MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Forebrain_E13.5_H3K4me1_7_153_0.555_8.005828e-217 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.385 0.185 0.19 0.24 0.17 0.137 0.1 0.593 0.129 0.101 0.16 0.61 0.606 0.186 0.05 0.158 0.803 0.015 0.021 0.161 0.179 0.051 0.035 0.735 0.196 0.116 0.127 0.561 0.583 0.211 0.109 0.097 0.31 0.001 0.096 0.593 0.029 0.032 0.733 0.206 0.022 0.915 0.051 0.012 0.592 0.213 0.001 0.194 MOTIF Midbrain_E13.5_H3K4me1_4_152_0.556_6.247249e-235 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.44 0.181 0.165 0.214 0.182 0.112 0.121 0.585 0.168 0.108 0.204 0.52 0.534 0.186 0.109 0.171 0.689 0.054 0.029 0.228 0.222 0.055 0.072 0.651 0.236 0.138 0.115 0.511 0.563 0.196 0.124 0.117 0.248 0.003 0.162 0.587 0.085 0.12 0.549 0.246 0.156 0.725 0.083 0.036 0.609 0.191 0.004 0.196 MOTIF Limb_E13.5_H3K4me1_10_161_0.538_2.75114e-153 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.047 0.703 0.104 0.146 0.112 0.007 0.011 0.87 0.009 0.007 0.946 0.038 0.02 0.895 0.073 0.012 0.503 0.002 0.009 0.486 0.092 0.067 0.621 0.22 0.621 0.177 0.09 0.112 0.668 0.039 0.074 0.219 0.257 0.03 0.069 0.644 0.199 0.012 0.112 0.677 0.578 0.169 0.065 0.188 0.767 0.096 0.034 0.103 MOTIF Midbrain_P0_H3K4me1_11_156_0.540_9.701927e-55 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.001 0.001 0.001 0.997 0.125 0.019 0.178 0.678 0.771 0.14 0.001 0.088 0.906 0.001 0.001 0.092 0.055 0.038 0.007 0.9 0.205 0.035 0.061 0.699 0.599 0.399 0.001 0.001 0.192 0.001 0.001 0.806 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.034 0.001 0.847 0.118