MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Hindbrain_E14.5_H3K4me2_86_37_0.515_3.846068e-12 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.0 0.464039 0.447107 0.088855 0.483062 0.131894 0.043726 0.341318 0.077631 0.861274 0.039371 0.021724 0.560199 0.035238 0.30643 0.098133 0.023922 0.182723 0.776531 0.016825 0.035236 0.802041 0.118112 0.044611 0.028998 0.127032 0.790851 0.053119 0.010519 0.914202 0.052067 0.023212 0.651583 0.157134 0.076614 0.114669 0.0 0.814614 0.18511 0.000275 0.853202 0.040292 0.060693 0.045813 0.0 0.776399 0.214914 0.008687 0.841844 0.054255 0.052206 0.051695 MOTIF Intestine_E15.5_H3K4me2_92_54_0.518_4.984816e-20 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.390573 0.598634 0.010793 0.0 0.415543 0.025695 0.491289 0.067473 0.019781 0.175784 0.793187 0.011249 0.040528 0.862981 0.047338 0.049154 0.066071 0.172611 0.701018 0.060299 0.005958 0.836702 0.132551 0.024789 0.710729 0.162178 0.040106 0.086987 0.0 0.788218 0.206908 0.004874 0.865816 0.036009 0.036317 0.061858 0.0 0.757478 0.229374 0.013148 0.823473 0.053037 0.059055 0.064435 MOTIF Kidney_E16.5_H3K4me3_73_89_0.562_3.116001e-239 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.024959 0.017224 0.84327 0.114547 0.023056 0.917917 0.038327 0.020701 0.0 0.03249 0.922037 0.045473 0.005695 0.795958 0.131165 0.067183 0.682017 0.233325 0.026763 0.057895 0.0 0.92738 0.07262 0.0 0.919291 0.0 0.060817 0.019892 0.0 0.593491 0.406509 0.0 0.854545 0.116112 0.006111 0.023232 MOTIF Intestine_E15.5_H3K4me3_61_50_0.593_1.176284e-165 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.01992 0.913844 0.052637 0.013599 0.032005 0.056244 0.887118 0.024633 0.019212 0.899455 0.019964 0.061368 0.7893 0.053482 0.073626 0.083592 0.027313 0.764701 0.180919 0.027067 0.773519 0.051427 0.011895 0.163159 0.002537 0.739486 0.246995 0.010982 0.691483 0.059399 0.222469 0.026649 0.031737 0.925917 0.037355 0.004991 0.010761 0.012357 0.479531 0.497351 MOTIF Heart_E11.5_H3K4me3_79_52_0.512_8.127364e-65 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.022889 0.916771 0.042749 0.017591 0.103853 0.048608 0.824366 0.023173 0.025709 0.840022 0.101834 0.032435 0.848272 0.075117 0.054149 0.022462 0.030111 0.822818 0.139172 0.007899 0.786788 0.045047 0.031614 0.13655 0.002666 0.880993 0.107351 0.008989 0.702385 0.070093 0.207272 0.020249 0.014319 0.786692 0.174266 0.024723 MOTIF Heart_E12.5_H3K4me3_90_81_0.514_4.571756e-44 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.04977 0.866623 0.063184 0.020423 0.014225 0.070123 0.897511 0.018141 0.020694 0.785947 0.151274 0.042084 0.803196 0.068558 0.039181 0.089065 0.03402 0.775045 0.179388 0.011547 0.895323 0.020165 0.049552 0.03496 0.002575 0.764932 0.222037 0.010456 0.857976 0.044835 0.064359 0.03283 0.036387 0.643692 0.306674 0.013248 MOTIF Liver_E14.5_H3K4me3_75_77_0.536_4.895052e-55 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.008324 0.902284 0.063433 0.025959 0.01424 0.031875 0.928664 0.02522 0.004431 0.802046 0.135493 0.05803 0.852062 0.033926 0.083119 0.030893 0.014107 0.772436 0.203622 0.009835 0.847497 0.036741 0.051301 0.064461 0.0 0.746596 0.221794 0.03161 0.778974 0.089147 0.087187 0.044692 0.007346 0.750065 0.235177 0.007412 MOTIF Hindbrain_E15.5_H3K4me3_85_55_0.553_3.582644e-107 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.134874 