MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Limb_E14.5_H3K4me1_37_174_0.518_7.841092e-32
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.0	0.0	1.0	0.0
0.141475	0.845202	0.013323	0.0
0.072885	0.167561	0.023703	0.735851
0.0	0.01398	0.928181	0.057839
0.002489	0.981417	0.012314	0.00378
0.041795	0.473667	0.022839	0.461699
0.029206	0.203195	0.757642	0.009956
0.0	0.837808	0.147253	0.014939
0.852421	0.113783	0.033795	0.0
0.0	1.0	0.0	0.0

MOTIF	Limb_E14.5_H3K4me1_15_207_0.524_1.587177e-53
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.598162	0.092092	0.21357	0.096176
0.002965	0.048511	0.864604	0.083919
0.114832	0.872273	0.012894	0.0
0.011864	0.054611	0.03329	0.900236
0.038296	0.005332	0.875293	0.08108
0.003988	0.917505	0.050582	0.027925
0.140213	0.075316	0.015141	0.769331
0.02014	0.120613	0.733467	0.12578
0.124992	0.789122	0.019743	0.066142

MOTIF	Midbrain_E15.5_H3K4me1_7_174_0.545_3.094967e-145
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.58118	0.02481	0.368607	0.025403
0.003076	0.030298	0.925089	0.041538
0.044915	0.951598	0.002982	0.000504
0.073973	0.023711	0.045122	0.857195
0.03094	0.018679	0.909097	0.041284
0.032058	0.915762	0.035724	0.016455
0.053188	0.239054	0.179265	0.528493
0.133651	0.080202	0.68736	0.098788
0.041986	0.862428	0.014198	0.081388
0.423027	0.379247	0.197727	0.0

MOTIF	Limb_E15.5_H3K4me2_75_104_0.538_5.726266e-57
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.0	0.0	1.0	0.0
0.167885	0.824028	0.0	0.008087
0.017328	0.136109	0.131808	0.714755
0.072809	0.166009	0.726371	0.034811
0.0	1.0	0.0	0.0
0.0	0.017298	0.0	0.982702
0.177132	0.283808	0.529222	0.009838
0.0	0.991859	0.0	0.008141
0.675318	0.035159	0.128711	0.160812

MOTIF	Forebrain_E15.5_H3K4me2_79_117_0.519_1.758135e-45
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.665697	0.176666	0.080889	0.076748
0.072257	0.019599	0.757064	0.15108
0.160762	0.823914	0.01146	0.003865
0.07604	0.037963	0.019125	0.866872
0.075899	0.014477	0.899432	0.010193
0.001509	0.960022	0.027574	0.010894
0.102834	0.024683	0.036979	0.835503
0.03716	0.065705	0.79299	0.104145
0.123515	0.533558	0.00435	0.338577

MOTIF	Midbrain_E13.5_H3K4me2_92_129_0.524_2.433727e-43
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.847074	0.0	0.135224	0.017702
0.007673	0.017401	0.902939	0.071988
0.0	0.983399	0.00351	0.013092
0.0	0.265654	0.090024	0.644322
0.195882	0.020631	0.603191	0.180296
0.0	0.982401	0.0	0.017599
0.027009	0.0	0.0	0.972991
0.0	0.051731	0.746739	0.20153
0.0	0.736038	0.012208	0.251753

MOTIF	Limb_E11.5_H3K4me2_76_71_0.534_6.205103e-43
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.035474	0.852286	0.057893	0.054347
0.335195	0.197978	0.457956	0.008871
0.009741	0.874621	0.070415	0.045223
0.816001	0.079698	0.009376	0.094924
0.0	0.020822	0.979178	0.0
0.079933	0.84875	0.024551	0.046765
0.800158	0.009538	0.103815	0.086489
0.0	0.15915	0.828203	0.012647
0.10804	0.830424	0.046537	0.014999

MOTIF	Limb_E15.5_H3K4me2_67_47_0.555_4.561329e-104
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.070333	0.829884	0.092673	0.007111
0.014339	0.251748	0.673757	0.060156
0.006268	0.966907	0.024987	0.001839
0.082681	0.034895	0.053719	0.828705
0.000623	0.01758	0.967735	0.014062
0.001145	0.858764	0.117253	0.022838
0.102139	0.047922	0.061489	0.78845
0.055053	0.21013	0.623726	0.111091
0.102045	0.686283	0.045028	0.166643

