MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Hindbrain_E15.5_H3K9me3_101_110_0.512_0.003545764 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.033206 0.945735 0.021059 0.0 0.611116 0.239778 0.0 0.149106 0.024282 0.026483 0.008331 0.940904 0.02904 0.006933 0.914244 0.049783 0.08125 0.147604 0.037292 0.733854 0.220011 0.051853 0.095754 0.632381 0.003788 0.078869 0.023808 0.893535 0.027673 0.037249 0.026007 0.909071 0.006316 0.895598 0.005995 0.09209 0.295817 0.4459 0.10227 0.156014 MOTIF Forebrain_E14.5_H3K9me3_49_90_0.515_3.969565e-05 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.124247 0.777618 0.021047 0.077089 0.789196 0.095427 0.046431 0.068947 0.014255 0.054892 0.000825 0.930027 0.033859 0.022065 0.934896 0.00918 0.127704 0.070626 0.032007 0.769662 0.135248 0.173877 0.107804 0.583071 0.026859 0.029259 0.012318 0.931564 0.039932 0.020441 0.061258 0.878369 0.0 0.832593 0.019454 0.147953 0.531309 0.148347 0.275678 0.044666 MOTIF Hindbrain_E14.5_H3K9me3_107_133_0.509_0.0002485432 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.092105 0.680244 0.186506 0.041145 0.673484 0.148994 0.014014 0.163508 0.031653 0.067974 0.031235 0.869138 0.049327 0.01352 0.88578 0.051373 0.118127 0.099619 0.010881 0.771373 0.113016 0.059414 0.071123 0.756448 0.015638 0.103452 0.011346 0.869564 0.015184 0.115477 0.030363 0.838977 0.003513 0.91698 0.013345 0.066162 MOTIF Hindbrain_P0_H3K9me3_34_122_0.523_4.04119e-07 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.127228 0.697759 0.06936 0.105654 0.800636 0.114966 0.037788 0.04661 0.028018 0.053792 0.021653 0.896537 0.081173 0.030544 0.86892 0.019363 0.102343 0.04827 0.044388 0.804999 0.136498 0.142982 0.119195 0.601324 0.022395 0.095009 0.015597 0.866999 0.010623 0.146557 0.051081 0.791739 0.002107 0.888072 0.012196 0.097626 MOTIF Midbrain_E14.5_H3K9me3_60_98_0.516_2.797484e-07 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.07896 0.767167 0.047328 0.106544 0.836051 0.064681 0.012663 0.086605 0.016238 0.055181 0.037004 0.891577 0.057156 0.020238 0.885159 0.037448 0.039672 0.073461 0.142236 0.744632 0.157076 0.168582 0.024527 0.649816 0.012914 0.13463 0.023824 0.828632 0.021696 0.074274 0.0682 0.835831 0.006177 0.870402 0.013283 0.110138