0.112989 0.602779 0.149358 0.022668 0.919484 0.035766 0.022082 0.018887 0.051855 0.909126 0.020132 0.02073 0.76077 0.173177 0.045323 0.736012 0.045637 0.064778 0.153572 0.022264 0.911952 0.05899 0.006794 0.851447 0.032935 0.01692 0.098698 0.002258 0.805247 0.181975 0.010521 0.790907 0.026113 0.071708 0.111272 0.031602 0.723402 0.239471 0.005524 MOTIF Midbrain_E14.5_H3K4me3_80_85_0.535_5.589773e-68 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.140319 0.198296 0.608413 0.052972 0.009084 0.832535 0.124115 0.034266 0.0 0.08228 0.901494 0.016226 0.016679 0.82449 0.099 0.059832 0.709581 0.088216 0.059283 0.14292 0.0 0.932016 0.066857 0.001127 0.889484 0.0 0.052874 0.057642 0.005157 0.820808 0.174035 0.0 0.791959 0.004877 0.104941 0.098223 MOTIF Forebrain_E12.5_H3K27me3_11_13_0.513_3.854887e-41 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.205965 0.077175 0.647133 0.069727 0.034099 0.767549 0.107412 0.090939 0.796828 0.056739 0.092625 0.053809 0.008654 0.824697 0.103426 0.063222 0.866887 0.043278 0.074561 0.015274 0.004707 0.899995 0.078525 0.016772 0.855915 0.032926 0.086275 0.024883 0.010847 0.727629 0.180207 0.081317 0.921957 0.014039 0.04087 0.023134 MOTIF Midbrain_E12.5_H3K27me3_16_15_0.511_8.834904e-43 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.126074 0.092124 0.715652 0.066149 0.044825 0.821937 0.06223 0.071008 0.763085 0.071684 0.099919 0.065312 0.012117 0.878408 0.093512 0.015964 0.81623 0.07793 0.079051 0.026789 0.003679 0.813939 0.123786 0.058596 0.851616 0.045787 0.076145 0.026453 0.008657 0.747031 0.190789 0.053522 0.902219 0.026024 0.045883 0.025874 MOTIF Midbrain_E13.5_H3K27me3_67_19_0.500_1.931833e-11 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.171793 0.089128 0.684206 0.054872 0.028406 0.814289 0.095367 0.061938 0.786644 0.060452 0.105505 0.0474 0.014001 0.876736 0.092459 0.016804 0.812264 0.075124 0.089359 0.023253 0.0038 0.887865 0.094324 0.014011 0.847377 0.039998 0.091141 0.021484 0.008333 0.774542 0.176544 0.040581 0.746274 0.094034 0.093421 0.06627 MOTIF Hindbrain_E16.5_H3K27me3_66_48_0.502_1.642406e-06 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.193992 0.534867 0.211202 0.05994 0.026244 0.105399 0.749757 0.118601 0.040522 0.819764 0.062821 0.076893 0.768102 0.040436 0.099393 0.092068 0.002031 0.855682 0.112965 0.029322 0.872855 0.011382 0.0581 0.057662 0.013923 0.933462 0.038295 0.01432 0.836023 0.015363 0.062038 0.086576 0.020217 0.880619 0.055206 0.043958 MOTIF Limb_E11.5_H3K27me3_36_28_0.506_2.196313e-21 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.079437 0.662535 0.133341 0.124687 0.070481 0.097569 0.771941 0.060009 0.006778 0.895779 0.069006 0.028437 0.76464 0.047713 0.124007 0.063641 0.009886 0.877708 0.090927 0.021479 0.815159 0.031193 0.110494 0.043155 0.008505 0.900957 0.079454 0.011084 0.732656 0.035655 0.166727 0.064963 0.0125 0.84846 0.108357 0.030682 MOTIF Liver_E11.5_H3K27me3_68_23_0.502_8.107199e-27 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.130442 0.628874 0.139233 0.10145 0.096554 0.120252 0.706486 0.076708 0.015513 0.899749 0.060287 0.024452 0.768333 0.058877 0.114014 0.058777 0.007195 0.900383 0.075139 0.017282 0.822335 0.053999 0.084229 0.039437 0.006206 0.897855 0.082818 0.013121 0.746681 0.071391 0.124232 0.057696 0.01077 