MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Midbrain_E16.5_H3K27me3_20_168_0.525_9.31369e-08 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.183 0.292 0.424 0.1 0.139 0.444 0.223 0.194 0.012 0.217 0.737 0.034 0.112 0.177 0.153 0.558 0.37 0.001 0.181 0.448 0.979 0.001 0.001 0.019 0.954 0.009 0.001 0.036 0.645 0.054 0.3 0.001 MOTIF Heart_E11.5_H3K27ac_33_171_0.532_2.325392e-33 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.12 0.489 0.19 0.201 0.089 0.14 0.652 0.119 0.46 0.189 0.188 0.163 0.162 0.108 0.638 0.092 0.098 0.217 0.041 0.644 0.178 0.089 0.183 0.55 0.847 0.009 0.004 0.14 0.526 0.237 0.092 0.145 0.214 0.054 0.093 0.639 0.106 0.554 0.118 0.222 MOTIF Limb_E11.5_H3K27ac_16_161_0.551_1.737726e-49 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.19 0.48 0.201 0.129 0.141 0.219 0.522 0.118 0.335 0.466 0.127 0.072 0.057 0.15 0.744 0.049 0.049 0.211 0.104 0.636 0.142 0.072 0.118 0.668 0.799 0.026 0.117 0.058 0.608 0.132 0.049 0.211 0.165 0.173 0.178 0.484 0.095 0.243 0.165 0.498 0.173 0.224 0.397 0.206 0.315 0.259 0.213 0.213 MOTIF Neural-Tube_E11.5_H3K27ac_32_160_0.545_2.496068e-38 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.235 0.194 0.348 0.224 0.156 0.379 0.284 0.181 0.437 0.14 0.385 0.039 0.538 0.13 0.165 0.167 0.216 0.155 0.156 0.473 0.068 0.258 0.141 0.533 0.054 0.145 0.13 0.671 0.697 0.079 0.068 0.156 0.738 0.181 0.053 0.028 0.054 0.15 0.207 0.589 0.165 0.436 0.207 0.192 0.193 0.209 0.425 0.173 MOTIF Cranio-Facial_E12.5_H3K27ac_24_161_0.536_1.132894e-44 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.532 0.175 0.14 0.153 0.114 0.154 0.635 0.097 0.139 0.554 0.154 0.153 0.13 0.134 0.577 0.159 0.139 0.153 0.064 0.644 0.158 0.099 0.162 0.581 0.627 0.077 0.133 0.163 0.724 0.08 0.117 0.079 0.549 0.153 0.141 0.157 0.152 0.146 0.128 0.574 MOTIF Limb_E15.5_H3K27ac_20_154_0.541_3.959804e-84 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.095 0.084 0.101 0.72 0.068 0.075 0.088 0.769 0.118 0.086 0.088 0.708 0.687 0.109 0.077 0.127 0.704 0.113 0.082 0.101 0.139 0.662 0.095 0.104 0.102 0.09 0.704 0.104 0.093 0.706 0.087 0.114 0.123 0.107 0.106 0.664 0.093 0.677 0.109 0.121 MOTIF Lung_E15.5_H3K27ac_22_165_0.536_1.07181e-51 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.059 0.115 0.801 0.025 0.688 0.147 0.076 0.089 0.076 0.006 0.905 0.013 0.127 0.492 0.06 0.321 0.072 0.132 0.671 0.125 0.085 0.238 0.05 0.627 0.159 0.036 0.056 0.749 0.602 0.008 0.067 0.323 0.935 0.014 0.05 0.001 0.726 0.105 0.059 0.11 MOTIF Kidney_P0_H3K27ac_8_168_0.550_1.123259e-115 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.104 0.69 0.104 0.102 0.113 0.102 0.689 0.096 0.102 0.102 0.684 0.112 0.119 0.695 0.103 0.083 0.096 0.109 0.693 0.102 0.077 0.093 0.096 0.734 0.097 0.083 0.11 0.71 0.689 0.108 0.089 0.114 0.717 0.095 0.09 0.098 0.091 0.698 0.112 0.099 MOTIF Midbrain_E12.5_H3K27ac_2_159_0.577_4.428888e-191 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.23 