.215048 0.753846 0.031106 0.0 0.034368 0.009371 0.019205 0.937055 0.032869 0.023041 0.907121 0.036969 0.136467 0.074105 0.040393 0.749035 0.026109 0.198937 0.758442 0.016512 0.859206 0.019328 0.031039 0.090427 0.017072 0.006457 0.942292 0.034179 0.004352 0.766338 0.182688 0.046622 0.0 0.942662 0.029891 0.027448 0.431995 0.052067 0.16893 0.347009 MOTIF Forebrain_E14.5_H3K9me3_37_89_0.519_1.267257e-05 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.049726 0.886054 0.018816 0.045404 0.027475 0.01042 0.015398 0.946707 0.041646 0.025617 0.932737 0.0 0.090778 0.004154 0.165081 0.739987 0.251791 0.00731 0.654642 0.086257 0.962733 0.001739 0.027945 0.007582 0.007377 0.024952 0.904075 0.063597 0.013127 0.651814 0.076897 0.258161 0.013006 0.711763 0.004014 0.271217 MOTIF Hindbrain_E13.5_H3K9me3_69_46_0.519_1.923349e-21 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.563704 0.200814 0.065969 0.169513 0.016754 0.95144 0.011539 0.020267 0.030666 0.011436 0.005073 0.952825 0.019408 0.05505 0.905057 0.020485 0.055885 0.0073 0.054502 0.882314 0.140149 0.014 0.81708 0.02877 0.706533 0.025326 0.240101 0.02804 0.087754 0.063498 0.783204 0.065545 0.121708 0.611272 0.178981 0.088038 MOTIF Cranio-Facial_E14.5_H3K9me3_99_74_0.508_3.424162e-09 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.030183 0.930504 0.039313 0.0 0.145693 0.038754 0.013263 0.80229 0.0594 0.145957 0.778074 0.016569 0.043895 0.006196 0.057738 0.89217 0.049814 0.002128 0.941658 0.006401 0.750129 0.010155 0.177273 0.062444 0.10366 0.08688 0.753427 0.056033 0.203314 0.622253 0.060526 0.113907 0.078407 0.78397 0.033874 0.103749 MOTIF Heart_P0_H3K9me3_63_31_0.520_3.499529e-32 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.080201 0.854314 0.026514 0.038971 0.087619 0.033346 0.003947 0.875089 0.080589 0.071112 0.839163 0.009135 0.075964 0.000586 0.045877 0.877574 0.16198 0.021748 0.815627 0.000644 0.743241 0.010996 0.130304 0.115458 0.109307 0.042459 0.802277 0.045957 0.121431 0.745376 0.078442 0.05475 0.103033 0.845758 0.01257 0.038639 MOTIF Cranio-Facial_E13.5_H3K9me3_63_58_0.518_1.212601e-21 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.036904 0.854655 0.032427 0.076014 0.088326 0.083468 0.019261 0.808945 0.072993 0.089981 0.821279 0.015748 0.031412 0.004375 0.03102 0.933193 0.07063 0.009656 0.890075 0.029639 0.645142 0.083542 0.198481 0.072835 0.054668 0.018163 0.863368 0.063801 0.044084 0.745083 0.167153 0.043681 0.058085 0.846858 0.026553 0.068504 MOTIF Kidney_E16.5_H3K9me3_59_68_0.522_1.0722e-30 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.052869 0.801476 0.030602 0.115053 0.110283 0.045832 0.018711 0.825174 0.054122 0.11691 0.808804 0.020164 0.020458 0.015392 0.074907 0.889243 0.052857 0.016353 0.927054 0.003737 0.730279 0.014187 0.166002 0.089532 0.106602 0.032366 0.830668 0.030364 0.108745 0.724206 0.116164 0.050885 0.086378 0.766824 0.025833 0.120966 MOTIF Limb_E13.5_H3K9me3_76_98_0.521_2.55614e-24 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.069602 0.784592 0.034286 0.11152 0.079906 0.059433 0.004508 0.856152 0.103511 0.104631 0.774476 0.017383 0.029907 0.01267 0.071364 0.886059 0.032434 0.018568 0.938091 0.010907 0.708947 0.040009 0.128885 0.122159 0.159137 0.008326 0.805498 0.027039 0.029608 0.741672 0.186825 0.041896 0.087424 0.807268 0.022078 0.08323 MOTIF Forebrain_P0_H3K9me3_80_15_0.513_3.321946e-06 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.082375 0.861114 0.041815 0.014696 0.036191 0.058986 0.014461 0.890362 0.150737 0.023428 0.791986 0.033849 0.063224 0.027088 0.165163 0.744525 0.121315 0.024998 0.843437 0.01025 0.880514 