0.863655 0.094791 0.030785 MOTIF Lung_E16.5_H3K27me3_64_30_0.504_1.024536e-24 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.044211 0.782499 0.112481 0.060809 0.093618 0.134346 0.701725 0.070311 0.012968 0.889865 0.070946 0.02622 0.725294 0.103359 0.111801 0.059546 0.007766 0.899231 0.077573 0.01543 0.80209 0.034676 0.126291 0.036943 0.009993 0.915635 0.05868 0.015692 0.679102 0.133112 0.123427 0.06436 0.013707 0.858164 0.105155 0.022975 MOTIF Lung_P0_H3K27me3_46_45_0.507_5.367907e-10 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.050356 0.732727 0.157551 0.059366 0.025313 0.085265 0.850868 0.038555 0.0271 0.837156 0.102044 0.033701 0.700648 0.117498 0.091244 0.09061 0.021316 0.852131 0.110467 0.016086 0.717923 0.062273 0.126358 0.093447 0.016356 0.921047 0.044762 0.017836 0.869566 0.025846 0.076477 0.028111 0.018595 0.768867 0.139506 0.073032 MOTIF Stomach_E14.5_H3K27me3_45_28_0.504_4.878489e-09 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.475977 0.357388 0.115265 0.051369 0.357502 0.514085 0.043785 0.084627 0.045227 0.797194 0.108047 0.049532 0.027297 0.108977 0.818735 0.044991 0.023267 0.821533 0.13318 0.02202 0.650221 0.188055 0.090792 0.070932 0.013716 0.858457 0.106076 0.021751 0.806832 0.041104 0.111903 0.040161 0.022931 0.784693 0.166129 0.026247 0.836358 0.022956 0.065568 0.075119 0.026145 0.817801 0.123692 0.032362 MOTIF Midbrain_E13.5_H3K4me2_102_87_0.505_5.822723e-55 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.038067 0.071479 0.844902 0.045551 0.041233 0.870324 0.042591 0.045852 0.025127 0.14116 0.765733 0.06798 0.017379 0.774818 0.137946 0.069857 0.751148 0.095153 0.055631 0.098068 0.011352 0.818836 0.167764 0.002048 0.832561 0.053836 0.037624 0.075979 0.00541 0.848455 0.08989 0.056245 0.912084 0.002795 0.019678 0.065443 0.063817 0.496664 0.309416 0.130103 MOTIF Limb_E14.5_H3K4me2_76_33_0.546_1.145555e-92 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.048202 0.869093 0.04362 0.039084 0.029785 0.063822 0.883516 0.022877 0.037327 0.808042 0.125275 0.029356 0.718689 0.05099 0.212019 0.018301 0.025287 0.883494 0.074214 0.017005 0.830454 0.053297 0.02894 0.087309 0.004227 0.757215 0.228912 0.009645 0.888646 0.034378 0.038141 0.038835 0.024479 0.693631 0.257591 0.024298 0.01921 0.07421 0.859384 0.047197 MOTIF Lung_P0_H3K4me2_83_73_0.512_8.997325e-49 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.057625 0.848365 0.061651 0.032358 0.0 0.074588 0.894341 0.031071 0.043896 0.79316 0.115321 0.047623 0.845625 0.048388 0.075129 0.030857 0.059176 0.683937 0.247764 0.009123 0.760008 0.072049 0.039538 0.128404 0.004712 0.947527 0.040684 0.007078 0.911464 0.010342 0.058361 0.019833 0.015895 0.655199 0.283137 0.045769 MOTIF Heart_E16.5_H3K4me2_96_47_0.503_5.05898e-54 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.073909 0.807306 0.072154 0.04663 0.009706 0.073901 0.895087 0.021305 0.031757 0.75799 0.160986 0.049267 0.795082 0.047916 0.073464 0.083539 0.038018 0.765632 0.176197 0.020152 0.860562 0.029619 0.058013 0.051806 0.0 0.755308 0.232177 0.012515 0.877239 0.040195 0.063252 0.019313 0.029072 0.733072 0.228241 0.009614 MOTIF Hindbrain_E15.5_H3K4me2_93_61_0.509_2.83871e-67 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.051207 0.820148 0.082153 0.046492 0.0 0.084114 0.878993 0.036893 0.021987 