MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Midbrain_E13.5_H3K4me3_87_170_0.545_2.1574e-59 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.722 0.099 0.079 0.1 0.099 0.077 0.078 0.746 0.072 0.077 0.062 0.789 0.098 0.081 0.075 0.746 0.757 0.087 0.067 0.089 0.794 0.043 0.082 0.081 0.111 0.09 0.716 0.083 0.102 0.731 0.094 0.073 0.77 0.091 0.049 0.09 0.085 0.09 0.077 0.748 0.075 0.081 0.088 0.756 0.098 0.723 0.07 0.109 MOTIF Kidney_E16.5_H3K9ac_75_164_0.537_4.009667e-33 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.14 0.057 0.733 0.07 0.865 0.042 0.063 0.03 0.802 0.074 0.054 0.07 0.181 0.007 0.153 0.659 0.059 0.112 0.696 0.133 0.062 0.808 0.026 0.104 0.083 0.061 0.004 0.852 0.126 0.091 0.168 0.615 0.777 0.066 0.095 0.062 0.891 0.046 0.058 0.005 0.824 0.026 0.116 0.034 0.213 0.484 0.164 0.139 MOTIF Hindbrain_E12.5_H3K9ac_60_171_0.550_3.485737e-91 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 MOTIF Forebrain_E12.5_H3K9ac_42_164_0.574_5.680806e-110 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.121 0.611 0.138 0.13 0.165 0.034 0.687 0.114 0.527 0.178 0.199 0.096 0.727 0.112 0.099 0.062 0.581 0.14 0.137 0.142 0.187 0.135 0.533 0.145 0.143 0.536 0.144 0.177 0.138 0.164 0.162 0.536 0.057 0.113 0.141 0.689 0.141 0.168 0.117 0.574 MOTIF Neural-Tube_E13.5_H3K9ac_48_171_0.562_4.861272e-114 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.135 0.598 0.138 0.129 0.131 0.104 0.639 0.126 0.582 0.136 0.162 0.12 0.631 0.13 0.123 0.116 0.572 0.149 0.134 0.145 0.131 0.13 0.603 0.136 0.141 0.591 0.132 0.136 0.15 0.129 0.159 0.562 0.111 0.131 0.142 0.616 0.133 0.142 0.12 0.605