MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Cranio-Facial_E13.5_H3K9me3_102_157_0.506_2.333001e-35
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.001	0.804	0.001	0.194
0.9	0.086	0.013	0.001
0.793	0.033	0.173	0.001
0.935	0.026	0.002	0.037
0.186	0.08	0.717	0.017
0.692	0.001	0.046	0.261
0.733	0.226	0.04	0.001
0.014	0.769	0.001	0.216
0.035	0.026	0.026	0.913
0.311	0.082	0.115	0.493
0.001	0.689	0.095	0.215
0.001	0.026	0.026	0.947

MOTIF	Cranio-Facial_E15.5_H3K9me3_36_159_0.518_1.276499e-12
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.001	0.917	0.052	0.03
0.698	0.139	0.09	0.073
0.913	0.001	0.056	0.03
0.902	0.03	0.001	0.067
0.061	0.043	0.866	0.03
0.909	0.03	0.001	0.06
0.849	0.061	0.06	0.03
0.001	0.919	0.03	0.05
0.001	0.001	0.089	0.909
0.329	0.001	0.118	0.552
0.001	0.671	0.03	0.298
0.001	0.001	0.089	0.909

MOTIF	Hindbrain_E16.5_H3K9me3_73_169_0.516_3.006029e-10
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.047	0.843	0.043	0.067
0.614	0.049	0.016	0.321
0.468	0.22	0.108	0.203
0.656	0.016	0.265	0.063
0.096	0.035	0.617	0.252
0.634	0.013	0.044	0.309
0.553	0.37	0.034	0.043
0.044	0.828	0.043	0.085
0.087	0.032	0.027	0.854
0.513	0.05	0.04	0.397
0.056	0.497	0.05	0.397
0.05	0.057	0.038	0.855

MOTIF	Midbrain_E15.5_H3K9me3_20_147_0.534_5.149489e-13
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.894648	0.089852	0.0	0.0155
0.024517	0.18313	0.698987	0.093365
0.659658	0.044254	0.106029	0.190059
0.968304	0.0	0.031696	0.0
0.070091	0.855916	0.026118	0.047875
0.184185	0.0	0.045653	0.770162
0.018646	0.028438	0.023533	0.929383
0.0	0.932175	0.033209	0.034616
0.0	0.012025	0.009466	0.978509