0.845015 0.099631 0.033368 0.790772 0.046755 0.083842 0.078631 0.033809 0.774281 0.171345 0.020565 0.84648 0.033438 0.050869 0.069213 0.002775 0.840492 0.145906 0.010826 0.814938 0.037642 0.078835 0.068585 0.031459 0.716431 0.21727 0.03484 MOTIF Midbrain_E16.5_H3K4me2_93_43_0.525_1.311386e-174 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.052957 0.828004 0.056333 0.062706 0.029316 0.037772 0.900831 0.032081 0.027045 0.873537 0.064061 0.035357 0.794051 0.023184 0.16001 0.022756 0.010116 0.72672 0.254046 0.009118 0.826782 0.051604 0.022594 0.09902 0.0049 0.830066 0.148881 0.016153 0.750018 0.025671 0.171666 0.052645 0.023454 0.776511 0.189319 0.010716 MOTIF Cranio-Facial_E12.5_H3K4me2_91_69_0.508_5.696651e-37 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.028676 0.164993 0.764368 0.041963 0.057109 0.772008 0.129877 0.041006 0.016012 0.130902 0.799467 0.053619 0.011183 0.746695 0.200118 0.042004 0.690397 0.142296 0.08502 0.082286 0.011065 0.919179 0.065372 0.004385 0.873458 0.023688 0.056366 0.046487 0.002772 0.772531 0.196306 0.028391 0.797724 0.051544 0.053245 0.097487 0.040727 0.189892 0.756319 0.013061 MOTIF Midbrain_E16.5_H3K4me2_80_62_0.538_1.168083e-105 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.542064 0.0 0.206337 0.251599 0.032815 0.031378 0.899576 0.036231 0.052913 0.881677 0.044522 0.020888 0.014069 0.04397 0.908364 0.033598 0.023316 0.769173 0.174305 0.033207 0.578976 0.1127 0.060504 0.24782 0.0 0.90724 0.088318 0.004442 0.881798 0.030882 0.038429 0.048891 0.0 0.666322 0.303906 0.029773 0.763264 0.019412 0.121538 0.095786 MOTIF Forebrain_E13.5_H3K4me2_72_42_0.535_3.89202e-96 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.028666 0.171797 0.787502 0.012036 0.059186 0.830618 0.056346 0.05385 0.036249 0.077749 0.824145 0.061857 0.007325 0.808102 0.153318 0.031255 0.844351 0.065361 0.046898 0.043389 0.004667 0.903257 0.086864 0.005211 0.849507 0.016608 0.042829 0.091056 0.002229 0.722965 0.248265 0.026541 0.633234 0.223417 0.039321 0.104028 0.237601 0.497639 0.16004 0.10472 0.192797 0.446422 0.188619 0.172162 MOTIF Intestine_P0_H3K4me2_85_61_0.512_2.917001e-32 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.018679 0.137556 0.816218 0.027547 0.034548 0.871163 0.051891 0.042397 0.029813 0.141148 0.710941 0.118098 0.006708 0.811952 0.113408 0.067933 0.747522 0.073251 0.059276 0.119951 0.003447 0.924787 0.071041 0.000725 0.806345 0.052827 0.042705 0.098123 0.003698 0.744848 0.213951 0.037502 0.735158 0.206643 0.017071 0.041128 0.171562 0.218112 0.423855 0.186471 MOTIF Forebrain_E12.5_H3K4me2_106_66_0.509_4.461648e-51 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.066631 0.16275 0.694695 0.075923 0.050991 0.804335 0.090719 0.053954 0.040159 0.121322 0.791573 0.046946 0.010455 0.810492 0.133039 0.046015 0.735125 0.104126 0.066411 0.094338 0.007019 0.868397 0.110719 0.013865 0.925873 0.045509 0.016108 0.01251 0.000952 0.792725 0.195769 0.010554 0.799262 0.056885 0.078583 0.06527 0.228984 0.284965 0.287418 0.198633 MOTIF Neural-Tube_E12.5_H3K4me2_92_58_0.522_1.405494e-67 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.038031 0.110543 0.799514 0.051912 0.047844 0.76691 0.137724 0.047522 0.031535 0.073122 0.853438 0.041905 0.013167 0.865548 0.071476 0.049809 0.769221 0.082083 0.051579 0.097117 0.002143 