0.264 0.263 0.243 0.149 0.555 0.146 0.15 0.118 0.158 0.585 0.139 0.127 0.578 0.155 0.14 0.169 0.132 0.527 0.172 0.146 0.151 0.148 0.555 0.16 0.128 0.147 0.565 0.553 0.148 0.135 0.164 0.546 0.138 0.149 0.167 0.268 0.232 0.229 0.271 MOTIF Stomach_E14.5_H3K27ac_22_170_0.544_4.274877e-62 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.242 0.249 0.271 0.237 0.499 0.184 0.159 0.158 0.151 0.155 0.572 0.122 0.155 0.565 0.128 0.152 0.118 0.153 0.573 0.156 0.129 0.156 0.154 0.561 0.177 0.13 0.124 0.569 0.549 0.154 0.147 0.15 0.572 0.159 0.158 0.111 0.267 0.231 0.259 0.243 MOTIF Midbrain_P0_H3K27ac_17_168_0.559_2.518282e-129 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.222 0.316 0.228 0.235 0.164 0.15 0.518 0.168 0.151 0.159 0.159 0.531 0.156 0.141 0.148 0.555 0.569 0.15 0.135 0.146 0.535 0.17 0.157 0.138 0.14 0.579 0.134 0.147 0.132 0.146 0.592 0.13 0.15 0.546 0.169 0.135 0.242 0.24 0.258 0.26 MOTIF Stomach_P0_H3K27ac_23_168_0.536_3.510352e-63 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.28 0.243 0.231 0.245 0.157 0.153 0.548 0.142 0.156 0.559 0.142 0.143 0.127 0.145 0.571 0.157 0.132 0.15 0.15 0.568 0.157 0.126 0.159 0.558 0.558 0.139 0.137 0.166 0.564 0.151 0.144 0.141 0.17 0.517 0.162 0.151 0.245 0.238 0.277 0.241 MOTIF Hindbrain_E14.5_H3K27me3_37_172_0.518_9.622138e-06 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.08 0.134 0.098 0.688 0.023 0.141 0.083 0.753 0.165 0.169 0.127 0.539 0.586 0.158 0.137 0.119 0.64 0.151 0.144 0.065 0.204 0.54 0.153 0.103 0.19 0.166 0.469 0.175 0.108 0.585 0.13 0.177 0.123 0.142 0.126 0.609 0.11 0.589 0.155 0.146 MOTIF Kidney_E15.5_H3K27me3_21_166_0.516_1.889839e-07 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.035 0.041 0.046 0.878 0.026 0.064 0.061 0.849 0.055 0.045 0.037 0.863 0.807 0.061 0.084 0.048 0.76 0.074 0.077 0.089 0.107 0.687 0.099 0.107 0.071 0.106 0.748 0.075 0.052 0.835 0.051 0.062 0.058 0.049 0.066 0.827 0.057 0.75 0.085 0.108 MOTIF Liver_E15.5_H3K27me3_32_165_0.525_4.840012e-15 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.13 0.1 0.68 0.09 0.036 0.782 0.084 0.098 0.095 0.024 0.688 0.193 0.096 0.073 0.048 0.783 0.087 0.058 0.087 0.768 0.715 0.127 0.091 0.067 0.848 0.046 0.043 0.063 0.74 0.057 0.1 0.103 MOTIF Cranio-Facial_E11.5_H3K4me1_17_169_0.552_1.280414e-60 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.283 0.319 0.168 0.231 0.441 0.203 0.152 0.204 0.146 0.204 0.591 0.059 0.009 0.496 0.257 0.239 0.047 0.139 0.673 0.141 0.096 0.113 0.126 0.665 0.174 0.077 0.446 0.302 0.649 0.199 0.034 0.118 0.635 0.303 0.043 0.019 0.348 0.213 0.151 0.288 MOTIF Heart_P0_H3K4me1_16_161_0.524_3.857687e-38 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.217 0.159 0.269 0.355 0.02 0.022 0.025 0.933 0.039 0.018 0.032 0.911 0.6 0.1 0.041 0.259 0.76 0.063 0.061 0.116 0.127 0.67 0.139 0.064 0.159 0.219 0.367 0.255 0.024 0.738 0.09 0.148 0.021 0.043 0.001 0.935 0.107 0.336 0.309 0.248 MOTIF