0.038155 0.038607 0.042724 0.126098 0.067645 0.764136 0.042122 0.039977 0.81332 0.064527 0.082176 0.027568 0.813858 0.006429 0.152146 0.712619 0.175337 0.020904 0.091141 0.210519 0.107017 0.303969 0.378495 MOTIF Hindbrain_P0_H3K9me3_66_47_0.516_1.950681e-06 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.093991 0.882611 0.00975 0.013648 0.056591 0.044466 0.001414 0.897529 0.088903 0.014368 0.860388 0.036342 0.096699 0.001593 0.29427 0.607438 0.215532 0.026938 0.750757 0.006773 0.933299 0.019963 0.032982 0.013756 0.042776 0.084807 0.802343 0.070074 0.039561 0.804759 0.113161 0.042519 0.043258 0.863689 0.01615 0.076903 0.663715 0.122399 0.09538 0.118506 MOTIF Midbrain_E16.5_H3K9me3_94_18_0.506_1.307896e-05 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.043504 0.939904 0.008468 0.008124 0.000981 0.018362 0.01479 0.965868 0.048767 0.019083 0.884159 0.047991 0.037262 0.005507 0.203676 0.753555 0.201689 0.012507 0.757448 0.028356 0.871912 0.010495 0.077062 0.040531 0.078294 0.051921 0.825673 0.044112 0.026836 0.664616 0.167557 0.140991 0.045672 0.888125 0.01675 0.049453 0.710691 0.165376 0.01382 0.110113 0.167409 0.207151 0.457468 0.167972 MOTIF Neural-Tube_E14.5_H3K9me3_75_88_0.507_0.000472321 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.071106 0.842863 0.05683 0.029201 0.009095 0.054698 0.016648 0.919559 0.082659 0.031956 0.852991 0.032394 0.056465 0.030188 0.217641 0.695705 0.102281 0.065296 0.824761 0.007662 0.778994 0.017787 0.097538 0.10568 0.049447 0.056265 0.862377 0.03191 0.037269 0.749384 0.030846 0.182501 0.05717 0.713606 0.005664 0.22356 MOTIF Cranio-Facial_E15.5_H3K9me3_44_47_0.517_1.639069e-05 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.077702 0.061513 0.065278 0.795507 0.067868 0.007807 0.890644 0.033681 0.037321 0.029693 0.899717 0.033269 0.036668 0.893468 0.026874 0.04299 0.01256 0.027607 0.037562 0.92227 0.006913 0.605788 0.013925 0.373374 0.82332 0.15601 0.012177 0.008493 0.008329 0.780488 0.115514 0.095669 0.805458 0.039414 0.136122 0.019006 0.132992 0.023649 0.765953 0.077406 0.390784 0.004888 0.005121 0.599207 MOTIF Hindbrain_E12.5_H3K9me3_31_12_0.529_1.512813e-85 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.067592 0.033259 0.052408 0.846741 0.05744 0.012199 0.892881 0.037479 0.027873 0.065226 0.769375 0.137527 0.034052 0.837291 0.059981 0.068676 0.025309 0.025747 0.031821 0.917124 0.013247 0.728227 0.010284 0.248242 0.822369 0.14101 0.0126 0.02402 0.028771 0.759575 0.151695 0.059959 0.899157 0.003724 0.04352 0.053599 0.166888 0.019543 0.779037 0.034532 MOTIF Forebrain_E14.5_H3K9me3_90_80_0.508_9.081276e-05 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.551555 0.126595 0.274217 0.047633 0.061549 0.040734 0.015587 0.882129 0.091693 0.004889 0.869827 0.033591 0.062292 0.087248 0.812935 0.037524 0.029487 0.897513 0.031218 0.041781 0.124182 0.028322 0.013541 0.833956 0.015253 0.781333 0.005173 0.198241 0.793174 0.177579 0.008907 0.02034 0.059035 0.659253 0.190688 0.091024 0.951055 0.015937 0.023872 0.009136 MOTIF Midbrain_E13.5_H3K9me3_53_84_0.525_2.152925e-26 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.078314 0.030423 0.047943 0.843319 0.04658 0.006866 0.907333 0.039221 0.059454 0.100764 0.767689 0.072093 0.102925 0.832721 0.02616 0.038194 0.187528 0.032997 0.012497 0.766978 0.020549 0.747586 0.020919 0.210947 0.797059 0.172056 0.011644 0.01924 0.042426 0.768602 0.1269 0.062071 0.960796 0.000456 0.02283 0.015918 MOTIF Midbrain_E14.5_H3K9me3_52_48_0.517_2.705596e-15 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.102859 0.035569 0.053162 0.80841 0.099194 0.006284 0.867803 