MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Limb_E11.5_H3K9me3_55_144_0.507_0.004429819
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.135138	0.13523	0.020641	0.708991
0.065211	0.810752	0.093492	0.030545
0.029166	0.018156	0.188372	0.764306
0.017175	0.355812	0.412431	0.214582
0.019572	0.971732	0.008697	0.0
0.015078	0.026992	0.014654	0.943276
0.069753	0.877309	0.00198	0.050958
0.0	0.976148	0.015572	0.008281
0.914325	0.041301	0.01322	0.031154

MOTIF	Midbrain_P0_H3K9me3_1_170_0.556_1.597937e-28
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.565	0.124	0.167	0.144
0.193	0.188	0.153	0.466
0.038	0.001	0.034	0.927
0.188	0.001	0.798	0.013
0.237	0.041	0.482	0.24
0.736	0.001	0.017	0.246
0.236	0.028	0.687	0.049
0.069	0.679	0.122	0.13
0.992	0.001	0.001	0.006
0.17	0.123	0.551	0.156
0.778	0.041	0.046	0.135
0.213	0.174	0.209	0.404

MOTIF	Neural-Tube_E11.5_H3K9me3_2_180_0.534_8.320174e-10
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.47	0.163	0.347	0.021
0.196	0.333	0.089	0.383
0.327	0.017	0.053	0.603
0.244	0.22	0.463	0.073
0.158	0.206	0.183	0.454
0.384	0.015	0.255	0.347
0.116	0.016	0.524	0.344
0.165	0.545	0.273	0.017
0.953	0.006	0.018	0.023
0.176	0.277	0.491	0.057