MOTIF	Liver_E16.5_H3K4me2_73_78_0.534_3.262926e-69
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.06126	0.866821	0.019297	0.052621
0.171906	0.093785	0.707474	0.026835
0.004105	0.971657	0.022959	0.001279
0.091506	0.051757	0.043393	0.813344
0.001988	0.022702	0.956627	0.018683
0.007401	0.890896	0.096364	0.005339
0.170725	0.008535	0.064645	0.756095
0.057636	0.034707	0.88483	0.022827
0.124181	0.492004	0.052145	0.331669

MOTIF	Liver_P0_H3K4me2_93_102_0.504_2.5185e-08
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.042842	0.011313	0.86877	0.077075
0.177192	0.725321	0.061042	0.036445
0.834212	0.042824	0.062117	0.060847
0.039565	0.155328	0.805106	0.0
0.007183	0.759707	0.228974	0.004136
0.798335	0.067823	0.059239	0.074603
0.023765	0.132599	0.826543	0.017093
0.071665	0.847706	0.071341	0.009289
0.760152	0.113792	0.063044	0.063012

MOTIF	Cranio-Facial_E12.5_H3K4me2_81_111_0.524_6.27142e-29
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.158759	0.007977	0.765145	0.068118
0.119166	0.830205	0.027047	0.023583
0.825345	0.035693	0.065774	0.073188
0.048925	0.111359	0.839716	0.0
0.086049	0.892773	0.010937	0.010241
0.786452	0.077207	0.058781	0.07756
0.055022	0.085407	0.824184	0.035387
0.113986	0.824999	0.025972	0.035043
0.705923	0.056741	0.166038	0.071298

MOTIF	Midbrain_E11.5_H3K4me2_102_104_0.515_1.31439e-18
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.154762	0.008736	0.770356	0.066147
0.108816	0.851576	0.018695	0.020913
0.858688	0.043121	0.038587	0.059604
0.039403	0.156815	0.802724	0.001058
0.049092	0.921077	0.019182	0.010649
0.768356	0.086432	0.052347	0.092865
0.027832	0.193876	0.75857	0.019723
0.058114	0.874311	0.024183	0.043391
0.69575	0.063886	0.16389	0.076475

MOTIF	Hindbrain_E12.5_H3K4me2_94_96_0.517_2.021288e-29
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.14672	0.222315	0.555057	0.075908
0.088665	0.870161	0.022152	0.019022
0.835193	0.042532	0.053983	0.068291
0.035957	0.089517	0.873697	0.000829
0.055308	0.914978	0.023319	0.006395
0.840084	0.034102	0.06058	0.065234
0.037661	0.048742	0.877619	0.035978
0.077322	0.854631	0.030572	0.037475
0.63246	0.142387	0.139786	0.085367

MOTIF	Hindbrain_E15.5_H3K4me2_83_94_0.525_3.174844e-68
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.23259	0.062397	0.631731	0.073282
0.130431	0.766977	0.087905	0.014686
0.886256	0.016704	0.034424	0.062615
0.044129	0.019247	0.932963	0.003661
0.049248	0.905893	0.025203	0.019656
0.742864	0.048086	0.049393	0.159657
0.029109	0.044397	0.880815	0.045679
0.070135	0.858345	0.037015	0.034504
0.633232	0.049642	0.117422	0.199705

MOTIF	Cranio-Facial_E13.5_H3K4me2_84_76_0.516_5.636071e-34
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.12691	0.047571	0.77674	0.048779
0.123497	0.807931	0.061129	0.007443
0.819396	0.038958	0.053955	0.087691
0.0376	0.038122	0.922199	0.002079
0.086715	0.747102	0.152098	0.014085
0.747396	0.087529	0.067586	0.09749
0.022743	0.07514	0.876902	0.025216
0.06087	0.78025	0.121555	0.037325
0.709106	0.071483	0.090906	0.128504

