MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Forebrain_E16.5_H3K9me3_11_157_0.538_1.903891e-27 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.207 0.027 0.659 0.107 0.104 0.228 0.079 0.589 0.636 0.065 0.208 0.091 0.812 0.101 0.07 0.017 0.078 0.793 0.012 0.117 0.102 0.807 0.003 0.088 0.881 0.008 0.031 0.08 0.754 0.011 0.143 0.092 0.132 0.565 0.085 0.218 0.252 0.361 0.093 0.293 0.419 0.103 0.292 0.187 0.159 0.528 0.109 0.204 MOTIF Kidney_E14.5_H3K9me3_26_162_0.532_4.386343e-16 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.049 0.016 0.896 0.039 0.055 0.233 0.071 0.641 0.829 0.016 0.107 0.048 0.951 0.016 0.032 0.001 0.08 0.918 0.001 0.001 0.001 0.938 0.001 0.06 0.913 0.054 0.001 0.032 0.824 0.001 0.143 0.032 0.062 0.784 0.048 0.106 0.137 0.555 0.016 0.292 0.482 0.049 0.377 0.093 0.001 0.862 0.001 0.136 MOTIF Midbrain_E11.5_H3K9me3_27_156_0.525_2.067447e-11 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.069 0.032 0.827 0.072 0.033 0.091 0.043 0.833 0.876 0.026 0.097 0.001 0.77 0.032 0.066 0.132 0.001 0.943 0.032 0.024 0.001 0.997 0.001 0.001 0.967 0.031 0.001 0.001 0.935 0.001 0.032 0.032 0.053 0.834 0.001 0.112 0.018 0.505 0.032 0.445 0.446 0.105 0.195 0.254 0.001 0.797 0.116 0.086