Heart_E14.5_H3K4me1_11_162_0.529_1.970039e-67 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.277 0.256 0.255 0.212 0.09 0.086 0.088 0.736 0.085 0.092 0.074 0.749 0.733 0.094 0.076 0.097 0.753 0.06 0.09 0.097 0.064 0.771 0.076 0.089 0.073 0.101 0.762 0.064 0.077 0.738 0.088 0.097 0.073 0.092 0.076 0.759 0.237 0.248 0.248 0.267 MOTIF Lung_E15.5_H3K4me1_13_165_0.533_8.420837e-93 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.274 0.25 0.253 0.223 0.097 0.085 0.083 0.735 0.043 0.1 0.087 0.77 0.748 0.082 0.078 0.092 0.744 0.066 0.09 0.1 0.06 0.767 0.079 0.094 0.086 0.091 0.728 0.095 0.085 0.739 0.083 0.093 0.075 0.093 0.062 0.77 0.247 0.243 0.249 0.261 MOTIF Limb_E15.5_H3K4me1_14_157_0.543_1.337285e-132 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.194 0.045 0.071 0.69 0.007 0.001 0.025 0.967 0.092 0.024 0.001 0.883 0.624 0.124 0.02 0.232 0.596 0.068 0.105 0.231 0.16 0.411 0.154 0.276 0.128 0.106 0.6 0.166 0.071 0.737 0.042 0.15 0.121 0.15 0.061 0.668 0.022 0.634 0.264 0.08 MOTIF Midbrain_E13.5_H3K4me1_20_161_0.539_1.008859e-115 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.164 0.26 0.485 0.091 0.494 0.126 0.155 0.224 0.156 0.132 0.607 0.105 0.189 0.437 0.197 0.177 0.263 0.109 0.444 0.185 0.187 0.122 0.168 0.523 0.21 0.057 0.196 0.537 0.665 0.057 0.087 0.191 0.875 0.113 0.011 0.001 0.617 0.081 0.085 0.217 MOTIF Neural-Tube_E15.5_H3K4me1_15_157_0.545_1.429684e-173 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.12 0.081 0.696 0.103 0.135 0.152 0.642 0.071 0.723 0.082 0.1 0.095 0.111 0.09 0.696 0.103 0.114 0.693 0.091 0.102 0.139 0.098 0.649 0.114 0.121 0.087 0.082 0.71 0.121 0.052 0.09 0.737 0.691 0.097 0.065 0.147 0.765 0.071 0.075 0.089 MOTIF Intestine_E15.5_H3K4me1_7_160_0.538_4.707882e-86 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.68 0.111 0.096 0.113 0.123 0.083 0.114 0.68 0.085 0.067 0.071 0.777 0.135 0.089 0.077 0.699 0.733 0.106 0.077 0.084 0.687 0.081 0.106 0.126 0.12 0.679 0.106 0.095 0.129 0.109 0.663 0.099 0.08 0.715 0.105 0.1 0.099 0.119 0.094 0.688 MOTIF Cranio-Facial_E13.5_H3K4me1_11_159_0.537_5.435797e-119 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.162 0.128 0.158 0.552 0.106 0.042 0.13 0.722 0.187 0.086 0.103 0.624 0.597 0.172 0.071 0.16 0.645 0.117 0.114 0.124 0.164 0.516 0.145 0.175 0.157 0.16 0.538 0.145 0.112 0.608 0.11 0.17 0.179 0.127 0.15 0.544 0.133 0.495 0.207 0.165 MOTIF Kidney_E14.5_H3K4me1_10_160_0.535_2.128208e-68 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.113 0.122 0.677 0.088 0.704 0.087 0.11 0.099 0.107 0.084 0.707 0.102 0.105 0.676 0.096 0.123 0.094 0.1 0.696 0.11 0.136 0.097 0.088 0.679 0.108 0.074 0.116 0.702 0.708 0.083 0.08 0.129 0.745 0.1 0.075 0.08 0.708 0.106 0.094 0.092 MOTIF Cranio-Facial_E14.5_H3K4me1_21_168_0.534_8.694723e-73 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.101 0.13 0.675 0.094 0.681 0.093 0.104 0.122 0.1 0.095 0.721 0.084 0.109 0.666 0.113 0.112 0.107 0.099 0.692 0.102 0.104 