0.02672 0.015112 0.134048 0.831787 0.019053 0.021297 0.933446 0.022085 0.023172 0.04609 0.030998 0.015505 0.907407 0.037693 0.769843 0.024504 0.16796 0.751709 0.215509 0.002575 0.030207 0.114467 0.741208 0.037591 0.106734 0.913688 0.002084 0.06717 0.017059 MOTIF Heart_E11.5_H3K9me3_14_24_0.537_2.103956e-34 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.109539 0.043339 0.048028 0.799094 0.079418 0.029502 0.837734 0.053345 0.07818 0.053137 0.831166 0.037517 0.034705 0.823451 0.045956 0.095889 0.137132 0.05359 0.041905 0.767373 0.004668 0.791905 0.068678 0.134749 0.796376 0.158675 0.022543 0.022406 0.01017 0.859406 0.063786 0.066637 0.865709 0.041054 0.044024 0.049213 0.103004 0.029945 0.598231 0.26882 0.324115 0.291815 0.208463 0.175607 MOTIF Cranio-Facial_E12.5_H3K9me3_33_95_0.523_2.709821e-17 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.104902 0.041942 0.062078 0.791078 0.046791 0.006537 0.901935 0.044737 0.098864 0.081791 0.805486 0.013859 0.112078 0.704315 0.033058 0.150549 0.151978 0.021606 0.087901 0.738515 0.019843 0.796097 0.010515 0.173545 0.799148 0.174365 0.016986 0.0095 0.032502 0.826372 0.113235 0.02789 0.839132 0.039159 0.061143 0.060566 MOTIF Cranio-Facial_E13.5_H3K9me3_35_76_0.526_5.32949e-21 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.094389 0.039925 0.063563 0.802123 0.068401 0.008681 0.877465 0.045453 0.100236 0.091006 0.799741 0.009017 0.072041 0.764135 0.017602 0.146222 0.172094 0.052649 0.064757 0.7105 0.006277 0.83946 0.006245 0.148017 0.861727 0.10885 0.022504 0.00692 0.058916 0.841144 0.035505 0.064436 0.896451 0.027974 0.062059 0.013515 MOTIF Hindbrain_E16.5_H3K9me3_56_21_0.520_4.577402e-22 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.077452 0.042716 0.043681 0.836152 0.057353 0.013443 0.902356 0.026848 0.094889 0.034032 0.73607 0.135009 0.048549 0.830738 0.034389 0.086324 0.160384 0.073085 0.020409 0.746121 0.012749 0.854656 0.008943 0.123652 0.854515 0.120616 0.006645 0.018224 0.037809 0.747549 0.117151 0.09749 0.853509 0.02421 0.090061 0.03222 0.030585 0.032707 0.827843 0.108865 MOTIF Forebrain_E16.5_H3K9me3_41_25_0.526_1.870233e-14 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.065758 0.026567 0.068441 0.839234 0.071176 0.008958 0.892345 0.027521 0.032763 0.034651 0.807207 0.125378 0.029804 0.793054 0.071264 0.105878 0.135977 0.044318 0.051517 0.768188 0.00217 0.849372 0.018212 0.130247 0.854952 0.094057 0.00399 0.047001 0.022423 0.756201 0.135116 0.08626 0.882465 0.019214 0.062641 0.03568 0.205973 0.03278 0.661036 0.100212 MOTIF Heart_E14.5_H3K9me3_15_17_0.542_1.013704e-123 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.061772 0.027925 0.042251 0.868051 0.077174 0.012662 0.886468 0.023697 0.079565 0.026927 0.849875 0.043632 0.017404 0.845465 0.067726 0.069405 0.092441 0.029167 0.036901 0.84149 0.004977 0.803164 0.018197 0.173662 0.841554 0.105368 0.011413 0.041665 0.017979 0.757944 0.137881 0.086196 0.87662 0.02647 0.051782 0.045129 0.242588 0.036478 0.592534 0.1284 MOTIF Heart_P0_H3K9me3_84_53_0.512_4.306158e-35 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.065339 0.030383 0.047559 0.856719 0.061357 0.00711 0.882649 0.048885 0.038346 0.022646 0.839141 0.099867 0.020951 0.761448 0.065195 0.152406 0.098062 0.053771 0.019429 0.828739 0.007254 0.820938 0.018767 0.153041 0.819881 0.10943 0.02431 0.04638 0.016068 0.74119 0.161335 0.081407 0.843174 0.035155 0.029816 0.091855 MOTIF Heart_E16.5_H3K9me3_17_58_0.547_2.379591e-111 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.065465 0.038288 0.041568 0.85468 0.082091 0.011589 0.858911 0.047409 0.073787 0.038292 