MOTIF	Limb_E14.5_H3K4me2_88_71_0.518_6.777806e-49
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.116002	0.177456	0.625969	0.080573
0.076907	0.732042	0.173014	0.018037
0.800404	0.056269	0.042789	0.100539
0.018973	0.024694	0.953291	0.003042
0.05769	0.889856	0.042844	0.00961
0.731738	0.082019	0.061617	0.124626
0.017074	0.072612	0.877827	0.032487
0.053071	0.822163	0.079588	0.045178
0.712946	0.076174	0.107518	0.103362

MOTIF	Limb_E13.5_H3K4me2_79_60_0.536_1.3474e-87
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.069553	0.116083	0.741985	0.07238
0.095553	0.793935	0.090052	0.02046
0.787784	0.064741	0.058905	0.08857
0.039732	0.026616	0.928819	0.004833
0.060235	0.858094	0.073453	0.008218
0.780738	0.056571	0.042683	0.120008
0.022267	0.036146	0.916547	0.025041
0.096316	0.812215	0.067352	0.024116
0.590109	0.117555	0.186023	0.106312

MOTIF	Neural-Tube_E12.5_H3K4me2_90_70_0.528_1.022402e-49
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.138442	0.149996	0.662974	0.048588
0.044921	0.88084	0.059367	0.014872
0.780147	0.069761	0.035444	0.114648
0.029072	0.027042	0.937349	0.006537
0.092568	0.820054	0.079871	0.007508
0.756569	0.093014	0.047849	0.102569
0.016148	0.035432	0.919873	0.028547
0.032795	0.854468	0.074384	0.038353
0.560391	0.09821	0.172525	0.168873

MOTIF	Cranio-Facial_E11.5_H3K4me2_85_75_0.516_4.722133e-21
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.784913	0.115246	0.045396	0.054445
0.075686	0.087605	0.811948	0.024761
0.044557	0.899208	0.033823	0.022412
0.723887	0.083388	0.06043	0.132295
0.027197	0.081405	0.891398	0.0
0.011878	0.817818	0.161267	0.009037
0.745109	0.092289	0.073517	0.089085
0.023474	0.173688	0.778742	0.024096
0.083457	0.719197	0.145024	0.052322

MOTIF	Intestine_E15.5_H3K4me2_91_75_0.519_4.013225e-46
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.735978	0.088972	0.087291	0.08776
0.124455	0.152743	0.670821	0.051981
0.087141	0.854309	0.039799	0.018752
0.785721	0.041163	0.066729	0.106387
0.025658	0.026526	0.947371	0.000444
0.055898	0.910187	0.027615	0.0063
0.761908	0.060201	0.063292	0.114599
0.021466	0.08057	0.865665	0.032299
0.093088	0.727788	0.123685	0.055439

MOTIF	Midbrain_E13.5_H3K4me2_77_50_0.546_3.10167e-91
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.712367	0.173425	0.061737	0.052471
0.084042	0.078701	0.812146	0.025111
0.074583	0.802254	0.113864	0.009299
0.759068	0.078819	0.102612	0.059502
0.024732	0.067428	0.905937	0.001903
0.054632	0.870438	0.060366	0.014564
0.730986	0.063264	0.115645	0.090104
0.017186	0.086413	0.872414	0.023987
0.070731	0.732111	0.119332	0.077826

MOTIF	Hindbrain_E12.5_H3K4me2_92_73_0.520_2.327068e-36
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.695202	0.095822	0.120443	0.088534
0.087409	0.142603	0.705485	0.064503
0.08584	0.80676	0.095294	0.012106
0.798023	0.058561	0.04271	0.100705
0.017817	0.061979	0.91965	0.000554
0.046648	0.827654	0.118088	0.00761
0.792357	0.051579	0.054118	0.101946
0.016131	0.054308	0.901417	0.028144
0.080698	0.759677	0.105564	0.054062

MOTIF	Heart_E14.5_H3K4me2_69_43_0.541_1.471276e-83
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.702087	0.127097	0.102135	0.068682
0.10599	0.106242	0.748124	0.039645
0.075754	0.815201	0.095813	0.013233
0.769311	0.085254	0.044789	0.100645
0.029828	0.032944	0.931754	0.005474
0.054049	0.874386	0.062639	0.008927
0.709515	0.117496	0.070059	0.102931
0.026484	0.056118	0.893382	0.024017
0.068181	0.765074	0.14178	0.024964

