MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Forebrain_E12.5_H3K9me3_48_161_0.523_1.692947e-35 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.849 0.054 0.066 0.031 0.032 0.703 0.007 0.258 0.912 0.08 0.001 0.007 0.157 0.049 0.542 0.252 0.823 0.025 0.106 0.046 0.816 0.007 0.155 0.022 0.185 0.001 0.771 0.043 0.086 0.784 0.024 0.106 0.043 0.007 0.021 0.929 0.848 0.032 0.098 0.022 0.662 0.216 0.014 0.108 0.216 0.624 0.1 0.06 MOTIF Cranio-Facial_E13.5_H3K9me3_5_160_0.537_1.411593e-61 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.039 0.896 0.061 0.004 0.972 0.006 0.011 0.011 0.037 0.007 0.946 0.01 0.816 0.005 0.029 0.15 0.802 0.008 0.178 0.012 0.127 0.022 0.833 0.018 0.386 0.574 0.03 0.01 0.071 0.136 0.023 0.77 0.466 0.016 0.294 0.224 0.972 0.001 0.016 0.011 0.029 0.274 0.663 0.034 0.941 0.027 0.022 0.01 MOTIF Hindbrain_E12.5_H3K9me3_4_158_0.550_1.436727e-93 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.903 0.008 0.032 0.057 0.108 0.042 0.764 0.086 0.741 0.056 0.052 0.151 0.9 0.003 0.062 0.035 0.125 0.125 0.718 0.032 0.081 0.794 0.027 0.098 0.092 0.151 0.002 0.755 0.506 0.015 0.434 0.045 0.633 0.049 0.121 0.197 0.06 0.192 0.391 0.357 0.86 0.016 0.109 0.015 0.044 0.119 0.713 0.124