0.095 0.082 0.719 0.116 0.083 0.111 0.69 0.708 0.083 0.084 0.125 0.757 0.082 0.081 0.08 0.693 0.113 0.079 0.115 MOTIF Stomach_E14.5_H3K4me1_16_162_0.532_1.584381e-58 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.109 0.131 0.675 0.085 0.703 0.084 0.11 0.103 0.122 0.099 0.698 0.081 0.113 0.651 0.12 0.116 0.098 0.094 0.714 0.094 0.102 0.086 0.11 0.702 0.107 0.082 0.107 0.704 0.707 0.089 0.093 0.111 0.777 0.071 0.081 0.071 0.669 0.116 0.087 0.128 MOTIF Liver_E16.5_H3K27me3_34_155_0.549_1.28967e-32 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.027 0.056 0.881 0.036 0.07 0.797 0.049 0.084 0.067 0.001 0.747 0.185 0.083 0.075 0.027 0.815 0.001 0.05 0.075 0.874 0.983 0.015 0.001 0.001 0.978 0.02 0.001 0.001 0.985 0.013 0.001 0.001 MOTIF Cranio-Facial_E15.5_H3K4me1_5_161_0.549_3.623338e-164 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.177 0.417 0.193 0.213 0.117 0.041 0.551 0.291 0.236 0.503 0.045 0.216 0.182 0.193 0.624 0.001 0.038 0.303 0.046 0.613 0.44 0.014 0.027 0.519 0.949 0.049 0.001 0.001 0.704 0.05 0.075 0.171 MOTIF Limb_E11.5_H3K4me1_3_153_0.559_8.293734e-162 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.005 0.001 0.001 0.993 0.024 0.062 0.023 0.891 0.985 0.001 0.001 0.013 0.965 0.001 0.018 0.016 0.037 0.847 0.001 0.115 0.064 0.029 0.851 0.056 0.216 0.691 0.001 0.092 0.057 0.069 0.818 0.056 MOTIF Cranio-Facial_E12.5_H3K4me1_7_164_0.545_1.743086e-132 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.702 0.077 0.076 0.145 0.069 0.059 0.049 0.823 0.119 0.053 0.035 0.793 0.819 0.076 0.015 0.09 0.782 0.041 0.123 0.054 0.072 0.716 0.05 0.162 0.169 0.073 0.586 0.172 0.049 0.778 0.087 0.086 MOTIF Forebrain_E11.5_H3K4me1_3_155_0.571_5.195215e-175 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.042 0.054 0.019 0.885 0.086 0.023 0.042 0.849 0.898 0.037 0.022 0.043 0.857 0.042 0.056 0.045 0.181 0.535 0.064 0.22 0.153 0.104 0.657 0.086 0.178 0.677 0.09 0.055 0.116 0.113 0.642 0.129 MOTIF Hindbrain_E16.5_H3K4me1_2_159_0.565_1.9285e-246 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.206 0.621 0.075 0.098 0.084 0.095 0.751 0.07 0.091 0.692 0.075 0.142 0.211 0.035 0.53 0.224 0.055 0.063 0.035 0.847 0.06 0.029 0.033 0.878 0.819 0.04 0.043 0.098 0.86 0.028 0.046 0.066 MOTIF Midbrain_E16.5_H3K4me1_5_161_0.561_8.261549e-205 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.215 0.524 0.193 0.068 0.089 0.038 0.745 0.128 0.066 0.563 0.134 0.237 0.121 0.037 0.639 0.203 0.11 0.102 0.071 0.717 0.074 0.004 0.056 0.866 0.964 0.029 0.006 0.001 0.87 0.036 0.022 0.072 MOTIF Stomach_E16.5_H3K4me1_16_168_0.531_1.721993e-64 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.275 0.229 0.249 0.247 0.167 0.524 0.147 0.162 0.152 0.137 0.138 0.573 0.168 0.135 0.155 0.542 0.589 0.141 0.12 0.15 0.577 0.144 0.144 0.135 0.17 0.542 0.139 0.149 0.16 0.138 0.548 0.154 0.138 0.555 0.157 0.15 0.253 0.237 0.233 0.277 MOTIF Stomach_P0_H3K4me1_4_180_0.547_1.581818e-87 