MOTIF	Midbrain_E16.5_H3K4me2_88_75_0.531_6.956754e-70
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.720782	0.082287	0.112009	0.084923
0.083345	0.100487	0.775943	0.040225
0.071898	0.794534	0.114099	0.019469
0.780728	0.052634	0.053354	0.113283
0.025227	0.013626	0.957829	0.003318
0.056561	0.834803	0.094807	0.013829
0.750502	0.07115	0.065709	0.112638
0.013986	0.091579	0.865981	0.028453
0.07397	0.753645	0.112749	0.059636

MOTIF	Hindbrain_E14.5_H3K4me2_73_63_0.540_5.506527e-88
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.727998	0.096291	0.077074	0.098637
0.072923	0.082175	0.801331	0.043571
0.09125	0.793772	0.103191	0.011787
0.755538	0.059266	0.085101	0.100095
0.03936	0.064576	0.892001	0.004063
0.039596	0.835856	0.115291	0.009257
0.752137	0.117237	0.069257	0.06137
0.035805	0.067089	0.868888	0.028217
0.07341	0.778469	0.118069	0.030052

MOTIF	Stomach_E14.5_H3K4me2_87_73_0.525_9.513875e-37
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.740697	0.111287	0.077541	0.070474
0.073519	0.068236	0.815191	0.043055
0.100623	0.811293	0.073696	0.014389
0.788683	0.045509	0.065735	0.100072
0.020952	0.061596	0.917325	0.000127
0.07	0.814728	0.103813	0.01146
0.737298	0.074538	0.084739	0.103426
0.021213	0.133158	0.811648	0.033981
0.072752	0.761072	0.114272	0.051904

MOTIF	Kidney_E16.5_H3K4me2_82_52_0.529_2.558116e-43
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.066723	0.860502	0.057121	0.015654
0.796676	0.049568	0.078556	0.0752
0.061117	0.084137	0.847486	0.00726
0.041963	0.890872	0.048278	0.018887
0.649456	0.089028	0.114538	0.146979
0.012807	0.031473	0.944316	0.011404
0.03598	0.899923	0.053467	0.010629
0.661346	0.105209	0.120828	0.112617
0.027513	0.09859	0.85829	0.015608
0.265009	0.376832	0.181591	0.176568

MOTIF	Kidney_P0_H3K4me2_110_69_0.514_3.189176e-32
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.073008	0.774308	0.134285	0.018398
0.81761	0.053304	0.049271	0.079815
0.0283	0.078436	0.885077	0.008187
0.044634	0.798448	0.151011	0.005907
0.73629	0.042959	0.053872	0.166879
0.005589	0.026445	0.966	0.001966
0.063522	0.794752	0.119492	0.022234
0.658253	0.090686	0.115222	0.135839
0.035148	0.143473	0.804114	0.017264
0.262752	0.490309	0.133761	0.113177

MOTIF	Limb_E13.5_H3K4me2_82_65_0.532_1.235985e-52
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.083345	0.781518	0.118351	0.016787
0.74086	0.12267	0.056255	0.080215
0.089536	0.085717	0.811262	0.013485
0.038796	0.921709	0.033027	0.006467
0.74408	0.043044	0.047143	0.165734
0.008129	0.074439	0.900233	0.017199
0.043357	0.899618	0.048171	0.008854
0.676717	0.08528	0.119266	0.118736
0.035397	0.087632	0.857028	0.019943
0.281883	0.521302	0.15216	0.044655

MOTIF	Limb_E14.5_H3K4me2_91_77_0.512_5.098619e-24
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.08952	0.821291	0.063807	0.025381
0.752044	0.05587	0.062854	0.129233
0.081763	0.126515	0.777037	0.014685
0.041644	0.892773	0.025676	0.039907
0.670466	0.066354	0.064692	0.198488
0.009087	0.097171	0.864367	0.029375
0.017487	0.872395	0.082719	0.027399
0.676358	0.101288	0.087661	0.134693
0.032687	0.184252	0.729818	0.053243
0.370293	0.395139	0.208891	0.025676

