MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Forebrain_E15.5_H3K9me3_7_174_0.539_5.90437e-15 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.001 0.04 0.001 0.958 0.001 0.806 0.066 0.127 0.043 0.001 0.016 0.94 0.84 0.048 0.001 0.111 0.001 0.046 0.001 0.952 0.047 0.001 0.063 0.889 0.068 0.001 0.93 0.001 0.001 0.051 0.777 0.171 MOTIF Forebrain_E12.5_H3K9me3_23_184_0.529_2.655914e-23 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.333 0.629 0.037 0.001 0.001 0.779 0.001 0.219 0.737 0.261 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.143 0.12 0.252 0.485 0.703 0.093 0.123 0.081 0.23 0.251 0.518 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.756 0.179 0.04 0.025 0.113 0.089 0.071 0.727 MOTIF Hindbrain_E13.5_H3K9me3_3_179_0.543_1.746979e-47 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.563 0.197 0.09 0.15 0.017 0.039 0.208 0.736 0.012 0.021 0.142 0.825 0.018 0.526 0.252 0.204 0.123 0.127 0.073 0.677 0.449 0.227 0.191 0.132 0.049 0.001 0.009 0.941 0.018 0.003 0.244 0.735 0.11 0.001 0.877 0.012 0.057 0.189 0.617 0.137 MOTIF Forebrain_E15.5_H3K9me3_1_153_0.555_1.608342e-31 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.369 0.05 0.089 0.491 0.498 0.174 0.037 0.292 0.039 0.24 0.104 0.617 0.062 0.474 0.323 0.141 0.262 0.477 0.061 0.2 0.664 0.182 0.021 0.133 0.22 0.371 0.304 0.105 0.166 0.569 0.024 0.241 0.842 0.028 0.015 0.115 0.512 0.127 0.339 0.022 0.513 0.206 0.205 0.076 0.564 0.14 0.12 0.176 MOTIF Hindbrain_E15.5_H3K9me3_1_174_0.556_3.82888e-36 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.129 0.077 0.002 0.792 0.146 0.664 0.073 0.117 0.196 0.178 0.007 0.619 0.465 0.146 0.186 0.203 0.066 0.125 0.122 0.687 0.089 0.001 0.158 0.752 0.213 0.001 0.507 0.279 0.097 0.091 0.587 0.225 0.437 0.157 0.258 0.148 0.01 0.131 0.157 0.702