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.099 0.086 0.728 0.087 0.132 0.666 0.091 0.111 0.122 0.096 0.67 0.112 0.099 0.129 0.094 0.678 0.104 0.092 0.105 0.699 0.671 0.122 0.111 0.096 0.751 0.061 0.083 0.105 0.104 0.088 0.722 0.086 0.097 0.72 0.079 0.104 0.116 0.696 0.076 0.112 MOTIF Limb_E13.5_H3K9ac_37_162_0.571_3.139319e-126 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.115 0.101 0.684 0.022 0.061 0.1 0.817 0.115 0.093 0.098 0.694 0.691 0.129 0.074 0.106 0.676 0.107 0.097 0.12 0.105 0.689 0.106 0.1 0.06 0.133 0.705 0.102 0.136 0.12 0.619 0.125 0.733 0.11 0.075 0.082 0.693 0.102 0.112 0.093 MOTIF Kidney_P0_H3K9ac_47_171_0.572_7.42343e-116 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.106 0.104 0.691 0.099 0.681 0.107 0.119 0.093 0.689 0.111 0.101 0.099 0.118 0.673 0.084 0.125 0.106 0.076 0.709 0.109 0.081 0.716 0.099 0.104 0.117 0.103 0.093 0.687 0.697 0.085 0.114 0.104 0.724 0.1 0.088 0.088 0.732 0.097 0.085 0.086 MOTIF Lung_E14.5_H3K9ac_34_157_0.604_1.262924e-206 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.204 0.154 0.471 0.17 0.567 0.148 0.147 0.138 0.581 0.135 0.16 0.124 0.157 0.681 0.047 0.115 0.117 0.058 0.698 0.127 0.116 0.532 0.167 0.185 0.196 0.132 0.187 0.484 0.622 0.065 0.166 0.147 0.741 0.106 0.107 0.046 0.624 0.128 0.13 0.118 MOTIF Heart_E14.5_H3K9ac_26_157_0.576_8.43473e-188 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.153 0.224 0.468 0.155 0.07 0.817 0.001 0.112 0.001 0.001 0.872 0.126 0.068 0.135 0.116 0.681 0.042 0.001 0.049 0.908 0.912 0.001 0.001 0.086 0.912 0.015 0.041 0.032 0.63 0.036 0.148 0.186 MOTIF Heart_P0_H3K9ac_27_156_0.600_2.149187e-201 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.202 0.2 0.501 0.097 0.523 0.088 0.14 0.249 0.544 0.094 0.268 0.094 0.102 0.833 0.014 0.051 0.039 0.026 0.897 0.038 0.029 0.156 0.24 0.575 0.151 0.018 0.228 0.603 0.776 0.019 0.019 0.186 0.817 0.139 0.025 0.019 0.603 0.164 0.128 0.105 MOTIF Limb_E12.5_H3K9ac_40_157_0.577_2.082392e-136 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.088 0.099 0.509 0.304 0.324 0.154 0.21 0.312 0.581 0.125 0.132 0.162 0.169 0.723 0.03 0.078 0.034 0.014 0.925 0.027 0.05 0.118 0.133 0.699 0.117 0.069 0.1 0.714 0.91 0.01 0.026 0.054 0.976 0.014 0.009 0.001 0.815 0.052 0.108 0.025 MOTIF Limb_E14.5_H3K9ac_30_158_0.600_2.037873e-183 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.412 0.184 0.172 0.232 0.518 0.184 0.17 0.128 0.197 0.545 0.089 0.169 0.089 0.079 0.672 0.16 0.098 0.184 0.126 0.592 0.241 0.094 0.098 0.567 0.534 0.099 0.088 0.279 0.685 0.096 0.108 0.111 0.599 0.101 0.163 0.137 0.252 0.366 0.174 0.209 MOTIF Midbrain_E11.5_H3K9ac_34_155_0.600_2.29313e-187 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.437 0.191 0.146 0.227 0.256 0.086 0.153 0.505 0.007 0.018 0.008 0.967 0.229 0.12 0.073 0.578 0.599 0.217 0.018 0.166 0.605 0.117 0.164 0.114 0.222 0.638 0.04 0.1 0.201 0.051 0.693 0.055 0.088 0.484 0.175 0.252 0.197 0.156 0.141 0.506