0.857195 0.030725 0.021941 0.798438 0.056388 0.123234 0.093783 0.052212 0.045259 0.808745 0.002389 0.800456 0.021119 0.176036 0.802249 0.150439 0.013463 0.03385 0.027131 0.767095 0.128206 0.077568 0.834953 0.043378 0.040742 0.080927 MOTIF Kidney_E16.5_H3K9me3_25_58_0.533_1.786e-85 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.057997 0.066694 0.03363 0.84168 0.087481 0.008066 0.866579 0.037874 0.061786 0.044494 0.851889 0.041831 0.018288 0.81989 0.060962 0.10086 0.079453 0.034073 0.058477 0.827996 0.005224 0.779753 0.025503 0.189519 0.76867 0.192234 0.021992 0.017104 0.018274 0.781774 0.124966 0.074986 0.82584 0.044946 0.043645 0.085569 MOTIF Limb_E14.5_H3K9me3_49_84_0.521_2.458833e-26 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.078384 0.048032 0.064484 0.8091 0.083745 0.018981 0.827268 0.070006 0.054005 0.069169 0.835429 0.041397 0.018791 0.79447 0.055307 0.131433 0.103568 0.061444 0.050872 0.784115 0.004474 0.803652 0.0163 0.175575 0.858479 0.094577 0.022007 0.024936 0.035205 0.807167 0.093249 0.064378 0.81756 0.062703 0.034295 0.085442 MOTIF Limb_E13.5_H3K9me3_62_78_0.524_1.266804e-65 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.059425 0.050588 0.069658 0.820329 0.068878 0.013048 0.874875 0.043198 0.074084 0.050603 0.800361 0.074952 0.044104 0.776103 0.026486 0.153307 0.160904 0.033574 0.056907 0.748616 0.003881 0.866057 0.022509 0.107553 0.830268 0.134354 0.007578 0.027799 0.019081 0.745285 0.156887 0.078747 0.857902 0.035347 0.044627 0.062124 MOTIF Lung_E16.5_H3K9me3_33_53_0.539_1.629251e-27 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.068058 0.020056 0.048542 0.863344 0.086713 0.028592 0.847932 0.036763 0.072124 0.019047 0.876912 0.031916 0.020292 0.823619 0.043977 0.112112 0.125522 0.029099 0.073019 0.772359 0.008811 0.862742 0.017844 0.110604 0.857556 0.107724 0.016955 0.017765 0.019729 0.756721 0.155824 0.067726 0.839274 0.046566 0.058706 0.055454 MOTIF Liver_E13.5_H3K9me3_53_95_0.509_5.916782e-15 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.094262 0.047913 0.04467 0.813154 0.059098 0.040204 0.852456 0.048242 0.07707 0.076626 0.802739 0.043566 0.041953 0.81376 0.048899 0.095388 0.051105 0.082658 0.061169 0.805068 0.01777 0.80154 0.046093 0.134597 0.700498 0.184965 0.01016 0.104377 0.008416 0.826734 0.126804 0.038046 0.823876 0.045708 0.076854 0.053563 MOTIF Neural-Tube_E11.5_H3K9me3_59_72_0.507_0.0001125596 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.109366 0.041405 0.121154 0.728075 0.109559 0.005987 0.845082 0.039372 0.058398 0.121825 0.760287 0.05949 0.035185 0.818852 0.097585 0.048378 0.051196 0.06008 0.021125 0.867599 0.007098 0.865149 0.022232 0.10552 0.801015 0.158641 0.007529 0.032815 0.013672 0.788109 0.156503 0.041717 0.880817 0.030931 0.048557 0.039695 MOTIF Limb_E15.5_H3K9me3_35_98_0.519_0.0001214289 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.163296 0.056412 0.01928 0.761012 0.069702 0.012433 0.891128 0.026736 0.018437 0.051885 0.914925 0.014752 0.040722 0.838741 0.013093 0.107444 0.008021 0.034338 0.0293 0.92834 0.056327 0.675803 0.025384 0.242486 0.600233 0.369877 0.013106 0.016784 0.031821 0.872234 0.038383 0.057562 0.904514 0.084541 0.010944 0.0 MOTIF Stomach_P0_H3K9me3_42_141_0.519_1.536627e-05 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.133935 0.014167 0.022512 0.829386 0.03079 0.060224 0.88262 0.026366 0.033944 0.038937 0.897342 0.029777 0.012927 0.810337 0.035649 0.141086 0.013702 0.033295 0.021115 0.931888 0.047078 0.860761 0.033969 0.058192 0.627003 0.279062 0.016702 0.077233 0.010111 0.702143 0.158274 0.129473 0.798437 0.099478 0.094634 0.007451