0.877648 0.114907 0.005302 0.820039 0.040436 0.052019 0.087506 0.004053 0.74261 0.219724 0.033613 0.737236 0.148264 0.053116 0.061384 0.333666 0.332692 0.217479 0.116163 MOTIF Forebrain_E11.5_H3K9ac_83_47_0.511_4.355682e-21 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.309329 0.42968 0.252176 0.008816 0.05195 0.299759 0.277468 0.370823 0.347199 0.181204 0.429281 0.042317 0.043534 0.866987 0.047111 0.042368 0.049014 0.066588 0.868878 0.01552 0.02913 0.78112 0.158545 0.031205 0.831553 0.024254 0.060277 0.083916 0.033478 0.887503 0.074949 0.00407 0.820889 0.016622 0.124412 0.038076 0.013609 0.712223 0.253064 0.021104 0.876192 0.036459 0.071812 0.015538 0.030491 0.677017 0.257123 0.035369 MOTIF Hindbrain_E14.5_H3K9ac_89_86_0.507_4.509478e-29 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.025443 0.250803 0.706142 0.017612 0.049177 0.850955 0.071988 0.027881 0.031797 0.169693 0.687798 0.110712 0.005955 0.798602 0.151656 0.043787 0.792259 0.129618 0.039749 0.038373 0.0 0.946201 0.049424 0.004375 0.868212 0.047726 0.0339 0.050162 0.0 0.745911 0.253826 0.000263 0.797203 0.080915 0.056657 0.065225 MOTIF Kidney_E15.5_H3K9ac_76_88_0.528_5.727805e-55 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.003827 0.915203 0.043639 0.037331 0.022095 0.085356 0.889305 0.003243 0.113195 0.606596 0.161598 0.118611 0.844172 0.041067 0.064027 0.050735 0.117227 0.820144 0.043034 0.019594 0.682019 0.023045 0.247582 0.047353 0.0 0.948294 0.038629 0.013077 0.876222 0.034945 0.056516 0.032317 0.04409 0.867216 0.055024 0.033671 MOTIF Hindbrain_E15.5_H3K9ac_77_73_0.519_1.572574e-65 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.030622 0.894879 0.050393 0.024106 0.045019 0.04006 0.877559 0.037361 0.030843 0.773176 0.15207 0.043911 0.911514 0.029462 0.041291 0.017733 0.018683 0.691962 0.282641 0.006714 0.764635 0.042926 0.054412 0.138028 0.007581 0.847745 0.115561 0.029114 0.822614 0.058202 0.069143 0.050041 0.058414 0.879281 0.046186 0.016119 MOTIF Hindbrain_E14.5_H3K9ac_88_49_0.508_7.137856e-43 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.050164 0.797961 0.096513 0.055362 0.059849 0.051784 0.846309 0.042059 0.038748 0.841586 0.097332 0.022334 0.811344 0.066677 0.101862 0.020117 0.010694 0.820209 0.155588 0.013509 0.852708 0.031425 0.051881 0.063986 0.011583 0.80143 0.176239 0.010748 0.753122 0.048186 0.169739 0.028953 0.023683 0.767808 0.18384 0.02467 MOTIF Limb_E11.5_H3K9ac_85_62_0.513_3.989494e-21 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.057597 0.854964 0.059704 0.027735 0.031986 0.055726 0.871361 0.040927 0.018996 0.805595 0.142403 0.033006 0.795051 0.043013 0.127913 0.034024 0.020127 0.831955 0.132249 0.015668 0.877764 0.005945 0.034466 0.081825 0.021074 0.832926 0.127436 0.018564 0.788148 0.044943 0.123862 0.043046 0.048203 0.693215 0.193154 0.065427 MOTIF Lung_E15.5_H3K9ac_68_58_0.550_2.344215e-73 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.014336 0.929764 0.052541 0.003359 0.024481 0.081224 0.855579 0.038716 0.04706 0.705536 0.187638 0.059766 0.701093 0.155571 0.080077 0.063259 0.031923 0.889963 0.060345 0.017769 0.71213 0.032023 0.03963 0.216217 0.004225 0.903065 0.072088 0.020621 0.892987 0.030291 0.05525 0.021472 0.028462 0.859083 0.079493 0.032962 0.079881 0.072259 0.750268 0.097593 0.05594 0.499036 0.018016 0.427008