MOTIF	Neural-Tube_E12.5_H3K4me2_91_79_0.526_3.103541e-38
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.063799	0.856608	0.056792	0.022801
0.751454	0.06989	0.050418	0.128237
0.059288	0.069092	0.86039	0.011229
0.107454	0.822719	0.033526	0.036301
0.685546	0.073536	0.053407	0.187511
0.008926	0.035315	0.91482	0.040939
0.018081	0.867088	0.077437	0.037394
0.576069	0.101339	0.180604	0.141988
0.032001	0.128528	0.785558	0.053913
0.37421	0.301307	0.233829	0.090654

MOTIF	Stomach_E16.5_H3K4me2_95_100_0.508_2.737131e-20
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.080218	0.780781	0.121913	0.017087
0.742118	0.098481	0.042855	0.116546
0.046433	0.070823	0.837491	0.045253
0.096816	0.794821	0.088456	0.019906
0.707722	0.077471	0.083628	0.131179
0.014455	0.146307	0.788342	0.050896
0.029228	0.799516	0.102211	0.069045
0.68146	0.100355	0.111721	0.106464
0.043759	0.178529	0.717043	0.060669

MOTIF	Limb_E15.5_H3K4me2_95_67_0.515_2.40794e-21
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.197225	0.188668	0.526846	0.087261
0.06293	0.8296	0.084767	0.022702
0.770709	0.068899	0.068435	0.091957
0.067949	0.080636	0.846556	0.004859
0.079017	0.795105	0.113615	0.012263
0.762984	0.053036	0.044262	0.139718
0.00777	0.075358	0.914139	0.002733
0.021067	0.84027	0.101932	0.036731
0.725724	0.097376	0.095452	0.081448
0.037484	0.112025	0.80821	0.042281

MOTIF	Hindbrain_E14.5_H3K4me2_80_92_0.524_1.061199e-54
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.106807	0.791735	0.083562	0.017896
0.692009	0.127018	0.066967	0.114005
0.048567	0.087675	0.816834	0.046923
0.070506	0.844658	0.073681	0.011155
0.766264	0.069905	0.040318	0.123513
0.006542	0.095203	0.834063	0.064191
0.046518	0.848909	0.087069	0.017504
0.688751	0.090643	0.11335	0.107256
0.040008	0.015304	0.914815	0.029874

MOTIF	Cranio-Facial_E14.5_H3K4me2_86_67_0.520_2.472015e-36
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.080994	0.853729	0.049845	0.015432
0.697808	0.103621	0.105973	0.092599
0.029761	0.053425	0.908885	0.00793
0.029846	0.91508	0.049341	0.005733
0.728033	0.03484	0.072471	0.164655
0.010548	0.078297	0.907025	0.00413
0.06171	0.853183	0.074774	0.010333
0.672448	0.090255	0.112522	0.124774
0.046152	0.078742	0.856734	0.018371

MOTIF	Hindbrain_E16.5_H3K4me2_81_56_0.536_1.59789e-70
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.05759	0.874324	0.051333	0.016754
0.700694	0.104922	0.117356	0.077028
0.042311	0.052178	0.896996	0.008514
0.036399	0.8642	0.062036	0.037365
0.674516	0.066266	0.100649	0.158569
0.008065	0.090056	0.885406	0.016473
0.027376	0.892074	0.05229	0.02826
0.635933	0.14871	0.11102	0.104337
0.030761	0.097759	0.846619	0.024861

MOTIF	Hindbrain_E12.5_H3K4me2_96_79_0.511_8.797771e-24
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.070559	0.811253	0.097397	0.020791
0.787046	0.056842	0.079076	0.077036
0.056524	0.092248	0.843442	0.007787
0.074194	0.805134	0.109349	0.011324
0.737667	0.067782	0.054251	0.140301
0.007953	0.077624	0.89214	0.022283
0.019272	0.860788	0.097083	0.022857
0.735148	0.082963	0.083112	0.098777
0.034067	0.080968	0.862437	0.022528

MOTIF	Stomach_P0_H3K4me2_72_62_0.521_5.905847e-36
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.063855	0.830972	0.090926	0.014246
0.758126	0.091069	0.056629	0.094176
0.034786	0.081496	0.859508	0.024209
0.053967	0.864387	0.074774	0.006872
0.674966	0.086932	0.097163	0.14094
0.014587	0.068094	0.88856	0.028759
0.020765	0.849599	0.087861	0.041775
0.615441	0.119978	0.173695	0.090886
0.047868	0.091963	0.830658	0.029511